演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

NHERF2SIP-1

NHERF family PDZ scaffold protein 2

NHERF2 是具有兩個 PDZ 結構域的支架蛋白,可連結細胞膜蛋白與 ezrin/moesin/radixin 家族,並參與調控 SLC9A3。

Homo sapiens16p13.3UniProt Q15599
OFFICIAL SYMBOL
NHERF2
CHROMOSOME
16
UNIPROT
Q15599
PDB / ALPHAFOLD
2HE4
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

NHERF2(NHERF family PDZ scaffold protein 2)是蛋白質編碼基因,產物屬於含 PDZ 結構域的支架蛋白。其結構包含兩個 PDZ 結構域,能協助組織膜蛋白相關的分子連結。來源亦指出,NHERF2 除了具有細胞膜相關功能,可能在細胞核中作為支架蛋白;此核內角色仍以可能性描述。

Official symbol
NHERF2
Gene name
NHERF family PDZ scaffold protein 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11076
UniProt
Q15599
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SIP-1TKA-1NHERF-2E3KARPOCTS2SLC9A3R2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p13.3
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegNHERF2pq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr16:2,025,356–2,039,026
Gene span
13,671 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000424542 ★2,026,902–2,039,0267
ENST000005675042,025,356–2,036,3893
ENST000004323652,026,853–2,039,0257
ENST000009015242,026,853–2,039,0266
ENST000009015252,026,853–2,039,0267
ENST000009015262,026,853–2,038,4787
ENST000009601332,026,853–2,038,4847
ENST000009601342,026,853–2,039,0257
ENST000009601352,026,853–2,039,0256
ENST000009830762,026,853–2,038,4796
ENST000011180282,026,853–2,038,4797
ENST000011350492,026,853–2,039,0267

顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

NHERF2 是連結細胞膜蛋白與細胞骨架調節因子的支架蛋白。它可連接質膜蛋白與 ezrin/moesin/radixin 家族成員,協助將膜上的分子連至 actin 細胞骨架,並參與調節這些蛋白在細胞表面的表現。這種支架作用使膜蛋白與細胞骨架相關因子得以形成連結,但來源未進一步說明其調節表面表現的具體步驟。

NHERF2 也參與 SLC9A3 的調控。來源指出,SLC9A3 的 cAMP 介導磷酸化及抑制作用需要 NHERF2;因此,NHERF2 在這項訊號調控中具有必要角色。此描述指出了 cAMP、磷酸化與抑制之間的關聯,但未提供更細的分子機制。

除細胞膜相關功能外,NHERF2 也可能在細胞核中作為支架蛋白。這項核內功能在來源中以可能性陳述,並未進一步界定其作用對象或生物學結果。整體而言,來源支持 NHERF2 具備細胞膜蛋白與細胞骨架間的連結功能,並參與特定膜蛋白的訊號調控;其他核內作用仍有待更明確描述。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 2026902 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>NHERF2 ENST00000424542 GRCh38 chr16:2025902-2027002 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AAAATGCACTTAGGCCTAAATGATTTCACTGTGGTGGTGACTGTCCTGTTGGGGAAGGAGGGACACTCGT
GCTTCAGGTAGAGGCTGAGGGACGTGGACGGCTGTGGGCAGGGGAGGGGAGGCCTGCTGCCTGCCTGTGG
ACACTGTGGAGCAGCGCCTGTGCACACCCAGAGCTTAGAGCCCAAATAATTCAGTGGAGTGTAGCCCATG
TCAGGAGGTGGGTAGCAGGGACCCTCGAGACTCATATCCTTTTGTCACCCTGCAAAGTCACAGTCCAGGC
CTGGGGTGGGCTGGGACACAAGTGAGGGGGCCGGCCCGGCCAAGGGAAAGAATGGCAGCAGGGCGTGGGA
ACCGACGCGGTGCAGATAGGCCGAACACGGTGGGTAGGCCAGGGAGTCTCCCAGCCACTGGCCCCCAGGA
TGCAGGGAGGGGCTGCTGCGTGTCACTTTTAAAGCCCTTTTTGCCTCCTGGGCCCTCCTGAGACTCTGCC
CTGGGCCAGGGAGTCTCCCAGCCACTGGCTGGGAGGGATCCAGGTGAGACACAGCCGAGAGGAGACAGGC
AAGGGGGTCCGGAAGGGCTTCCCGGGGAGGGTGGGGAGGGCTGTGGCCCTTGTTCTTACCCTTTGGCCCC
TTTGTCGGGGTCCCTTGGCCTGGAGACCCTTTGTCCAACCCGTCGCCCACCTCAAGACCTGCCTCGATGC
TGCGCATACAGTAGGTATCCAATAAATGTTCCTGGGATAGAAGGCAAAGGCGCTGGCACCAAGGCGGCTG
CCCAGAGTAGGGGCGAGACAGAGAGGTCCCGGTGGTTAAGGGGTCCCCTAGCCCTGCCGCCTCCCCCTGC
CCCGCCTCGGGCTGGCCGGGCGCGGAGGTAGGGGCCTGGCCGGGACGGCTGGGACTGGAGGCGGGGGCGG
CCGGGCGGCGGGGGCGGGGAAGGGGCGGGCGCGGAGGCGGTGCCGCAGCCCGAGCCGGAGCCCGAGCCGG
ATCCCGAGGCGACGGGAGCCGAACAGGAGCCGCCGCTGAAGCCACCGCCGGGTGCCCAGCGCCGCCGCCG
CCCCCGAGCTCCCCCGCGCCCCTGCCCGCGGGCGGCCGGTGGGCAGCGGGC
NHERF2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC9A3R2_1 ↗16:2,026,902正股2,026,853–2,026,912

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_C7FD · enhancer · 2022564–2024467 · regulatory

ENSR16_BDT7 · promoter · 2026412–2026938 · regulatory

ENSR16_5GTNB · CTCF_binding_site · 2027647–2027668 · regulatory

ENSR16_5GW3T · CTCF_binding_site · 2029931–2029952 · regulatory

· motif · 2023275–2023284 · motif

· motif · 2023364–2023374 · motif

· motif · 2023383–2023393 · motif

· motif · 2026799–2026812 · motif

· motif · 2026816–2026829 · motif

· motif · 2026839–2026852 · motif

· motif · 2027175–2027187 · motif

· motif · 2027177–2027184 · motif

· motif · 2027613–2027620 · motif

· motif · 2027649–2027665 · motif

· motif · 2029933–2029949 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:337 aa

1 aa337 aa結構域功能區域
依 Q15599 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

NHERF2 蛋白全長為 337 個胺基酸,含有兩個 PDZ 結構域:PDZ 1 位於第 11–90 個胺基酸,PDZ 2 位於第 150–230 個胺基酸。另有兩段被註記為無序區,分別位於第 107–144 個及第 240–337 個胺基酸。

結構域PDZ 111–90 aa
結構域PDZ 2150–230 aa
功能區域Disordered107–144 aa
功能區域Disordered240–337 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2HE4…

PDB · 2HE4

X-ray · 1.45 A · A=147-230

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Endomembrane system;Nucleus;Apical cell membrane

NHERF2 位於內膜系統,並被註記為周邊膜蛋白,也可見於細胞核及頂端細胞膜。 腎小球上皮細胞中,NHERF2 與 EZR、PODXL 同定位於頂端細胞膜及足突側面;此定位描述標示為相似性推定。 核內訊號呈點狀分布。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Endomembrane system。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 50 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SIP-1NHERF2ABCC4ACE2AKAP10AMOTL1ANXA2APBA1APBA2APCARHGAP17ARHGEF16ASIC3CFTRCTNNA1CTNNB1DGKKDGKZDLG1DLG2DLG3DLG4DLGAP4DOCK4FRMPD1FRMPD2FRMPD4FZD7GRID2IPGRIP1GRIP2IL16KCNA5KCTD3KIDINS220KIR3DL3LNX1LNX2LPAR2MAGI1MAGI2MAP2K2MAPK12MCCMPDZNHERF1NHERF4OTULINPATJPBKPDGFRBPDZK1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 90 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

NHERF2 可形成同源二聚體,亦可與 NHERF1 形成異源二聚體,並與 PDZK1 結合。它可透過 PDZ 結構域與 PODXL 的 C 端 PDZ 結合基序 DTHL 互作;此互作於腎小球上皮細胞中被觀察到,但標示為相似性推定。來源另記載 NHERF2 與 ADRB2、SLC9A3、P2RY1、P2YR2、SRY、RDX、LPAR2、MCC、SGK1 及 KCNJ1/ROMK1 互作,並透過 PDZ 結構域與 SLC26A6 的異構型 4、5 互作。另有與 EZR、PODXL 及 NHERF2 同處複合體的描述,亦屬相似性推定。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能NHERF2 是支架蛋白,可連接質膜蛋白與 ezrin/moesin/radixin 家族成員,協助把膜蛋白連至 actin 細胞骨架,並調節其表面表現。NHERF2 也是 SLC9A3 受到 cAMP 介導磷酸化及抑制所必需的因子;此外,它可能在細胞核中擔任支架蛋白。含實驗來源
證據與來源

Scaffold protein that connects plasma membrane proteins with members of the ezrin/moesin/radixin family and thereby helps to link them to the actin cytoskeleton and to regulate their surface expression. Necessary for cAMP-mediated phosphorylation and inhibition of SLC9A3. May also act as scaffold protein in the nucleus

PMID 10455146 ↗ · PMID 18829453 ↗ · PMID 9096337 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用NHERF2 可形成同源二聚體,並與 NHERF1 形成異源二聚體,也會結合 PDZK1。來源記載它與 EZR、PODXL 位於同一複合體,並透過 PDZ 結構域和 PODXL 的 C 端 PDZ 結合基序 DTHL 互作;後者見於腎小球上皮細胞,相關描述標示為相似性推定。此外,NHERF2 與 ADRB2、SLC9A3、P2RY1、P2YR2、SRY、RDX、LPAR2、MCC、SGK1、KCNJ1/ROMK1 互作,並透過 PDZ 結構域與 SLC26A6 異構型 4、5 互作。含實驗來源
證據與來源

Homodimer, and heterodimer with NHERF1. Binds PDZK1. Found in a complex with EZR, PODXL and NHERF2 (By similarity). Interacts (via the PDZ domains) with PODXL (via the C-terminal PDZ-binding motif DTHL); interaction is detected in glomerular epithelium cells (By similarity). Binds ADRB2, SLC9A3, P2RY1, P2YR2, SRY, RDX and LPAR2. Interacts with MCC and PODXL. Interacts with SGK1 and KCNJ1/ROMK1. Interacts (via the PDZ domains) with SLC26A6 isoform 4 and isoform 5

PMID 10455146 ↗ · PMID 12444019 ↗ · PMID 14623317 ↗ · PMID 15143197 ↗ · PMID 15642748 ↗ · PMID 16615918 ↗ · PMID 19555689 ↗ · PMID 9054412 ↗ · PMID 9096337 ↗ · PMID 9671706 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位NHERF2 被註記為位於內膜系統的周邊膜蛋白,也可定位於細胞核與頂端細胞膜。在腎小球上皮細胞中,它與 EZR、PODXL 同定位於頂端細胞膜及足突側面;該同定位描述標示為相似性推定。其核內分布呈點狀。含實驗來源
證據與來源

Endomembrane system / Peripheral membrane protein; Nucleus; Apical cell membrane; Localizes with EZR and PODXL at the apical cell membrane of glomerular epithelium cells and the sides of the food processes (By similarity). Nuclear, in a punctate pattern

PMID 9054412 ↗

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000424542 · 2,160 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAACAGGAGCCGCCGCTGAAGCCACCGCCGGGTGCCCAGC40
41GCCGCCGCCGCCCCCGAGCTCCCCCGCGCCCCTGCCCGCG80
81GGCGGCCGGTGGGCAGCGGGCGCCATGGCCGCGCCGGAGC120
121CGCTGCGGCCGCGCCTGTGCCGCTTGGTGCGCGGAGAGCA160
161GGGCTACGGCTTCCACCTGCACGGCGAGAAGGGCCGCCGC200
201GGGCAGTTCATCCGGCGCGTGGAACCCGGTTCCCCCGCCG240
241AGGCCGCCGCGCTGCGCGCTGGGGACCGCCTGGTCGAGGT280
281CAACGGCGTCAACGTGGAGGGCGAGACGCACCACCAGGTG320
321GTGCAAAGGATCAAGGCTGTGGAGGGGCAGACTCGGCTGC360
361TGGTGGTGGACCAGGAGACAGATGAGGAGCTCCGCCGGCG400
401GCAGCTGACCTGTACCGAGGAGATGGCCCAGCGAGGGCTC440
441CCACCCGCCCACGACCCCTGGGAGCCGAAGCCAGACTGGG480
481CACACACCGGCAGCCACAGCTCCGAAGCTGGCAAGAAGGA520
521TGTCAGTGGGCCCCTGAGGGAGCTGCGCCCTCGGCTCTGC560
561CACCTGCGAAAGGGACCTCAGGGCTATGGGTTCAACCTGC600
601ATAGTGACAAGTCCCGGCCCGGCCAGTACATCCGCTCTGT640
641GGACCCGGGCTCACCTGCCGCCCGCTCTGGCCTCCGCGCC680
681CAGGACCGGCTCATTGAGGTGAACGGGCAGAATGTGGAGG720
721GACTGCGCCATGCTGAGGTGGTGGCCAGCATCAAGGCACG760
761GGAGGACGAGGCCCGGCTGCTGGTCGTGGACCCCGAGACA800
801GATGAACACTTCAAGCGGCTTCGGGTCACACCCACCGAGG840
841AGCACGTGGAAGGTCCTCTGCCGTCACCCGTCACCAATGG880
881AACCAGCCCTGCCCAGCTCAATGGTGGCTCTGCGTGCTCG920
921TCCCGAAGTGACCTGCCTGGTTCCGACAAGGACACTGAGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。