基因總覽
PCDH17 是蛋白質編碼基因，其正式名稱為 protocadherin 17。來源將其產物描述為可能具有鈣離子依賴性細胞黏附功能的蛋白質；目前提供的資料未進一步說明其家族特徵或其他整體生物學角色。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000377918 ★ | 57,631,744–57,729,311 | 4 |
| ENST00001131740 | 57,631,429–57,729,311 | 4 |
| ENST00000612954 | 57,634,383–57,725,293 | 4 |
| ENST00000615375 | 57,635,013–57,724,748 | 5 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
PCDH17 的產物被描述為可能參與鈣離子依賴性細胞黏附。現有資料未提供其作用機制、參與的生物學過程或實驗條件，因此無法據此進一步說明其功能。
Promoter 與基因調控
>PCDH17 ENST00000377918 GRCh38 chr13:57630744-57631844 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCTTTCTATAGACTGAGTCAGAGAAAGCGTTAGGAAGAAGCCGCAACTAATGTCTGTGAAGGGAGGACCA TGAGGCGAGAGTGAATACGATTCGTTCCGCTGCTTCTGACTCATCCGGCAGATCGGAACACCTGCATTTC TGGATGTGTCATTCCCGTATGTCGAGGCGCCTCCAGAACCCGAAATAATGTGTAGACAGACCTGTGTCTA ACATCCCCTCGGAGGGAGCTCCCCGGGGTAGGAGCCCCTGGCTGGACCGCCGCGGCCGCAGCTCTGCACC CCCTGCCCTCCCTGAGTCGCCCAGAAAAACTGAAAGAGAGACTGCAGAATGCATCACGCCAAACCTTGAT GTGTTGCTTTCATCCAGCCCACTCCTCCTACTATAAGAGAAAATTGAAGGAAAAAAAAAAACACGTACTT TATTTGCTTCAAATATTCATCACTTTTATTCCTCGCCAAGGTTTTCTTTTCTAGATGAAGAGGACTGGGA GGCAGGGCTATTGGAAGGAGATGCTGAATAGAAAGAAAAGAGGCACTTGACAGCCCAGCCCTGTGAATGC AGAGACTGTTTCCCTTCTAGCGAGAGACAGGGAGAGTGTGTGTGCAAGGACTGGGAGGGAGGCTCCCCCT TCCTTTTTATTCGGCCTCCCCCCTCCTCCTTTAAATGTGCACGTCCAACCATGAGTTGCCTGTTGATTTC CCTTCGCCTGGGAAGAAAAGCAAACTGGAATTAAACTGCTTGGAGAGAAGTCCTTGCTCGCGGGGAGAGG ATGGGATGGTAGCGGAGGCTACTGGCTTGGCGTAGAGAAATCAGAGAGTGTGTTCTACGAACAGAGGCGA AGATTTATCTCTCTACTTCCCCCCTCCCAATAGACTCACACAGCAAATGCTGATCAGGCTGTGGCTTTCT TGATTTCGGGGGAGAGCCTTTTCCGAGGAAGAGAGGGAGGAGCCTGGTGGGGAGAGGAAACTACAAATCG GGACACTAGTTCTTTACGCTGCATTTCCTCCCCTCCCTTTGGCTGCTCGGAAAGGAGAGAGAGGAAAAAA AAAATACGCTTGGCTGGTAGATGCAGTCCGCCGCCGCCGCTGCCTCAGCCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| PCDH17_2 ↗ | 13:57,631,435 | 正股 | 57,631,386–57,631,445 |
| PCDH17_1 ↗ | 13:57,631,744 | 正股 | 57,631,695–57,631,754 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR13_9STKP · enhancer · 57627676–57628127 · regulatory
ENSR13_5HJZBB · CTCF_binding_site · 57627778–57627799 · regulatory
ENSR13_5HJZJW · CTCF_binding_site · 57629203–57629224 · regulatory
ENSR13_BFFRM · promoter · 57629575–57630110 · regulatory
ENSR13_5HJZMN · CTCF_binding_site · 57629805–57629826 · regulatory
ENSR13_5HJZNK · CTCF_binding_site · 57629995–57630016 · regulatory
ENSR13_9STLF · enhancer · 57630111–57630374 · regulatory
ENSR13_9STLR · promoter · 57631254–57631754 · regulatory
ENSR13_5HJZWW · CTCF_binding_site · 57631362–57631383 · regulatory
ENSR13_5HK24M · CTCF_binding_site · 57632385–57632406 · regulatory
ENSR13_5HK265 · CTCF_binding_site · 57632703–57632724 · regulatory
ENSR13_9STMG · promoter · 57633565–57634065 · regulatory
ENSR13_5HK2B7 · CTCF_binding_site · 57633585–57633606 · regulatory
ENSR13_5HK2BB · CTCF_binding_site · 57633610–57633631 · regulatory
ENSR13_5HK2QN · CTCF_binding_site · 57636285–57636306 · regulatory
· motif · 57627780–57627796 · motif
· motif · 57629205–57629221 · motif
· motif · 57629807–57629823 · motif
· motif · 57629974–57629984 · motif
· motif · 57629997–57630013 · motif
· motif · 57631364–57631380 · motif
· motif · 57632387–57632403 · motif
· motif · 57632705–57632721 · motif
· motif · 57633587–57633603 · motif
· motif · 57633612–57633628 · motif
· motif · 57636287–57636303 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1159 aa
Protocadherin-17 長 1,159 個胺基酸，具有 17 個胺基酸的訊號胜肽。其胞外區域包含六個 Cadherin 結構域；之後接續一段跨膜螺旋，並連接胞質區域。序列註解另標示兩段無序區，以及一處 Cell attachment site。
蛋白質三維結構
細胞內定位
PCDH17 被註解為位於細胞膜的單次穿膜 I 型膜蛋白。 現有定位資料未提供條件性變化或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- TSC22D4Q9Y3Q8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- YAF2Q8IY57-5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GCATTTCCTCCCCTCCCTTTGGCTGCTCGGAAAGGAGAGA40GAGGAAAAAAAAAATACGCTTGGCTGGTAGATGCAGTCCG80CCGCCGCCGCTGCCTCAGCCAGCAATGCAAGATTAGATCT120CTAAATGCAGCAAAACACTGCCTGAAAACAGACCGGCCCG160CGCAGCAAGCAGACATTTCACGGTGCGCTGGGGAAGCTTC200AAAATATATCTGTGACTCTGTCTTCGTTGCTCTTCATCCC240CATCAATTTCATCACGGGAGGCGAGCAGCAAGTAAGAATT280TCACTTTCGGATCTGCCTAGAGACACACCTCCCTGCTCCC320TCCCCCACTCGATGTGAAGAGTATTCCGGAGTCTCCGGGC360GGGAGTAGATTTGCAGCACCCTAGCGGGAGCGAGGAAAAC400CTACTGATTCTTTAGCTCATTATCATCTCTCCCAGACGAG440ATTTCCTTCTTATCGCCTGCCTCATCGCTCAAGTTTGAGC480CTCCCGAAGTCCGGGCGGGAGAGACGAAACCCCTGGCTCA520CCCCCAGCCGCAGGAAGCCACCGCCTTGCTCCAAGCCCCT560GCAGCTCTGCTGCACCGCAGCTTCTCACCCAGTGCGGATG600CTGTAGATCAACAGGTTCAGGGAACTTGAGCAGAATAAGG640AGAGACCACCGGGTGCCGCAGCTCGGGTGCAGAGGGAAAA680AAGGACCCATAGACTTGTGGCTCGCGTCGCGCGCGCACGC720TGCGCCAGGGCCCCAGGCTGGCGCGCACTCCCTCTCTGGC760TCCTCCAGTCCGATTGCTCCTGCCCCCACCTTACAGGTCT800GGGATGTACCTTTCCATCTGTTGCTGCTTTCTTCTATGGG840CCCCTGCCCTCACTCTCAAGAACCTCAACTACTCCGTGCC880GGAGGAGCAAGGGGCCGGCACGGTGATCGGGAACATCGGC920AGGGATGCTCGACTGCAGCCTGGGCTTCCGCCTGCAGAGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。