基因總覽
NEK4 是一個蛋白質編碼基因，產物為 Serine/threonine-protein kinase Nek4。這種蛋白質屬於 protein kinase superfamily，並歸入 NEK Ser/Thr protein kinase family 的 NIMA subfamily。其序列包含蛋白質激酶區域，另有一段被註記為無序的區域。NEK4 的基本特性是具有激酶身分；來源資料並指出其與細胞進入增殖停滯及細胞週期停滯有關，具體作用情境見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000233027 ★ | 52,708,444–52,770,940 | 16 |
| ENST00001145167 | 52,708,444–52,770,973 | 16 |
| ENST00000862198 | 52,708,451–52,770,973 | 15 |
| ENST00001056893 | 52,708,672–52,770,973 | 15 |
| ENST00000911340 | 52,710,435–52,770,973 | 16 |
| ENST00000862199 | 52,710,780–52,770,973 | 15 |
| ENST00000944571 | 52,710,780–52,770,973 | 15 |
| ENST00001056895 | 52,710,780–52,770,973 | 16 |
| ENST00000944573 | 52,710,782–52,770,973 | 15 |
| ENST00000911341 | 52,710,784–52,770,973 | 16 |
| ENST00000911342 | 52,710,787–52,770,973 | 15 |
| ENST00000944574 | 52,710,787–52,770,973 | 14 |
顯示 12/26 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
NEK4 是蛋白質激酶，來源註記指出它似乎只作用於 threonine 殘基，但此描述標示為依相似性推定（By similarity），因此不應視為已由此資料直接確立的特異性結論。酵素反應資料分別列出以 serine 或 threonine 為受質的磷酸化反應：蛋白質上的受質殘基與 ATP 反應，形成磷酸化蛋白質、ADP 與 H⁺。這些反應式說明可能的催化形式，不能據此推定特定細胞情境中的受質或作用對象。
在細胞增殖方面，NEK4 是細胞經有限次分裂後正常進入增殖停滯所必需；這種停滯亦稱為複製性細胞衰老。這項描述指出 NEK4 對正常建立該狀態具有必要性，但來源未提供其在此過程中的下游分子步驟或受質，因此不宜進一步指定作用機制。
NEK4 也為細胞在雙股 DNA 損傷後正常停止細胞週期所必需。這表示其功能涵蓋 DNA 損傷情境下的細胞週期停滯；現有資料未細述損傷訊號如何傳遞，也沒有提供停滯時程或其他細胞結果。上述增殖性停滯與 DNA 損傷反應是來源分別記載的功能情境，不應合併成單一機制。
Promoter 與基因調控
>NEK4 ENST00000233027 GRCh38 chr3:52770840-52771940 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGCCATAAAAAGGAAAGAGGCCAGGCACGATGGCGCACACCTGTAATAACGGCATTTTGGGAGGCCAACG TGGGTGAATTGCTTGAGCCGAGGAGTTCAAGACCGGTCTGGGGAACATAGTGACACCCTGTCTCTGAAAA AAAATAAAATAGGATTAGCCAGGCATGGACGTGTGTGCCTGTAGTTGGGAGGATGGCTTGAGCCCAGGAA GTCTAGGCAGCAGTGAGCACCATTGCACCACTGCACTCCAAGCTGGGTGGCAGGGCGAGACCCTGTCTCA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAGGAAGCGCTCTGGGAAAGGGAGGCTTTGGCTGGAACAA ATGGTGAATTCTTTTGGCACCCCTGAGCTTTCTTGGGCAGGCATTTTAAAGGGGCCTAGGCCCACCTAGA GATCCGCCCTTAGGCTGTTAACTTAGCATGATGCCATGTTAGAGTTTAGTCAAGTCTCTTAGTGCAGTGG TTAGGGTAGTCGTTAAATGCTGAGGAGTCTTTGTAGTTCTCAATTAGCAGGCGAGTTTTTAGGGATGAAA GGTACTGATAATTTACTTTGAATGTATCAAAAAATAGGATGGATTGCTGGATGCAGAGACGGCATGTGAT AAAGCGGATACAGCAAATGTTACTGGTAGAGAGTCTGTCACCCAGTCATTAGAACATGAGCTCCAGGAGG GCAGGGACTTTGTTGGCCTGGCACATAGGCGGTCAACAAATATTTGCAGAATGAACGAACAATACTTGTA ACGGCCTTAGGACAAACAAGTGCACAAAAAGAGGAAGCTTTCCCTGACTCTGTTGTGGCGGGGATCCGGA CGGTGGAACGGACGCACAGAAAGTGCGCGGAGCCTGGCGGAGTCGCTCTGGCCTCCTGGAGCCTCTGCTC TATGGCGGGTCCTCCCGGGGCTGCGGAACCTCTCTGGCCGCTCGTGGCGTCCGCTCTATGGCCGTCCTTT GGGGACGCAGGAGCATGCGCAGAACTGCTCCCGGCCCGGATCGCTATGGCAGCGGCGTCGTCGCGGGCCG GGCCCCAGCAATCCCGCCCGGGCCCGGCTGCCTCAACAGCCGCCCCCACTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| NEK4_1 ↗ | 3:52,770,940 | 負股 | 52,770,930–52,770,989 |
| NEK4_2 ↗ | 3:52,778,381 | 負股 | 52,778,371–52,778,430 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR3_BDGQL · enhancer · 52769936–52770928 · regulatory
ENSR3_5GF5HF · CTCF_binding_site · 52770825–52770846 · regulatory
ENSR3_9QXJF · promoter · 52770929–52771430 · regulatory
ENSR3_83JW6C · enhancer · 52775346–52775558 · regulatory
· motif · 52770683–52770696 · motif
· motif · 52770707–52770722 · motif
· motif · 52770827–52770843 · motif
· motif · 52770940–52770951 · motif
· motif · 52770940–52770951 · motif
· motif · 52771021–52771031 · motif
· motif · 52771132–52771145 · motif
· motif · 52771593–52771604 · motif
· motif · 52775582–52775597 · motif
· motif · 52775740–52775750 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：841 aa
Serine/threonine-protein kinase Nek4 長 841 個胺基酸。其 N 端第 6–261 位胺基酸為 Protein kinase 結構域；第 517–700 位胺基酸則註記為無序區域。蛋白質家族分類為 NEK Ser/Thr protein kinase family，隸屬 NIMA subfamily。
蛋白質三維結構
細胞內定位
NEK4 被記錄於細胞質與纖毛。 來源沒有提供不同條件下定位改變、動態變化或異構型之間的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Cell projection, cilium。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
NEK4 與 RPGRIP1 及 RPGRIP1L 有交互作用。來源僅記載交互作用，未進一步說明是否為直接實體結合、是否同屬特定複合體，或其功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | NEK4 是蛋白質激酶；依相似性推定，它似乎專一作用於 threonine 殘基。NEK4 對細胞在有限次分裂後正常進入增殖停滯（亦稱複製性細胞衰老）是必要的，也對雙股 DNA 損傷後正常停止細胞週期是必要的。 | 含實驗來源 | 證據與來源Protein kinase that seems to act exclusively upon threonine residues (By similarity). Required for normal entry into proliferative arrest after a limited number of cell divisions, also called replicative senescence. Required for normal cell cycle arrest in response to double-stranded DNA damage PMID 22851694 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 推論支持 | |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 推論支持 | |
| 交互作用 | NEK4 與 RPGRIP1 及 RPGRIP1L 有交互作用；此項資料未進一步界定交互作用的型態或功能結果。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | NEK4 的定位記錄包括細胞質與纖毛；此資料未說明定位隨條件或時間改變的情形。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGAACTGCTCCCGGCCCGGATCGCTATGGCAGCGGCGTCG40TCGCGGGCCGGGCCCCAGCAATCCCGCCCGGGCCCGGCTG80CCTCAACAGCCGCCCCCACTGCCCCCTCTCGGGCATGAAC120CGAGCTTCTTGTTGCCGCCCGCTGCCCTACCCGCCGCTGC160CGCCGCATCCCGACTCTGGGCCAGCGCTGGGAACATGCCC200CTGGCCGCCTACTGCTACCTGCGGGTCGTGGGCAAGGGGA240GCTATGGAGAGGTGACGCTTGTGAAGCACCGGCGGGACGG280CAAGCAGTATGTCATCAAAAAACTGAACCTCCGAAATGCC320TCTAGCCGAGAGCGGCGAGCTGCTGAACAGGAAGCCCAGC360TCTTGTCTCAGTTGAAGCATCCCAACATTGTCACCTACAA400GGAGTCATGGGAAGGAGGAGATGGTCTGCTCTACATTGTC440ATGGGCTTCTGTGAAGGAGGTGATTTGTACCGAAAGCTCA480AGGAGCAGAAAGGGCAGCTTCTGCCTGAGAATCAGGTGGT520AGAGTGGTTTGTACAGATCGCCATGGCTTTGCAGTATTTA560CATGAAAAACACATCCTTCATCGAGATCTGAAAACTCAAA600ATGTCTTCCTAACAAGAACAAACATCATCAAAGTAGGGGA640CCTAGGAATTGCCCGAGTGTTAGAGAACCACTGTGACATG680GCTAGCACCCTCATTGGCACACCCTACTACATGAGCCCTG720AATTGTTCTCAAACAAACCCTACAACTATAAGTCTGATGT760TTGGGCTCTAGGATGCTGTGTCTATGAAATGGCCACCTTG800AAGCATGCTTTCAATGCAAAAGATATGAATTCTTTAGTTT840ATCGGATTATTGAAGGAAAGCTGCCACCAATGCCAAGAGA880TTACAGCCCAGAGCTGGCAGAACTGATAAGAACAATGCTG920AGCAAAAGGCCTGAAGAAAGGCCGTCTGTGAGGAGCATCC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。