基因總覽
NID2 是蛋白質編碼基因，產物 nidogen 2 為細胞黏附糖蛋白，廣泛分布於基底膜。來源指出它與多種細胞外基質成分結合，並可能參與細胞與細胞外基質之間的相互作用。這些資料呈現 nidogen 2 作為基底膜相關蛋白的基本性質；其具體結構特徵見蛋白質特徵段落。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000216286 ★ | 52,004,809–52,069,059 | 22 |
| ENST00001139317 | 52,001,787–52,069,274 | 22 |
| ENST00000556572 | 52,005,455–52,038,952 | 13 |
| ENST00001111464 | 52,049,192–52,069,274 | 5 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
nidogen 2 是一種細胞黏附糖蛋白，廣泛分布於基底膜。來源資料指出，它可與 I 型及 IV 型膠原蛋白、perlecan 和 laminin 1 結合，顯示其能與多種細胞外基質成分發生結合。這些結合對象包括不同類型的膠原蛋白及其他基底膜成分。
資料亦明確指出，nidogen 2 不與 fibulins 結合，因此其與基質成分的結合並非對所有相關蛋白都成立。來源沒有提供這些結合的分子機制或實驗條件，故不宜據此延伸推論其作用方式。
nidogen 2 可能參與細胞與細胞外基質之間的相互作用；此角色在來源中以可能性描述，而非確定結論。現有資料支持其基底膜分布、特定基質結合對象，以及可能涉及細胞—基質互動，但未詳述相關細胞過程或其生物學後果。
Promoter 與基因調控
>NID2 ENST00000216286 GRCh38 chr14:52068959-52070059 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTCCTGAGGCTTCGCAGAGGGGATGTTTATGGTGGATGGGGTTCCCCTTCTCCTGCGCAGCTGGTTTCGA GGTTGTGCGGTTTCCAGTCCTGCGGAGCAGCTCAGGTTACCGCCTCCGTGGCCGCGGGGGAGGGCATCTC CGACGGCCGCAGCAATGGGCAAGAGATCAGGGTCTTCCCATCCCCGCGACTCGCCCCTTTCTGCCTGGTA ACCAAGCGGGATGCCTCATCCTACTCCCCAAACGGAGCGGATCACACACAGTAGTATTTCATGGTCTTTC CTGCTGCGGTTTTCCCGGGGGAAGGTACTTCCAGAGGGTGGCCAAGTCTTCCCTAGCGGCCGGCCTTCGG GAGGGGGACAGAACTTAGGAGTCAGCCCTCTGCCTTCGTACAAAGGCTCGCTTCTCCTCAGGGCGTCTCT GGGTGGAGCGAAGCGGCCGAGGGGACCACGACAATGTCCCTTTGCTTTTCGGACCGATGGCCAGGCCTCC AGAGCCAGGAGCGCCCGGGACCCCAGGGCAGGGAGCAAAGCTCATACCGCAACCCCGCCACCCGCCCGCG CCCTGCCAGCCTGTTGGGGCCACAGCGCGCAGGCCAGCAGCCGCACTCGCCGCTGCGGGGTTCCCTTTGC GCTGAGCTCATCTCCTGCAACGCCGCTGCCCCAAACCTTGCGGGCCATTTGGTCCCGGGGGTGGGGCTCC TTGGGGGCCGCGGGGCAGCCCGGATGAGAGGATGACCCGGGAGCTCCCTGGGGGCGGAGTGGAAGGGGCA GCTCCAGGCAGCCCTGGCCAGGAGCTTTTACCCCGCCAGCCCCGCTGCTCCAGCGGCCGCTGCCTTAGAA AAGTTAACGAGAACCAGATGTGGTGGCCACTGCCGAACTTTCTCAGAGCCGGTGATTGGTCCCCAGCCGA GGGCCTCAGCCAATTAGCTTGCTGGGTGGGCCTGGAGTCCCGCCCCGCCCAGGCGCCCGCGGAGATCCAG GTTCGAGGCTGGCGCGGCGCGGAGAGTGGGCTGGAGGCCGGGGCGGGACGCGTTGTGCAGCGGGTAAGCG CACGGCCGAGCGAGCATGGAGGGGGACCGGGTGGCCGGGCGGCCGGTGCTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| NID2_1 ↗ | 14:52,069,058 | 負股 | 52,069,048–52,069,107 |
| NID2_2 ↗ | 14:52,069,638 | 負股 | 52,069,628–52,069,687 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR14_9QN2C · promoter · 52069049–52069549 · regulatory
ENSR14_9QN34 · enhancer · 52071748–52072020 · regulatory
ENSR14_BDC2Q · enhancer · 52073095–52073636 · regulatory
· motif · 52069098–52069108 · motif
· motif · 52069759–52069776 · motif
· motif · 52069768–52069776 · motif
· motif · 52069977–52069985 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1375 aa
nidogen 2 長 1,375 個胺基酸，具有 NIDO 結構域、Nidogen G2 beta-barrel、五個 EGF-like 結構域（其中兩個標示為 calcium-binding）及兩個 Thyroglobulin type-1 結構域。其 C 端另有五個 LDL-receptor class B 重複序列；序列中並註記兩段無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
nidogen 2 為分泌蛋白，定位於細胞外空間、細胞外基質及基底膜。 來源未提供其定位變化條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
nidogen 2 與 LAMA2、COL13A1 及 EFEMP2 有互作記錄；其中與 LAMA2、EFEMP2 的互作標示為依相似性推定。來源未說明這些互作是否形成特定複合體，也未提供其功能關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | nidogen 2 是廣泛分布於基底膜的細胞黏附糖蛋白，可與 I 型及 IV 型膠原蛋白、perlecan 和 laminin 1 結合，但不與 fibulins 結合；它可能參與細胞與細胞外基質之間的相互作用。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Cell adhesion glycoprotein which is widely distributed in basement membranes. Binds to collagens I and IV, to perlecan and to laminin 1. Does not bind fibulins. It probably has a role in cell-extracellular matrix interactions |
| 交互作用 | nidogen 2 與 LAMA2、COL13A1 及 EFEMP2 有互作記錄；與 LAMA2 和 EFEMP2 的互作依相似性推定，來源未對 COL13A1 的互作標示此類推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with LAMA2 (By similarity). Interacts with COL13A1. Interacts with EFEMP2 (By similarity) PMID 11956183 ↗ |
| 細胞定位 | nidogen 2 被註記為分泌蛋白，定位於細胞外空間、細胞外基質及基底膜。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GGAGAGTGGGCTGGAGGCCGGGGCGGGACGCGTTGTGCAG40CGGGTAAGCGCACGGCCGAGCGAGCATGGAGGGGGACCGG80GTGGCCGGGCGGCCGGTGCTGTCGTCGTTACCAGTGCTAC120TGCTGCTGCCGTTGCTAATGTTGCGGGCCGCGGCGCTGCA160CCCAGACGAGCTCTTCCCACACGGGGAGTCGTGGGGGGAC200CAGCTCCTGCAGGAAGGCGACGACGAAAGCTCAGCCGTGG240TGAAGCTGGCGAATCCCCTGCACTTCTACGAAGCCCGATT280CAGCAACCTCTACGTGGGCACCAACGGCATCATCTCCACT320CAGGACTTCCCCAGGGAAACGCAGTATGTGGACTATGATT360TCCCCACCGACTTCCCGGCCATCGCCCCTTTTCTGGCGGA400CATCGACACGAGCCACGGCAGAGGCCGAGTCCTGTACCGA440GAGGACACCTCCCCCGCAGTGCTGGGCCTGGCCGCCCGCT480ATGTGCGCGCTGGCTTCCCGCGCTCTGCGCGCTTTACCCC520CACCCACGCCTTCCTGGCCACCTGGGAGCAGGTAGGCGCT560TACGAGGAGGTCAAGCGCGGGGCGCTGCCCTCGGGAGAGC600TGAACACTTTCCAGGCAGTTTTGGCATCTGATGGGTCTGA640TAGCTACGCCCTCTTTCTTTATCCTGCCAACGGCCTGCAG680TTCCTTGGAACCCGCCCCAAAGAGTCTTACAATGTCCAGC720TTCAGCTTCCAGCTCGGGTGGGCTTCTGCCGAGGGGAGGC760TGATGATCTGAAGTCAGAAGGACCATATTTCAGCTTGACT800AGCACTGAACAGTCTGTGAAAAATCTCTATCAACTAAGCA840ACCTGGGGATCCCTGGAGTGTGGGCTTTCCATATCGGCAG880CACTTCCCCGTTGGACAATGTCAGGCCAGCTGCAGTTGGA920GACCTTTCCGCTGCCCACTCTTCTGTTCCCCTGGGACGTT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。