基因總覽
NHERF family PDZ scaffold protein 1 是由 NHERF1 編碼的蛋白質，屬於 PDZ 支架蛋白。它的作用特色在於可與多種細胞膜蛋白及細胞骨架相關蛋白連結，協助組織不同分子間的關係。蛋白質含有兩個 PDZ 結構域；來源亦將其部分區域註記為無序區。這些性質使 NHERF1 能參與細胞膜相關分子的組織與調節。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000262613 ★ | 74,748,628–74,769,353 | 6 |
| ENST00000851800 | 74,748,619–74,769,360 | 6 |
| ENST00000851801 | 74,748,619–74,769,360 | 5 |
| ENST00000851802 | 74,748,619–74,769,360 | 5 |
| ENST00000851803 | 74,748,619–74,769,360 | 6 |
| ENST00000851804 | 74,748,619–74,769,360 | 7 |
| ENST00000967136 | 74,748,619–74,769,360 | 6 |
| ENST00000996004 | 74,748,619–74,769,351 | 4 |
| ENST00000996006 | 74,748,619–74,769,350 | 5 |
| ENST00001141167 | 74,748,619–74,769,360 | 6 |
| ENST00000583369 | 74,748,652–74,768,582 | 3 |
| ENST00000413388 | 74,762,003–74,769,360 | 5 |
顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
NHERF1 是連結細胞膜蛋白與 ezrin/moesin/radixin 家族成員的支架蛋白，藉此協助它們與 actin 細胞骨架相連，並調節相關蛋白在細胞表面的表現。這種組織作用也涉及特定膜蛋白的運送與回收：NHERF1 是內化後 ADRB2 再循環所必需的因子，並參與 SLC9A3 活性及亞細胞位置的調節。
在 SLC9A3 的調控中，NHERF1 亦是 cAMP 介導其磷酸化與抑制所必需的因子。此處的作用涵蓋訊號調控與轉運蛋白活性變化；來源並指出，NHERF1 最初即因參與 SLC9A3 的活性和定位調節而受到關注。
NHERF1 也參與其他生物學過程。它可能增強 Wnt 訊號，並可能參與 HTR4 導向微絨毛的過程；後者是依相似性推定。於腎臟近端小管，NHERF1 參與磷酸鹽再吸收的調節。此外，它參與精子獲能，並可能參與精子中氯離子與碳酸氫根離子恆定的調節。這些功能涵蓋膜蛋白調控、上皮轉運與精子生理，但來源對部分作用明確保留「可能」的推定程度。
Promoter 與基因調控
>NHERF1 ENST00000262613 GRCh38 chr17:74747628-74748728 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCCCCACCCCACCTCCCTAGCCAAACGCTGCTGCCAAAGCCCACGCTATTGCCCTAGATGGCCTGTCTTC AGCGGGCTGCCCCTCGAGGTCCCAGGCTCTCCGCGGAGCCCTCACCTTCCCAGCAGGGATCAGAACCTGC ACTCCTCTATGCGAGTCCTGGGACAGCACAAAGTGGATTAGGGTTAGGGTTCCCACAAACGGAAAAATGT TATTCAAACAACTCTGTAGGGTCCGAGGAGGCCCTCCGTCTTAATTCTCGAGACTGACCGGCCCTCGCTG CCCCGAGCGGGAGCAGTTGCCCCGGCAACAGCCGCTCCCTCTCAACTGGAGCTGCACCCAGGCTTTGGCT AAAGGCTGTTAAAACGTTGGCCAGGTGCGGTGGCTCACGTCTGTAATCCCAGGGCGGATCACCTGAGGTC AGGAGTTTGAAACCATCCTGGCCAACATGGCGAAATTTCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCGGGG CGTGGTGGTGCGCGCCTGTAACCCCAGCTGCTCGGGAGGCTGAGGCAGGGGAATCGCTTGAACCCGGGAG GCGGAGGTTGCAGTGATCCGAGATCGCGCCACGGCAGTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAGTTAGGGTCCTTTACCCGAGGGCCGGCTTTCCTCACTCCCCGCCACAGGTAGGG GAAACCAGGCCGGAGCCGGCGGGCCCACCCGCCCAGAACCGGGAATTCGGCGAGCCCCGCCCCTGCCACC CCAGCGCCGGCCGCTCGGTAACAAACACTTCCACTTCCTGAGCGCTAGTCTTCGCCCGCCGCGGGGCGCC GCGCCGAGCGCAGGCCCCGCCCCGCGCGTTCCCAATGGCCGGCGCCGTTCACCCGGCCGGAGCGCCCAGG CCTGCAGCCCCCTATTGGCCCGCGGAGGTCCCCACCCTCAGCGCGGCCCCGCCCCCGGGGTAAGGAGCCG GGGCGGACTCTGGGACGCTCAGACGCCGCGCGGGGCGGGGATTGGTCTGTGGTCCTCTCTCGGCTCCTCG CGGCTCGCGGCGGCCGACGGTTCCTGGGACACCTGCTTGCTTGGCCCGTCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC9A3R1_1 ↗ | 17:74,748,628 | 正股 | 74,748,579–74,748,638 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_5MKNBM · CTCF_binding_site · 74744773–74744794 · regulatory
ENSR17_C9F94 · enhancer · 74746480–74748421 · regulatory
ENSR17_847C58 · promoter · 74748422–74748638 · regulatory
ENSR17_934N3R · promoter · 74748902–74749402 · regulatory
ENSR17_5MKP3H · CTCF_binding_site · 74749058–74749079 · regulatory
ENSR17_C9F9C · enhancer · 74750403–74752126 · regulatory
· motif · 74744745–74744757 · motif
· motif · 74744775–74744791 · motif
· motif · 74748381–74748391 · motif
· motif · 74748481–74748491 · motif
· motif · 74748583–74748593 · motif
· motif · 74748705–74748714 · motif
· motif · 74748923–74748932 · motif
· motif · 74748958–74748967 · motif
· motif · 74749060–74749076 · motif
· motif · 74749064–74749073 · motif
· motif · 74750198–74750213 · motif
· motif · 74750198–74750213 · motif
· motif · 74750287–74750300 · motif
· motif · 74750287–74750300 · motif
· motif · 74750322–74750335 · motif
· motif · 74750387–74750397 · motif
· motif · 74750430–74750443 · motif
· motif · 74750430–74750445 · motif
· motif · 74750591–74750601 · motif
· motif · 74750683–74750698 · motif
· motif · 74750683–74750698 · motif
· motif · 74750684–74750698 · motif
· motif · 74750738–74750753 · motif
· motif · 74750738–74750753 · motif
· motif · 74750739–74750753 · motif
· motif · 74750762–74750772 · motif
· motif · 74750766–74750776 · motif
· motif · 74750768–74750778 · motif
· motif · 74750772–74750782 · motif
來源指出，NHERF1 受 estrogen 調控；未提供更具體的調控方式或條件。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：358 aa
NHERF1 蛋白長 358 個胺基酸，含有兩個 PDZ 結構域：PDZ 1 位於第 14–94 個胺基酸，PDZ 2 位於第 154–234 個胺基酸。另有兩段被註記為無序區，分別位於第 114–192 個及第 277–358 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
NHERF1 可由細胞質移至細胞頂端膜，此轉位依賴 PODXL。 它與 CFTR 在精子尾部中段共定位的描述依相似性推定；在其他來源所述細胞中，則見於富含微絨毛的頂端區域、膜皺褶、絲狀偽足或 T 細胞脂筏。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Endomembrane system；Cell projection, filopodium；Cell projection, ruffle；Cell projection, microvillus。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 47 個夥伴
- ACE2Q9BYF1 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- ADRB2P07550 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APPBP2Q92624 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ASIC3Q9UHC3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CFTRP13569 · UniProt INTERACTION · 26 experiments
- CRABP1P29762 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CREBBPQ92793 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG1Q12959 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG2Q15700 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG3Q92796 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG4P78352 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLGAP4Q9Y2H0-1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DOCK4Q8N1I0 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- EZRP15311 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- FRMPD2Q68DX3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FRMPD4Q14CM0 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GPER1Q99527 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- GRID2IPA4D2P6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRIP1Q9Y3R0 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GRIP2Q9C0E4 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- IL16Q14005 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX2Q8N448 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI1Q96QZ7 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
NHERF1 可形成同源二聚體，也可與 NHERF2 形成異源二聚體；它與多種蛋白質有結合或交互作用，包括 ezrin、radixin、moesin、CFTR、ADRB2、PODXL 及多種轉運蛋白。它也參與特定複合體：靜止 T 細胞中可形成 PAG1-NHERF1-MSN 複合體，TCR 活化時此複合體會解離；另與 CFTR、SLC4A7 形成複合體，亦與 SLC4A7、ATP6V1B1 形成複合體。PODXL 交互作用在腎小球上皮細胞中未被偵測到；來源並指出該作用可發生於分泌途徑早期，且對 PODXL 頂端膜分選是必要的。NHERF1 與 ACE2 的交互作用則可能增強 ACE2 在細胞膜上的停留。
疾病與遺傳關聯
NHERF1 基因變異與低磷血症性腎結石／骨質疏鬆症 2（NPHLOP2）相關。此疾病的特徵包括腎臟磷酸鹽吸收降低、腎性磷酸鹽流失、低磷血症、高磷酸尿、高鈣尿、腎結石及骨質疏鬆；來源將病因描述為影響此基因的變異。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | NHERF1 是連結細胞膜蛋白與 ezrin/moesin/radixin 家族成員的支架蛋白，可協助連結 actin 細胞骨架並調節表面表現。它是內化 ADRB2 再循環及 cAMP 介導 SLC9A3 磷酸化與抑制所必需，也參與 SLC9A3 活性、定位、腎近端小管磷酸鹽再吸收與精子獲能調節；增強 Wnt 訊號、HTR4 導向微絨毛及精子離子恆定則為可能作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Scaffold protein that connects plasma membrane proteins with members of the ezrin/moesin/radixin family and thereby helps to link them to the actin cytoskeleton and to regulate their surface expression. Necessary for recycling of internalized ADRB2. Was first known to play a role in the regulation of the activity and subcellular location of SLC9A3. Necessary for cAMP-mediated phosphorylation and inhibition of SLC9A3. May enhance Wnt signaling. May participate in HTR4 targeting to microvilli (By similarity). Involved in the regulation of phosphate reabsorption in the renal proximal tubules. Involved in sperm capacitation. May participate in the regulation of the chloride and bicarbonate homeostasis in spermatozoa PMID 10499588 ↗ · PMID 18784102 ↗ · PMID 9096337 ↗ · PMID 9430655 ↗ |
| 交互作用 | NHERF1 可形成同源二聚體或與 NHERF2 形成異源二聚體，並與多種蛋白質結合或交互作用。它參與靜止 T 細胞中的 PAG1-NHERF1-MSN 複合體，該複合體在 TCR 活化時解離；另與 CFTR、SLC4A7 及 ATP6V1B1 形成所述複合體。PODXL 交互作用在腎小球上皮細胞中未被偵測，與 ACE2 的交互作用則可能延長其膜上停留。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer, and heterodimer with NHERF2. Binds the N-termini of EZR, RDX and MSN. Binds the C-termini of PDGFRA, PDGFRB, ADRB2, NOS2 and CFTR. Binds ARHGAP17, EPI64, RACK1, OPRK1, GNAQ, CTNNB1 and PLCB3. Binds PDZK1 (By similarity). Interacts with CLCN3. Binds the C-terminus of PAG1. In resting T-cells, part of a PAG1-NHERF1-MSN complex which is disrupted upon TCR activation. Forms a complex with CFTR and SLC4A7. Forms a complex with SLC4A7 and ATP6V1B1. Interacts with TRPC4 (via the PDZ-binding domain). Directly interacts with HTR4 (By similarity). Interacts (via the PDZ 1 domain) with PODXL (via the C-terminal PDZ-binding motif DTHL); interaction is not detected in glomerular epithelium cells. Interacts (via the PDZ 1 domain) with PODXL (via the C-terminal PDZ-binding motif DTHL); the interaction take place early in the secretory pathway and is necessary for its apical membrane sorting (By similarity). Interacts with SLC26A3 (By similarity). Interacts with MCC. Interacts with SLC34A1. Interacts (via the PDZ domains) with SLC26A6 isoform 4 and isoform 5. Interacts (via PDZ domains) with ACE2 (via PDZ-binding motif); the interaction may enhance ACE2 membrane residence PMID 10499588 ↗ · PMID 11285285 ↗ · PMID 11304524 ↗ · PMID 11684085 ↗ · PMID 11882663 ↗ · PMID 11956211 ↗ · PMID 12004055 ↗ · PMID 12080081 ↗ · PMID 12154080 ↗ · PMID 12193606 ↗ · PMID 12403779 ↗ · PMID 12444018 ↗ · PMID 12444019 ↗ · PMID 12471024 ↗ · PMID 12830000 ↗ · PMID 15020681 ↗ · PMID 16615918 ↗ · PMID 19555689 ↗ · PMID 22506049 ↗ · PMID 34189428 ↗ · PMID 9096337 ↗ · PMID 9314537 ↗ · PMID 9430655 ↗ |
| 細胞定位 | NHERF1 位於細胞質、頂端細胞膜及內膜系統，也見於絲狀偽足、膜皺褶與微絨毛。它可依賴 PODXL 從細胞質轉至頂端膜；與 CFTR 在精子尾部中段共定位的描述依相似性推定。其他描述包括與合體滋養層微絨毛豐富的頂端區域 actin 共定位、出現在 HeLa 細胞的微絨毛、膜皺褶及絲狀偽足，以及存在於 T 細胞脂筏。 | 推論支持 | 證據與來源Cytoplasm; Apical cell membrane; Endomembrane system / Peripheral membrane protein; Cell projection, filopodium; Cell projection, ruffle; Cell projection, microvillus; Translocates from the cytoplasm to the apical cell membrane in a PODXL-dependent manner. Colocalizes with CFTR at the midpiece of sperm tail (By similarity). Colocalizes with actin in microvilli-rich apical regions of the syncytiotrophoblast. Found in microvilli, ruffling membrane and filopodia of HeLa cells. Present in lipid rafts of T-cells |
| 調控 | NHERF1 受 estrogen 調控。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | 影響 NHERF1 基因的變異可造成低磷血症性腎結石／骨質疏鬆症 2（NPHLOP2）。此病包括腎臟磷酸鹽吸收降低、腎性磷酸鹽流失、低磷血症、高磷酸尿、高鈣尿、腎結石及骨質疏鬆。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nephrolithiasis/osteoporosis, hypophosphatemic, 2 NPHLOP2 A disease characterized by decreased renal phosphate absorption, renal phosphate wasting, hypophosphatemia, hyperphosphaturia, hypercalciuria, nephrolithiasis and osteoporosis. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 612287 PMID 18784102 ↗ · PMID 22506049 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGACGCCGCGCGGGGCGGGGATTGGTCTGTGGTCCTCTCT40CGGCTCCTCGCGGCTCGCGGCGGCCGACGGTTCCTGGGAC80ACCTGCTTGCTTGGCCCGTCCGGCGGCTCAGGGCTTCTCT120GCTGCGCTCCCGGTTCGCTGGACGGGAAGAAGGGCTGGGC160CGTCCCGTCCCGTCCCCATCGGAACCCCAAGTCGCGCCGC200TGACCCGTCGCAGGGCGAGATGAGCGCGGACGCAGCGGCC240GGGGCGCCCCTGCCCCGGCTCTGCTGCCTGGAGAAGGGTC280CGAACGGCTACGGCTTCCACCTGCACGGGGAGAAGGGCAA320GTTGGGCCAGTACATCCGGCTGGTGGAGCCCGGCTCGCCG360GCCGAGAAGGCGGGGCTGCTGGCGGGGGACCGGCTGGTGG400AGGTGAACGGCGAAAACGTGGAGAAGGAGACCCACCAGCA440GGTGGTGAGCCGCATCCGCGCCGCACTCAACGCCGTGCGC480CTGCTGGTGGTCGACCCCGAGACGGACGAGCAGCTGCAGA520AGCTCGGCGTCCAGGTCCGAGAGGAGCTGCTGCGCGCCCA560GGAAGCGCCGGGGCAGGCCGAGCCGCCGGCCGCCGCCGAG600GTGCAGGGGGCTGGCAACGAAAATGAGCCTCGCGAGGCCG640ACAAGAGCCACCCGGAGCAGCGCGAGCTTCGGCCTCGGCT680CTGTACCATGAAGAAGGGCCCCAGTGGCTATGGCTTCAAC720CTGCACAGCGACAAGTCCAAGCCAGGCCAGTTCATCCGGT760CAGTGGACCCAGACTCCCCGGCTGAGGCTTCAGGGCTCCG800GGCCCAGGATCGCATTGTGGAGGTGAACGGGGTCTGCATG840GAGGGGAAGCAGCATGGGGACGTGGTGTCCGCCATCAGGG880CTGGCGGGGACGAGACCAAGCTGCTGGTGGTGGACAGGGA920AACTGACGAGTTCTTCAAGAAATGCAGAGTGATCCCATCT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。