基因總覽
NEUROD4（neuronal differentiation 4）是蛋白質編碼基因，產物名稱為 Neurogenic differentiation factor 4，也稱 Class A basic helix-loop-helix protein 4 或 Protein atonal homolog 3。其蛋白質長331個胺基酸，含有 bHLH 結構域；來源資料並將部分序列區段註記為無序區。功能註解指出，該蛋白可能具有轉錄活化作用，並與神經元分化有關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000242994 ★ | 55,019,974–55,030,017 | 2 |
| ENST00001141650 | 55,019,968–55,030,017 | 2 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
NEUROD4 的產物可能作為轉錄活化因子，並介導神經元分化。來源以「可能」描述其轉錄活化作用，因此這項功能仍應保留推測性，不宜視為已確立的結論。
在視網膜中，NEUROD4 被註記為調控無長突細胞命運指定所必需；這項描述標示為依相似性推定（By similarity），代表相關功能是由相似性支持，而非此處直接呈現的實驗證據。資料未進一步說明其調控步驟或作用機制。
Promoter 與基因調控
>NEUROD4 ENST00000242994 GRCh38 chr12:55018974-55020074 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCCAATTGCTTAATCTGAGCACCTTTCTTTTTCCTTCTTGGAAACACAAGATGATTAGAAAATCTTTGGT ATCTTAAGTTCACAATCATTTATTTTTCCTTGGTGTAGTTTTAAATAAGATAGTATGAATATCTATATAC TTAAATTATTCCAGATGTAGTTTTCTTTCTGTCTTCTAGCAATTTAATTCAACCTCCTAATACCAAAGGA GTTTTAGGAATTATTATGAGCCTTCTCTTCTTCTAAGCTTATTACTACTCAGGTGGACTTTTTCTACGTG AATGCTTAATGATGTATTTTTGAAAAACAATAGTAGATCTCAGTTTGTAACTCAAGGAACTAACTGCCCT TAAAATGAAGGATTTTATTAATTTCCTTTTTGTTTTTATAAATTTAAAGTGATCAGAAAGTTGAAAGAAT AGCACAACAAATATAGCTTCACCTAAATTCACAAATTAAAAGTTTTAATGAGAGTAGCTTTGACGTGCTG AAAAGGTGGGAGAGACATACTTCTTCCTTCTACTTTTAGAACGCTGAAGTTTATAAGCCAAAGACCCCAG TCCACATGTGTAAGGAAGCAGCCACTGATGCTGTGTCCTTGACACGCATCTTTCTCACCTTTTGATTCTT TTCAGACGTGGGTCAGCAGCGTCATCTGCCCTTTTTAGCTCTCTCTCCAAGTCTATCCCCAATTTTCTTT CTCCATTCTGTCCACACTACTCCGCTCCCATTTCTTATCTTTTTAATCACAAAGGTTTCCAGTCCTCTTT TTCTTTACTCCTTAACTTCAGCAACTCTCCTCCCCTGCTCCCCTTCCACCAACCCCCATCTCTATTTAAA CAAACAAACGGGCGGCAAAACTGGACCTGGCCGGAGGAGCCTTTCAAGTGGGCGTGTCTTTCGGCTGGGG AAAAGGGAGGAGTTAGACTCTGGGCAACATCACTCCTCCCTGGTCAGCTGGGAGAGCAATCAAAACTGCA GCAAGTCAGAGGCTCCGGCCAGAGAGCAGGAGCTGCCCAGAGGCTTGTGGTCCTGAAAGCTCCTCTCCGG GGAGCTAACCAGGGAGAGGAGGTACTGAAGAGCGACTAAACTGGCTGCAGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| NEUROD4_1 ↗ | 12:55,019,974 | 正股 | 55,019,925–55,019,984 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR12_9RSM4 · promoter · 55019728–55019984 · regulatory
ENSR12_83LN9C · enhancer · 55019985–55020216 · regulatory
· motif · 55019861–55019871 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：331 aa
NEUROD4 蛋白長331個胺基酸。其 bHLH 結構域位於第87至139位；第1至80位及第246至265位則分別被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
NEUROD4 的細胞內定位註記為細胞核。 來源未提供定位隨條件或異構型改變的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- MAGEB4O15481 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- PIN1Q13526 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TCF4P15884-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
NEUROD4 有效結合 DNA 需要與另一個 bHLH 蛋白形成二聚體。此註記描述的是 DNA 結合所需的二聚化條件，未指出該夥伴的名稱，也未提供特定複合體資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | NEUROD4 可能具有轉錄活化作用，並介導神經元分化；在視網膜中，該蛋白被描述為調控無長突細胞命運指定所必需，但此項視網膜功能是依相似性推定，應保留其推論性質。 | 推論支持 | 證據與來源Probably acts as a transcriptional activator. Mediates neuronal differentiation. Required for the regulation of amacrine cell fate specification in the retina (By similarity) |
| 交互作用 | NEUROD4 要有效結合 DNA，必須與另一個 bHLH 蛋白形成二聚體；來源未指明該夥伴蛋白的名稱，也未提供其他互作細節。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | NEUROD4 的細胞內定位為細胞核；此項註記未描述定位變化的條件或其他定位資訊。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGAGAGCAGGAGCTGCCCAGAGGCTTGTGGTCCTGAAAGC40TCCTCTCCGGGGAGCTAACCAGGGAGAGGAGGTACTGAAG80AGCGACTAAACTGGCTGCAGCGGAGAGATCAGCCCGAAGG120CGTCCTTGAGGAGCATACGGAACTCCAAGGAAGGAGTAGA160ATAAGGAGCAGGCAGAGAAACCAGACCCGGTGGAATCTCT200AAGAGGTAACAACCGGGTTTGACATGGATCGCTGAAAGCG240TCTCTTCTACCATCTGGATGGTCAGGGAGACTTGGCTTCT280CTGACTGTCCTCTAAGACGCAGATTCACAGAGTTCACTCC320AGGAACGGCCAGTGACCGAGAGTCTGGAAATGTCAAAAAC360TTTTGTAAAATCCAAGGAGATGGGAGAGCTAGTCAACACA400CCATCCTGGATGGATAAAGGTCTGGGCTCCCAAAATGAGG440TGAAGGAGGAAGAGAGCAGACCAGGTACTTATGGGATGCT480CAGCAGCTTAACTGAAGAGCATGACAGTATTGAGGAAGAA520GAAGAAGAGGAAGAAGATGGGGAGAAACCTAAGAGAAGGG560GTCCCAAGAAAAAGAAGATGACCAAAGCTCGCCTTGAGAG600ATTCAGGGCTCGAAGAGTCAAGGCTAATGCCAGAGAACGG640ACCCGGATGCATGGCCTGAATGACGCCCTGGATAACCTGA680GGCGAGTCATGCCATGCTACTCTAAAACCCAAAAACTTTC720CAAGATAGAGACTCTTAGACTGGCCAGGAACTATATTTGG760GCTTTATCTGAAGTCCTGGAGACTGGCCAGACACCTGAAG800GGAAAGGCTTTGTGGAGATGCTGTGTAAAGGGCTCTCTCA840GCCCACAAGCAACCTGGTGGCTGGATGTCTCCAACTGGGC880CCTCAGTCTGTCCTCCTGGAGAAGCACGAGGATAAATCTC920CTATTTGTGACTCTGCCATCTCTGTCCACAACTTCAACTA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。