演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN GENE LOCUS

OR2B7Phs6M1-31P

olfactory receptor family 2 subfamily B member 7 pseudogene

OR2B7P 是人類嗅覺受體家族 2、B 亞家族成員 7 的假基因;來源並未提供可確認其產生功能性受體的資料。

Homo sapiens6p22.1
OFFICIAL SYMBOL
OR2B7P
CHROMOSOME
6
LOCUS TYPE
unprocessed_pseudogene
TRANSCRIPTS
1
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

OR2B7P 的正式名稱為 olfactory receptor family 2 subfamily B member 7 pseudogene,屬於假基因。現有資料沒有說明它是否產生 RNA 或蛋白質,因此不能將嗅覺受體家族一般成員的蛋白質特性直接視為 OR2B7P 的產物特徵。NCBI 摘要描述的嗅覺受體蛋白屬於 G 蛋白偶聯受體(GPCR)家族,具有七次跨膜結構;這些是該家族蛋白的概括資訊,並非對 OR2B7P 產物的確認。

Official symbol
OR2B7P
Gene name
olfactory receptor family 2 subfamily B member 7 pseudogene
Organism
Homo sapiens
Gene type
pseudogene
HGNC ID
HGNC:13967
Locus type
pseudogene
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
hs6M1-31P

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 66p22.1
chr6 · 170,805,979 bp · GRCh38chr6p25.3 · 1–2300000 · gnegchr6p25.2 · 2300001–4200000 · gpos25chr6p25.1 · 4200001–7100000 · gnegchr6p24.3 · 7100001–10600000 · gpos50chr6p24.2 · 10600001–11600000 · gnegchr6p24.1 · 11600001–13400000 · gpos25chr6p23 · 13400001–15200000 · gnegchr6p22.3 · 15200001–25200000 · gpos75chr6p22.2 · 25200001–27100000 · gnegchr6p22.1 · 27100001–30500000 · gpos50chr6p21.33 · 30500001–32100000 · gnegchr6p21.32 · 32100001–33500000 · gpos25chr6p21.31 · 33500001–36600000 · gnegchr6p21.2 · 36600001–40500000 · gpos25chr6p21.1 · 40500001–46200000 · gnegchr6p12.3 · 46200001–51800000 · gpos100chr6p12.2 · 51800001–53000000 · gnegchr6p12.1 · 53000001–57200000 · gpos100chr6p11.2 · 57200001–58500000 · gnegchr6p11.1 · 58500001–59800000 · acenchr6q11.1 · 59800001–62600000 · acenchr6q11.2 · 62600001–62700000 · gnegchr6q12 · 62700001–69200000 · gpos100chr6q13 · 69200001–75200000 · gnegchr6q14.1 · 75200001–83200000 · gpos50chr6q14.2 · 83200001–84200000 · gnegchr6q14.3 · 84200001–87300000 · gpos50chr6q15 · 87300001–92500000 · gnegchr6q16.1 · 92500001–98900000 · gpos100chr6q16.2 · 98900001–100000000 · gnegchr6q16.3 · 100000001–105000000 · gpos100chr6q21 · 105000001–114200000 · gnegchr6q22.1 · 114200001–117900000 · gpos75chr6q22.2 · 117900001–118100000 · gnegchr6q22.31 · 118100001–125800000 · gpos100chr6q22.32 · 125800001–126800000 · gnegchr6q22.33 · 126800001–130000000 · gpos75chr6q23.1 · 130000001–130900000 · gnegchr6q23.2 · 130900001–134700000 · gpos50chr6q23.3 · 134700001–138300000 · gnegchr6q24.1 · 138300001–142200000 · gpos75chr6q24.2 · 142200001–145100000 · gnegchr6q24.3 · 145100001–148500000 · gpos75chr6q25.1 · 148500001–152100000 · gnegchr6q25.2 · 152100001–155200000 · gpos50chr6q25.3 · 155200001–160600000 · gnegchr6q26 · 160600001–164100000 · gpos50chr6q27 · 164100001–170805979 · gnegOR2B7Ppq1 bp170,805,979 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr6:28,046,434–28,047,367
Gene span
934 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000429302 ★28,046,434–28,047,3671

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

已知功能與來源註解

NCBI 摘要概述嗅覺受體家族的功能:受體與鼻腔中的氣味分子互動,啟動神經元反應,進而引發對氣味的感知。這描述的是嗅覺受體蛋白的一般作用,來源未指出 OR2B7P 假基因本身具有該功能,也未提供其可能產物的實驗證據。

對於具功能的嗅覺受體蛋白,氣味分子辨識與訊號傳遞相連。受體辨識氣味訊號後,透過 G 蛋白介導的訊號轉導,將分子層級的刺激轉為細胞反應,並啟動神經元反應。這條途徑與嗅覺感知的形成相關;來源未進一步說明特定氣味分子、受體配對或下游訊號細節。

摘要指出,嗅覺受體蛋白是大型 GPCR 家族的一員,具有七次跨膜結構,並與許多神經傳導物質及荷爾蒙受體共享這項結構特徵。嗅覺受體基因家族被描述為基因組中最大的基因家族;此為家族層級的背景資訊,不能據此推定 OR2B7P 會表現為受體或參與氣味訊號傳遞。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 28046434 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>OR2B7P ENST00000429302 GRCh38 chr6:28045434-28046534 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCTAGGAAGTAGAGGTCAGGGTGCAGACTTCAGAACCGCAAAGCTTATTCATGGCAGATTTATACTTAGA
ATACAAGTATTCTGATTCATATTTTATTGTGTTTTAAAATTTATTATTCAAAATTAGTTGCATTCTTTGG
CACTGCAGTAATAATTGCCACTGAAGCAATCATTGAAAGCATTTGTAATAGAAAGAACCAGGAGCACCAG
AGTGCAACAGAAAAGGTGCAATAGAGAGAAGGCAAATTTCTATAAACTCTACATTCATTATCTATAGCCT
ACTATACTTTTTAAGTTTCTCCCATATTTTTATTTATCCAACAATTTTTTGTGAGTCCACCATATGCCAG
GATTGTTTCTAGCTTATGGTGAATATGTAATATCTTATGATGAAGATAGTAATATATTTAGTATAAGATA
TTACCTTGTTTAGGTACTGTTTACTATTAAACTTATACCATAGTGTGTCAGCAGAATGGGGCGATGGTTA
GGAGGGAGAGAAATTTCTAATAACAGGTCCAAATTATTTTAAGAGAAAGGAGGATTATTTTTGTGAAATT
AGATCTAATTTGTGGAGAAATTCAAGTTATCTTTCAAGTTCATGCAATCATGAAAAGGCAGGGCCCCTAG
CAGTGAAGAAATTGTGCTAGAGTCAGTTTAAATCCTGCCCCTGGCATTTATTGGGTGAGTCAGACTATGA
AAATTACTGAACCTCTTTTCAGTTTCATCATTTATTCAACAGACATAATGATATTGCCAATCTTGTAAAG
TCATGAGAAAATGCATACAAGGTACTGAGGCCAGTGCCTGCAAGCTGGAAGACACTCATATATAGTACTA
ATAGCTATTTATCACCCCCTTAATTGCCAACAAGAAAGAGACTGCAAAAACACCTCAAGCTCCCAATCAA
GCTCTATTGACCTATGCTAGGAAAAAAGACATGAATTAGACACACTAGATAAAAGTTAAAAAGCCTCTTA
ATTCCAACAGGTAGAGTACAATGGAAAGAGCTAACGACAGCACCTTCTCTGGATTCATCCTCCTGGGCTT
CTCCAACAGGCCTCAGCTGGAAACAGCTCTCTTTGTGGTCATCTTGATCAT
OR2B7P 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / GENE ANATOMY

基因座與轉錄註解

pseudogene

OR2B7P 依 HGNC/Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。

轉錄本Biotype拼接長度Exons
ENST00000429302 ★unprocessed_pseudogene934 nt1

拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與基因產物定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能嗅覺受體可與鼻腔中的氣味分子互動,啟動神經元反應並引發氣味感知。嗅覺受體蛋白屬於 G 蛋白偶聯受體家族,具有七次跨膜結構,負責辨識氣味訊號並透過 G 蛋白介導其轉導;嗅覺受體基因家族是基因組中最大的基因家族。資料庫紀錄
證據與來源

Olfactory receptors interact with odorant molecules in the nose, to initiate a neuronal response that triggers the perception of a smell. The olfactory receptor proteins are members of a large family of G-protein-coupled receptors (GPCR) arising from single coding-exon genes. Olfactory receptors share a 7-transmembrane domain structure with many neurotransmitter and hormone receptors and are responsible for the recognition and G protein-mediated transduction of odorant signals. The olfactory receptor gene family is the largest in the genome.

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

DNA 與 RNA 序列

完整非編碼轉錄本 · FASTA
ENST00000429302 · 934 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATGGAAAGAGCTAACGACAGCACCTTCTCTGGATTCATCC40
41TCCTGGGCTTCTCCAACAGGCCTCAGCTGGAAACAGCTCT80
81CTTTGTGGTCATCTTGATCATCTACTTTCTGAGCTTTCTG120
121GGCAATGGCACCATTATACTTTTATCCATTGTAGATCCTC160
161GCCTCCATACCCCTATGTATTTCTTCCTCTCCAATCTCTC200
201TTTTATGGATCTTTGTTTGACCACTTGTACTGTCCCTCAG240
241ACACTGGTCAACTTTAAGGGGAAGGACAAGACCATCACCT280
281ATGGTGGCTGCGTGACCCAGCTATTCATTGCCTTGGGACT320
321CGGGGGGAGTGGAGTGTGTCTTATTGTCTGCCATGGCCTA360
361TGACCGCTATGCAGCCGTCTGCCGCCCACTCCACTACATG400
401GTGAGCATGCATCCCCAACTTTGCTTGCAGTTGGTTGTAA440
441CCACTTGGCTCACAGGGTTTGGCAATTCTGTGATACAGAC480
481AGCATTGACCATGACTCTCCCCCTCTGTGATAAAAACCAA520
521GTGGATCATTTCTTCTGTGAAGTTCCAGTGATGCTGAAAC560
561TGTCCTGCACCAACACCTCCATCAACGAGGCTGAAATCTT600
601TGCTGTCAGTGTCTTCTTCTTGGTGGTGCCTCTCTCACTC640
641ATCTTAGCATCCTATGGTCACATTACTCATGCAGTCCTGA680
681AGATAAAGTCAGCTCAAGGGAGGCAGAAGGCTTTTGGAAC720
721CTGTGGTTCTCACCTCCTGGTAGTGATCATTTTCTTTGGG760
761ACACTCATCTCCATGTACCTCCAGCCTCCCTCCAGTTATT800
801CACAGGATGTGAACAAAAGCATTGCACTCTTCTATACTCT840
841GGTGACTCCTCTACTGAATCCCCTAATTTACACTCTGAGG880
881AACAAGGAAGTCAAAGGGGCAACTAAGAAGACTAGTGGGG920
921AGGACCATAGATGC934

cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。