基因總覽
NRIP3 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 nuclear receptor interacting protein 3。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 11p15.4。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000309166 ★ | 8,980,576–9,004,001 | 7 |
| ENST00000696747 | 8,965,682–9,004,651 | 9 |
| ENST00000534759 | 8,982,559–8,984,103 | 3 |
| ENST00000531142 | 8,983,518–8,985,756 | 3 |
| ENST00000531090 | 8,983,579–9,004,049 | 5 |
| ENST00000525100 | 8,985,771–9,004,001 | 4 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>NRIP3 ENST00000309166 GRCh38 chr11:9003901-9005001 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTCCAGAGTGAAAACGTGATTTGTGTCAAATCACAATGTCGAGACCAGAATCCAGGATGCCTGAAGGCCC GATTAGAATGGCTTAAAAGTATGGATTATTCAGGAAGAAAAACGGGTTCCAATCGCTCCTACTAAGGACG CTGGAGGGATGGTGAACGATCCTTTAGATGGTAAGCCCTAGCACTTATTGAGAAAAACAGGTGCTTCTTT GGTCGGAGAGCAGGTGTAGGGCTCGCAGCCGCGTGCGCTCCCGCGGAGGCGGGGGACCCTCGCCACTCCC CCGCCCCACGCCCACCCGCGGGCTTCCGACTGCACCTGCTCCCCCGGCTCGGAAACGCGGGCCGGGTGCC GGGCTGCAGGCAGAGGGTGCCCGGGGGAGGAGGTCCCGAAAGCCTCCTCCACACGCCTGCACCGGCTGCC CCCTCCCCAGTCACGTGGCCCGGTGGGTGGGGACCGACCTGAAGTTGGAGAAATCCGGAGCGCTCCCAAC CTCGGAGGGAGTCGCCAGTCCTCCGGGCCCGGGCGGTGGACCCTGGAGCCCCGGCTGGCGGCGTGGAGGT GCGTTTCTGAGAAGCCGAGCAGCGGCGCGGGCGGCGGGACTCGAGGCATGGCCCGGCTGTCGGTGATCCC CGGGTCGGCCACGGCGTGGACAGGTGAGCAGGTACCCGCGGCCAGCGGCAGAGATGGCCGGGGCTGCCAG GGCATCGGGCCCCAGAGCCCACGCCAGTCCAGGGGATGCGGGGCCCCCACGCAGGAGGGGGCGGTTGGGT GAAAAGGCCGCGGTGGATTCTCGGACTGCCGGGTCAGTCCCCACCAGCGCCGCCGCCTCCTCGCCGGCTT TGCCACCGGGTGAGCAGGGGACGCGGGACGCGGGACGCGGGACGCGAGGGAGCCGCGCGGGGCGTGGACT CTGTGCCGGCCCCGCCCCCCGCGCGCGCACTGGCTGCTCCCCGCGACGTCACGCTCGGCTATAAAAGGCG CGGCTCGGGGCCCTTGCGGCGCTGGAGGAGCTCGAGGCTGAGGCTGCCGGGGGGCTGTGGGCTACCGGGC CGCCGGCGCCTCAGCGATGTTTTACTCAGGGCTCCTCACTGAGGGCGGCCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| NRIP3_1 ↗ | 11:9,004,001 | 負股 | 9,003,991–9,004,050 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_B3R8C · enhancer · 9001675–9002197 · regulatory
ENSR11_895ZN · promoter · 9003991–9004153 · regulatory
ENSR11_95KHF · enhancer · 9004154–9004640 · regulatory
ENSR11_95KHK · promoter · 9004641–9005141 · regulatory
· motif · 9003671–9003679 · motif
· motif · 9003799–9003814 · motif
· motif · 9004103–9004119 · motif
· motif · 9004103–9004119 · motif
· motif · 9004563–9004572 · motif
· motif · 9004563–9004572 · motif
· motif · 9008239–9008245 · motif
· motif · 9008830–9008836 · motif
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- C14orf119Q9NWQ9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDC37Q16543 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EFHC1Q5JVL4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KASH5Q8N6L0 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- NUTF2P61970 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBL5Q9BZL1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GCTGGAGGAGCTCGAGGCTGAGGCTGCCGGGGGGCTGTGG40GCTACCGGGCCGCCGGCGCCTCAGCGATGTTTTACTCAGG80GCTCCTCACTGAGGGCGGCCGCAAGGAGACCGACATGCGG120GAGGCGGCGTCACTGCGACAGCAGCGCCGGATGAAGCAGG160CGGTGCAGTTCATCCACAAGGACTCCGCCGACCTGCTGCC200CCTGGACGGCCTCAAGAAGCTGGGCTCGTCCAAGGACATG240CAACCTCATAATATTCTGCAGAGGCGCCTCATGGAAACCA280ACCTGTCTAAGCTCCGAAGCGGTCCCCGTGTCCCTTGGGC320CTCTAAGACGAACAAACTCAATCAGGCTAAGTCTGAGGGG360CTAAAGAAGTCTGAGGAGGATGACATGATTTTGGTTTCTT400GCCAGTGTGCTGGAAAGGATGTGAAAGCCTTGGTTGACAC440AGGCTGCCTATATAATCTCATCTCTTTGGCCTGTGTGGAC480AGATTGGGACTCAAGGAGCATGTCAAATCCCACAAGCATG520AAGGAGAAAAGCTTTCTCTACCCCGGCATCTCAAAGTAGT560GGGCCAGATTGAGCACCTAGTGATCACACTGGGCTCCCTC600CGCCTGGACTGCCCAGCAGCTGTGGTTGATGACAATGAGA640AAAACTTGTCCCTTGGTCTACAGACTCTCCGATCTCTGAA680GTGCATCATAAACTTGGATAAGCACCGGCTGATCATGGGG720AAGACAGACAAGGAAGAAATCCCTTTTGTGGAGACAGTCT760CTTTGAATGAAGACAACACTTCAGAAGCATAACTACAGCC800TGCAGCATGTCTGCACGTGTGCATGCATACACACCGGGTT840GACAGATAGAGAAAACTGGGTTTGAACCAAATGCCGTAGT880GACTTGCTGTGGACCAAGTCCTTCCATCTAATAGAAGCTC920CAGGGGCTCCTTCCCATTCAGACCTCTCTAGACTATAGTC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。