基因總覽
NEK8 是蛋白質編碼基因，其產物屬於 protein kinase 超家族中的 NEK Ser/Thr protein kinase 家族及 NIMA subfamily。這種蛋白質具有蛋白質激酶區域，並含有多個 RCC1 repeats；其序列中另有一段被註記為無序區。這些特徵構成 NEK8 蛋白的基本分子架構。NEK8 與腎小管上皮細胞及初級纖毛相關的生物學過程有關，也參與器官發育與 Hippo signaling pathway 的調控。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000268766 ★ | 28,728,788–28,743,455 | 15 |
| ENST00000579671 | 28,725,897–28,735,367 | 4 |
| ENST00000579060 | 28,725,928–28,735,371 | 4 |
| ENST00000903448 | 28,728,781–28,743,455 | 14 |
| ENST00000969681 | 28,728,781–28,743,455 | 15 |
| ENST00001137786 | 28,728,781–28,743,455 | 15 |
| ENST00000592510 | 28,735,278–28,738,245 | 5 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
NEK8 對維持腎小管完整性是必要的。資料指出，它可能調節腎小管上皮細胞局部的細胞骨架結構；但此作用以可能性描述，並未在來源中限定特定的細胞骨架成分或調控步驟。這項角色將 NEK8 與腎小管組織的結構維持相連結。
NEK8 也可能透過將蛋白質定位至纖毛，調節纖毛生合成。這表示其作用可能涉及纖毛相關蛋白的運送或定位，而非僅限於纖毛本身的結構；來源未進一步列出受其定位調控的蛋白質或說明詳細機制。
此外，NEK8 參與器官發育，並涉及 Hippo signaling pathway 的調控。現有資料支持這些生物學角色，但未說明 NEK8 在該訊息傳遞路徑中的具體作用方向或下游結果，因此不宜據此推定其對路徑活性具有促進或抑制效果。
NEK8 的酵素反應包括以 ATP 為磷酸基來源，將磷酸基轉移至蛋白質中的 serine 或 threonine 殘基，分別形成磷酸化的 serine 或 threonine 殘基，同時產生 ADP 與 H⁺。此反應描述其蛋白質激酶活性；來源未提供特定底物，因此不能據此指定腎小管、纖毛或 Hippo pathway 相關作用由哪個底物直接介導。
Promoter 與基因調控
>NEK8 ENST00000268766 GRCh38 chr17:28727788-28728888 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTACCATGTTGGCCAGGTTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGT GATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAATACT GAGTTTTTCTAGAGCTCCCGCAGAGCAGGAGCCCGGGAGAACCTGGAATTAACCTCACTTCCGGTAAAGA GCCTAGCTGGTCACACTAACCAGCCCCCTGCCTCTAGGCTTTTGCCTTGAGCTCATTTCGGCGAAACCGC GGTCTTTCCTTCTCCCCTTGATGCTTTCAGGTACTGACCCACTACCGCCCCCATCTTCCCCCATGGGAAG ATGAGCACTGAGGGCAGATTACCCTCCTGCAGCGCGTGTGTGAAAGGGGAGTTGAGAGTGCTGACGAGCG CGGCGCTCACTAGTCGGGACGGCCCGAGACCGTGTCATGTCCTCTTCAGGTGAATCAACTTGCACGACTT GGGATTTCCCCCGTCCCTCCCCAGGCAAACACGAAACCAACCCTGCTGCCTTCTCCCAGGAGCGCTGGTC TCGGTCGTTTTGGGTGTGTTTATCGTTTGCGTGCCAAGGAGAACCCGCTTTCTCCTGAAATAGCGTCACT CGTGGGCAAGAAGGGGGTCAATCTTCTCTTCCCACCCCTTCCCGGCCTGTGGGGTTTAACTCTCGGGAAC GCGACATCCTTTTAGTCTAGCAAGCTTTACAAGGGCTGGGTATATGTGTGGGAGGGGCGGGTACCGTGCC CGCCATTGCGGGCGCGCCCTATTTTCTTGCCCTATTCTTGGACACTGCGTGGGGCAGGGTCGTGAGGGGA AAAGTGACGGCGTGTCGCAGCGGGAGGTGTGTGGTGCAGGCCCACAAATACGGACGCGTGGCGGAACCCA CACCTAGGGCGCTGGCTCCGCCCCGCAAGCCGCTCGCCGTGAAGGGGCGGGGCCCAGAGTGGGTGGGTCC GCGCACGCGCCGCGTGGGGGACGGAAGTGAAACTCTAAGAAATGAGATGGAGAAGTACGAGCGGATCCGA GTGGTGGGGAGAGGTGCCTTCGGGTGAGCCAGGGCTCTGGGGGAGGAAACT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| NEK8_2 ↗ | 17:28,725,888 | 正股 | 28,725,839–28,725,898 |
| NEK8_1 ↗ | 17:28,728,790 | 正股 | 28,728,741–28,728,800 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_9FDT3 · promoter · 28726223–28726723 · regulatory
ENSR17_58QFNH · CTCF_binding_site · 28726585–28726606 · regulatory
ENSR17_9FDT8 · promoter · 28726922–28727268 · regulatory
ENSR17_58QFQD · CTCF_binding_site · 28726990–28727011 · regulatory
ENSR17_9FDTM · promoter · 28728298–28728798 · regulatory
ENSR17_B7NXF · enhancer · 28728799–28729677 · regulatory
· motif · 28724702–28724713 · motif
· motif · 28724829–28724844 · motif
· motif · 28725303–28725316 · motif
· motif · 28725303–28725316 · motif
· motif · 28725324–28725337 · motif
· motif · 28725324–28725337 · motif
· motif · 28725344–28725359 · motif
· motif · 28725637–28725650 · motif
· motif · 28725637–28725650 · motif
· motif · 28725734–28725747 · motif
· motif · 28725734–28725747 · motif
· motif · 28725740–28725757 · motif
· motif · 28725749–28725764 · motif
· motif · 28725968–28725977 · motif
· motif · 28726269–28726282 · motif
· motif · 28726291–28726304 · motif
· motif · 28726310–28726323 · motif
· motif · 28726329–28726342 · motif
· motif · 28726587–28726603 · motif
· motif · 28726712–28726729 · motif
· motif · 28726772–28726788 · motif
· motif · 28726992–28727008 · motif
· motif · 28727191–28727201 · motif
· motif · 28727353–28727365 · motif
· motif · 28727791–28727802 · motif
· motif · 28727838–28727853 · motif
· motif · 28727843–28727855 · motif
· motif · 28727846–28727853 · motif
· motif · 28727983–28727992 · motif
· motif · 28727983–28727994 · motif
· motif · 28727983–28727994 · motif
· motif · 28728124–28728137 · motif
· motif · 28728124–28728137 · motif
· motif · 28728396–28728407 · motif
· motif · 28728555–28728565 · motif
· motif · 28728649–28728658 · motif
· motif · 28728650–28728660 · motif
· motif · 28728740–28728750 · motif
· motif · 28728756–28728766 · motif
· motif · 28728767–28728778 · motif
· motif · 28728767–28728778 · motif
· motif · 28728785–28728796 · motif
· motif · 28728787–28728796 · motif
· motif · 28728788–28728802 · motif
· motif · 28728979–28728989 · motif
· motif · 28728989–28728998 · motif
· motif · 28729002–28729015 · motif
· motif · 28729002–28729015 · motif
· motif · 28729003–28729016 · motif
· motif · 28729003–28729016 · motif
· motif · 28729033–28729043 · motif
· motif · 28729056–28729066 · motif
· motif · 28729935–28729950 · motif
· motif · 28729935–28729950 · motif
· motif · 28731270–28731277 · motif
· motif · 28731314–28731329 · motif
· motif · 28731320–28731332 · motif
· motif · 28731322–28731329 · motif
· motif · 28731322–28731337 · motif
· motif · 28732398–28732409 · motif
· motif · 28733058–28733069 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：692 aa
NEK8 蛋白長 692 個胺基酸，N 端第 4–258 位為 Protein kinase domain。蛋白質另含五個 RCC1 repeats，分布於第 312–350、410–461、462–513、580–631 與 632–684 位；第 277–301 位則註記為無序區。其家族分類為 protein kinase 超家族中的 NEK Ser/Thr protein kinase family、NIMA subfamily。
蛋白質三維結構
細胞內定位
NEK8 主要位於細胞質，也被記錄於初級纖毛近端區域。 來源並列出其與細胞骨架、中心體及纖毛軸絲相關的定位；這些描述指向 NEK8 本身。 NEK8 在分裂中的細胞未被觀察到，顯示其纖毛相關定位具有細胞狀態上的限制。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Cell projection, cilium。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
- ADAMTSL4Q6UY14-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATXN1P54253 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSP90AB1P08238 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP13-2Q52LG2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NUDCD2Q8WVJ2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- OXER1Q8TDS5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RGS20O76081-6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TCF4P15884 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM42Q8IWZ5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM69Q86WT6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
NEK8 與 PKD2、ANKS6 及 ANKS3 有交互作用；其中 NEK8 調節 PKD2 朝纖毛定位的說法標示為 By similarity。NEK8 也是至少含有 ANKS6、INVS、NEK8 與 NPHP3 的複合體成員。資料提出 ANKS6 可能透過連結 INVS 與 NPHP3 至 NEK8 來組織複合體組裝，而 INVS 可能將複合體定位至纖毛近端軸絲；這些複合體組織與定位角色均保留來源所述的可能性。
疾病與遺傳關聯
影響 NEK8 的基因變異與三種疾病相關。Nephronophthisis 9 為常染色體隱性疾病，可進展至末期腎病，並有腎小管基底膜增厚、間質纖維化及晚期髓質囊腫等特徵。Renal-hepatic-pancreatic dysplasia 2 涉及腎、肝與胰臟囊性畸形，病理表現可包括多囊性發育不良腎、膽管擴張及胰臟發育不良。Polycystic kidney disease 8 則為常染色體顯性疾病，特徵是雙腎囊腫逐漸形成與增大，通常可導致成年期末期腎病，也可能累及其他器官，尤其是肝臟。來源將這些疾病歸因於影響該基因的變異，但未在此提供特定變異細節。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 8 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | NEK8 對維持腎小管完整性是必要的，並可能調節腎小管上皮細胞局部的細胞骨架結構。它也可能透過將蛋白質定位至纖毛來調節纖毛生合成，並參與器官發育及 Hippo signaling pathway 的調控；來源未界定這些作用的具體機制。 | 含實驗來源 | 證據與來源Required for renal tubular integrity. May regulate local cytoskeletal structure in kidney tubule epithelial cells. May regulate ciliary biogenesis through targeting of proteins to the cilia. Plays a role in organogenesis, and is involved in the regulation of the Hippo signaling pathway PMID 23418306 ↗ · PMID 26967905 ↗ · PMID 37598857 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | NEK8 與 PKD2、ANKS6 及 ANKS3 有交互作用；調節 PKD2 朝纖毛定位的作用標示為依相似性推定。NEK8 也是至少含 ANKS6、INVS、NEK8 與 NPHP3 的複合體成員。ANKS6 可能連結 INVS、NPHP3 與 NEK8 以組織複合體組裝，INVS 則可能將複合體定位至纖毛近端軸絲。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with PKD2; may regulate PKD2 targeting to the cilium (By similarity). Interacts with ANKS6. Component of a complex containing at least ANKS6, INVS, NEK8 and NPHP3. ANKS6 may organize complex assembly by linking INVS and NPHP3 to NEK8 and INVS may target the complex to the proximal ciliary axoneme. Interacts with ANKS3 PMID 23418306 ↗ · PMID 23793029 ↗ · PMID 26188091 ↗ |
| 細胞定位 | NEK8 主要位於細胞質，並記錄於細胞骨架、中心體、纖毛及纖毛軸絲相關區域；它也定位於初級纖毛近端，但在分裂中的細胞未被觀察到。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Cytoplasm, cytoskeleton; Cell projection, cilium; Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome; Cytoplasm, cytoskeleton, cilium axoneme; Predominantly cytoplasmic. Localizes to the proximal region of the primary cilium and is not observed in dividing cells PMID 18199800 ↗ · PMID 26967905 ↗ |
| 疾病關聯 | 影響 NEK8 的基因變異會造成 Nephronophthisis 9，這是一種常染色體隱性、可進展至末期腎病的腎小管間質疾病。其組織特徵包括腎小管基底膜增厚與間質纖維化，晚期可出現髓質囊腫。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nephronophthisis 9 NPHP9 An autosomal recessive disorder resulting in end-stage renal disease. It is a progressive tubulo-interstitial kidney disorder histologically characterized by modifications of the tubules with thickening of the basement membrane, interstitial fibrosis and, in the advanced stages, medullary cysts. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 613824 PMID 18199800 ↗ · PMID 26967905 ↗ |
| 疾病關聯 | 影響 NEK8 的基因變異會造成 Renal-hepatic-pancreatic dysplasia 2，特徵為腎臟、肝臟與胰臟的囊性畸形。病理所見包括多囊性發育不良腎、擴張且發育異常的膽管，以及具有擴張導管、囊腫、纖維化與發炎浸潤的發育不良胰臟。 | 含實驗來源 | 證據與來源Renal-hepatic-pancreatic dysplasia 2 RHPD2 A form of renal-hepatic-pancreatic dysplasia, a disease characterized by cystic malformations of the kidneys, liver, and pancreas. The pathological findings consist of multicystic dysplastic kidneys, dilated and dysgenetic bile ducts, a dysplastic pancreas with dilated ducts, cysts, fibrosis and inflammatory infiltrates. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 615415 PMID 23418306 ↗ · PMID 26967905 ↗ |
| 疾病關聯 | 影響 NEK8 的基因變異會造成 Polycystic kidney disease 8，屬常染色體顯性疾病。其特徵為雙腎囊腫逐漸形成並增大，通常在成年期進展至末期腎病；囊腫也可能出現在其他器官，尤其是肝臟。 | 含實驗來源 | 證據與來源Polycystic kidney disease 8 PKD8 A form of polycystic kidney disease, a disorder characterized by progressive formation and enlargement of cysts in both kidneys, typically leading to end-stage renal disease in adult life. Cysts may also occur in other organs, particularly the liver. PKD8 inheritance is autosomal dominant. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620903 PMID 36215968 ↗ · PMID 37598857 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACGGAAGTGAAACTCTAAGAAATGAGATGGAGAAGTACGA40GCGGATCCGAGTGGTGGGGAGAGGTGCCTTCGGGATTGTG80CACCTGTGCCTGCGAAAGGCTGACCAGAAGCTGGTGATCA120TCAAGCAGATTCCAGTGGAACAGATGACCAAGGAAGAGCG160GCAGGCAGCCCAGAATGAGTGCCAGGTCCTCAAGCTGCTC200AACCACCCCAATGTCATTGAGTACTACGAGAACTTCCTGG240AAGACAAAGCCCTTATGATCGCCATGGAATATGCACCAGG280CGGCACTCTGGCTGAGTTCATCCAAAAGCGCTGTAATTCC320CTGCTGGAGGAGGAGACCATCCTGCACTTCTTCGTGCAGA360TCCTGCTTGCACTGCATCATGTGCACACCCACCTCATCCT400GCACCGAGACCTCAAGACCCAGAACATCCTGCTTGACAAA440CACCGCATGGTCGTCAAGATCGGTGATTTCGGCATCTCCA480AGATCCTTAGCAGCAAGAGCAAGGCCTACACGGTGGTGGG520TACCCCATGCTATATCTCCCCTGAGCTGTGTGAGGGCAAG560CCCTACAACCAGAAGAGTGACATCTGGGCCCTGGGCTGTG600TCCTCTACGAGCTGGCCAGCCTCAAGAGGGCTTTCGAGGC640TGCGAACTTGCCAGCACTGGTGCTGAAGATCATGAGTGGC680ACCTTTGCACCTATCTCTGACCGGTACAGCCCTGAGCTTC720GCCAGCTGGTCCTGAGTCTACTCAGCCTGGAGCCTGCCCA760GCGGCCACCACTCAGCCACATCATGGCACAGCCCCTCTGC800ATCCGTGCCCTCCTCAACCTCCACACCGACGTGGGCAGTG840TCCGCATGCGGAGGGCAGAGAAGTCCGTGGCCCCCAGCAA880CACAGGGAGCAGGACCACCAGTGTCCGCTGCAGAGGTATC920CCCCGGGGACCTGTGAGGCCAGCCATCCCACCACCACTGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。