基因總覽
PABPC5（poly(A) binding protein cytoplasmic 5）是位於 X 染色體的蛋白質編碼基因，產物屬於細胞質 poly(A) 結合蛋白。蛋白質長 382 個胺基酸，具有四個 RNA recognition motif（RRM），分布於蛋白質序列不同區段。這些結構特徵與其 RNA 結合性質相符。現有資料指出，PABPC5 可結合 mRNA 的 poly(A) 尾端；此外，第二異構型有粒線體定位的證據。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000312600 ★ | 91,434,839–91,438,584 | 2 |
| ENST00000373105 | 91,434,595–91,438,981 | 2 |
| ENST00001133037 | 91,434,595–91,441,885 | 2 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
PABPC5 可結合 mRNA 的 poly(A) 尾端。poly(A) 是 mRNA 尾端的腺嘌呤核苷酸序列；此結合特性構成目前資料所描述的主要分子作用。來源並未進一步說明 PABPC5 如何改變所結合 mRNA 的命運，也未提供其作用於哪些特定轉錄本或細胞條件的資訊，因此不宜延伸推定其調控結果。
資料指出，PABPC5 可能參與細胞質中的 mRNA 代謝調控過程，但這項描述保留「可能」的不確定性，並未界定涉及的代謝步驟或調控方向。另有相似性推論認為，PABPC5 在體內可能也會結合 poly(A) 以外的細胞質 RNA 序列；這並非確證的實驗結論，且現有資料未指出這些序列的種類或其結合所帶來的功能。
因此，來源支持的功能範圍主要限於 poly(A) 尾端結合，以及可能參與細胞質 mRNA 代謝調控和可能辨識其他細胞質 RNA 序列。這些資訊顯示 PABPC5 具有與 RNA 互動的特性，但不足以確定其完整的生理角色、作用機制或對特定生物學結果的影響。
Promoter 與基因調控
>PABPC5 ENST00000312600 GRCh38 chrX:91433839-91434939 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GAGTCCAGTCTGATGGCACTGTTTCCTTCAAGGGTTTCAAGTTGACAACTCATGATGAAATTCATAATTG TGTAAAGTGCATATATCTTAACATGTTTATTTCATCTGTAAATATTAATTACATATTTTGTATTGATTCT GTGGCTTTTATCTCTTTAACTGAGATTTTGTAACTGTAATTCTCGCGGCAGCTCAACAGTTTCAACGTTT TGTGGCACTAAACACCATCAAAAGCCATTATATGGCTCTCCAATCATTAAAACCTTAGTATTATGGGATC AGAGAAAAGATCTCTTTGCCTACCACCTGAGGAAAATATTACCATTATGTTGGAGATTAATGAAGTAAGG CTAAAGGCCAAAGGCAACATGGTCCTGTGTTCTACTTGACCCTGTGATCCTTTAGCACTGGATTGGGAGG CCAGGACATTTGTAAACTTTGACTTTCCAATGCACTCAGGAAAGTATGCAACCTATCCTTTTCCCTAAGC TTAAATGATTTTGATAATTAGTTTTTTAAAACTTATTATTTTTGCCCAGGTCGTCATCTTCTTATGTGAT TTTTAGATGTTCGGCTTAAATATAGTGTTTTAAATAATAAATAACATTTAAAATATAAGAAACATCTAAA AGCCATCTTAGATTTTTCTTTCTCTCCTTCTCTCTCTCTCTCTCATTCTCTCCCCTTCTCTCTCTCTCTC TCTCTCTCTCTCTCTCTCCCCCCTTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTAAATCTTGGTACAGAGGAAGCGGGA AGTTACTTAGCACGGTTCCGGGTTTCTCGCGCCCCGCCTGTCCCCCCTCCCTATCACTGCTACTGGCTCT TGGTCCCTCCGTTGGACTGTCCTGCGGAGAGAAACCCCAGCCCATCGGTCTGCGCTGGGACCGCCCGCCG CGCATCTGCCCTTCTTCGCTGACTCCGCCCCGCATCTGGCCAGACCCGCCTCGCGTCAGAGCTGACCCAC TCACTGCGCGTTTGCCAGTCAGTCTCTCCGGACCTGCCTCGAGCCTCAGGCTGCTGAAATCACCGCGCCT CACTCGGTCCGTACCCAGTGGGCATCTTGGGTATCTGGGCGGTCTTCGATC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| PABPC5_1 ↗ | X:91,434,839 | 正股 | 91,434,790–91,434,849 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSRX_93C9TR · promoter · 91434505–91434849 · regulatory
ENSRX_77D6JF · enhancer · 91434850–91434958 · regulatory
ENSRX_BN5XG · promoter · 91434959–91435513 · regulatory
· motif · 91430254–91430263 · motif
· motif · 91430254–91430263 · motif
· motif · 91430443–91430452 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：382 aa
PABPC5 蛋白質長 382 個胺基酸，含有四個 RNA recognition motif：RRM 1 位於第 18–96 位、RRM 2 位於第 106–182 位、RRM 3 位於第 199–276 位，RRM 4 位於第 302–378 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
另有研究資料指出，第二異構型位於粒線體基質，並與粒線體 DNA 共分餾，且可與粒線體 poly(A) polymerase 共免疫沉澱；這些結果描述的是第二異構型及其伴隨現象，不應延伸為所有異構型皆具有相同定位。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- PAIP2Q9BPZ3 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | PABPC5 可結合 mRNA 的 poly(A) 尾端，並可能參與細胞質中的 mRNA 代謝調控。此外，根據相似性推論，PABPC5 在體內可能也能結合 poly(A) 以外的細胞質 RNA 序列；此項結合可能性並非確證結果。 | 推論支持 | 證據與來源Binds the poly(A) tail of mRNA. May be involved in cytoplasmic regulatory processes of mRNA metabolism. Can probably bind to cytoplasmic RNA sequences other than poly(A) in vivo (By similarity) |
| 細胞定位 | PABPC5 定位於細胞質。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | 第二異構型定位於粒線體基質，並與粒線體 DNA 共分餾，也可與粒線體 poly(A) polymerase 共免疫沉澱。這些資料描述特定異構型及其關聯，不代表所有異構型都具有相同定位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Isoform 2; Mitochondrion matrix; Co-fractionates with mtDNA and co-immunoprecipitates with the mitochondrial poly(A) polymerase PMID 23275553 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTCTCTCCGGACCTGCCTCGAGCCTCAGGCTGCTGAAAT40CACCGCGCCTCACTCGCCTCGACAGTGATTCTGAGTCTGC80TTTTAGCTTCCTTTTGCCTGCCTTGGCTTTTTCTGTTCGT120GAACAGCTGTTTGGCCCATAGCTTAGAGAAAGCAGCCTTT160TTTCTCTTCAAAGAGAACCTCCTCCCAGTGCTCAGAGAGA200TGGGGAGCGGGGAGCCTAATCCTGCTGGCAAGAAAAAGAA240GTATCTCAAGGCCGCTCTGTACGTGGGTGACTTGGACCCA280GATGTCACCGAGGACATGCTCTATAAGAAGTTCAGGCCTG320CTGGCCCTCTGCGATTCACCCGAATCTGCCGTGATCCGGT360GACCCGCAGCCCCCTGGGCTATGGGTATGTTAACTTCCGC400TTTCCCGCGGATGCAGAGTGGGCCTTGAACACCATGAATT440TTGATTTGATTAATGGAAAACCATTCCGCCTTATGTGGTC480TCAGCCAGATGACCGCTTAAGAAAGTCTGGAGTGGGAAAT520ATATTCATCAAAAACCTGGACAAATCCATAGACAATAGGG560CCCTGTTTTACTTATTTTCTGCTTTTGGGAACATTCTGTC600CTGCAAAGTCGTATGCGATGACAACGGCTCTAAGGGTTAT640GCCTATGTTCACTTTGACAGCCTGGCCGCTGCCAATAGAG680CCATCTGGCACATGAATGGAGTGCGGCTCAACAACCGCCA720GGTGTATGTTGGCAGATTCAAATTCCCAGAAGAGCGGGCG760GCTGAGGTCAGAACCAGGGATAGAGCAACTTTCACCAATG800TTTTCGTTAAAAACATTGGAGACGACATAGATGACGAAAA840ACTGAAGGAACTTTTCTGTGAATATGGGCCAACTGAGAGT880GTTAAAGTAATAAGAGATGCCAGTGGGAAATCTAAAGGCT920TTGGATTTGTGAGATATGAGACACACGAGGCTGCCCAAAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。