基因總覽
OSGIN2(oxidative stress induced growth inhibitor family member 2)是人類的蛋白質編碼基因,位於染色體 8q21.3。其產物屬於 OKL38 family。現有資料提供的基本特徵主要是家族歸屬,未描述蛋白質的長度、結構域或其他序列特徵;功能方面則有單加氧酶催化活性的相似性推定,以及可能與生殖細胞相關的角色。這些功能資訊的條件與證據限制見下方功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000451899 ★ | 89,902,570–89,927,888 | 6 |
| ENST00000647849 | 89,901,849–89,927,888 | 6 |
| ENST00000297438 | 89,901,859–89,927,888 | 6 |
| ENST00000520659 | 89,902,530–89,921,319 | 5 |
| ENST00000869563 | 89,902,530–89,927,888 | 6 |
| ENST00001027147 | 89,902,530–89,927,888 | 6 |
| ENST00001137598 | 89,902,530–89,927,888 | 6 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
OSGIN2 被註記具有單加氧酶催化活性,但此功能是根據相似性推定,並非此處所列資料直接確認的催化結果。因此,這項註記代表其可能具備相關催化能力,解讀時需保留推定性質。
催化活性與 NADPH 有關:在缺乏 NADPH 時,沒有單加氧酶催化活性。這項條件限制表示,不能將所述活性視為不受底物或反應條件影響的固有結果;資料並未進一步說明 NADPH 如何參與反應,也未提供其他反應物或產物資訊。
此外,OSGIN2 可能參與減數分裂或生殖細胞成熟。這兩項角色均以「可能」描述,現有資訊未指出其作用發生於哪一階段、涉及何種調控方式,或是否同時參與兩個過程。因此,較適合將其理解為與生殖細胞相關過程的候選功能,而非已確立的具體機制。
Promoter 與基因調控
>OSGIN2 ENST00000451899 GRCh38 chr8:89901570-89902670 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCAGTAAAACTTAACATTTGTTTTACAAAATTATGTTGAAAGATATAAACATAAACGTATATTTGAAGCA CAAAAATAATTACGGCTTTTTTTGGAAGCGGAGTTAGACATTTCCGTAGAAAAGTAGATGCAATCAATCT CTCCTGATTTTTGTCCTCCCCACCTTTAATTTTTGACAAACCGAATAACGACACTCACTATTGAGTACTT TTCTAACTCCCTATTGCATCACAAACGCCCGCAGGGGCTTAAAAAGCAGCAGGGGTTCCTGCCCTTCCCC ACACTGGCCGGTGTGGTCTGGGGCGGGCCTGATGAGCACCTGGATTTTCACCCGGCGTGCTGGTAATTCC TACACTTGTGGGTGTTTGAGAGACATGAAGAGGGGAGGATGACCTCTTCCCGGAAGCGGGACTTCCATAA AAGAAGCGTGGTGGGCGGGTCCCGGGCACCTGTGGTTTGGTGAGTCCTCCAGGTAACTGTGATGCGGGGG TCAGCGGGAGAGGCACCCGGAAGCTCCCGGCGTCTGCACCCCGGCAGCGCGAGGAAATGCCCAAAGGTGG GTTCTCAGGCGTGGGAAGCTCGACCCTTCCCGGGGTCCTCGGCGAAGTGGCCGAGGCCGCGCCTTACGCA GGGAACTCCGCCGGGCCATCTGGGTGGCCCGAGTTCGCAGCAGCTTCTCTTCCGCTCGTCCCTCGGCCCT CTCGACGCGCACCCACCGGCCTCACCAAGTCGCACGCAGAGGGGCGGCGGGGCGCTGACCGAGGTCTAGG TCTCGATTGCCGCCGGTCGAGCCGCGCAGTTTGCCTGCAGACCTCGGTCCCCTGCCCGCGCAGCCTCGGC TCCATCAGGCCCGGCCCCTCGCCCGGGCCGTGGCTCCACCAATCGCAGACTTCGCCCGCCGCAGCCGCAC CTGCGAGGAGGGGCCCGCGCGCCGCTGCAGCCGCCGTCGCAGCGTCCCCGCCCCGCTCCGCCCCTATCGC GGCGCCCCGAGATCACCCGCCTCCGGCGCCTGGCTCCCTGCAGGCGAGGAGCGGAAGCCGCTATCTGGAG GCGGACTCCGGCGCCACAGAGCCGGGGCAGCCGCGGCAACGGCGAGGCGCG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| OSGIN2_3 ↗ | 8:89,901,850 | 正股 | 89,901,801–89,901,860 |
| OSGIN2_2 ↗ | 8:89,902,017 | 正股 | 89,901,968–89,902,027 |
| OSGIN2_1 ↗ | 8:89,902,570 | 正股 | 89,902,521–89,902,580 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR8_93BNG3 · enhancer · 89900863–89901332 · regulatory
ENSR8_93BNG7 · promoter · 89901359–89901869 · regulatory
ENSR8_BMSPN · enhancer · 89901870–89902416 · regulatory
ENSR8_93BNGH · promoter · 89902417–89902771 · regulatory
ENSR8_CBWTG · enhancer · 89902772–89904636 · regulatory
· motif · 89901472–89901481 · motif
· motif · 89901884–89901893 · motif
· motif · 89901955–89901967 · motif
· motif · 89901958–89901965 · motif
· motif · 89901966–89901977 · motif
· motif · 89901966–89901977 · motif
· motif · 89901968–89901977 · motif
· motif · 89901969–89901983 · motif
· motif · 89902019–89902027 · motif
· motif · 89902054–89902066 · motif
· motif · 89902056–89902063 · motif
· motif · 89902073–89902084 · motif
· motif · 89902075–89902084 · motif
· motif · 89902462–89902479 · motif
· motif · 89902475–89902484 · motif
· motif · 89902647–89902664 · motif
· motif · 89902687–89902702 · motif
· motif · 89902931–89902948 · motif
· motif · 89903447–89903458 · motif
· motif · 89904243–89904256 · motif
· motif · 89904291–89904303 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:505 aa
OSGIN2 的蛋白質家族歸屬為 OKL38 family。現有來源未提供其結構域、功能區域或序列特徵的具體描述,因此無法據此進一步整理蛋白質架構。
蛋白質三維結構
細胞內定位
OSGIN2 在細胞分裂後期的胞質分裂過程中定位於中體(midbody)。 此註記描述的是晚期胞質分裂時的定位,來源未提供其他階段或條件下的定位變化。
未繪示構造:Midbody。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | OSGIN2 被註記具有單加氧酶催化活性,但此功能是根據相似性推定;此外,它可能參與減數分裂或生殖細胞成熟,這些角色仍屬可能性描述。 | 推論支持 | 證據與來源Monooxygenase catalytic activity (By similarity). May be involved in meiosis or the maturation of germ cells |
| 分子活性 | 在缺乏 NADPH 的條件下,OSGIN2 沒有單加氧酶催化活性。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | OSGIN2 定位於中體,且在胞質分裂後期可見此定位。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
CTCCGGCGCCTGGCTCCCTGCAGGCGAGGAGCGGAAGCCG40CTATCTGGAGGCGGACTCCGGCGCCACAGAGCCGGGGCAG80CCGCGGCAACGGCGAGGCGCGAGGCAGGGGCGCCCGGCAG120ACCCCGCGACCCCGAGCCAGCGGGCGCCCCGAGCGGGCAG160CCTCGCCGGGGGAGGCGGAGGCGGCCACGGCGGCCGCGCT200CGGGCGCCCCTCGCGCAGCGCTCCATGCCCGTGTGGTGCT240GCCGCTGCTCCCTGGCCGGTCATTTCAGAAACTATAGTGA280CACTGAAACTGAAGGAGAGATTTTTAATTCCTTAGTGCAA320TACTTTGGTGACAACTTGGGGCGAAAAGTTAAAGCGATGC360CATTAGTTGAAGAAACTTCTTTACTGGAAGATTCGTCAGT400GACTTTTCCTGTGGTAATAATAGGAAATGGACCCTCAGGA440ATATGCCTTTCTTATATGTTATCAGGCTACAGACCGTATT480TATCATCAGAAGCAATACACCCAAATACAATCTTAAATAG520TAAATTAGAAGAAGCAAGACATCTTTCCATTGTTGATCAG560GACTTAGAATACTTGTCTGAGGGCCTTGAGGGCCGATCAT600CCAATCCAGTTGCAGTACTTTTCGATACACTTCTTCATCC640AGATGCTGACTTTGGGTATGATTATCCATCCGTTTTGCAT680TGGAAATTAGAGCAACATCATTATATCCCTCACGTAGTTC720TTGGTAAAGGTCCACCTGGTGGGGCTTGGCATAATATGGA760AGGCTCCATGTTGACAATCAGCTTTGGAAGTTGGATGGAA800CTACCTGGACTTAAATTTAAGGACTGGGTATCAAGTAAAC840GAAGGAGCCTAAAAGGGGATCGAGTTATGCCAGAGGAAAT880AGCTCGCTACTATAAACATTATGTAAAAGTCATGGGTCTT920CAGAAGAATTTCAGAGAGAATACTTACATAACTTCCGTAT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。