演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

OR12D3hs6M1-27

olfactory receptor family 12 subfamily D member 3

OR12D3 是一種嗅覺受體,屬於蛋白質編碼基因;其蛋白質家族與多次穿膜的結構特徵見下文。

Homo sapiens6p22.1UniProt Q9UGF7
OFFICIAL SYMBOL
OR12D3
CHROMOSOME
6
UNIPROT
Q9UGF7
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

OR12D3 的正式名稱為 olfactory receptor family 12 subfamily D member 3,屬於蛋白質編碼基因。其產物被註記為嗅覺受體;目前提供的資料未進一步說明其辨識的氣味分子或特定生理作用。

Official symbol
OR12D3
Gene name
olfactory receptor family 12 subfamily D member 3
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13963
UniProt
Q9UGF7
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
hs6M1-27

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 66p22.1
chr6 · 170,805,979 bp · GRCh38chr6p25.3 · 1–2300000 · gnegchr6p25.2 · 2300001–4200000 · gpos25chr6p25.1 · 4200001–7100000 · gnegchr6p24.3 · 7100001–10600000 · gpos50chr6p24.2 · 10600001–11600000 · gnegchr6p24.1 · 11600001–13400000 · gpos25chr6p23 · 13400001–15200000 · gnegchr6p22.3 · 15200001–25200000 · gpos75chr6p22.2 · 25200001–27100000 · gnegchr6p22.1 · 27100001–30500000 · gpos50chr6p21.33 · 30500001–32100000 · gnegchr6p21.32 · 32100001–33500000 · gpos25chr6p21.31 · 33500001–36600000 · gnegchr6p21.2 · 36600001–40500000 · gpos25chr6p21.1 · 40500001–46200000 · gnegchr6p12.3 · 46200001–51800000 · gpos100chr6p12.2 · 51800001–53000000 · gnegchr6p12.1 · 53000001–57200000 · gpos100chr6p11.2 · 57200001–58500000 · gnegchr6p11.1 · 58500001–59800000 · acenchr6q11.1 · 59800001–62600000 · acenchr6q11.2 · 62600001–62700000 · gnegchr6q12 · 62700001–69200000 · gpos100chr6q13 · 69200001–75200000 · gnegchr6q14.1 · 75200001–83200000 · gpos50chr6q14.2 · 83200001–84200000 · gnegchr6q14.3 · 84200001–87300000 · gpos50chr6q15 · 87300001–92500000 · gnegchr6q16.1 · 92500001–98900000 · gpos100chr6q16.2 · 98900001–100000000 · gnegchr6q16.3 · 100000001–105000000 · gpos100chr6q21 · 105000001–114200000 · gnegchr6q22.1 · 114200001–117900000 · gpos75chr6q22.2 · 117900001–118100000 · gnegchr6q22.31 · 118100001–125800000 · gpos100chr6q22.32 · 125800001–126800000 · gnegchr6q22.33 · 126800001–130000000 · gpos75chr6q23.1 · 130000001–130900000 · gnegchr6q23.2 · 130900001–134700000 · gpos50chr6q23.3 · 134700001–138300000 · gnegchr6q24.1 · 138300001–142200000 · gpos75chr6q24.2 · 142200001–145100000 · gnegchr6q24.3 · 145100001–148500000 · gpos75chr6q25.1 · 148500001–152100000 · gnegchr6q25.2 · 152100001–155200000 · gpos50chr6q25.3 · 155200001–160600000 · gnegchr6q26 · 160600001–164100000 · gpos50chr6q27 · 164100001–170805979 · gnegOR12D3pq1 bp170,805,979 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr6:29,373,423–29,375,291
Gene span
1,869 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000396806 ★29,373,423–29,375,2911

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

OR12D3 的功能註記為嗅覺受體。現有資料未提供其所辨識的氣味分子、受體活化方式、下游訊號傳遞,或其參與的特定生物學過程,因此無法據此描述更具體的作用機制或生理意義。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 29375291 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>OR12D3 ENST00000396806 GRCh38 chr6:29375191-29376291 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGAGAACTTATGATATTGTGGACCAATTATTAGCAGAAGAATCTTAGTAGGCATGGGTGGGAGGAGTATC
CTAGTTAGCCTTTCCAATTCCTCAGTGCAAGGGCTCCCTCTTCTGTTGATAAGGTGGTGATTATTATTAT
TGTTATTATTATTATTATTATTAATTACTTACAAATGACAAGCTTCCTTTGTTCTTCATATATTTACTAT
ACCTCTTCTCTCCATCACCTTCAGTGCTTAGACTGTGCCTTTTTCTATCCCCTGCCCCACAGAAATTCTC
ACTCCCTGGGAGGTACTCCCCTTTTGGATTGAAAAATTGGGGGTGTTTTCGAAGTTCTTCTACTAATGGG
ACCTCTAACTATTTCAAGTTTTTCCCAACTACATCCACTGCCTCATTGCTATGACACAGTCTTGTGACTA
ATGATGCTAATTTTGCTGTTTTTTTCTCCTCTACTCATACAACATTTGGTTTGTGGGTGTTTATGTTTCT
TACTTTCACTGAAAGTTTGGGTTGTCAGAAGACATGTGTTACTCTCTTGTGGCTTTTATGTATCTTAGAA
GAAGTGATGAAATCCCCACTGAGCTACATCTGAATTTTTGCCAGAACCTAGAATCATAAGTTGAAAAACT
ATTCCCTGTTTGTATGTTTAAAATTTTTGTAATACATAATTCTAATGCCATACATGAGGTTATGATTATG
TCCATCAAATCTTGCACTTCCTAGTTTTGAAAACAAATGCCCTTTATCTATATCTGATTTGTTCATAATA
TAATGCTTTTATTAGTCTAGTGCCATTTTAACAGCTCAGAATTTATCAGGTATATTAGTCTTCCTCAATT
TTGTTGTACATAAATTTAGTTTTACTGTTCGTAACTATTCTTCACACTGTTGCTCACCCCTAGGTTCCTC
CAAATAGTAAACTTGCTTTATTTAATCCTCACAGTGTAAAATTAAAAATTCAGAAAAATTAATTCTGTTA
TTGTTAAATTTGCTTCCCAGAGCAATGGAGAATGTCACTACAATGAATGAGTTTCTTCTACTTGGCCTGA
CTGGTGTTCAGGAGCTGCAGCCTTTCTTCTTTGGGATTTTCTTAATCATTT
OR12D3 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR6_58WK3S · CTCF_binding_site · 29376172–29376193 · regulatory

· motif · 29376174–29376190 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:316 aa

1 aa316 aa跨膜區拓樸區域
依 Q9UGF7 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

OR12D3 蛋白質長 316 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 1 family。序列註解預測其具有七段穿膜螺旋,並在細胞外側與細胞質側交替分布短區段;此處僅概述所列拓樸特徵。

拓樸區域Extracellular1–23 aa
跨膜區Helical; Name=124–44 aa
拓樸區域Cytoplasmic45–52 aa
跨膜區Helical; Name=253–73 aa
拓樸區域Extracellular74–97 aa
跨膜區Helical; Name=398–118 aa
拓樸區域Cytoplasmic119–137 aa
跨膜區Helical; Name=4138–158 aa
拓樸區域Extracellular159–195 aa
跨膜區Helical; Name=5196–215 aa
拓樸區域Cytoplasmic216–236 aa
跨膜區Helical; Name=6237–257 aa
拓樸區域Extracellular258–270 aa
跨膜區Helical; Name=7271–291 aa
拓樸區域Cytoplasmic292–316 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9UGF7…

AlphaFold · Q9UGF7

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

OR12D3 被註記位於細胞膜,並屬於多次穿膜蛋白。 資料未提供其定位變化條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
hs6M1-27OR12D3
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能OR12D3 的功能註記為嗅覺受體。此註記未指出其辨識的氣味分子、作用機制或特定生物學情境,因此僅能確認其受體類別,不能據此補充更具體的功能細節。推論支持
證據與來源

Odorant receptor

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位OR12D3 被註記為位於細胞膜的多次穿膜蛋白。此項定位資料未描述其在不同條件下的變化,也未提供異構型或其他細胞區室定位的資訊。資料庫紀錄
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000396806 · 1,869 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGCAATGGAGAATGTCACTACAATGAATGAGTTTCTTCTA40
41CTTGGCCTGACTGGTGTTCAGGAGCTGCAGCCTTTCTTCT80
81TTGGGATTTTCTTAATCATTTACCTGATAAACTTGATTGG120
121AAATGGATCTATATTGGTGATGGTTGTTTTGGAACCACAA160
161CTCCACTCCCCTATGTATTTTTTTCTGGGAAACCTTTCTT200
201GTCTGGATATTTCTTATTCTTCAGTGACACTGCCCAAGCT240
241GCTCGTAAACCTCGTGTGCAGTCGCAGGGCTATATCTTTT280
281CTAGGCTGTATCACCCAGCTACACTTCTTCCACTTTTTGG320
321GAAGCACAGAGGCCATTTTACTGGCTATCATGGCCTTTGA360
361CCGTTTTGTTGCCATCTGCAATCCTCTTCGCTACACTGTC400
401ATCATGAACCCCCAGGTGTGTATTCTGTTGGCAGCTGCGG440
441CCTGGCTCATCAGCTTCTTTTACGCTCTGATGCATTCTGT480
481CATGACTGCACACCTGAGTTTTTGTGGCTCTCAGAAACTC520
521AATCACTTCTTCTACGATGTCAAGCCGCTCTTAGAATTGG560
561CCTGTAGTGACACATTACTCAATCAATGGCTTCTTTCCAT600
601TGTCACAGGCAGCATATCCATGGGAGCTTTCTTTCTGACT640
641CTTCTCTCCTGCTTCTATGTAATTGGCTTCCTTCTGTTTA680
681AGAACAGGTCCTGCAGAATACTCCACAAGGCTCTGTCCAC720
721TTGTGCCTCCCATTTTATGGTGGTATGTCTTTTCTATGGA760
761CCTGTGGGCTTCACATATATTCGTCCTGCTTCAGCCACCT800
801CCATGATTCAGGACCGGATAATGGCCATCATGTATAGCGC840
841CGTCACCCCTGTACTGAATCCACTAATCTACACCCTTAGG880
881AACAAAGAAGTGATGATGGCTCTGAAGAAAATCTTTGGTA920
921GGAAGTTGTTTAAAGACTGGCAGCAACACCACTAGGACTA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。