基因總覽
OR12D3 的正式名稱為 olfactory receptor family 12 subfamily D member 3,屬於蛋白質編碼基因。其產物被註記為嗅覺受體;目前提供的資料未進一步說明其辨識的氣味分子或特定生理作用。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000396806 ★ | 29,373,423–29,375,291 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
OR12D3 的功能註記為嗅覺受體。現有資料未提供其所辨識的氣味分子、受體活化方式、下游訊號傳遞,或其參與的特定生物學過程,因此無法據此描述更具體的作用機制或生理意義。
Promoter 與基因調控
>OR12D3 ENST00000396806 GRCh38 chr6:29375191-29376291 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGAGAACTTATGATATTGTGGACCAATTATTAGCAGAAGAATCTTAGTAGGCATGGGTGGGAGGAGTATC CTAGTTAGCCTTTCCAATTCCTCAGTGCAAGGGCTCCCTCTTCTGTTGATAAGGTGGTGATTATTATTAT TGTTATTATTATTATTATTATTAATTACTTACAAATGACAAGCTTCCTTTGTTCTTCATATATTTACTAT ACCTCTTCTCTCCATCACCTTCAGTGCTTAGACTGTGCCTTTTTCTATCCCCTGCCCCACAGAAATTCTC ACTCCCTGGGAGGTACTCCCCTTTTGGATTGAAAAATTGGGGGTGTTTTCGAAGTTCTTCTACTAATGGG ACCTCTAACTATTTCAAGTTTTTCCCAACTACATCCACTGCCTCATTGCTATGACACAGTCTTGTGACTA ATGATGCTAATTTTGCTGTTTTTTTCTCCTCTACTCATACAACATTTGGTTTGTGGGTGTTTATGTTTCT TACTTTCACTGAAAGTTTGGGTTGTCAGAAGACATGTGTTACTCTCTTGTGGCTTTTATGTATCTTAGAA GAAGTGATGAAATCCCCACTGAGCTACATCTGAATTTTTGCCAGAACCTAGAATCATAAGTTGAAAAACT ATTCCCTGTTTGTATGTTTAAAATTTTTGTAATACATAATTCTAATGCCATACATGAGGTTATGATTATG TCCATCAAATCTTGCACTTCCTAGTTTTGAAAACAAATGCCCTTTATCTATATCTGATTTGTTCATAATA TAATGCTTTTATTAGTCTAGTGCCATTTTAACAGCTCAGAATTTATCAGGTATATTAGTCTTCCTCAATT TTGTTGTACATAAATTTAGTTTTACTGTTCGTAACTATTCTTCACACTGTTGCTCACCCCTAGGTTCCTC CAAATAGTAAACTTGCTTTATTTAATCCTCACAGTGTAAAATTAAAAATTCAGAAAAATTAATTCTGTTA TTGTTAAATTTGCTTCCCAGAGCAATGGAGAATGTCACTACAATGAATGAGTTTCTTCTACTTGGCCTGA CTGGTGTTCAGGAGCTGCAGCCTTTCTTCTTTGGGATTTTCTTAATCATTT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR6_58WK3S · CTCF_binding_site · 29376172–29376193 · regulatory
· motif · 29376174–29376190 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:316 aa
OR12D3 蛋白質長 316 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 1 family。序列註解預測其具有七段穿膜螺旋,並在細胞外側與細胞質側交替分布短區段;此處僅概述所列拓樸特徵。
蛋白質三維結構
細胞內定位
OR12D3 被註記位於細胞膜,並屬於多次穿膜蛋白。 資料未提供其定位變化條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AGCAATGGAGAATGTCACTACAATGAATGAGTTTCTTCTA40CTTGGCCTGACTGGTGTTCAGGAGCTGCAGCCTTTCTTCT80TTGGGATTTTCTTAATCATTTACCTGATAAACTTGATTGG120AAATGGATCTATATTGGTGATGGTTGTTTTGGAACCACAA160CTCCACTCCCCTATGTATTTTTTTCTGGGAAACCTTTCTT200GTCTGGATATTTCTTATTCTTCAGTGACACTGCCCAAGCT240GCTCGTAAACCTCGTGTGCAGTCGCAGGGCTATATCTTTT280CTAGGCTGTATCACCCAGCTACACTTCTTCCACTTTTTGG320GAAGCACAGAGGCCATTTTACTGGCTATCATGGCCTTTGA360CCGTTTTGTTGCCATCTGCAATCCTCTTCGCTACACTGTC400ATCATGAACCCCCAGGTGTGTATTCTGTTGGCAGCTGCGG440CCTGGCTCATCAGCTTCTTTTACGCTCTGATGCATTCTGT480CATGACTGCACACCTGAGTTTTTGTGGCTCTCAGAAACTC520AATCACTTCTTCTACGATGTCAAGCCGCTCTTAGAATTGG560CCTGTAGTGACACATTACTCAATCAATGGCTTCTTTCCAT600TGTCACAGGCAGCATATCCATGGGAGCTTTCTTTCTGACT640CTTCTCTCCTGCTTCTATGTAATTGGCTTCCTTCTGTTTA680AGAACAGGTCCTGCAGAATACTCCACAAGGCTCTGTCCAC720TTGTGCCTCCCATTTTATGGTGGTATGTCTTTTCTATGGA760CCTGTGGGCTTCACATATATTCGTCCTGCTTCAGCCACCT800CCATGATTCAGGACCGGATAATGGCCATCATGTATAGCGC840CGTCACCCCTGTACTGAATCCACTAATCTACACCCTTAGG880AACAAAGAAGTGATGATGGCTCTGAAGAAAATCTTTGGTA920GGAAGTTGTTTAAAGACTGGCAGCAACACCACTAGGACTA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。