演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

OR5V1hs6M1-21

olfactory receptor family 5 subfamily V member 1

OR5V1 是蛋白質編碼基因,其產物屬於 G 蛋白偶聯受體家族;來源推測它可參與嗅覺訊號及嗅覺系統以外的代謝調節。

Homo sapiens6p22.1UniProt Q9UGF6
OFFICIAL SYMBOL
OR5V1
CHROMOSOME
6
UNIPROT
Q9UGF6
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

OR5V1 的正式名稱為 olfactory receptor family 5 subfamily V member 1,屬於蛋白質編碼基因。其產物是 G 蛋白偶聯受體家族成員,具有嗅覺受體的角色;來源也指出,它在嗅覺上皮之外可能以典型 G 蛋白偶聯受體的方式作用。這些功能描述均標示為依相似性推定,並非此處列出的直接驗證結果。來源提出的基本定位與訊號作用,分別見下方細胞定位及功能說明。

Official symbol
OR5V1
Gene name
olfactory receptor family 5 subfamily V member 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13972
UniProt
Q9UGF6
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
hs6M1-21

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 66p22.1
chr6 · 170,805,979 bp · GRCh38chr6p25.3 · 1–2300000 · gnegchr6p25.2 · 2300001–4200000 · gpos25chr6p25.1 · 4200001–7100000 · gnegchr6p24.3 · 7100001–10600000 · gpos50chr6p24.2 · 10600001–11600000 · gnegchr6p24.1 · 11600001–13400000 · gpos25chr6p23 · 13400001–15200000 · gnegchr6p22.3 · 15200001–25200000 · gpos75chr6p22.2 · 25200001–27100000 · gnegchr6p22.1 · 27100001–30500000 · gpos50chr6p21.33 · 30500001–32100000 · gnegchr6p21.32 · 32100001–33500000 · gpos25chr6p21.31 · 33500001–36600000 · gnegchr6p21.2 · 36600001–40500000 · gpos25chr6p21.1 · 40500001–46200000 · gnegchr6p12.3 · 46200001–51800000 · gpos100chr6p12.2 · 51800001–53000000 · gnegchr6p12.1 · 53000001–57200000 · gpos100chr6p11.2 · 57200001–58500000 · gnegchr6p11.1 · 58500001–59800000 · acenchr6q11.1 · 59800001–62600000 · acenchr6q11.2 · 62600001–62700000 · gnegchr6q12 · 62700001–69200000 · gpos100chr6q13 · 69200001–75200000 · gnegchr6q14.1 · 75200001–83200000 · gpos50chr6q14.2 · 83200001–84200000 · gnegchr6q14.3 · 84200001–87300000 · gpos50chr6q15 · 87300001–92500000 · gnegchr6q16.1 · 92500001–98900000 · gpos100chr6q16.2 · 98900001–100000000 · gnegchr6q16.3 · 100000001–105000000 · gpos100chr6q21 · 105000001–114200000 · gnegchr6q22.1 · 114200001–117900000 · gpos75chr6q22.2 · 117900001–118100000 · gnegchr6q22.31 · 118100001–125800000 · gpos100chr6q22.32 · 125800001–126800000 · gnegchr6q22.33 · 126800001–130000000 · gpos75chr6q23.1 · 130000001–130900000 · gnegchr6q23.2 · 130900001–134700000 · gpos50chr6q23.3 · 134700001–138300000 · gnegchr6q24.1 · 138300001–142200000 · gpos75chr6q24.2 · 142200001–145100000 · gnegchr6q24.3 · 145100001–148500000 · gpos75chr6q25.1 · 148500001–152100000 · gnegchr6q25.2 · 152100001–155200000 · gpos50chr6q25.3 · 155200001–160600000 · gnegchr6q26 · 160600001–164100000 · gpos50chr6q27 · 164100001–170805979 · gnegOR5V1pq1 bp170,805,979 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr6:29,353,749–29,431,967
Gene span
78,219 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000641768 ★29,353,749–29,368,8652
ENST0000037715429,355,230–29,431,9674

顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

OR5V1 的受體活化與配體結合所引起的構形變化相關,並可啟動 Gα 蛋白訊號;以下功能皆為依相似性推定。在嗅覺上皮中,植物氣味分子 methyl (9R,10E,12E)-9-methoxyoctadeca-10,12-dienoate 可促進受體與 GNAL/G(olf) 偶聯,進而活化 adenylate cyclase、提高 cAMP 生成。這條訊號會啟動神經元反應,並引發嗅覺感知。

來源也提出 OR5V1 可能參與葡萄糖代謝調節。在肝臟中,oxylipin 12(S)-hydroxyeicosapentaenoate(12(S)-HEPE)活化受體後,可啟動訊號,透過 PKA 依賴性活化轉錄因子 ATF2,促進 carnitine palmitoyltransferase CPT1A 的表現;這與肝臟脂肪酸氧化增強相關。

在缺乏 GNAL/G(olf) 的嗅覺系統以外組織,受體則可能與 GNAS/G(s) 偶聯,促進 adenylate cyclase 活性及 cAMP 生成。這些描述支持 OR5V1 可能依組織中的 Gα 蛋白情況參與不同訊號途徑;來源將相關功能均標示為依相似性推定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 29368865 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>OR5V1 ENST00000641768 GRCh38 chr6:29368765-29369865 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGTTAGATACAATAAATGAATAATGCAAAATTTATTATCGTCTGTTTTTGGAGTGAAATAACCACTCATA
GATATCTTCAGATGATAACTCTCTTGCTGTGTGTACCCAAGTCAGCCGGTAAGAATTTAGCAAGTGATGA
AATTGGATAATGCCTAGTAGGTAATTAATTTGTTGAGAATTGAGATTTGATTTTAAGCCATAGGTGATGA
TTAAGAACCATATGAATCTGGGAGAAATAACTCTTCTTTAATCCAAATTCTTAATTTTAAAGGGCAGGCA
ATATAATCATTAGAGGTCAAAGGATTCAGAAATTCTGTTTTTATGTGATAGTGGCATACTTAGCTGCCTC
AATTCTTAAATAATTATAGGATCAAAATTAATCAAGCAATTATACTTTTAATTTACAAGTCATGCTCAAA
ATTAATATTTAATCTATCACAAAATATATGGATACTGTATATTCGTTAGTGAGTTTTTGATACATCTTCA
AGAACACATAACATGCAAAGGAATAGATATTTGGAGGACTAATCAGTCTTCGGTGGCTGAAGAATATTTC
TTCAGTGCGAAGTAGTGTGCAATGTAAGCTTCCCCCACCTCCAGGAGGAAATGAGGATGCTTTCTCCTAA
TTTAAGCTGAGAGAAAAACCAGTTAGAGAGCTTGATTTCTACATCTGGAATTTTGGAGTCCAAAGACTGA
TATTTCTTACATGGCCAAGAAGCAAAATCTAGAGAACTGCATTTCCTGTGTTAATAGGGGAAGCATGTGG
GTTGTTTCTCACTAGACAGATGTGGGCCAGGAGGTAGTGGTCCACCTGGAGCAGGTCGGACTCCACAGGA
CACTTTCTGAAGCATAATTATGATGGCAACAGAGCCACTAGAAGACAAATAGATGCTCAGGGGTTGAAGC
AGGAACCAGAAGTAGTGAGTCTCAGGACTTGTGCTTGAAGATCCCCAACGTGTGTCTCCGAGGCTCTTGA
AATATTCCCATAAGATGTGGGGATCTTCTTAATCCAAAGGGCATTTTCCTTACTCACTCCAGTCCCATGC
ACTGGCCTTCAGGGACTGAGTAGAGTCTTGGCACTCACCTAGAAAACCCAT
OR5V1 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:321 aa

1 aa321 aa跨膜區拓樸區域
依 Q9UGF6 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

OR5V1 蛋白長 321 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 1 family。序列註解預測其具有七段跨膜螺旋,並在膜外側與細胞質側交替分布多個拓撲區段;兩端區域分別位於細胞外側與細胞質側。

拓樸區域Extracellular1–25 aa
跨膜區Helical; Name=126–46 aa
拓樸區域Cytoplasmic47–54 aa
跨膜區Helical; Name=255–75 aa
拓樸區域Extracellular76–99 aa
跨膜區Helical; Name=3100–120 aa
拓樸區域Cytoplasmic121–139 aa
跨膜區Helical; Name=4140–160 aa
拓樸區域Extracellular161–196 aa
跨膜區Helical; Name=5197–217 aa
拓樸區域Cytoplasmic218–237 aa
跨膜區Helical; Name=6238–258 aa
拓樸區域Extracellular259–271 aa
跨膜區Helical; Name=7272–292 aa
拓樸區域Cytoplasmic293–321 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9UGF6…

AlphaFold · Q9UGF6

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

OR5V1 被註解為多次跨膜蛋白,定位於細胞膜。 來源沒有提供其定位隨條件改變的資訊,也未描述不同異構型的定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
hs6M1-21OR5V1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能OR5V1 被推測可作為嗅覺受體,也可能在嗅覺上皮以外發揮典型 G 蛋白偶聯受體作用。配體結合引起構形改變後,可經由 GNAL/G(olf) 或 GNAS/G(s) 傳遞訊號。在嗅覺上皮中,植物氣味分子可促進其與 GNAL/G(olf) 偶聯,活化 adenylate cyclase 並增加 cAMP,啟動與嗅覺感知相關的神經元反應。來源亦推測它可調節葡萄糖代謝;在肝臟,12(S)-HEPE 所引發的訊號可經 PKA、ATF2 促進 CPT1A 表現並增強脂肪酸氧化。上述功能均屬依相似性推定。推論支持
證據與來源

G protein-coupled receptor that acts both as an odorant receptor, and as a classical G protein-coupled receptor outside the olfactory epithelium (By similarity). Ligand-binding causes a conformation change that triggers signaling via G(s)-class of G alpha proteins (GNAL/G(olf) or GNAS/G(s)) (By similarity). In olfactory epithelium, activation by methyl (9R,10E,12E)-9-methoxyoctadeca-10,12-dienoate, a plant odorant isolated from E.fortunei Turcz, promotes coupling to GNAL/G(olf), mediating activation of adenylate cyclase activity and increased production of cAMP, initiating a neuronal response that triggers the perception of a smell (By similarity). Beyond its role in olfaction, also acts as a regulator of glucose metabolism (By similarity). In liver, activation by oxylipin 12(S)-hydroxyeicosapentaenoate (12(S)-HEPE), initiates a signaling that enhances hepatic fatty acid oxidation via PKA-dependent activation of the transcription factor ATF2, which promotes expression of carnitine palmitoyltransferase CPT1A (By similarity). Outside of the olfactory system, in tissues lacking GNAL/G(olf), couples to GNAS/G(s), promoting activation of adenylate cyclase activity and production of cAMP (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位OR5V1 被註解為位於細胞膜的多次跨膜蛋白。推論支持
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000641768 · 2,763 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGATCTTCTTAATCCAAAGGGCATTTTCCTTACTCACTCC40
41AGTCCCATGCACTGGCCTTCAGGGACTGAGTAGAGTCTTG80
81GCACTCACCTAGAAAACCCATCACTCAGAAGTTTATCAGC120
121ACAGACTCTGTAGGGAACATTATTTTGTGTTACTTCGTTG160
161TATTCTTAAAAACAGCCCCATATCAGTCTCTCAGAGTCTG200
201AATGGTAATCTCTGCTCAATATCTCCAATCACAGGTCATG240
241CTATTGCAGCATATGATTCATTTTTATAATCTGGTCTTCT280
281CTTTGCCCAATTCCTGAAAGGAAACCAGGCGACATCATGG320
321AAAGAAAGAATCAAACAGCTATAACTGAATTCATCATCTT360
361GGGATTCTCCAACCTAAATGAATTGCAGTTTTTACTATTC400
401ACCATCTTCTTTCTGACTTATTTCTGTACTTTGGGAGGAA440
441ATATATTAATTATCTTGACGACTGTGACTGATCCACACCT480
481GCATACACCTATGTATTATTTTCTAGGGAACTTGGCCTTT520
521ATTGACATCTGCTACACCACCAGCAATGTCCCCCAGATGA560
561TGGTGCACCTCCTCTCAAAGAAAAAAAGCATTTCTTATGT600
601GGGGTGTGTGGTTCAACTTTTTGCATTTGTTTTCTTTGTA640
641GGATCAGAGTGTCTCCTACTGGCAGCAATGGCATATGATC680
681GTTACATTGCAATCTGCAATCCTTTAAGGTATTCAGTTAT720
721TCTGAGCAAGGTTCTATGCAATCAATTAGCAGCCTCATGC760
761TGGGCTGCTGGTTTCCTTAACTCAGTGGTGCATACAGTGT800
801TGACATTCTGCCTGCCCTTCTGTGGCAACAATCAGATTAA840
841TTACTTCTTCTGTGACATCCCCCCTTTGCTGATCTTGTCT880
881TGTGGAAACACTTCTGTCAATGAGTTGGCACTGCTATCCA920
921CTGGGGTCTTCATTGGTTGGACTCCTTTCCTTTGTATCGT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。