基因總覽
NPVF 是蛋白質編碼基因,產物名稱為 neuropeptide VF precursor,屬於 FARP(FMRFamide related peptide)家族。此蛋白質長 196 個胺基酸,序列起始處具有 26 個胺基酸的訊號胜肽,且註記為分泌型。來源並未提供其成熟胜肽加工方式或其他結構區段的說明。功能註記涉及 cAMP 生成、促性腺激素合成與分泌、泌乳激素分泌,以及嗎啡誘發止痛作用;其中不同條目對 forskolin 誘發的 cAMP 生成抑制作用有不一致描述,且泌乳激素相關敘述標示為相似性推定。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000222674 ★ | 25,224,570–25,228,486 | 3 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
NPVF 的功能註記指出,其產物能有效抑制 forskolin 誘發的 cAMP 生成。另有功能紀錄描述它可強力負向調節促性腺激素的合成與分泌,並阻斷嗎啡誘發的止痛作用。這些敘述提供了不同的功能面向,但來源未說明各作用間的因果關係或具體分子機制,因此不宜據此推定其訊息傳遞路徑或作用靶點。
對泌乳激素的作用則有不同證據層級:資料註記 NPVF 會誘導泌乳激素分泌,但此項標示為「By similarity」,屬於相似性推定,而非此處明確列出的直接實驗證據。來源未交代這項推定的研究情境或限制,故不能進一步延伸其生理作用範圍。
不同功能條目對 cAMP 的結果並不一致:部分註記記載可有效抑制 forskolin 誘發的 cAMP 生成,另一條目則指出未見此抑制活性。來源沒有提供足以解釋差異的實驗條件或蛋白質形式資訊,因此應保留這項差異,不將其中一種結果視為普遍適用。綜合現有資料,NPVF 的功能紀錄涵蓋內分泌相關分泌調節與嗎啡止痛效應,但作用條件及各項功能間的關聯尚未由這些註記界定。
Promoter 與基因調控
>NPVF ENST00000222674 GRCh38 chr7:25228386-25229486 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGAAAGGGCTGAAGGGACTGGTGGGAACAAGTAAAGGTGTCTCTAGAACCCAGGCAGTCTAGTGATAAGG CAGATATTTAAGAACAGTCAGCTGCTCCAAAAGAGATTCGCTTTGGCATTTCAGTAAATGCGCATTTATT TCTGTAAATTCTCTTTTAATGTCATGATGACAGCACACCTTTGGCAATACGCGATTACCTAAATAATATG CGTCCTGGGACCAATAGAGTTAGCATGTGTATGACTTACCAAGCCCCTGCTAGTCTCCCTAAGGACTTTG AGAGGGAAGGTAGGATGCAGCATCTTGATAGAAAGTTTTGGTGATTGACACAGCTTTACCAAATAAGACC CATAGAGCAAATACAGAGGGCCTGACTGCCTCCAGCTTCTCCTGAGACGCCAGTTTGTCAAAATGCCTAT CAAGTATTTGCTCATATACACATCCTTCATGTTACGGCTAACATTGACCCCTGAAGCTTTTTAATAACCA AACAGCATTTTACAAAAAAACTAATTCATGGCATTTTGTTGGGATATTATAATTTTTTTCACATTCTTAA TTTTGCTTGACATTTTGAAAATACTACGCCTAACTCTTTTGTGCAGATTAAAAAAAAAAAAACATAGCTA GCATGGATTGAATACTTCCTTTTCCTTCCCTCAAGAATTGACACAAACACCAAAAACAAAATACTTTTTG TTTAAGCTTAGAGAAATGAAGCATTCTGTCTGTTTGGAATCTTAATTACTATCCCCCCAAACTTACCTAA TTAGAAGCTCTTTTATAATGAGGAAAATTATTTTCAAAGTTAATGAATTTGCAAGCACAAACATTGCTGT CTTCCCAGAATGAATTATTCACATTCCTTACATGCATATTTTAGTTGTACACTCTAATTAATATTAGTAC TTAAAATGTGTGAGATTGATTTCACTGTTTAAAAAAAACTTTCCTTTGTTTTTAGACGATATAAAAACAC CACAATTTTTTTCTCCTCTCATAAACATTGGGCTGCACATAGAGACTTAATTTTAGATTTAGACAAAATG GAAATTATTTCATCAAAACTATTCATTTTATTGACTTTAGCCACTTCAAGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| NPVF_1 ↗ | 7:25,228,486 | 負股 | 25,228,476–25,228,535 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:196 aa
neuropeptide VF precursor 長 196 個胺基酸,屬於 FARP(FMRFamide related peptide)家族。其序列第 1 至 26 個胺基酸被註記為訊號胜肽;來源未提供其他功能區域或成熟產物的序列界定。
蛋白質三維結構
細胞內定位
NPVF 的定位註記為分泌型;來源未提供會改變其定位的條件、異構型差異或細胞內動態資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- SGTAO43765 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBQLN2Q9UHD9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | NPVF 能有效抑制 forskolin 誘發的 cAMP 生成,並被記載為促性腺激素合成與分泌的強力負向調節因子。資料也指出它會誘導泌乳激素分泌,但此項作用僅標示為相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Efficiently inhibits forskolin-induced production of cAMP. Acts as a potent negative regulator of gonadotropin synthesis and secretion. Induces secretion of prolactin (By similarity) PMID 11025660 ↗ · PMID 20027225 ↗ |
| 功能 | 此功能註記記載,NPVF 能有效抑制 forskolin 誘發的 cAMP 生成,並阻斷嗎啡誘發的止痛作用;來源未在此條目中進一步說明這些作用的實驗情境或彼此關聯。 | 含實驗來源 | 證據與來源Efficiently inhibits forskolin-induced production of cAMP. Blocks morphine-induced analgesia PMID 11025660 ↗ · PMID 20027225 ↗ |
| 功能 | 此功能註記指出,NPVF 未顯示抑制 forskolin 誘發之 cAMP 生成的活性。來源未提供可用來解釋此結果與其他抑制作用註記差異的條件或蛋白質形式資訊。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | Secreted | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ATAAACATTGGGCTGCACATAGAGACTTAATTTTAGATTT40AGACAAAATGGAAATTATTTCATCAAAACTATTCATTTTA80TTGACTTTAGCCACTTCAAGCTTGTTAACATCAAACATTT120TTTGTGCAGATGAATTAGTGATGTCCAATCTTCACAGCAA160AGAAAATTATGACAAATATTCTGAGCCTAGAGGATACCCA200AAAGGGGAAAGAAGCCTCAATTTTGAGGAATTAAAAGATT240GGGGACCAAAAAATGTTATTAAGATGAGTACACCTGCAGT280CAATAAAATGCCACACTCCTTCGCCAACTTGCCATTGAGA320TTTGGGAGGAACGTTCAAGAAGAAAGAAGTGCTGGAGCAA360CAGCCAACCTGCCTCTGAGATCTGGAAGAAATATGGAGGT400GAGCCTCGTGAGACGTGTTCCTAACCTGCCCCAAAGGTTT440GGGAGAACAACAACAGCCAAAAGTGTCTGCAGGATGCTGA480GTGATTTGTGTCAAGGATCCATGCATTCACCATGTGCCAA520TGACTTATTTTACTCCATGACCTGCCAGCACCAAGAAATC560CAGAATCCCGATCAAAAACAGTCAAGGAGACTGCTATTCA600AGAAAATAGATGATGCAGAATTGAAACAAGAAAAATAAGA640AACCTGGAGCCTGTCCCTAAAGCTGTGGCCTGTAATCTAC680AAATGGCTCTATAGCGAAGACCACACGGAAGAGTAGCTAC720ATACACTTCATCAGCTATGGATCATCAACGGCAATTTTTC760CTTGTCAGTACAGCTATAATAGTATCTTGAAAGTTGTAAA800AAAATTAAAGCATATTTGTTACGTAAAGTTAAAATGATTT840TTGTCTGAATAAAAAAAAAGCATTGCAAATGCTTTAGAAA880TCTCTGATAATGGAGAGAGAGACAGAGGACCCTCCTCACT920ACCCTATATAAAAATCATTGGCACAGTTACACTTAATAAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。