基因總覽
NHP2 基因是位於人類第 5 號染色體的蛋白質編碼基因，其正式名稱為 NHP2 ribonucleoprotein。產物屬於真核生物核糖體蛋白 eL8 家族，並參與兩類核糖核蛋白複合體：H/ACA 小核仁核糖核蛋白複合體，以及端粒酶全酶。這些複合體與 RNA 的處理和端粒維持相關，使 NHP2 在核糖體生成與端粒相關過程中具有重要角色。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000274606 ★ | 178,149,463–178,153,885 | 4 |
| ENST00001130074 | 178,139,872–178,153,961 | 3 |
| ENST00001130075 | 178,142,157–178,153,961 | 4 |
| ENST00001112330 | 178,142,164–178,153,961 | 4 |
| ENST00000940844 | 178,149,459–178,153,961 | 3 |
| ENST00000314397 | 178,149,463–178,153,961 | 3 |
| ENST00000890268 | 178,149,463–178,153,961 | 4 |
| ENST00000940843 | 178,149,463–178,153,961 | 4 |
| ENST00000975146 | 178,149,463–178,153,961 | 4 |
| ENST00001079288 | 178,149,463–178,153,961 | 4 |
| ENST00001079289 | 178,149,463–178,153,961 | 4 |
| ENST00001101778 | 178,149,463–178,153,961 | 3 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
NHP2 參與核糖體生成與端粒維持。它是 H/ACA 小核仁核糖核蛋白複合體（H/ACA snoRNP）的組成成分；此複合體可催化核糖體 RNA（rRNA）的假尿苷化。此修飾將尿苷異構化，使核糖由原本連接於 N1 的位置改為連接於 C5，形成假尿苷。單一 rRNA 最多可含有 100 個假尿苷殘基，這些修飾可能有助於穩定 rRNA 的構形。
NHP2 在 H/ACA snoRNP 中的角色，與該複合體對 RNA 修飾的作用相連；這項 RNA 修飾是其參與核糖體生成的功能依據。來源指出複合體催化假尿苷化，但未進一步說明 NHP2 本身是否具有催化活性，因此不應將複合體的催化功能直接歸為 NHP2 單獨執行。
NHP2 也與端粒酶相關的端粒維持相連。它可能是 TERC 正確加工或在細胞核內運輸所需的因子；TERC 是端粒酶反轉錄酶（TERT）全酶中的 RNA 成分。這項作用以可能性表述，來源未指定其加工或運輸機制，也未說明兩者何者是主要作用。整體而言，資料支持 NHP2 參與核糖體生成及端粒維持，並指出它可能透過影響 TERC 的處理或核內運輸支援端粒酶相關功能。
Promoter 與基因調控
>NHP2 ENST00000274606 GRCh38 chr5:178153785-178154885 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACCCGTCCAAAGGGTAGCTCCTCATAGCTCTCACCCTGCACGGCAGGGAGCTCAGTCCCCAAAGCCTTCC CTCCGCTGTTCCCGGCTTCGCTGGAGCCGTCCTTCCCTCAGCCCCGGCTGGCTTCTCGGCTAGGCCCTCT GCATGTGTAGCGTCAGGCAATGGTAAGAACTGCGGGAAAATAGCGGGTGAAGGGATGCTGGTTTGGAGAG AGAGGGGACGGCAATTTTAGATAAAATCACCAGGGAAACCTCTCCCATGGGAAACACTGAAACGGAACCC TGCGGGATGAGAGTGAGCCACACGCTATCTGTGGAAAAGCGGTGCAGACGCAGGTCAGTGGGGTCATCCC TTGCTCTGTATCTTTCACACCTGCGCAGCCGGGTCCAGGGGTCAGAAAACAAAGAAAAATTATGCAAGAA AGGAGGCAGCCTTAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGG CGGATCGCCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAACCCCTGTCTCTAGTAAAAAT ACAAAATTATCTGGGCGTGGTGGCGCATGCCTGCAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAAGTAGGAGAATC GCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGTCGAGATTGCGCCACTGTACCCCAGCCTGGGCAATAAG AGCGAAACTCTGCCTCAAAAAAGAAAAAAAACGAGGCAGCCTTTCCAGCACCCAGAGCCCCGCCCTCTCC GGCCCCGATTCCCAGGGCTCCGCCCCTTGCCTCACATTCCCTCCGCTCCGCCCTAATCGGTTCCGCCCAG TCCCTTGGTCCGGGGATGGCCCCGCCTTAAGGACCATGACTCCGCCCCTCTCCGCTCTCCGTAGTTACGA AGCTGGGCGTCAACGATTGGGCTGAGTCGGAGACTTCCTTTCCTGATTGGCCGTGTTGTACGGCGGCTTC TCGCGCAGCTGATGACCTGGAAGTGATGCCTAAAGCTGTGGACCGCGTGGGCTCGCCTCCCTGGGACTAG GTTTCAGCGGCCGCTGCGATGACCAAAATAAAGGCAGATCCCGACGGGCCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| NHP2_1 ↗ | 5:178,153,866 | 負股 | 178,153,856–178,153,915 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR5_B3BCL8 · enhancer · 178151155–178151883 · regulatory
ENSR5_53JWD7B · CTCF_binding_site · 178151241–178151262 · regulatory
ENSR5_878FGC · promoter · 178153838–178154058 · regulatory
ENSR5_B3BCLM · enhancer · 178154059–178154932 · regulatory
· motif · 178150973–178150984 · motif
· motif · 178151243–178151259 · motif
· motif · 178153678–178153689 · motif
· motif · 178153678–178153689 · motif
· motif · 178153881–178153892 · motif
· motif · 178153997–178154007 · motif
· motif · 178154089–178154099 · motif
· motif · 178154119–178154129 · motif
· motif · 178154491–178154505 · motif
· motif · 178154492–178154505 · motif
· motif · 178155917–178155930 · motif
· motif · 178155979–178155991 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：153 aa
NHP2 ribonucleoprotein 屬於真核生物核糖體蛋白 eL8 家族。來源未提供其胺基酸長度、結構域、功能區域或其他序列註解，因此無法進一步描述蛋白質結構細節。
蛋白質三維結構
細胞內定位
NHP2 定位於細胞核中的核仁與 Cajal bodies（coiled bodies）。 來源未提供定位隨條件或異構型改變的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NOP10Q9NPE3 · UniProt INTERACTION · 12 experiments
NHP2 是 H/ACA snoRNP 複合體的成分；此複合體的穩定核心由一或兩個 NOP10-DKC1 異二聚體與 NHP2 結合形成，GAR1 再經由 DKC1 加入。複合體可結合 box H/ACA snoRNA，也與 TERC 互作；NHP2 與 GAR1 參與其對 snoRNA 或 TERC 的特定互作。NHP2 亦為端粒酶全酶的組成成分。來源另記載 H/ACA snoRNP 與 SMN 複合體的功能關係，但此互作由 GAR1 與 SMN1 或 SMN2 介導，且 SMN 複合體可能有助於 H/ACA snoRNP 正確組裝。
疾病與遺傳關聯
NHP2 基因變異與常染色體隱性遺傳的先天性角化不良第 2 型（DKCB2）相關。此罕見多系統疾病與端粒維持缺陷有關，常見特徵包括進行性骨髓衰竭，以及網狀皮膚色素沉著、指甲營養不良和黏膜白斑的臨床三聯徵。其他表現可能包括早發性白髮、再生不良性貧血、血小板偏低、骨質疏鬆、肺纖維化及肝纖維化；早期死亡常與骨髓衰竭、感染、嚴重肺部併發症或惡性腫瘤相關。來源指出致病變異影響此基因，但未提供特定變異資訊。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | NHP2 參與核糖體生成與端粒維持，並為 H/ACA 小核仁核糖核蛋白複合體的一部分；該複合體催化 rRNA 假尿苷化，使尿苷異構化，令核糖由連接 N1 改為連接 C5。每個 rRNA 最多可有 100 個假尿苷，可能有助穩定 rRNA 構形。NHP2 也可能是 TERC 正確加工或在細胞核內運輸所需因子。 | 含實驗來源 | 證據與來源Required for ribosome biogenesis and telomere maintenance. Part of the H/ACA small nucleolar ribonucleoprotein (H/ACA snoRNP) complex, which catalyzes pseudouridylation of rRNA. This involves the isomerization of uridine such that the ribose is subsequently attached to C5, instead of the normal N1. Each rRNA can contain up to 100 pseudouridine ('psi') residues, which may serve to stabilize the conformation of rRNAs. May also be required for correct processing or intranuclear trafficking of TERC, the RNA component of the telomerase reverse transcriptase (TERT) holoenzyme PMID 15044956 ↗ |
| 交互作用 | NHP2 與 GAR1、NOP10、DKC1 組成 H/ACA snoRNP；複合體核心由一或兩個 NOP10-DKC1 異二聚體結合 NHP2 形成，GAR1 再經 DKC1 加入。複合體結合可定位 RNA 修飾位點的 box H/ACA snoRNA，組裝期間則由 NAF1 取代 GAR1；複合體亦與 TERC 互作，特定 snoRNA 或 TERC 互作由 GAR1、NHP2 介導。H/ACA snoRNP 與 SMN 複合體的互作由 GAR1 和 SMN1 或 SMN2 介導，後者可能促進其正確組裝。NHP2 也是端粒酶全酶成分。 | 含實驗來源 | 證據與來源Part of the H/ACA small nucleolar ribonucleoprotein (H/ACA snoRNP) complex, which contains NHP2/NOLA2, GAR1/NOLA1, NOP10/NOLA3, and DKC1/NOLA4, which is presumed to be the catalytic subunit. The complex contains a stable core formed by binding of one or two NOP10-DKC1 heterodimers to NHP2; GAR1 subsequently binds to this core via DKC1. The complex binds a box H/ACA small nucleolar RNA (snoRNA), which may target the specific site of modification within the RNA substrate. During assembly, the complex contains NAF1 instead of GAR1/NOLA1. The complex also interacts with TERC, which contains a 3'-terminal domain related to the box H/ACA snoRNAs. Specific interactions with snoRNAs or TERC are mediated by GAR1 and NHP2. Associates with NOLC1/NOPP140. H/ACA snoRNPs interact with the SMN complex, consisting of SMN1 or SMN2, GEMIN2/SIP1, DDX20/GEMIN3, and GEMIN4. This is mediated by interaction between GAR1 and SMN1 or SMN2. The SMN complex may be required for correct assembly of the H/ACA snoRNP complex. Component of the telomerase holoenzyme complex composed of one molecule of TERT, one molecule of WRAP53/TCAB1, two molecules of H/ACA ribonucleoprotein complex subunits DKC1, NOP10, NHP2 and GAR1, and a telomerase RNA template component (TERC). The telomerase holoenzyme complex is associated with TEP1, SMG6/EST1A and POT1 PMID 11074001 ↗ · PMID 19179534 ↗ · PMID 20351177 ↗ · PMID 29695869 ↗ |
| 細胞定位 | NHP2 定位於細胞核的核仁與 Cajal bodies（coiled bodies）。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Nucleus, nucleolus; Nucleus, Cajal body; Also localized to Cajal bodies (coiled bodies) |
| 疾病關聯 | NHP2 基因變異與常染色體隱性遺傳先天性角化不良第 2 型（DKCB2）相關，該罕見多系統疾病源於端粒維持缺陷。其特徵包括進行性骨髓衰竭，以及網狀皮膚色素沉著、指甲營養不良和黏膜白斑三聯徵；其他可變表現涵蓋早發白髮、再生不良性貧血、血小板偏低、骨質疏鬆、肺與肝纖維化。早期死亡常與骨髓衰竭、感染、致命肺部併發症或惡性腫瘤有關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Dyskeratosis congenita, autosomal recessive, 2 DKCB2 A rare multisystem disorder caused by defective telomere maintenance. It is characterized by progressive bone marrow failure, and the clinical triad of reticulated skin hyperpigmentation, nail dystrophy, and mucosal leukoplakia. Common but variable features include premature graying, aplastic anemia, low platelets, osteoporosis, pulmonary fibrosis, and liver fibrosis among others. Early mortality is often associated with bone marrow failure, infections, fatal pulmonary complications, or malignancy. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 613987 PMID 18523010 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AAGTGATGCCTAAAGCTGTGGACCGCGTGGGCTCGCCTCC40CTGGGACTAGGTTTCAGCGGCCGCTGCGATGACCAAAATA80AAGGCAGATCCCGACGGGCCCGAGGCTCAGGCGGAGGCGT120GTTCCGGGGAGCGCACCTACCAGGAGCTGCTGGTCAACCA160GAACCCCATCGCGCAGCCCCTGGCTTCTCGCCGCCTCACG200CGGAAGCTCTACAAATGCATCAAGAAAGCGGTGAAGCAGA240AGCAGATTCGGCGCGGGGTGAAAGAGGTTCAGAAATTTGT280CAACAAAGGAGAAAAAGGGATCATGGTTTTGGCAGGAGAC320ACACTGCCCATTGAGGTATACTGCCATCTCCCAGTCATGT360GTGAGGACCGAAATTTGCCCTATGTCTATATCCCCTCTAA400GACGGACCTGGGTGCAGCCGCAGGCTCCAAGCGCCCCACC440TGTGTGATAATGGTCAAGCCCCATGAGGAGTACCAGGAGG480CTTACGATGAGTGCCTGGAGGAGGTGCAGTCCCTGCCCCT520ACCCCTATGAGGGGCTCCGGTAGCACCTGGGCACCTGCCG560CTGGAAGCTATTGGGCTGGCAGCAGGACGACTGGCTGTCC600TCCTGCCCACCCACACTGACGGCATCTTCCCAGTTCCCCA640AGGCACGCCTTCTTCCCAGGCAGCTCTAACAGCCCTTTCA680TGAAGGTAATGCTAGTCTTCTGTCCATCAGTGCCATTTCC720TGTAGAACTAAAGGCTGTTCCAAGAATGTGGGGTGGGGAA760AGTAAATGCTAAGACTAAAA780cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。