基因總覽
OR14J1(olfactory receptor family 14 subfamily J member 1)是蛋白質編碼基因,所編碼的蛋白質屬於 G protein-coupled receptor 1 family,並被註記為氣味受體。其蛋白質由 321 個胺基酸組成,具有多段穿膜區,形成細胞膜上的多次穿膜蛋白。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000641895 ★ | 29,301,701–29,313,017 | 2 |
| ENST00000377160 | 29,306,626–29,307,742 | 1 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
OR14J1 的產物被註記為氣味受體,這項資料支持其受體類別與嗅覺相關身分;來源未進一步說明其可辨識的氣味分子、受體活化方式或下游作用,因此不宜據此推定特定配體或訊號機制。
Promoter 與基因調控
>OR14J1 ENST00000641895 GRCh38 chr6:29300701-29301801 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAGCTGGAAACCATCATTCTCAGCAAACTATCACAAAGGACAAA AACCCAAACATCGCATGTTCTCACTCATAGGTGGGAATTGAACAATGAGATCACATGGACACAGGAAGGG GAACATCACACTCTGGGGCCTGTTGTGGGGTGGGGGGAGTGGGGAGGGATAGCATTAGGAGATATACCTA ATGCTAAATGACTAGTTAATGGGTGCAGCACACCAACATGGCACATGTATACATATGTAACAAACCTGCA CGTTGTGCACATGTATCCTAAAATTTAAAGTATAATTTAAAAAAATGCCTTTTCCATAATCACACATATT TAAGAATGGAATTCATTCACTTTTGAGTAAAAATTATTCATCTGGGGGATTGTTAAAATGAGGGCTGGAT TATCAGTTTCAGAGTAATTTTAGAAAAGACACCATGTTTGAAGAAAGTTTAGCTCTCTAAGTCATGGTTT TATTCTGAGATTCTTTGATTCTACTATTATGTATGGGTTTATGTAAATAATTACTAAGTATTCCTTTTTT TTTTTACATAAGGCCAGTGCAATCATGCATGATTTTATTGGTGACCAGTTAAAATGAAACTGTTAATTAA TGAAAAAAATCCTTTTTACTAGAAAAACCTGTGAACCTGTGTTACAGAAAACGAGTTATGTATAATATTC ATTTTTTTAACCTGAAATGCATCGACTACAAGAGTTAGCTAAACCAAGATAATAATTAACTACTTCCCAC TGAGGCAATTCCCTGAGGGAGAGGTCCATGAAATCCCCTGCTTTGAACTCATAGTTTTTATCTGAAACAC CAACTTTCCTGCACAGGATTTTTGTCCCCAGTGCCTGGACAGCACTGGCTTCATTTCAAATACCCCTTAG TTAATAGGAAATTTAAATGTCCCTGGGCAGTTACATCCTGTTTGGTCCTATATAAAAGCGTTTCAGTCCT TTCCTTACATGGAAATTTCACTGACTGAAACACCAGCTTGATTCTAGAACAAAGATGCTCAGTCTCAGGA TCAATTGAGATTTGTTTCTACCGAGAGATCCACTCTGGTGAGTAAAACTTC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
· motif · 29301478–29301491 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:321 aa
OR14J1 蛋白長 321 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 1 family。序列註解包含七段螺旋狀穿膜區;其間的拓撲區段交替位於細胞外側與細胞質側,兩端則分別為細胞外端與細胞質端。
蛋白質三維結構
細胞內定位
OR14J1 被註記為細胞膜上的多次穿膜蛋白。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型之間定位差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
CTGACTGAAACACCAGCTTGATTCTAGAACAAAGATGCTC40AGTCTCAGGATCAATTGAGATTTGTTTCTACCGAGAGATC80CACTCTGAGTCACACTTGGTATCTTCAGAGAGACTATGGT120CAATTTGACTTCAATGAGTGGATTCCTTCTTATGGGGTTT160TCTGATGAGCGTAAGCTTCAGATTTTACATGCATTGGTAT200TTCTGGTGACATACCTGCTGGCCTTGACAGGCAACCTCCT240CATTATCACCATCATTACCGTGGACCGTCGTCTCCATTCC280CCCATGTATTACTTTTTAAAGCACCTCTCTCTTCTGGACC320TCTGCTTCATCTCTGTCACAGTCCCCCAGTCCATTGCAAA360TTCACTTATGGGCAACGGTTACATTTCTCTTGTTCAGTGC400ATTCTTCAGGTTTTCTTCTTCATAGCTCTGGCCTCATCAG440AAGTGGCCATTCTCACAGTGATGTCTTATGACAGGTACGC480AGCAATCTGTCAACCACTTCATTATGAGACTATTATGGAT520CCCCGTGCCTGTAGGCATGCAGTGATAGCTGTGTGGATTG560CTGGGGGCCTCTCTGGGCTCATGCATGCTGCCATTAACTT600CTCCATACCTCTCTGTGGGAAGAGAGTCATTCACCAATTC640TTCTGTGATGTTCCTCAGATGCTGAAACTAGCCTGTTCTT680ATGAATTCATTAATGAGATTGCACTGGCTGCATTCACAAC720GTCTGCAGCATTTATCTGTTTGATCTCCATTGTGCTCTCC760TACATTCGCATCTTCTCTACAGTGCTGAGAATCCCATCAG800CTGAGGGCCGGACCAAGGTCTTCTCCACCTGCCTACCACA840CCTATTTGTAGCCACCTTCTTTCTTTCAGCTGCAGGCTTT880GAGTTTCTCAGACTGCCTTCTGATTCCTCATCGACTGTGG920ACCTTGTATTCTCCGTATTCTATACTGTGATACCTCCAAC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。