基因總覽
NSDHL 是位於 X 染色體的蛋白質編碼基因，產物正式名稱為 NAD(P) dependent 3-beta-hydroxysteroid dehydrogenase NSDHL，屬於 3-beta-HSD family。此蛋白質長 373 個胺基酸，具有一段跨膜區，並帶有與避免蛋白質自內質網分泌相關的短序列基序。其基本角色與膽固醇生合成有關，也被註記與 EGFR 的胞內運輸調節相關；這些功能描述皆為依相似性推定。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000370274 ★ | 152,831,063–152,869,729 | 8 |
| ENST00000440023 | 152,830,967–152,870,235 | 9 |
| ENST00000881875 | 152,830,967–152,870,235 | 8 |
| ENST00000881876 | 152,830,967–152,870,235 | 7 |
| ENST00000881877 | 152,830,967–152,870,235 | 10 |
| ENST00000881878 | 152,830,967–152,870,235 | 7 |
| ENST00000881879 | 152,830,967–152,870,235 | 8 |
| ENST00000881880 | 152,830,967–152,870,235 | 9 |
| ENST00000881881 | 152,830,967–152,870,235 | 10 |
| ENST00000881882 | 152,830,967–152,870,235 | 8 |
| ENST00000881883 | 152,830,967–152,870,235 | 8 |
| ENST00000881884 | 152,830,967–152,870,235 | 10 |
顯示 12/30 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
NSDHL 的功能註解指出，它參與角鯊烯之後的膽固醇生合成，催化 4-alpha-carboxysterols 的 C4 甲基氧化脫羧反應。此反應使用 NAD(+) 或 NADP(+) 作為輔因子，並生成相應的還原型輔因子、二氧化碳與 3-oxosteroid。相關註解標示為依相似性推定，因此不應視為此處直接呈現的實驗證明。
列出的反應底物包括 4alpha-carboxyzymosterol、4alpha-carboxy-4beta-methyl-5alpha-cholest-8-en-3beta-ol、4alpha-carboxy-5alpha-cholest-8-ene-3beta-ol，以及 4beta-methylzymosterol-4alpha-carboxylate。它們分別可轉化為 zymosterone、4alpha-methyl-5alpha-cholest-8-en-3-one、5alpha-cholest-8-en-3-one 或 3-dehydro-4-methylzymosterol；使用 NADP(+) 時產生 NADPH，使用 NAD(+) 時產生 NADH，且反應均釋出 CO2。
此酵素反應被置於類固醇生合成脈絡中，並對應 zymosterol 生合成路徑中由 lanosterol 生成 zymosterol 的第 4/6 步。來源另將 NSDHL 與 EGFR 的胞內運輸調節相連結，同樣註明為依相似性推定；現有資料未詳述此調節的分子方式或條件。
Promoter 與基因調控
>NSDHL ENST00000370274 GRCh38 chrX:152830063-152831163 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGAGATAATCAGCTCTTCCCGAACGTGGGGATCCTGGTTCTGAAAACAGTCTTACGATGCCCACTCCCAG TACTCCCCTTCCCAGTAAGTACTCCGACTTCCCAATTACTTCTAGATTTGGCCAAATATTAGTAAGTTGT TAAGATGTATATTGTGTCAGTACCGAGTAATAAAACTCAATCCATCTGGCACCTTCGTGCCTTCTCCAAG AAGCTAAAGCATCCCCTGAATGCCCCTGTATTTAAATTGTAAAAAACATTGTAACAGAACACGATACACC TTTTCCCAGCTGTGTGTGGAAATTTTGGCAGAATGAGGAGGCCAGGGGGCCAAGGTCTGAGAGAGTCAGG GGCCTGTGAGGGATTCGAGTCTTTTTTGCCCAGGGAGGTTCACCGAGGGGATCAGGGAATGCAAGGGGAG CCCGAGGGGCGGGTGTGGGCCTGTTGTGGGTGAAGAGGAGGCAGCAGCGAAGCGCAGGCCCAGTAGGTTG GTTAGCGTCTGTACCCTACTCTCCCGGGAAAGAGCTCAAAGGAAAGACTGGTGCGCTAAAGCCGAGAAAG GCGCAGGAGAGGCGGCGTGGCCGAGCTGGGGCCTGGGAAGGGCTCAGCCGCTGGGCGTGGGGCGCGACAG AGCGGCAGCACTCACCATAGCCAAAGGAGTCCGCTGCCGGTTGTTAGGCAACCGACGTGTACACTGACTC GGCGCCGTTCCCACCGCCCCGCGCGCGCAGCCCCGCTCCCCATTGGCCGTCCGCTCGTCGCCGCCTCTCC CTATTGGTGCAGGGCCGAAGAGGGTGGGACTAACCTGGCAAAGCCCCGGCCCAGCGCGGGGAGGGGCACG CTGGCGACAGAGCCCCGTCTTTATTGGGCAAGATCACGCCGTGAGCGCCAATTGGCTGAGTCGTCGCCGA GCTGGGCCAATCCTCTTGGTGGAGGAAGCTCGGCTGATTCTCGGCTCACGCGGGAGGGGAGTAAAGGGTG GCGGTCCGGGCCTGGAGTTCAGTGGGTGCAGCCTGCTTGCGAGCTGAGGCCAGACAGGGGGGCGCCTACG GACGGGTAAGAGTCGTGGCCTTGCCATTGGAGGTCACCCTGTGTCAGCGAC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| NSDHL_2 ↗ | X:152,830,773 | 正股 | 152,830,724–152,830,783 |
| NSDHL_1 ↗ | X:152,831,063 | 正股 | 152,831,014–152,831,073 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSRX_948MSR · enhancer · 152830289–152830746 · regulatory
ENSRX_948MSW · promoter · 152830747–152831073 · regulatory
ENSRX_B35BX2 · enhancer · 152831074–152831783 · regulatory
· motif · 152829769–152829778 · motif
· motif · 152830889–152830899 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：373 aa
NSDHL 蛋白質長 373 個胺基酸，屬於 3-beta-HSD family。其第 298–318 位胺基酸構成螺旋型跨膜區；第 370–373 位則有一段被註記為可避免蛋白質自內質網分泌的基序，該基序功能為依相似性推定。
蛋白質三維結構
細胞內定位
NSDHL 是單次穿膜蛋白，定位於內質網膜，也可見於脂滴。 蛋白質經過 Golgi 的運輸是其定位至內質網膜所必需的。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Lipid droplet。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- ATXN1P54253 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RHBDD1Q8TEB9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMX2Q9Y320 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
NSDHL 被註記可形成同源二聚體；此資料支持其複合體組成形式，未提供其他結合夥伴或功能性互作細節。
疾病與遺傳關聯
NSDHL 變異與兩種 X 染色體相關疾病有關。CHILD syndrome 為 X 連鎖顯性脂質代謝疾病，伴隨膽固醇生合成異常，通常造成男性致死；臨床表現包括先天、單側且有明顯中線界限的魚鱗癬樣紅皮症，以及同側肢體缺陷或發育不全，嚴重程度可由手指或肋骨發育不全至肢體缺如，且常伴脊柱側彎。CK syndrome 則為 X 連鎖隱性疾病，特徵包括程度不一的認知障礙、癲癇、小頭症、大腦皮質畸形、面部特徵異常及體型瘦削。這些資料描述的是影響 NSDHL 的變異與疾病的關聯。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 16 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | NSDHL 被註記可在膽固醇生合成中，催化 4-alpha-carboxysterols 的 C4 甲基進行 NAD(P)(+) 依賴的氧化脫羧；另與 EGFR 胞內運輸調節有關。兩項功能皆為依相似性推定。 | 推論支持 | 證據與來源Catalyzes the NAD(P)(+)-dependent oxidative decarboxylation of the C4 methyl groups of 4-alpha-carboxysterols in post-squalene cholesterol biosynthesis (By similarity). Also plays a role in the regulation of the endocytic trafficking of EGFR (By similarity) |
| 分子活性 | a 3beta-hydroxysteroid-4alpha-carboxylate + NADP(+) = a 3-oxosteroid + CO2 + NADPH | 推論支持 | |
| 分子活性 | a 3beta-hydroxysteroid-4alpha-carboxylate + NAD(+) = a 3-oxosteroid + CO2 + NADH | 推論支持 | |
| 分子活性 | 4alpha-carboxyzymosterol + NADP(+) = zymosterone + CO2 + NADPH | 推論支持 | |
| 分子活性 | 4alpha-carboxy-4beta-methyl-5alpha-cholest-8-en-3beta-ol + NADP(+) = 4alpha-methyl-5alpha-cholest-8-en-3-one + CO2 + NADPH | 推論支持 | 證據與來源4alpha-carboxy-4beta-methyl-5alpha-cholest-8-en-3beta-ol + NADP(+) = 4alpha-methyl-5alpha-cholest-8-en-3-one + CO2 + NADPH |
| 分子活性 | 4alpha-carboxy-5alpha-cholest-8-ene-3beta-ol + NADP(+) = 5alpha-cholest-8-en-3-one + CO2 + NADPH | 推論支持 | 證據與來源4alpha-carboxy-5alpha-cholest-8-ene-3beta-ol + NADP(+) = 5alpha-cholest-8-en-3-one + CO2 + NADPH |
| 分子活性 | 4beta-methylzymosterol-4alpha-carboxylate + NADP(+) = 3-dehydro-4-methylzymosterol + CO2 + NADPH | 推論支持 | 證據與來源4beta-methylzymosterol-4alpha-carboxylate + NADP(+) = 3-dehydro-4-methylzymosterol + CO2 + NADPH |
| 分子活性 | 4beta-methylzymosterol-4alpha-carboxylate + NAD(+) = 3-dehydro-4-methylzymosterol + CO2 + NADH | 推論支持 | 證據與來源4beta-methylzymosterol-4alpha-carboxylate + NAD(+) = 3-dehydro-4-methylzymosterol + CO2 + NADH |
| 分子活性 | 4alpha-carboxy-5alpha-cholest-8-ene-3beta-ol + NAD(+) = 5alpha-cholest-8-en-3-one + CO2 + NADH | 推論支持 | 證據與來源4alpha-carboxy-5alpha-cholest-8-ene-3beta-ol + NAD(+) = 5alpha-cholest-8-en-3-one + CO2 + NADH |
| 分子活性 | 4alpha-carboxy-4beta-methyl-5alpha-cholest-8-en-3beta-ol + NAD(+) = 4alpha-methyl-5alpha-cholest-8-en-3-one + CO2 + NADH | 推論支持 | 證據與來源4alpha-carboxy-4beta-methyl-5alpha-cholest-8-en-3beta-ol + NAD(+) = 4alpha-methyl-5alpha-cholest-8-en-3-one + CO2 + NADH |
| 分子活性 | 4alpha-carboxyzymosterol + NAD(+) = zymosterone + CO2 + NADH | 推論支持 | |
| 分子活性 | 此功能註記將 NSDHL 所參與的反應置於類固醇生合成與 zymosterol 生合成路徑，並指出由 lanosterol 生成 zymosterol 的過程中，此步驟是全程六步中的第四步。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | Homodimer | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | NSDHL 是單次穿膜蛋白，定位於內質網膜及脂滴；蛋白質經過 Golgi 的運輸是其定位至內質網膜所必需的，資料未說明此運輸條件對脂滴定位的影響。 | 含實驗來源 | 證據與來源Endoplasmic reticulum membrane / Single-pass membrane protein; Lipid droplet; Trafficking through the Golgi is necessary for ER membrane localization PMID 21129721 ↗ |
| 疾病關聯 | NSDHL 變異與 X 連鎖顯性 CHILD syndrome 有關，此脂質代謝疾病伴隨膽固醇生合成異常且通常造成男性致死；表現包括單側魚鱗癬樣紅皮症及同側肢體發育缺陷，嚴重程度不一，常見脊柱側彎。 | 含實驗來源 | 證據與來源Congenital hemidysplasia with ichthyosiform erythroderma and limb defects CHILD An X-linked dominant disorder of lipid metabolism with disturbed cholesterol biosynthesis, which typically results in male lethality. Clinically, it is characterized by congenital, unilateral, ichthyosisform erythroderma with striking lateralization, sharp midline demarcation, and ipsilateral limb defects and hypoplasia of the body. Limbs defects range from hypoplasia of digits or ribs to complete amelia, often including scoliosis. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 308050 PMID 10710235 ↗ · PMID 11907515 ↗ |
| 疾病關聯 | NSDHL 變異與 X 連鎖隱性 CK syndrome 有關；其臨床特徵涵蓋輕至重度認知障礙、癲癇、小頭症、大腦皮質畸形、面部特徵異常及體型瘦削。 | 含實驗來源 | 證據與來源CK syndrome CKS An X-linked recessive disorder characterized by mild to severe cognitive impairment, seizures, microcephaly, cerebral cortical malformations, dysmorphic facial features, and thin body habitus. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 300831 PMID 21129721 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTGGGTGCAGCCTGCTTGCGAGCTGAGGCCAGACAGGGG40GGCGCCTACGGACGGAAAAGAAAAGTTGATTACAAACGGG80ACCATATTTTGCTTCGAAATGGAACCAGCAGTTAGCGAGC120CAATGAGAGACCAAGTCGCACGGACTCATTTGACAGAGGA160CACTCCCAAAGTGAATGCTGACATAGAAAAGGTTAACCAG200AATCAGGCCAAGAGATGCACAGTGATCGGTGGCTCTGGAT240TCCTGGGGCAGCACATGGTGGAGCAGTTGCTGGCAAGAGG280ATATGCTGTCAATGTATTTGATATCCAGCAAGGGTTTGAT320AATCCCCAGGTGCGGTTCTTTCTGGGTGACCTCTGCAGCC360GACAGGATCTGTACCCAGCTCTGAAAGGTGTAAACACAGT400TTTCCACTGTGCGTCACCCCCACCATCCAGTAACAACAAG440GAGCTCTTTTATAGAGTGAATTACATTGGCACCAAGAATG480TCATTGAAACTTGCAAAGAGGCTGGGGTTCAGAAACTCAT520TTTAACCAGCAGTGCCAGTGTCATCTTTGAGGGCGTCGAT560ATCAAGAATGGAACTGAAGACCTTCCCTATGCCATGAAAC600CCATTGACTACTACACAGAGACTAAGATCTTACAGGAGAG640GGCAGTTCTGGGCGCCAACGATCCTGAGAAGAATTTCTTA680ACCACAGCCATCCGCCCTCATGGCATTTTCGGCCCAAGGG720ACCCGCAGTTGGTACCCATCCTCATCGAGGCAGCCAGGAA760CGGCAAGATGAAGTTCGTGATTGGAAATGGGAAGAACTTG800GTGGACTTCACCTTTGTGGAGAACGTGGTCCATGGACACA840TCCTGGCGGCAGAGCAGCTCTCCCGAGACTCGACACTGGG880TGGGAAGGCATTTCACATCACCAATGATGAGCCCATCCCT920TTCTGGACATTCCTGTCTCGCATCCTGACAGGCCTCAATT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。