基因總覽
OR5V1 的正式名稱為 olfactory receptor family 5 subfamily V member 1,屬於蛋白質編碼基因。其產物是 G 蛋白偶聯受體家族成員,具有嗅覺受體的角色;來源也指出,它在嗅覺上皮之外可能以典型 G 蛋白偶聯受體的方式作用。這些功能描述均標示為依相似性推定,並非此處列出的直接驗證結果。來源提出的基本定位與訊號作用,分別見下方細胞定位及功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000641768 ★ | 29,353,749–29,368,865 | 2 |
| ENST00000377154 | 29,355,230–29,431,967 | 4 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
OR5V1 的受體活化與配體結合所引起的構形變化相關,並可啟動 Gα 蛋白訊號;以下功能皆為依相似性推定。在嗅覺上皮中,植物氣味分子 methyl (9R,10E,12E)-9-methoxyoctadeca-10,12-dienoate 可促進受體與 GNAL/G(olf) 偶聯,進而活化 adenylate cyclase、提高 cAMP 生成。這條訊號會啟動神經元反應,並引發嗅覺感知。
來源也提出 OR5V1 可能參與葡萄糖代謝調節。在肝臟中,oxylipin 12(S)-hydroxyeicosapentaenoate(12(S)-HEPE)活化受體後,可啟動訊號,透過 PKA 依賴性活化轉錄因子 ATF2,促進 carnitine palmitoyltransferase CPT1A 的表現;這與肝臟脂肪酸氧化增強相關。
在缺乏 GNAL/G(olf) 的嗅覺系統以外組織,受體則可能與 GNAS/G(s) 偶聯,促進 adenylate cyclase 活性及 cAMP 生成。這些描述支持 OR5V1 可能依組織中的 Gα 蛋白情況參與不同訊號途徑;來源將相關功能均標示為依相似性推定。
Promoter 與基因調控
>OR5V1 ENST00000641768 GRCh38 chr6:29368765-29369865 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGTTAGATACAATAAATGAATAATGCAAAATTTATTATCGTCTGTTTTTGGAGTGAAATAACCACTCATA GATATCTTCAGATGATAACTCTCTTGCTGTGTGTACCCAAGTCAGCCGGTAAGAATTTAGCAAGTGATGA AATTGGATAATGCCTAGTAGGTAATTAATTTGTTGAGAATTGAGATTTGATTTTAAGCCATAGGTGATGA TTAAGAACCATATGAATCTGGGAGAAATAACTCTTCTTTAATCCAAATTCTTAATTTTAAAGGGCAGGCA ATATAATCATTAGAGGTCAAAGGATTCAGAAATTCTGTTTTTATGTGATAGTGGCATACTTAGCTGCCTC AATTCTTAAATAATTATAGGATCAAAATTAATCAAGCAATTATACTTTTAATTTACAAGTCATGCTCAAA ATTAATATTTAATCTATCACAAAATATATGGATACTGTATATTCGTTAGTGAGTTTTTGATACATCTTCA AGAACACATAACATGCAAAGGAATAGATATTTGGAGGACTAATCAGTCTTCGGTGGCTGAAGAATATTTC TTCAGTGCGAAGTAGTGTGCAATGTAAGCTTCCCCCACCTCCAGGAGGAAATGAGGATGCTTTCTCCTAA TTTAAGCTGAGAGAAAAACCAGTTAGAGAGCTTGATTTCTACATCTGGAATTTTGGAGTCCAAAGACTGA TATTTCTTACATGGCCAAGAAGCAAAATCTAGAGAACTGCATTTCCTGTGTTAATAGGGGAAGCATGTGG GTTGTTTCTCACTAGACAGATGTGGGCCAGGAGGTAGTGGTCCACCTGGAGCAGGTCGGACTCCACAGGA CACTTTCTGAAGCATAATTATGATGGCAACAGAGCCACTAGAAGACAAATAGATGCTCAGGGGTTGAAGC AGGAACCAGAAGTAGTGAGTCTCAGGACTTGTGCTTGAAGATCCCCAACGTGTGTCTCCGAGGCTCTTGA AATATTCCCATAAGATGTGGGGATCTTCTTAATCCAAAGGGCATTTTCCTTACTCACTCCAGTCCCATGC ACTGGCCTTCAGGGACTGAGTAGAGTCTTGGCACTCACCTAGAAAACCCAT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:321 aa
OR5V1 蛋白長 321 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 1 family。序列註解預測其具有七段跨膜螺旋,並在膜外側與細胞質側交替分布多個拓撲區段;兩端區域分別位於細胞外側與細胞質側。
蛋白質三維結構
細胞內定位
OR5V1 被註解為多次跨膜蛋白,定位於細胞膜。 來源沒有提供其定位隨條件改變的資訊,也未描述不同異構型的定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | OR5V1 被推測可作為嗅覺受體,也可能在嗅覺上皮以外發揮典型 G 蛋白偶聯受體作用。配體結合引起構形改變後,可經由 GNAL/G(olf) 或 GNAS/G(s) 傳遞訊號。在嗅覺上皮中,植物氣味分子可促進其與 GNAL/G(olf) 偶聯,活化 adenylate cyclase 並增加 cAMP,啟動與嗅覺感知相關的神經元反應。來源亦推測它可調節葡萄糖代謝;在肝臟,12(S)-HEPE 所引發的訊號可經 PKA、ATF2 促進 CPT1A 表現並增強脂肪酸氧化。上述功能均屬依相似性推定。 | 推論支持 | 證據與來源G protein-coupled receptor that acts both as an odorant receptor, and as a classical G protein-coupled receptor outside the olfactory epithelium (By similarity). Ligand-binding causes a conformation change that triggers signaling via G(s)-class of G alpha proteins (GNAL/G(olf) or GNAS/G(s)) (By similarity). In olfactory epithelium, activation by methyl (9R,10E,12E)-9-methoxyoctadeca-10,12-dienoate, a plant odorant isolated from E.fortunei Turcz, promotes coupling to GNAL/G(olf), mediating activation of adenylate cyclase activity and increased production of cAMP, initiating a neuronal response that triggers the perception of a smell (By similarity). Beyond its role in olfaction, also acts as a regulator of glucose metabolism (By similarity). In liver, activation by oxylipin 12(S)-hydroxyeicosapentaenoate (12(S)-HEPE), initiates a signaling that enhances hepatic fatty acid oxidation via PKA-dependent activation of the transcription factor ATF2, which promotes expression of carnitine palmitoyltransferase CPT1A (By similarity). Outside of the olfactory system, in tissues lacking GNAL/G(olf), couples to GNAS/G(s), promoting activation of adenylate cyclase activity and production of cAMP (By similarity) |
| 細胞定位 | OR5V1 被註解為位於細胞膜的多次跨膜蛋白。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GGATCTTCTTAATCCAAAGGGCATTTTCCTTACTCACTCC40AGTCCCATGCACTGGCCTTCAGGGACTGAGTAGAGTCTTG80GCACTCACCTAGAAAACCCATCACTCAGAAGTTTATCAGC120ACAGACTCTGTAGGGAACATTATTTTGTGTTACTTCGTTG160TATTCTTAAAAACAGCCCCATATCAGTCTCTCAGAGTCTG200AATGGTAATCTCTGCTCAATATCTCCAATCACAGGTCATG240CTATTGCAGCATATGATTCATTTTTATAATCTGGTCTTCT280CTTTGCCCAATTCCTGAAAGGAAACCAGGCGACATCATGG320AAAGAAAGAATCAAACAGCTATAACTGAATTCATCATCTT360GGGATTCTCCAACCTAAATGAATTGCAGTTTTTACTATTC400ACCATCTTCTTTCTGACTTATTTCTGTACTTTGGGAGGAA440ATATATTAATTATCTTGACGACTGTGACTGATCCACACCT480GCATACACCTATGTATTATTTTCTAGGGAACTTGGCCTTT520ATTGACATCTGCTACACCACCAGCAATGTCCCCCAGATGA560TGGTGCACCTCCTCTCAAAGAAAAAAAGCATTTCTTATGT600GGGGTGTGTGGTTCAACTTTTTGCATTTGTTTTCTTTGTA640GGATCAGAGTGTCTCCTACTGGCAGCAATGGCATATGATC680GTTACATTGCAATCTGCAATCCTTTAAGGTATTCAGTTAT720TCTGAGCAAGGTTCTATGCAATCAATTAGCAGCCTCATGC760TGGGCTGCTGGTTTCCTTAACTCAGTGGTGCATACAGTGT800TGACATTCTGCCTGCCCTTCTGTGGCAACAATCAGATTAA840TTACTTCTTCTGTGACATCCCCCCTTTGCTGATCTTGTCT880TGTGGAAACACTTCTGTCAATGAGTTGGCACTGCTATCCA920CTGGGGTCTTCATTGGTTGGACTCCTTTCCTTTGTATCGT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。