基因總覽
NDRG4（NDRG family member 4）是蛋白質編碼基因，產物屬於 NDRG family。蛋白質長度為 352 個胺基酸，序列末端第 314 至 352 位被註解為無序區域。現有資料將它與腦內 BDNF 水準的維持，以及生長因子誘發的磷酸化反應相連；其中部分功能描述標示為依相似性推定，另有描述以可能性表述，因此不宜視為均已確立的作用。這些資訊構成目前可支持的基本認識，未提供更多結構或家族內比較細節。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000570248 ★ | 58,500,143–58,513,619 | 15 |
| ENST00000568999 | 58,462,846–58,504,649 | 7 |
| ENST00000564207 | 58,463,370–58,504,642 | 7 |
| ENST00000258187 | 58,463,665–58,513,628 | 16 |
| ENST00000961842 | 58,463,671–58,513,628 | 16 |
| ENST00000961840 | 58,463,674–58,513,628 | 19 |
| ENST00000889963 | 58,463,703–58,513,628 | 17 |
| ENST00000569404 | 58,463,704–58,504,397 | 7 |
| ENST00000889964 | 58,463,706–58,513,628 | 18 |
| ENST00000569539 | 58,463,710–58,506,946 | 8 |
| ENST00000564126 | 58,463,713–58,506,461 | 8 |
| ENST00000961841 | 58,463,719–58,513,628 | 18 |
顯示 12/49 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
NDRG4 被描述為有助於使腦內 BDNF 維持在正常範圍。這項作用與空間學習的保存，以及抵抗缺血壓力所造成的神經元細胞死亡有關；原始註記將此功能標為依相似性推定，故應保留其推論性質，而不視為已在此處直接確立的因果機制。
此外，NDRG4 可能增強生長因子誘發的 ERK1 與 ERK2 磷酸化反應。來源列出的誘發因子包括 PDGF 與 FGF，但以「可能」描述這項調節作用，並未進一步說明其分子步驟或條件。
在另一條訊息反應中，NDRG4 可能以微管依賴的方式，減弱 NGF 促進的 ELK1 磷酸化。這表示其與不同生長因子相關的磷酸化變化可能呈現不同方向：對 ERK1、ERK2 磷酸化可能有增強作用，對 NGF 促進的 ELK1 磷酸化則可能有抑制作用。現有資料未提供這些作用的細胞或實驗條件細節，因此不宜進一步推定其普遍性或延伸至其他路徑。
Promoter 與基因調控
>NDRG4 ENST00000570248 GRCh38 chr16:58499143-58500243 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGCCTCGGGCGAGCTCGCCACCCAGATCCTTGCTGCCCAGGAGAACAGGGCACGGAGCCTGAGATAGACC TAGTGTTCTGCTCCCCAGAGACCCGAGAGCCAAGCCCCAAACTGGTTGCCTCTGGGAACGAGGGCCGGGT GGGTCTACAGGAGGTGGGCATGTCAATGTCAGCAAGCTGCCTCCTAGCCCCGCTTCCTCTCCCTGGTGGT CTGGAGCCCCTGGCAGCAGGGTGAGGGTGGGGAGGGCAGAGCTGGTGTGTGCCTGACCATACCCCTGGCC CTGCTATCTGCCCAGGGCCCCTGGCCCCCGGCCCCCAAACTCCATTTTCAGCATGTGGGGAAACCCCCTG TATCTGCGTGGGCAAGGTGGGATTTTCATCCCTGGTGGGTGGAGAAGGAGCAGCCCCTTGAAGCAGGGTG ATAACCCAAGTTGCCCCAGAAAGCAGCAGCTCCCCAGGCCTCCACAAGGTTAAGCGATGGAACCTTCCTA ATGGGAAGGCTGGGCGTGGGGGTCTGGTCCCCAAGATGTTGGGCTTGGGGCCCTCTCGGGCCCTCCATAC TCCCCAAGGTGTGGGTCAAGGGCTCTAGCTGTCTGGGCAGTGCCCATGCACCCTGCCCTGCCCCGCATTG GTAAGCTGTGCATGTCTGTGACGACCCTGTGTGTACCTGACATGGGTGAGTCTGTACGTGTGGTCTCGGC TTTTGTATTCGGAGGATCCCGTGTGAGCTGCAGCTGTTGGCGTGTGCCTATGTGCTGGGGGCGGATGCAG GGGCTGGGGACCATCAAGGATGATGTGTGGCTGGGGTGGGAGGAGCAGTGACAGGGCTGGGGCAAGGAGG ACTTCAGAAGCCAATTGGAGCCAGGCTTGTCTCCCAGCAGCCAATATGGGAGCTGGGGCTCCTGGTAAGC GAGTGGCTGCTCAGAAACCCTGCGGGGAGGAGGGGCTAGCTAGGCTGGGCCAGGATCCCTGTATAAATGG CCCAGGAGCTGTGCCCCATCACAGAGCCGACCATCTCCCACTCGAGCTGCCCCCGCCCTCTGGACCCGAG TGACTCAGGCCTTTGTTTGTCCTTCCTGGTAGAGGCGGGTTCCCTCCCTCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 4 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| NDRG4_2 ↗ | 16:58,463,725 | 正股 | 58,463,676–58,463,735 |
| NDRG4_4 ↗ | 16:58,464,005 | 正股 | 58,463,956–58,464,015 |
| NDRG4_3 ↗ | 16:58,464,282 | 正股 | 58,464,233–58,464,292 |
| NDRG4_1 ↗ | 16:58,500,145 | 正股 | 58,500,096–58,500,155 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR16_C7RPG · enhancer · 58494882–58496892 · regulatory
ENSR16_5HQH34 · CTCF_binding_site · 58495182–58495203 · regulatory
ENSR16_5HQHBL · CTCF_binding_site · 58496812–58496833 · regulatory
ENSR16_BFLGJ · promoter · 58499557–58500153 · regulatory
ENSR16_D4WCX · enhancer · 58500154–58502354 · regulatory
ENSR16_5HQHZ9 · CTCF_binding_site · 58500623–58500644 · regulatory
ENSR16_5HQJ7C · CTCF_binding_site · 58501937–58501958 · regulatory
ENSR16_5HQJ7R · CTCF_binding_site · 58502030–58502051 · regulatory
· motif · 58495184–58495200 · motif
· motif · 58495192–58495202 · motif
· motif · 58495230–58495244 · motif
· motif · 58495237–58495248 · motif
· motif · 58495285–58495300 · motif
· motif · 58495285–58495300 · motif
· motif · 58495292–58495305 · motif
· motif · 58495292–58495305 · motif
· motif · 58495300–58495315 · motif
· motif · 58495300–58495315 · motif
· motif · 58495393–58495407 · motif
· motif · 58495443–58495452 · motif
· motif · 58495443–58495454 · motif
· motif · 58495443–58495454 · motif
· motif · 58496814–58496830 · motif
· motif · 58497848–58497855 · motif
· motif · 58497885–58497907 · motif
· motif · 58497887–58497909 · motif
· motif · 58497887–58497909 · motif
· motif · 58497975–58497987 · motif
· motif · 58498101–58498114 · motif
· motif · 58498127–58498139 · motif
· motif · 58498129–58498136 · motif
· motif · 58498129–58498142 · motif
· motif · 58500192–58500200 · motif
· motif · 58500625–58500641 · motif
· motif · 58501448–58501461 · motif
· motif · 58501448–58501461 · motif
· motif · 58501652–58501664 · motif
· motif · 58501746–58501759 · motif
· motif · 58501746–58501759 · motif
· motif · 58501909–58501921 · motif
· motif · 58501912–58501919 · motif
· motif · 58501939–58501955 · motif
· motif · 58502032–58502048 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：352 aa
NDRG4 蛋白質長 352 個胺基酸，屬於 NDRG family。其第 314 至 352 位胺基酸被註解為無序區域；來源未提供其他結構域或功能區域資訊。
蛋白質三維結構
細胞內定位
NDRG4 的定位註解為細胞質與細胞溶質。 來源未指出定位變化的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 38 個夥伴
- AGTRAPQ6RW13 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- ARL6IP1Q15041 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- CMTM5Q96DZ9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- RABAC1Q9UI14 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- ARFIP2P53365 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATP5PFP18859 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CACFD1Q9UGQ2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDR1P51861 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CIDEBQ9UHD4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- COQ3Q9NZJ6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CPLX2Q6PUV4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DDIT4LQ96D03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DERL3Q96Q80 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DGAT2L6Q6ZPD8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ERGIC3Q9Y282 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LEUTXA8MZ59 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LIME1Q9H400 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LRRC59Q96AG4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MAL2Q969L2 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- MTIF3Q9H2K0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PLP2Q04941 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRAF2O60831 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- REEP6Q96HR9-2 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- RHBDD2Q6NTF9-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RTN3O95197-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | NDRG4 有助於使腦內 BDNF 維持在正常範圍，這與保存空間學習能力及抵抗缺血壓力引起的神經元細胞死亡有關；此功能為依相似性推定。NDRG4 也可能增強 PDGF、FGF 等生長因子誘發的 ERK1 與 ERK2 磷酸化，並可能以微管依賴方式減弱 NGF 促進的 ELK1 磷酸化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Contributes to the maintenance of intracerebral BDNF levels within the normal range, which is necessary for the preservation of spatial learning and the resistance to neuronal cell death caused by ischemic stress (By similarity). May enhance growth factor-induced ERK1 and ERK2 phosphorylation, including that induced by PDGF and FGF. May attenuate NGF-promoted ELK1 phosphorylation in a microtubule-dependent manner PMID 12755708 ↗ |
| 細胞定位 | NDRG4 的細胞定位註解為細胞質與細胞溶質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACAGAGCCGACCATCTCCCACTCGAGCTGCCCCCGCCCTC40TGGACCCGAGTGACTCAGGCCTTTGTTTGTCCTTCCTGGT80AGAGGCGGGTTCCCTCCCTCGGCAAGATGCCGGAGTGCTG120GGATGGGGAACATGACATCGAGACACCCTACGGCCTTCTG160CATGTAGTGATCCGGGGCTCCCCCAAGGGGAACCGCCCAG200CCATCCTCACCTACCATGATGTGGGCCTCAACCACAAACT240ATGCTTCAACACCTTCTTCAACTTCGAGGACATGCAGGAG280ATCACCAAGCACTTTGTGGTGTGTCACGTGGATGCCCCTG320GACAACAGGTGGGGGCGTCGCAGTTTCCTCAGGGGTACCA360GTTCCCCTCCATGGAGCAGCTGGCTGCCATGCTCCCCAGC400GTGGTGCAGCATTTCGGGTTCAAGTATGTGATTGGCATCG440GAGTGGGCGCCGGAGCCTATGTGCTGGCCAAGTTTGCACT480CATCTTCCCCGACCTGGTGGAGGGGCTGGTGCTGGTGAAC520ATCGACCCCAATGGCAAAGGCTGGATAGACTGGGCTGCCA560CCAAGCTCTCCGGCCTAACTAGCACTTTACCCGACACGGT600GCTCTCCCACCTCTTCAGCCAGGAGGAGCTGGTGAACAAC640ACAGAGTTGGTGCAGAGCTACCGGCAGCAGATTGGGAACG680TGGTGAACCAGGCCAACCTGCAGCTCTTCTGGAACATGTA720CAACAGCCGCAGAGACCTGGACATTAACCGGCCTGGAACG760GTGCCCAATGCCAAGACGCTCCGCTGCCCCGTGATGCTGG800TGGTTGGGGATAATGCACCCGCTGAGGACGGGGTGGTGGA840GTGCAACTCCAAACTGGACCCGACCACTACGACCTTCCTG880AAGATGGCAGACTCTGGAGGGCTGCCCCAGGTCACACAGC920CAGGGAAGCTGACTGAAGCCTTCAAATACTTCCTGCAAGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。