基因總覽
PCDH20（protocadherin 20）是人類的蛋白質編碼基因。其產物被描述為可能具有鈣依賴性細胞黏附功能，並屬於 protocadherin 類蛋白。蛋白質全長 951 個胺基酸，具有細胞外區域、單次穿膜區段及短的細胞質區域。細胞外部分含有多個 Cadherin 結構域，構成其主要結構特色。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000409204 ★ | 61,409,685–61,415,849 | 2 |
| ENST00001131854 | 61,408,965–61,415,849 | 2 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
protocadherin 20 被描述為可能參與鈣依賴性細胞黏附的蛋白質。這項功能註記指出其可能涉及細胞間黏附，且過程與鈣離子相關；但現有資料僅提供潛在功能描述，沒有進一步說明其作用機制、調控方式或特定生物學情境，因此不宜將其視為已確立的詳細機制。
Promoter 與基因調控
>PCDH20 ENST00000409204 GRCh38 chr13:61415749-61416849 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGTTTAGGATTATTAGAAATGAGGAGAAAATAGGAAGGATAGGAAGCAAAACAGTTAGCTCAGCCAAGCA ATTTATATTCTAGTTAGCATTTGGTGGAAGGGGAAAATTGAAGTAGTTCCTACAGAAAGCATATGGAAAT CAGGTATCAAAGACCTTTTTTCACTCTAGGCTCAGTCACTGGTCATTCAGCATGTGAGGTTTTATGTTCA GGACCCTGCAGAGGATATCTGGAAGCCTAGCGATGAAGAGAAATGTCTTCTCAAGGAAAGGCCGAATCAT GGGCTTTTCCATTACTTACATGGCAACCTGCAGATCAAAAAGTGTTTCAGAGGCTTAATGCACTGGAGTA TCCCACTAGCCTTGATTTTATAAATGAGGAAACAGAAGGCCAGGAGTTAGGTGACTCCAGGTTACATAGC TATTCAGTGTCAAAGCCATAGAAGATAGGCAATCATTTGGCACCACACTCTTCCACAATTCCTTTATGAA GGACCAGTTTTCCAGTAGGCAATCCAGGAGAAAGAAAGAGAGAGAGAAAGGGAGAGAGGCAGGGAAAGAG GGAGAGAGTGAGGGAGCGAGGGAGCTAGGGAGTAAGGGAGGGAGGGAGGAAGGAAGGAAGAAAGGAAGGG GGGAAGGGGAAGAGGGGAAGGGGAAGGAAGGAAAGGAAGGAAGGAGGAAAGGGGGAGGGAAAGAAGGGGG AAGGAAAGAAGGAAGCAGGGAAGAGGAAAGAAGGGAAGGGGGAAGGGGAAAGAGGGGAGGGGGGGAGAGA AGGAAGGAAGGAAACAAGGAAGGAAGGACTAATTTGAAAAATAACCAATGTTTTACCTAGGCTTCAGTGA ATACCTCCCCCTCCCCACACCAATTTACCGCTTAGATAAATATGTTTAAGATTACTTGCAGGCAGAACTA CTTGTGTTACAGCACAATTGTTTCTACTTTCCCCTTGGCTCTTCCCCGCATCCAGAAGCCACTACTGCCT CTAAAATAAGACCACAAGGCAAACACCCAGAGACATTTGAGCCTCCAACTAGGAAACTAGCAGAAGCTCT ACCACTGCCCACAGCAAAGATTCAAAATTGGGGTATGTCGAAACCTTCACT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR13_83RQ8P · enhancer · 61410807–61410966 · regulatory
ENSR13_5JFZZN · CTCF_binding_site · 61410881–61410902 · regulatory
ENSR13_C84JM · enhancer · 61414423–61415838 · regulatory
ENSR13_75LHP7 · promoter · 61415839–61415942 · regulatory
· motif · 61410883–61410899 · motif
· motif · 61415481–61415495 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：951 aa
protocadherin 20 長 951 個胺基酸。其 N 端訊號區為第 1–60 位，細胞外區域為第 61–890 位，接續第 891–911 位的螺旋型穿膜區，細胞質區域則為第 912–951 位。細胞外含六個 Cadherin 結構域，分別位於第 64–209、210–320、321–535、536–639、640–742 與 746–863 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
protocadherin 20 位於細胞膜，屬於單次穿膜的第一型膜蛋白。 此定位註記未提供定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AAACACCCAGAGACATTTGAGCCTCCAACTAGGAAACTAG40CAGAAGCTCTACCACTGCCCACAGCAAAGATTCAAAATTG80GGGTATGTCGAAACCTTCACTGAATTCATATATTTACTTT120TCCGGTTCACCCTACGTTACACAGAAGTTGAGATTCCTTC160CCTCCGCTGAGAAAAGTGCATTTTCTTTCTCTGTGCCAAC200ACTGCTGGATCCGAGGCTCCAGGAGGAACTGTTGGCAAAG240CAGGCGTTTTGGGACCGCGCCTGTGATTGCTCTGTGGCGC280CGACTTCCTCTCTCTGTTACATCCATATACAAATGCAAGC320TTATTTATTTATTTTAATTCTCCCTCTCTTGCTAGCAACC360TGTGGACTTGGCATCTGACTGGTGCGGCAAGGAAGGAGGC400TGGTAGGTAAGCGCTACTGTGCCCAACCCCGAGCTGCCTC440TTCGCAGTCTTCAGGAGCAAGTCCCCCATTCCAGCTCCTC480TGGCAGAGTATGGAGTTACCTGCGTCCGGGGCAGGAAACC520ATGAATGTGCCCTTCTGCCCTCTTGCCTTTCTGCCACTCT560TTGAGTTCCCGTCCTTAATTGAAGAGCCAGTGACTATTGG600CTGAAGTTCCCCCAGCGATTTGCATGAACCGAGAGGGAGT640GTCTTCTGCCGCCCTCCCTTCAAGAGCGCTCTGACTGCAG680CCTCCCAGGGAATGCGCGGCCGAGGGAATGCGCGCAGCTC720ACAGGCCCTGGGAGTGAGCTGGTGCCCGGCGACCTGGCAC760CCGCGCCTGGATATGGGGCGTCTACATCGTCCCAGGAGCA800GCACCAGCTACAGGAACCTGCCGCATCTGTTTCTGTTTTT840CCTCTTCGTGGGACCCTTCAGCTGCCTCGGGAGTTACAGC880CGGGCCACCGAGCTTCTGTACAGCCTAAACGAGGGACTAC920CCGCGGGGGTGCTCATCGGCAGCCTGGCCGAGGACCTGCG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。