演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

PARD3BPar3L

par-3 family cell polarity regulator beta

PARD3B 是 PAR3 家族的蛋白質,可能參與不對稱細胞分裂、細胞極化及上皮細胞緊密連結的形成。

Homo sapiens2q33.3UniProt Q8TEW8
OFFICIAL SYMBOL
PARD3B
CHROMOSOME
2
UNIPROT
Q8TEW8
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

PARD3B(par-3 family cell polarity regulator beta)是蛋白質編碼基因,產物屬於 PAR3 家族。其蛋白質長 1205 個胺基酸,具有三個 PDZ 結構域,並含有多段預測為無序的區域。來源將其描述為可能參與細胞極性相關過程的適配蛋白;至於這些結構特徵如何支持其作用,現有資料未提供進一步說明。

Official symbol
PARD3B
Gene name
par-3 family cell polarity regulator beta
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14446
UniProt
Q8TEW8
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
Par3LPAR3betaALS2CR19

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22q33.3
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegPARD3Bpq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr2:204,545,162–205,620,162
Gene span
1,075,001 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000406610 ★204,545,475–205,620,16223
ENST00001144358204,545,162–205,620,16223
ENST00000349953204,546,000–205,615,81322
ENST00000351153204,546,000–205,615,81322
ENST00000358768204,546,000–205,615,81322

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

PARD3B 的蛋白質產物被描述為一種推定的適配蛋白,可能參與不對稱細胞分裂與細胞極化。適配蛋白通常涉及協調不同分子或細胞結構,但現有來源未詳述 PARD3B 在這些過程中的具體作用方式,因此其分子機制與作用對象仍無法由此資料確定。

細胞極化涉及細胞內部或細胞表面形成不對稱的組織狀態;不對稱細胞分裂則與細胞分裂時產生不同細胞特徵有關。來源指出 PARD3B 可能參與這兩類過程,但未提供細胞類型、實驗條件或對其作用的直接測試結果,故不宜將這些角色視為已確立的機制。

此外,PARD3B 可能參與上皮細胞緊密連結的形成。緊密連結是上皮細胞間的連結結構;然而來源只提出可能的參與關係,沒有說明 PARD3B 如何促成其形成,也未界定其作用階段或必要性。上述描述共同指出 PARD3B 與細胞極性及上皮細胞連結相關,但現有資料不足以進一步判定其功能細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 204545475 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>PARD3B ENST00000406610 GRCh38 chr2:204544475-204545575 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGAGCACATCCTTCTGTAGAGAAACACATGATGCAGCCCTGAGGGTCTTGCTGGATGAACTGGATGGCTA
AGAAAACTGCAGGGAGAGACCAGAGATTGAGCTCAGAAGACCTGAGTTCTTTTCAACAGAACTAACACCA
TGGTCTGCTCAGTCTCTTGACCTCTCCGAGCACCATTCTTGATGCACAAGATGCGAAGAATAATATCTAC
CTACCGGGTAGTTGTTAAGCTCAAAGGAGCTCATTTACATGAGAGCTAAGAATGAAACTAACGTAATTTG
TTGGTTTCCCCCACATATTCCCATTTCAATTGGTGATGGATACACACCTGCCAAATCATGAGCCTAAGGG
TGTTAACTTTTTTTTTTCCTAATAAAATGCACAACGGTAGTCGCATTCCAGAAGGCTATGTGTCAACACA
CGCGATCATATCTGGGTCTTGGGTGTGACCTTTGGCCAAATACTCAGTGTCCTCGAGGGTCTGTAAAAGG
AAAAGTTTCCACTGGCGCGTTCTCTCCAAGGTTCGCTTCAGCTCTGCTATCCCAGGGCTCCTGATGGCAG
CGGCACGGGCTGTGCTTAAGGCGAGTTCCTAACAGGCCCTCGGGGCACTCCTGCATCTCCGCACCCGGCA
GCCTCGCCCCTTGGGTGTTTTTGGTGGGCGTGACTAGAAGCACCTGCTCCTGGGCTCCTTTTGCATCTTG
CTGCAGTCCCCTCCTGTGAAGGGCGCAGCTCTGCAGTCTCCTCGCTCTTCCCTCGGGTGTTCTTTCTGAG
ATCCGGTTTCAATCCTCGAGCGTGTAGCCCTCAGGTCCCCTTACAACTCCCCAGAGCTCCGTGTGCATGC
GTGCGAGAGGGAGAGAGCCAGGGAGAGACCCAGGTGACGAGACGAGGCTCCCGGGCTCCAGTTACTGGCC
CGCAGGGCCGGGGCACGTCGTCGCCCAGCGTGCGGCGGGGCCCGGGAGCGCCGCGGCCCCTTTAAGAGCC
GGGCCCAGGCCGTCGCCGGGACCGCAGGAGCCCAGAGCGCGGGCGCCGCAGAGGAGTTGGGAGCCGGCGC
AAAAGTTTCCTCCCAACTCTGGCCCCGTGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCCAC
PARD3B 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 4 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
PARD3B_4 ↗2:204,544,940正股204,544,891–204,544,950
PARD3B_1 ↗2:204,545,539正股204,545,490–204,545,549
PARD3B_2 ↗2:204,545,809正股204,545,760–204,545,819
PARD3B_3 ↗2:204,545,994正股204,545,945–204,546,004

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR2_95273J · promoter · 204544985–204545485 · regulatory

ENSR2_95273N · promoter · 204545510–204546010 · regulatory

ENSR2_53R522D · CTCF_binding_site · 204545811–204545832 · regulatory

ENSR2_B3HL3K · enhancer · 204550366–204551342 · regulatory

· motif · 204543152–204543161 · motif

· motif · 204543428–204543437 · motif

· motif · 204543428–204543437 · motif

· motif · 204545813–204545829 · motif

· motif · 204545950–204545957 · motif

· motif · 204546567–204546576 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1205 aa

1 aa1205 aa結構域功能區域
依 Q8TEW8 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

PARD3B 蛋白質長 1205 個胺基酸,屬於 PAR3 家族。序列註解標示三個 PDZ 結構域,分別位於胺基酸 201–289、383–468 與 498–585;另有多段區域被註解為無序區,包括 784–921 與 1111–1205 等區段。

結構域PDZ 1201–289 aa
結構域PDZ 2383–468 aa
結構域PDZ 3498–585 aa
功能區域Disordered83–104 aa
功能區域Disordered137–165 aa
功能區域Disordered318–374 aa
功能區域Disordered707–743 aa
功能區域Disordered784–921 aa
功能區域Disordered1111–1205 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q8TEW8…

AlphaFold · Q8TEW8

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Endomembrane system;Cell junction;Cell junction, tight junction

PARD3B 被記錄於內膜系統及細胞連結,並部分分布於細胞與細胞接觸區域。 在上皮細胞中,PARD3B 與 TJP1 共定位於緊密連結;資料未提供其定位變化的條件或異構型差異。

未繪示構造:Endomembrane system;Cell junction;Cell junction, tight junction。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 29 個夥伴 · 最多顯示 50 個
Par3LPARD3BABCC4ARHGEF16ASIC3ATP2B4CIB2CYSLTR2DGKKDGKZDOCK4FRMPD4FZD7KCNA5KIR3DL3MAP2K2PBKPTENRASSF6RPS6KA1SLC15A5SLCO1C1TAMALINTJP23aE6E6E6GP1ORF putativ…Tax
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 29 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

PARD3B 與 PARD6B 及 INSC(inscuteable)有交互作用的記錄。來源未進一步說明這些關係是否屬於直接實體結合,亦未指出相關複合體或其功能後果,因此不將其延伸解讀為特定複合體或機制。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能PARD3B 被描述為推定的適配蛋白,可能參與不對稱細胞分裂與細胞極化過程;此外,它也可能參與上皮細胞緊密連結的形成。這些內容表示可能的功能角色,來源未提供更具體的作用機制。資料庫紀錄
證據與來源

Putative adapter protein involved in asymmetrical cell division and cell polarization processes. May play a role in the formation of epithelial tight junctions

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用PARD3B 與 PARD6B 及 INSC(inscuteable)有交互作用的記錄。此敘述未進一步說明交互作用的性質、發生條件或功能結果。含實驗來源
證據與來源

Interacts with PARD6B. Interacts with INSC/inscuteable

PMID 12234671 ↗ · PMID 16458856 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位PARD3B 被記錄於內膜系統與細胞連結,包括緊密連結,並部分分布於細胞接觸區域。在上皮細胞中,PARD3B 與 TJP1 共定位於緊密連結。資料庫紀錄
證據與來源

Endomembrane system; Cell junction; Cell junction, tight junction; Partially localized along the cell-cell contact region. Colocalizes with TJP1 to epithelial tight junctions

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000406610 · 8,492 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1ACCGCAGGAGCCCAGAGCGCGGGCGCCGCAGAGGAGTTGG40
41GAGCCGGCGCAAAAGTTTCCTCCCAACTCTGGCCCCGTGC80
81GCCGCCGCCGCCGCCGCCCACTCCAGCCCCCGGCTTGGGG120
121CCGGCCCTGCCAACGCCGCCAGGGCCAGGGCCAGGGCCAG160
161GACCAGCGACAGGGCAGGGCCGGCAGTTTCGCTTTGGTGG200
201GCGCGGAGCAGCCGCCTGGGCCGGGCAGGAGTAGGAGCGG240
241GAGGAGGAGGAGGAGGAGCCGGTGCCGCGGAGCTGCCGCG280
281TCCCGGGCCGCCGGGCACCTGGGAGGTAACCCCTTTCCGC320
321GGCCGCCCCTCCCCGATTCCCGCCACCTGCCGCCTGGCCA360
361GGTGGAAGGGGCGCTGCCGCGAGCCTCCGGGCCTCAGGGT400
401GTTCCGGGGAGCGGCGCCCCGGGTCTCTGGGCCCACCCGC440
441CCCGGGCGTCCTCCGAGAGTGGGGGCTGCGCCCGCGGGGT480
481CAGACACCTGTTCGGCCCGGCCCGGCGTGGTCGCCGGGGG520
521CCAGGATGAAAGTGACCGTGTGCTTCGGCAGGACGGGCAT560
561CGTGGTGCCCTGCAAGGAGGGCCAGCTGCGCGTCGGCGAG600
601CTCACCCAGCAGGCGCTGCAGCGGTACCTGAAGACCCGGG640
641AGAAGGGTCCTGGTTACTGGGTGAAGATTCATCACTTAGA680
681ATATACAGATGGAGGAATCCTGGATCCAGATGATGTCTTG720
721GCAGATGTTGTTGAAGATAAAGACAAGCTGATTGCTGTGT760
761TTGAAGAACAAGAACCACTCCACAAGATTGAGAGCCCCAG800
801TGGAAACCCTGCAGATCGGCAGAGCCCAGATGCTTTTGAG840
841ACAGAAGTGGCCGCCCAACTGGCCGCATTTAAGCCAATTG880
881GTGGGGAGATTGAAGTAACCCCTTCTGCTCTAAAACTAGG920
921CACTCCACTGCTGGTGAGGAGAAGCAGTGACCCAGTGCCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。