演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

NUTF2NTF2

nuclear transport factor 2

NUTF2(nuclear transport factor 2)是蛋白質編碼基因,其產物參與 GDP 結合型 RAN 的核輸入,並間接支持受貨物受體介導的核質運輸。

Homo sapiens16q22.1UniProt P61970
OFFICIAL SYMBOL
NUTF2
CHROMOSOME
16
UNIPROT
P61970
PDB / ALPHAFOLD
1GY5
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

NUTF2 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 nuclear transport factor 2。其產物參與細胞核與細胞質之間的運輸,與 RAN 及核孔相關蛋白質的作用有關。現有資料未提供其所屬家族或整體蛋白質結構的更多說明;已註解的蛋白質區域見蛋白質特徵欄。

Official symbol
NUTF2
Gene name
nuclear transport factor 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13722
UniProt
P61970
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
NTF2PP15

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616q22.1
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegNUTF2pq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr16:67,844,369–67,872,569
Gene span
28,201 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000219169 ★67,846,933–67,872,5675
ENST0000109186767,844,369–67,871,4125
ENST0000109186867,846,165–67,871,3235
ENST0000070061067,846,672–67,871,1344
ENST0000056823367,846,672–67,871,0634
ENST0000056839067,846,672–67,868,7413
ENST0000070061267,846,672–67,871,3095
ENST0000070061367,846,672–67,872,5496
ENST0000056943667,846,672–67,872,5495
ENST0000057002667,846,672–67,871,0564
ENST0000089978367,846,672–67,871,3207
ENST0000089978467,846,672–67,871,3126

顯示 12/37 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

NUTF2 促進 GDP 結合型 RAN 由細胞質進入細胞核。這項作用支持 RAN 在受貨物受體介導的核質運輸中的功能;因此,NUTF2 也間接參與較廣泛的核質運輸過程。

在細胞質中,NUTF2 與 GDP 結合型 RAN 互作,並透過與核孔蛋白的互作,將其招募至核孔複合體,進而促進 RAN 的核輸入。這些步驟構成 NUTF2 介導運輸的機制;資料指出,核孔蛋白的參與是 GDP 結合型 RAN 經 NUTF2 輸入細胞核所需的一步。

此外,NUTF2 與 CAPG 互作並介導其核輸入。這項資料顯示其運輸關係不只涉及 RAN,但現有來源未進一步說明 CAPG 核輸入的分子步驟或生物學後果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 67846933 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>NUTF2 ENST00000219169 GRCh38 chr16:67845933-67847033 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GAACAGGAGTACTGAGAGACCTCCGGCCAGGAAGGAAGGCTAGGAGTTGCCTGGAGAGGCCTTGTAGCCA
TTTCCCTTACCTGTGGTACCCCAAGTTGGCTGCAGATCTCTTTGCCAAGCACAGGTCTGACCTAGAGACT
GGCCTTACCACAAATGTTTGTGTTACCAAGAAAACAAATGGGCGTTGAAAGGAAAGGGCAATGGGTAGGA
AGAGAACTATTTACAATCTGGTCACTTAAATCACAGCGAAATTTTGGGTAAGTCAGTCATTTCTCTTTCC
TCATTAATAAAAATGAAACACTTAGCTGCTCTATCTGCTGCAAAAAAACCTTACAGAATGTTTTGGGGGG
ACCCCTGACTGTAGAAGTTTGAGGGTAACCTCTCCAACCAAGCCCCACCTGAGGGACATTTGAGTCTCCG
GCCCAAGAATAGCCTAGCCTGCTCGAAACCAGCTTTGGGCCCGACTCGCCGAGGTGCAGGCGCACGAATG
TTGGGATTGCAGGAGCTGTGCGTTCCGCCCGGGCTGGTTAAGGCCACACAGCTCGGAAGAGTAACAGCGG
CAGCCATAGCCCCAAGGGGAGGGGGTTTCGTGAGCGGAAACGGCCCAGGGGCCCAGGGAGGGGCAGCTGG
GCCAGCTTGGGGCCGGGCTGGGCTCCCACGGAGGCGGGGCCAACCCCCACCCCAGTGCACAGACTGGGCG
GGGCCGAGCCAGCTGAGACCAGGAGACAACTGAGCCCTGACCCTAGCCTGGCGCCAACCTCTAGTGTTCC
AGAGGCTTCCGCTAGACCACAATTCTCAGGGGCTTGCCCCGGCAGCCTCCCTCCCTGGCTTAGCCTCACC
TCCCGCGCTGCGGGCCGTGTCTGGGCCTCCGCGCATAGCACGCCGGGAATTGTAGTTTTCTCTCGGCGCG
CTCATGCCGGAAAGGGGGGGCGGTGGGACTGCGTCTCCCAGAGTGCAGCGGGGCGGGCGAAGGAAGGCAG
GGGGGAAGGGACAGTCGGCCGCAGACCGCGCTGGGTTGCCGCTGCCGCTGCCGCCATCGTGCCAGCCCCT
CGGGTGAGTGTCGGGGCCAGCACGCCGGGGCGGGGGCTGGGCCGCAGGAGC
NUTF2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
NUTF2_1 ↗16:67,846,935正股67,846,886–67,846,945

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_9ZX38 · promoter · 67841830–67842330 · regulatory

ENSR16_9ZX3Z · enhancer · 67844430–67844818 · regulatory

ENSR16_BHGJR · promoter · 67846392–67847226 · regulatory

ENSR16_5KXTJ3 · CTCF_binding_site · 67846683–67846704 · regulatory

ENSR16_9ZX4R · enhancer · 67847227–67847682 · regulatory

ENSR16_5KXTN2 · CTCF_binding_site · 67847534–67847555 · regulatory

ENSR16_9ZX4W · promoter · 67847683–67848098 · regulatory

· motif · 67842035–67842046 · motif

· motif · 67842035–67842046 · motif

· motif · 67842239–67842250 · motif

· motif · 67842239–67842250 · motif

· motif · 67842241–67842250 · motif

· motif · 67843144–67843161 · motif

· motif · 67843321–67843332 · motif

· motif · 67846347–67846358 · motif

· motif · 67846500–67846513 · motif

· motif · 67846500–67846513 · motif

· motif · 67846507–67846517 · motif

· motif · 67846592–67846602 · motif

· motif · 67846626–67846636 · motif

· motif · 67846685–67846701 · motif

· motif · 67846716–67846724 · motif

· motif · 67846858–67846868 · motif

· motif · 67846928–67846943 · motif

· motif · 67846961–67846971 · motif

· motif · 67847021–67847038 · motif

· motif · 67847536–67847552 · motif

· motif · 67847797–67847810 · motif

· motif · 67847797–67847810 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:127 aa

1 aa127 aa結構域
依 P61970 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

NUTF2 蛋白質長 127 個胺基酸。序列註解指出,第 10 至 121 位胺基酸包含 NTF2 結構域;來源未提供其他功能區域的描述。

結構域NTF210–121 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1GY5…

PDB · 1GY5

X-ray · 2.30 A · A/B=1-127

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytosol;Nucleus outer membrane;Nucleus, nuclear pore complex;Nucleus inner membrane;Nucleus, nucleoplasm

NUTF2 在細胞質溶膠與細胞核相關區域均有定位,包括核膜、核孔複合體及核質。 穩態時主要位於核質,並在核質內的聚集點富集。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 42 個夥伴 · 最多顯示 50 個
NTF2NUTF2BEND7BRWD1CAMK2GCCDC106CCDC150CHCHD3CHMP4ACKMT1BCLPPFAM50BHMG20AHMG20BKHDC4KRT86KRTAP9-8LASP1LCE1CLCE5ALENG1MRNIPMYOZ3NME1NME4NRIP3NUP54NUP62PAX4PBX4PCNAPFKPPHF11PPP1R16ARANRPRD1BSPATC1LSPRY4TEX35THAP3TLE5UBAP2YAF2ZMAT2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 42 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

NUTF2 可形成同源二聚體。它與 GDP 結合型 RAN 直接互作,並調節 RAN 的核輸入;與 NUP54、NUP58 及 NUP62 的 FG 重複序列互作,將 NUTF2 招募至核孔複合體,此步驟是其介導 GDP 結合型 RAN 核輸入所需。NUTF2 也與 CAPG 互作,並介導 CAPG 的核輸入。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能NUTF2 促進 GDP 結合型 RAN 從細胞質輸入細胞核,此作用對 RAN 參與受貨物受體介導的核質運輸至關重要,並使 NUTF2 間接參與較廣泛的核質運輸。NUTF2 在細胞質中與 GDP 結合型 RAN 互作,透過核孔蛋白將其招募至核孔複合體並促進其核輸入。含實驗來源
證據與來源

Mediates the import of GDP-bound RAN from the cytoplasm into the nucleus which is essential for the function of RAN in cargo receptor-mediated nucleocytoplasmic transport. Thereby, plays indirectly a more general role in cargo receptor-mediated nucleocytoplasmic transport. Interacts with GDP-bound RAN in the cytosol, recruits it to the nuclear pore complex via its interaction with nucleoporins and promotes its nuclear import

PMID 10679025 ↗ · PMID 7744965 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用NUTF2 形成同源二聚體,並直接結合 GDP 結合型 RAN、調節其核輸入;它也透過 FG 重複序列與 NUP54、NUP58 及 NUP62 互作,將自身招募至核孔複合體,此步驟為其促進 GDP 結合型 RAN 核輸入所需。此外,NUTF2 與 CAPG 互作並介導其核輸入。含實驗來源
證據與來源

Homodimer. Interacts with RAN (GDP-bound form); the interaction is direct and regulates RAN nuclear import. Interacts with the nucleoporins NUP54, NUP58 and NUP62 (via FG repeats); recruits NUTF2 to the nuclear pore complex a step required for NUTF2-mediated GDP-bound RAN nuclear import. Interacts with CAPG; mediates its nuclear import

PMID 10679025 ↗ · PMID 18266911 ↗ · PMID 7744965 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位NUTF2 的定位包括細胞質溶膠、核外膜、核孔複合體、核內膜及核質;在穩態時,NUTF2 主要位於核質,並在核質內的聚集點富集。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm, cytosol; Nucleus outer membrane; Nucleus, nuclear pore complex; Nucleus inner membrane; Nucleus, nucleoplasm; At steady state it is essentially nucleoplasmic, enriched in nucleoplasmic foci

PMID 10679025 ↗ · PMID 7744965 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000219169 · 2,120 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCAGACCGCGCTGGGTTGCCGCTGCCGCTGCCGCCATCGT40
41GCCAGCCCCTCGGGTCTCCGTGAGGCCGGGTGACGCTCCA80
81GAATGGGAGACAAGCCAATTTGGGAGCAGATTGGATCCAG120
121CTTCATTCAACATTACTACCAGTTATTTGATAATGATAGA160
161ACCCAACTAGGCGCAATTTACATTGACGCGTCATGCCTTA200
201CGTGGGAAGGACAACAGTTCCAGGGGAAAGCTGCCATTGT240
241GGAGAAGTTGTCTAGCCTTCCGTTCCAGAAAATTCAGCAC280
281AGCATCACCGCGCAGGACCATCAGCCCACTCCAGATAGCT320
321GCATCATCAGCATGGTTGTGGGCCAGCTTAAGGCGGATGA360
361AGACCCCATCATGGGGTTCCACCAGATGTTCCTATTAAAG400
401AACATCAACGATGCTTGGGTTTGCACCAATGACATGTTCA440
441GGCTCGCCCTGCACAACTTTGGCTGACCTCCTCTCAGCTA480
481GGCACTCACGCTGTTTCCTCCTCCCTCCTCTTCCCAATAC520
521TATTCCCACTCCTCCAGATGCTCCAAATATCATGCACAAA560
561TGAGCAGGGCCGCGGTGGGAGTGGGCGCAGTGCGCTGCTG600
601CCACTGAGGTGTTGTGCATGATGTTTGGATGCTAGACTAG640
641TTGCATCTGACGGGAGAAGTTTGTGTTGTACCAGCGCATG680
681CCTTGGAAAGACTTAAGTAATGCAAAAGGTTGTCCTTTTT720
721TTTTTTTTTTTTTTTTTAATCTACTGACAAGTTGCTCTAG760
761TAACCCAAAGAAGTGAAGGAGAAAGCAGCTGCCTCACCGC800
801CCAGACATTGATTTGTTCAGATGTTTCAATGCCTCATGAT840
841ACAATAAAACCACAAAAATTTTCTTAACAGTTTAAATTGT880
881TTTAATTAGTTTACTAGTTGGCTGGGCATCAGAAGCTACC920
921CAGACCCGTTGTCTCTCTCATGTTTCACCCTCCCACTTCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。