基因總覽
NOXA1(NADPH oxidase activator 1)是由蛋白質編碼基因 NOXA1 產生的蛋白質,屬於 NCF2/NOXA1 family。其主要角色是作為 NADPH oxidase 的活化因子;來源指出它能活化 NOX1,也可能作用於 CYBB/gp91phox 與 NOX3。這些資料將 NOXA1 定位為氧化酶活性調控網絡中的一員,但未提供更完整的蛋白質生合成或表現資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000683555 ★ | 137,423,393–137,434,406 | 14 |
| ENST00000341349 | 137,423,219–137,434,406 | 14 |
| ENST00000392815 | 137,423,219–137,434,406 | 12 |
| ENST00000881438 | 137,423,219–137,434,451 | 14 |
| ENST00000881439 | 137,423,219–137,434,451 | 14 |
| ENST00000881440 | 137,423,219–137,434,451 | 14 |
| ENST00000881441 | 137,423,219–137,434,451 | 14 |
| ENST00000881442 | 137,423,219–137,434,406 | 14 |
| ENST00000881443 | 137,423,219–137,434,451 | 12 |
| ENST00000881444 | 137,423,219–137,434,451 | 14 |
| ENST00000881445 | 137,423,219–137,434,451 | 14 |
| ENST00000881446 | 137,423,219–137,434,451 | 14 |
顯示 12/22 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
NOXA1 的主要功能是活化 NOX1。NOX1 是可產生超氧化物的 NADPH oxidase,而 NOXA1 作為其活化因子,參與活性氧(ROS)的生成。現有資料支持這項主要作用,但未進一步說明 NOXA1 如何在分子層級促成 NOX1 的酵素活性。
由 NOXA1 參與的 ROS 生成與多種生物過程相關,包括宿主防禦、荷爾蒙生合成、氧感知及訊號傳遞。這些是 ROS 所參與的過程,來源並未將每一項過程限定為 NOXA1 在特定組織或情境中的直接作用,因此不宜據此推定其作用範圍或生理效果。
除了 NOX1,NOXA1 也可能活化 CYBB/gp91phox 與 NOX3。來源以「可能」描述這些作用,故其確定性低於對 NOX1 活化的陳述;目前資料亦未提供這些候選作用所適用的條件或其對各生物過程的具體影響。
Promoter 與基因調控
>NOXA1 ENST00000683555 GRCh38 chr9:137422393-137423493 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CACTACCCCTCGAGCCAAGTAACTATCCACTGATGACACCAAGCCGTGGTCAATCGCGAACCAATGCCAT TTCTACAAGCCAGTGAGCTCCTGGGCAACGTTCGAAACCACCTGCTCTCCGATGGGCTCTGTTTTCTTTA AAAACCTGAGCCTCTGTTTTGTTCTCCGTTGCACCTGGTGACCCAGGCCGCCCTCGACCTCTGTGCCTGA ATAAACCCACCGGGCACCACATTCTGACCCTTTTAATTATTTTAGGTTGACAACTAATACAGGACTCAGC GCCGGTGGACAGGAAGCCAGGGCCCCTGCAGGGAGGCGCCCGTCCCTTCTCCCGGGGAGGGCAGGGCGGG CGCGCGCGCGTCCCACCGGGAGCGCCTCCTCCTCGGCGAGGGAGCGAAGGGCCTCCGGGTCCTGTGATGT CCGTGCTCGGAAGGCGCGGAGGAGGGCAGGCCCTGCGGGACAGGGCGGCGGGGTCGCCGGGGTCGGCTCA GCTCCCCGCGGCGTCCGGCTGCTCGGCGGCCTCCGGAGCGGGGCCCTGCGGGAGAACGCACCTTCCCCGC CCCATCGGGGCCTCAGTTTCCCCACCCCGGGAGAGCCGGCGGCCCGCCCCCGGCTCACTCCCAGCTACGG CCCTCACCTCAGGACGCGCACCCGGCCCGGCCCCGCTCTGCCCCCGGCGCCCAGACCGCCCACCTGGCCC GCGCGGCCCGGGGTCGCTCACCTGCGGGGCCGGGACCGCCCCACACCGTCCACGCCCGGCGCGGAACCTT GGCCCGACCGCAGCCGCTGGCCCGGAGGGCTTTATCCGGCGCACCAAGGCCAGCGCGGGCGGGGCGAGGA AGCCGGGCGCACAAAGCTCCCGGCGGAAGTCCGGCCGGGGCGGGGGCCGAATGGGAGGTGGGCGAGGCCT GAGGGTCTGGAGTGGGCGTAGCCGTTTCTGGCGGGGGCGTGGCCTTACCGGGGAGGGGCGGGCGCCTGCC GCCAGGGGGCGCCGCGGGGCAGCGGGGTTGCACCTGGCGCTTGGCGCCCGCACCTCTGCCCGCCTCGGAG ACCCCGCAGCCCCGCGCCGCCGCCTGGCCCCGGCCCCGGCCCCTCCGCGGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| NOXA1_1 ↗ | 9:137,423,402 | 正股 | 137,423,353–137,423,412 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR9_B329CQ · enhancer · 137422327–137423144 · regulatory
ENSR9_942JPN · promoter · 137423145–137423405 · regulatory
ENSR9_537BPNC · CTCF_binding_site · 137423367–137423388 · regulatory
ENSR9_537BPRX · CTCF_binding_site · 137424143–137424164 · regulatory
ENSR9_B329D4 · enhancer · 137424714–137425292 · regulatory
ENSR9_537BPX9 · CTCF_binding_site · 137424862–137424883 · regulatory
ENSR9_8634HR · enhancer · 137425633–137425850 · regulatory
· motif · 137422583–137422595 · motif
· motif · 137422792–137422806 · motif
· motif · 137423217–137423227 · motif
· motif · 137423268–137423278 · motif
· motif · 137423269–137423282 · motif
· motif · 137423309–137423322 · motif
· motif · 137423314–137423324 · motif
· motif · 137423330–137423343 · motif
· motif · 137423335–137423345 · motif
· motif · 137423351–137423361 · motif
· motif · 137423356–137423366 · motif
· motif · 137423369–137423385 · motif
· motif · 137423401–137423410 · motif
· motif · 137423421–137423430 · motif
· motif · 137423523–137423533 · motif
· motif · 137423923–137423931 · motif
· motif · 137424145–137424161 · motif
· motif · 137424656–137424671 · motif
· motif · 137424661–137424673 · motif
· motif · 137424664–137424671 · motif
· motif · 137424864–137424880 · motif
· motif · 137424956–137424964 · motif
· motif · 137425125–137425137 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:476 aa
NOXA1 蛋白質長 476 個胺基酸,屬於 NCF2/NOXA1 family。其 N 端包含四個 TPR 重複區,第 1–224 個胺基酸所在區域註記為可介導與 RAC1 的交互作用;第 259–308 個胺基酸為無序區。C 端則含 PB1 domain(315–395)及 SH3 domain(399–458)。
蛋白質三維結構
細胞內定位
其轉移至膜的過程依賴 NOXO1 或 NCF1,也可能依賴 RAC1;來源對 RAC1 的作用保留不確定性,未提供更具體的轉位條件或動態資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 43 個夥伴
- NOXO1Q8NFA2 · UniProt INTERACTION · 2 experiments · 2 筆來源紀錄
- RIMBP3Q9UFD9 · UniProt INTERACTION · 4 experiments · 2 筆來源紀錄
- ACTMAPQ5BKX5-3 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- ANKRD55Q3KP44 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP70Q8NHQ1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CFPP27918 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CRYBA1P05813 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CTDSP1Q9GZU7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYSRT1A8MQ03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DCLRE1BQ9H816 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DDAH2O95865 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DUSP4Q13115 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GATAD2BQ8WXI9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IL16Q14005-2 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- KCTD15Q96SI1-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP15-1Q3LI76 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP19-4Q3LI73 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP19-7Q3SYF9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP8-1Q8IUC2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LASP1Q14847-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMO2P25791-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- METTL27Q8N6F8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MORN3Q6PF18 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MYLIPQ8WY64 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- NAA10P41227 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
NOXA1 與 NOX1、NOXO1、RAC1、CYBA 共同形成支持 ROS 生成的功能性多聚體複合體;另有資料指出它可與 NCF1 交互作用。NOXA1 也直接透過 N 端與 SH3PXD2A、SH3PXD2B 交互作用。YWHAZ 與 NOXA1 的交互作用會妨礙 NOXA1 與 NOXO1、RAC1 的互作及其膜定位,因而降低其活化 NOX1 的能力。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | NOXA1 可活化會產生超氧化物的 NADPH oxidase NOX1,並參與活性氧(ROS)的生成。ROS 與宿主防禦、荷爾蒙生合成、氧感知及訊號傳遞等過程有關。NOXA1 也可能活化 CYBB/gp91phox 與 NOX3。 | 含實驗來源 | 證據與來源Functions as an activator of NOX1, a superoxide-producing NADPH oxidase. Functions in the production of reactive oxygen species (ROS) which participate in a variety of biological processes including host defense, hormone biosynthesis, oxygen sensing and signal transduction. May also activate CYBB/gp91phox and NOX3 PMID 12657628 ↗ · PMID 12716910 ↗ · PMID 14617635 ↗ · PMID 14978110 ↗ · PMID 15181005 ↗ · PMID 15824103 ↗ · PMID 17602954 ↗ · PMID 19755710 ↗ |
| 交互作用 | NOX1、NOXA1、NOXO1、RAC1 與 CYBA 形成支持 ROS 生成的功能性多聚體複合體。YWHAZ 會阻止 NOXA1 與 NOXO1、RAC1 交互作用及其膜定位,降低 NOXA1 活化 NOX1 的能力。NOXA1 直接透過 N 端與 SH3PXD2A、SH3PXD2B 交互作用,並與 NCF1、RAC1、NOXO1 及 NOX1 交互作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源NOX1, NOXA1, NOXO1, RAC1 and CYBA forms a functional multimeric complex supporting ROS production. Interaction with YWHAZ prevents the interaction of NOXA1 with NOXO1 and RAC1 and its targeting to membranes, hence reducing its ability to activate NOX1. Interacts (via N-terminus) with SH3PXD2A and SH3PXD2B; the interaction is direct. Interacts with NCF1. Interacts with RAC1. Interacts with NOXO1. Interacts with NOX1 PMID 12716910 ↗ · PMID 16329988 ↗ · PMID 16636067 ↗ · PMID 16762923 ↗ · PMID 17126813 ↗ · PMID 17913709 ↗ · PMID 19755710 ↗ · PMID 20609497 ↗ |
| 細胞定位 | NOXA1 位於細胞質與細胞膜。NOXA1 轉移至膜的過程依賴 NOXO1 或 NCF1,也可能依賴 RAC1;來源對 RAC1 是否參與此定位轉移保留不確定性。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Cytoplasm; Cell membrane; Translocation to membranes depends on NOXO1 or NCF1 and maybe RAC1 |
核酸與蛋白質序列
AGCGGGGTTGCACCTGGCGCTTGGCGCCCGCACCTCTGCC40CGCCTCGGAGACCCCGCAGCCCCGCGCCGCCGCCTGGCCC80CGGCCCCGGCCCCTCCGCGGGATCCTGGCCCCTCCTCGAG120CGCCGCCACCGGCCGCCATGGCCTCTCTGGGGGACCTGGT160GCGCGCCTGGCACCTGGGCGCGCAGGCTGTGGATCGTGGG200GACTGGGCCCGCGCCTTGCACCTCTTCTCGGGCGTCCCGG240CGCCGCCCGCCAGGCTGTGCTTCAACGCGGGCTGCGTGCA280CCTGCTGGCCGGGGACCCCGAGGCCGCGCTGCGGGCATTT320GACCAAGCCGTGACCAAGGACACCTGCATGGCGGTTGGCT360TCTTCCAGCGAGGAGTGGCCAACTTCCAGCTGGCAAGGTT400CCAGGAGGCTCTGTCTGACTTCTGGCTGGCCCTGGAGCAG440CTGAGGGGCCACGCTGCCATCGACTACACGCAGCTGGGCC480TGCGGTTCAAGCTGCAAGCCTGGGAGGTGCTACACAATGT520GGCGTCGGCACAGTGCCAGCTGGGGCTCTGGACAGAGGCG560GCCAGCAGCCTAAGGGAGGCCATGTCCAAGTGGCCGGAGG600GGTCCCTGAATGGCCTGGACTCAGCCCTGGACCAAGTGCA640GAGACGGGGCTCACTGCCGCCACGGCAGGTCCCCAGGGGC680GAGGTCTTCCGGCCCCACCGGTGGCACCTGAAGCACTTGG720AGCCCGTGGATTTCCTGGGCAAGGCCAAGGTGGTGGCCTC760TGCCATCCCCGACGACCAGGGCTGGGGCGTCCGCCCTCAG800CAGCCACAGGGACCAGGAGCGAACCATGATGCCAGGTCCC840TAATCATGGACTCCCCAAGAGCTGGCACCCACCAGGGCCC880CCTCGATGCAGAGACAGAGGTCGGTGCTGACCGCTGCACG920TCGACTGCCTACCAGGAGCAGAGGCCCCAGGTGGAGCAAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。