基因總覽
ONECUT3（one cut homeobox 3）是位於人類第 19 號染色體的蛋白質編碼基因，產物屬於 CUT homeobox 家族。現有資料將其描述為轉錄活化因子，並註記其可結合特定 DNA 序列；這些功能資訊標示為依據相似性推定。來源未提供更多關於此蛋白質基本性質或家族特色的說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000382349 ★ | 1,753,506–1,780,988 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ONECUT3 的產物被註記為轉錄活化因子。依據相似性推定，它可結合一種共識 DNA 序列，並作用於多種基因的啟動子；來源列舉 HNF3B 與 TTR 的啟動子為例。這項資料支持其與轉錄調控相關，但未提供實驗條件、作用細節或其他生物學過程的資訊，因此相關敘述應視為依據相似性作出的推定，而非此處已獨立驗證的功能。
Promoter 與基因調控
>ONECUT3 ENST00000382349 GRCh38 chr19:1752506-1753606 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CAGATCCGCAGCCCTGACCTTACCCCACTGGCGGGATCTAGTCCCCTGGGGGTCTCTCTGATTATAGGAG CCCTTCCCCCATCTATCCCAGTTCCCAGGGGCCCCTGGGGCTCACCTGTCTCCAGGTGCTGAGAAAAAGG AGACCCCTGCCTCCCCCCACATTGAAGAGAAGCCCCAGGGACAAAGAGGAGTTTGCACCAGCGACGTCTC AGAAGACAGGGGATCCAGCCTCAGCCTCCGTGGGCTGGAGGGTGACAGGGGCTCTTAGTGGTCACCCCCA GGCTCCAGTGCCTCCAGCGGCCGCACTGTAAAAAGGCCCTGCAATTAGAAGGGGCCTTTGGCAACCCCGA GGCCGGGCAGCCCATTGTACAGTTGGGGAAACGGAGGCCCAGGTGCCCACACATGGGCAGAGGCTGACCC CTGGGGCGCACGGAGGCCCTGACCTAGCCTTAGGACCTCCCTTTTCCCCCACTTCCTCCACAAAGAGGTT GTGGGAAGGGGGCTGTGACTCCGTAGGTGTGAGTGGGAGTCGGGGGAAGCTGAGCTTGCAGTGGGGATCT AGCTCCTGGGGGTCTGTAGGGAACGGGGGGGGGGGGGGACACGTACATTACAGGCGACCGTCCAGCCACA CTCCCAGAAACTCCCTGGAGATGGACTTGGGGGTGCCAGGCAGAAAGCCACATCTGGGACTCTGGAGAGA ATCACACAGAGACGCGAAATCGGAGACTCTGGGTCGAGGCCCCCAGCCCCACCTGGGCAGAGTCTGTCCT CGGACCCCCGCCCGCTGTCCCCCGGGTACGGCCTGCCCCAGCGGGCGCGGGCGGGCGCAGTGGCCAGGGA CGCCGAAGCCCCAAGTCTGGCCGACTTCGGCCTGCTTGGTGCTCGAGTGGGGCCGGGGCGGGCGGAGAGC GAGGCTGCGGGAGGCAGCGGTGGCAGGAGCGGGTGGGCGGGGGCGCTGACGTCAGACCCGGGCCCGGGCG CCGGCGGCCGCTCCCCTGCCACATCCTGGTGGCCGCGCTCGCAGCCGGGCCGGGCCGTGCGCCGCGCAGC CTGGCAGCCTCGCGCGCAGCCACCGGGGAGCGGGCGGGAGTCATGCAGCGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR19_5F4ST · CTCF_binding_site · 1748696–1748717 · regulatory
ENSR19_5F553 · CTCF_binding_site · 1750251–1750272 · regulatory
ENSR19_9NR3 · enhancer · 1752118–1752535 · regulatory
ENSR19_9NRB · promoter · 1753016–1753516 · regulatory
ENSR19_5F5TB · CTCF_binding_site · 1754627–1754648 · regulatory
ENSR19_83DMG · enhancer · 1756347–1756573 · regulatory
ENSR19_9NSG · enhancer · 1757114–1757484 · regulatory
ENSR19_9NSM · enhancer · 1757629–1758053 · regulatory
· motif · 1748698–1748714 · motif
· motif · 1750253–1750269 · motif
· motif · 1752231–1752244 · motif
· motif · 1754629–1754645 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：494 aa
ONECUT3 蛋白質長 494 個胺基酸，屬於 CUT homeobox 家族。序列註解包含兩個 DNA 結合區域：CUT 位於第 312–398 位，Homeobox 位於第 414–473 位。另有數段被預測為無序區，分別位於第 130–162、199–239、295–319 及 475–494 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源將 ONECUT3 蛋白質定位於細胞核；未提供定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- CIB1Q99828 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NCK2O43639 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZMYND12Q9H0C1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ONECUT3 被註記為轉錄活化因子；依據相似性推定，它可結合共識 DNA 序列 5'-DHWATTGAYTWWD-3'，並作用於多種基因啟動子，例子包括 HNF3B 與 TTR。 | 推論支持 | 證據與來源Transcriptional activator. Binds the consensus DNA sequence 5'-DHWATTGAYTWWD-3' on a variety of gene promoters such as those of HNF3B and TTR (By similarity) |
| 細胞定位 | 此項定位註記指出 ONECUT3 位於細胞核。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ACATCCTGGTGGCCGCGCTCGCAGCCGGGCCGGGCCGTGC40GCCGCGCAGCCTGGCAGCCTCGCGCGCAGCCACCGGGGAG80CGGGCGGGAGTCATGCAGCGGCCTTGAGCACTAGGGGCCG120GCGCTGAGGAGCGCGCGCGGCGGGAGGGCAGCCGAGCATG160GAGCTGAGCCTGGAGAGCCTGGGGGGCCTGCACAGCGTGG200CCCACGCGCAGGCGGGCGAGCTGCTGAGCCCGGGCCACGC240GCGCTCGGCGGCGGCGCAGCACCGCGGCCTGGTGGCGCCC280GGGCGCCCGGGCCTGGTGGCCGGCATGGCGAGCCTGCTGG320ACGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGTGGGGGCGCCGGGGGCGC360GGGCGGCGCGGGCAGCGCGGGCGGCGGCGCGGACTTCCGC400GGGGAACTGGCGGGCCCGCTGCACCCGGCAATGGGCATGG440CCTGCGAGGCGCCGGGCCTGGGCGGCACCTACACGACGCT480CACGCCCCTGCAGCACCTGCCGCCGCTCGCGGCCGTGGCC520GACAAGTTCCACCAGCACGCGGCGGCCGCGGCCGTGGCCG560GGGCGCACGGCGGCCATCCCCACGCGCACCCGCACCCGGC600GGCCGCGCCGCCCCCGCCACCCCCGCCGCAGCGTCTGGCG640GCCAGCGTGAGCGGCAGCTTCACCCTCATGCGCGACGAGC680GGGCGGCGCTCGCCTCCGTGGGCCACCTCTACGGACCCTA720CGGCAAGGAGCTGCCCGCCATGGGGTCGCCGCTGTCGCCG760CTGCCCAACGCGCTGCCGCCCGCGCTGCACGGCGCCCCGC800AGCCCCCGCCGCCGCCACCACCCCCGCCGCTGGCCGCCTA840CGGCCCGCCAGGCCACCTGGCTGGGGACAAGCTGCTGCCG880CCCGCCGCCTTCGAGCCGCACGCCGCGCTGCTGGGACGCG920CGGAGGACGCACTGGCCCGCGGGCTGCCCGGAGGCGGCGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。