演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

NEUROG2Atoh4

neurogenin 2

NEUROG2 是編碼 neurogenin 2 的蛋白質基因;其產物為轉錄調節因子,參與神經元分化。

Homo sapiens4q25UniProt Q9H2A3
OFFICIAL SYMBOL
NEUROG2
CHROMOSOME
4
UNIPROT
Q9H2A3
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

NEUROG2 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 neurogenin 2。其產物屬於轉錄調節因子,來源資料指出它參與神經元分化。蛋白質含有 bHLH 結構域;此結構特徵與其 DNA 結合所需的二聚化關係相符。現有資料未提供更多基因產物的家族分類或其他基本性質。

Official symbol
NEUROG2
Gene name
neurogenin 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13805
UniProt
Q9H2A3
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
Atoh4Math4Angn-2bHLHa8NGN2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 44q25
chr4 · 190,214,555 bp · GRCh38chr4p16.3 · 1–4500000 · gnegchr4p16.2 · 4500001–6000000 · gpos25chr4p16.1 · 6000001–11300000 · gnegchr4p15.33 · 11300001–15000000 · gpos50chr4p15.32 · 15000001–17700000 · gnegchr4p15.31 · 17700001–21300000 · gpos75chr4p15.2 · 21300001–27700000 · gnegchr4p15.1 · 27700001–35800000 · gpos100chr4p14 · 35800001–41200000 · gnegchr4p13 · 41200001–44600000 · gpos50chr4p12 · 44600001–48200000 · gnegchr4p11 · 48200001–50000000 · acenchr4q11 · 50000001–51800000 · acenchr4q12 · 51800001–58500000 · gnegchr4q13.1 · 58500001–65500000 · gpos100chr4q13.2 · 65500001–69400000 · gnegchr4q13.3 · 69400001–75300000 · gpos75chr4q21.1 · 75300001–78000000 · gnegchr4q21.21 · 78000001–81500000 · gpos50chr4q21.22 · 81500001–83200000 · gnegchr4q21.23 · 83200001–86000000 · gpos25chr4q21.3 · 86000001–87100000 · gnegchr4q22.1 · 87100001–92800000 · gpos75chr4q22.2 · 92800001–94200000 · gnegchr4q22.3 · 94200001–97900000 · gpos75chr4q23 · 97900001–100100000 · gnegchr4q24 · 100100001–106700000 · gpos50chr4q25 · 106700001–113200000 · gnegchr4q26 · 113200001–119900000 · gpos75chr4q27 · 119900001–122800000 · gnegchr4q28.1 · 122800001–127900000 · gpos50chr4q28.2 · 127900001–130100000 · gnegchr4q28.3 · 130100001–138500000 · gpos100chr4q31.1 · 138500001–140600000 · gnegchr4q31.21 · 140600001–145900000 · gpos25chr4q31.22 · 145900001–147500000 · gnegchr4q31.23 · 147500001–150200000 · gpos25chr4q31.3 · 150200001–154600000 · gnegchr4q32.1 · 154600001–160800000 · gpos100chr4q32.2 · 160800001–163600000 · gnegchr4q32.3 · 163600001–169200000 · gpos100chr4q33 · 169200001–171000000 · gnegchr4q34.1 · 171000001–175400000 · gpos75chr4q34.2 · 175400001–176600000 · gnegchr4q34.3 · 176600001–182300000 · gpos100chr4q35.1 · 182300001–186200000 · gnegchr4q35.2 · 186200001–190214555 · gpos25NEUROG2pq1 bp190,214,555 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr4:112,513,516–112,516,180
Gene span
2,665 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000313341 ★112,513,516–112,516,1802

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

neurogenin 2 是轉錄調節因子,參與神經元分化。來源資料指出,它可藉由結合 E box 序列來活化轉錄;該序列以 5'-CANNTG-3' 表示。這項描述將其 DNA 序列辨識與轉錄活化相連,但未進一步說明受調控的特定基因或轉錄活化的分子步驟。

neurogenin 2 的有效 DNA 結合需要與另一個 bHLH 蛋白形成二聚體。此需求說明其 DNA 結合能力與蛋白質二聚化相關;資料並未指出另一個 bHLH 蛋白的名稱,也未交代二聚體的組成是否具有特定限制。

依現有資料,neurogenin 2 的功能可概括為透過辨識 E box 活化轉錄,並參與神經元分化。來源未提供其在分化過程中調控哪些目標基因、作用於何種細胞或發育階段等細節,因此無法據此進一步界定其具體調控範圍。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 112516180 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>NEUROG2 ENST00000313341 GRCh38 chr4:112516080-112517180 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GAGTGATTTCATTCTCACATCCTCTAAAAGCTCATCAACTGCTCCCCTATCCGACCTCCCCTCCCAAGAG
ACGCCTGTTTGAATCCCCAGTGTCCTCTCCCTTCACTCTCCCACGCCAGTTTCGACGGACCCCAAACACA
CTTGTTCACGAGGTGTCCACATCTCTCCATCCACGCCATTCTCCTCCCCTAACCAAATGAATCCATTTTA
AAATCGTTTACTATTTGATACAACCCCTAAGAGGCTTTGCCAAGAGACGCCCGGCAGCACCACAGGGCTA
ACTGCTTTCCCCGGGATTCTGACCCCCATTAACTAATTCCTAGTTCCCATCACCCGGGAGTTAGGAGGGC
CGGCAGCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGCGCGCGCCGGGCGGGGGGAGCCTCGGCGGCAGCGAGGACGAAGG
CGGGGGCGGTAGCACGGGTCCCCCCATCCGCCCCCAGCGCTCGGGCCCCTAATGAGCTGCTGAAAGGGAG
CGGGCTCCGGTGCGCGTGGCTCGCAGGCCTCCCGGAGTCCAGGGCGCCCTGATTGGCCAGCTGCGCCTCG
CGACCTCCATTCATTAATAAATTAGCGGCACGCTCCAGCCGAGCGCGAGCCACCAATCACAATGGACAGC
GGCGGCGACAACAGCCGCAGCTTGAGCCTCTGCGGCCGCTGCGGCTTCGCCAGCTCCGGCCGCAGCCCGG
AGCTCCAACAGGAGCTTTAGAACCATTTTATGTTGATTAGATAAAGGGGGAAAAGAGAGGCGGGGGTGGT
GGGAGGAGGAGGATGGATGGCAGGGCCAAGGGAGGGGGAAAGGCGGTGAAGAAAGAGGAAGAAATGAATG
ATGATAATGCAATGAAAAGAATAAGCCAGAGGAGGGAAAAGCGGGGGAGAAGGGGGGCAGGACTGACAGG
AGGAGGAGGCGGTGGCGGGGGAGGAGGGGGCCCGGGGCAGATCTGATTGTTTTCTTGGTGGTATATAAGG
GGTTTTAAGGAGAGTCGTGTGCCAGACACGCAGCCACTGAACCACAAGCAGCTTCGCGTTAACTGGAGTG
CCTGGGAGTCGCGTGCCAGGAGCCGCACGGCCAGGGACTGACTGACAGACA
NEUROG2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
NEUROG2_1 ↗4:112,516,180負股112,516,170–112,516,229

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR4_CF6FS · enhancer · 112510287–112512177 · regulatory

ENSR4_BSBW5 · promoter · 112513981–112514856 · regulatory

ENSR4_BSBW8 · promoter · 112514885–112515398 · regulatory

ENSR4_5ZGJNG · CTCF_binding_site · 112514920–112514941 · regulatory

ENSR4_BSBWB · enhancer · 112515399–112516169 · regulatory

ENSR4_93MMRS · promoter · 112516170–112516670 · regulatory

ENSR4_BSBWM · enhancer · 112517671–112518375 · regulatory

ENSR4_D7KPQ · enhancer · 112519953–112522036 · regulatory

ENSR4_6H89S2 · CTCF_binding_site · 112520443–112520476 · regulatory

ENSR4_5ZGKNN · CTCF_binding_site · 112520802–112520823 · regulatory

· motif · 112512712–112512725 · motif

· motif · 112512712–112512725 · motif

· motif · 112512779–112512791 · motif

· motif · 112514078–112514091 · motif

· motif · 112514233–112514248 · motif

· motif · 112514437–112514449 · motif

· motif · 112514602–112514622 · motif

· motif · 112514630–112514643 · motif

· motif · 112514811–112514824 · motif

· motif · 112514835–112514848 · motif

· motif · 112514922–112514938 · motif

· motif · 112514933–112514946 · motif

· motif · 112514939–112514952 · motif

· motif · 112514945–112514958 · motif

· motif · 112515093–112515110 · motif

· motif · 112515102–112515110 · motif

· motif · 112515381–112515388 · motif

· motif · 112515636–112515648 · motif

· motif · 112516147–112516162 · motif

· motif · 112516479–112516494 · motif

· motif · 112516504–112516521 · motif

· motif · 112516751–112516764 · motif

· motif · 112516875–112516882 · motif

· motif · 112517018–112517034 · motif

· motif · 112517108–112517121 · motif

· motif · 112517108–112517121 · motif

· motif · 112517302–112517315 · motif

· motif · 112517381–112517393 · motif

· motif · 112517384–112517391 · motif

· motif · 112517385–112517398 · motif

· motif · 112517595–112517608 · motif

· motif · 112517595–112517608 · motif

· motif · 112517631–112517653 · motif

· motif · 112517631–112517653 · motif

· motif · 112518227–112518238 · motif

· motif · 112518724–112518735 · motif

· motif · 112518725–112518736 · motif

· motif · 112520445–112520461 · motif

· motif · 112520457–112520473 · motif

· motif · 112520804–112520820 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:272 aa

1 aa272 aa結構域功能區域
依 Q9H2A3 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

neurogenin 2 長 272 個胺基酸,含有位於第 112 至 164 個胺基酸的 bHLH 結構域。資料另將第 30 至 69 位及第 197 至 264 位標註為無序區域。

結構域bHLH112–164 aa
功能區域Disordered30–69 aa
功能區域Disordered197–264 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9H2A3…

AlphaFold · Q9H2A3

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

neurogenin 2 的定位資料標示為細胞核;來源未提供定位變化的條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
Atoh4NEUROG2PFDN5
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

neurogenin 2 有效結合 DNA 需要與另一個 bHLH 蛋白二聚化。這項資料描述的是二聚化對 DNA 結合的必要性,未指出伴侶蛋白名稱,也未提供更具體的複合體組成或結合證據。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能neurogenin 2 是轉錄調節因子,參與神經元分化,並可藉由結合 E box 序列(5'-CANNTG-3')活化轉錄。來源未列出特定受調控基因或更進一步的作用機制。資料庫紀錄
證據與來源

Transcriptional regulator. Involved in neuronal differentiation. Activates transcription by binding to the E box (5'-CANNTG-3')

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用neurogenin 2 有效結合 DNA 需要與另一個 bHLH 蛋白二聚化。資料未指出該蛋白的名稱,也未提供二聚體的具體組成。推論支持
證據與來源

Efficient DNA binding requires dimerization with another bHLH protein

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位neurogenin 2 的細胞內定位標示為細胞核;此資料未說明定位變化的條件或異構型差異。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000313341 · 2,295 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GCCAGACACGCAGCCACTGAACCACAAGCAGCTTCGCGTT40
41AACTGGAGTGCCTGGGAGTCGCGTGCCAGGAGCCGCACGG80
81CCAGGGACTGACTGACAGACAGACACGCACCACCACCACA120
121ACACACGAGACCCGGGCGGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGG160
161GCTCTTGGCAAACTCGCCGGTCGCAGAGGTCCCCCGCGGA200
201GCTGCGCCACAGTAGCGCCGGGCTTGCAGCTTTCACGCCG240
241GGCGAAGGACCCGGCGCTGCGCTCGCAGCTGCGCGGAGAT280
281TCCCGGCACAGGCCAAAGTCACAGCAACGCTGAGGCACAG320
321TTAGAGCCAACTAAGATGTTCGTCAAATCCGAGACCTTGG360
361AGTTGAAGGAGGAAGAGGACGTGTTAGTGCTGCTCGGATC400
401GGCCTCCCCCGCCTTGGCGGCCCTGACCCCGCTGTCATCC440
441AGCGCCGACGAAGAAGAGGAGGAGGAGCCGGGCGCGTCAG480
481GCGGGGCGCGTCGGCAGCGCGGGGCTGAGGCCGGGCAGGG520
521GGCGCGGGGCGGCGTGGCTGCGGGTGCGGAGGGCTGCCGG560
561CCCGCACGGCTGCTGGGTCTGGTACACGATTGCAAACGGC600
601GCCCTTCCCGGGCGCGGGCCGTCTCCCGAGGCGCCAAGAC640
641GGCCGAGACGGTGCAGCGCATCAAGAAGACCCGTAGACTG680
681AAGGCCAACAACCGCGAGCGAAACCGCATGCACAACCTCA720
721ACGCGGCACTGGACGCGCTGCGCGAGGTGCTCCCCACGTT760
761CCCCGAGGACGCCAAGCTCACCAAGATCGAGACCCTGCGC800
801TTCGCCCACAACTACATCTGGGCACTCACCGAGACCCTGC840
841GCCTGGCGGATCACTGCGGGGGCGGCGGCGGGGGCCTGCC880
881GGGGGCGCTCTTCTCCGAGGCAGTGTTGCTGAGCCCGGGA920
921GGAGCCAGCGCCGCCCTGAGCAGCAGCGGAGACAGCCCCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。