基因總覽
NDRG3 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 NDRG family member 3。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 20q11.23。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000349004 ★ | 36,651,771–36,746,090 | 16 |
| ENST00000373803 | 36,651,766–36,746,147 | 17 |
| ENST00000359675 | 36,651,766–36,746,147 | 15 |
| ENST00000373773 | 36,651,766–36,721,787 | 13 |
| ENST00000855484 | 36,651,766–36,746,147 | 15 |
| ENST00000855485 | 36,651,766–36,746,147 | 15 |
| ENST00000855486 | 36,651,766–36,746,147 | 16 |
| ENST00000855487 | 36,651,766–36,746,044 | 17 |
| ENST00000855488 | 36,651,766–36,746,046 | 16 |
| ENST00000930944 | 36,651,766–36,746,147 | 15 |
| ENST00000930945 | 36,651,766–36,746,147 | 14 |
| ENST00000930946 | 36,651,766–36,746,044 | 16 |
顯示 12/26 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>NDRG3 ENST00000349004 GRCh38 chr20:36745990-36747090 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCGGGTTAAAAGGGCGTGGTGGCTCACACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGAT GACGAGGTCAAGAGATCGAGACCATCCTGGCCAACACGGTGAAAACCCGTCTCTACTAATAATAGAAAAA TTAGCCAGGCCCGGTGGCACACGCCTACAGTGCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGA ACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCTAGTGCACTCCAGCCTGGCGACAGAGTGAGAC TCCGTCTCAAAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAAAACTTTTAGTCAGTGGTACTTAATGGTAAAGAAAT AATAGATAATAAATAGAGGAAGAGTGTGTCCTGTACATTTTGGTGTTAAATTGTTGGGTCATTAAGTTTA ATATCTGCAATCATTCTGGGAAAAAAAATTCCATCTCTAATGTTGCATTCAAGAAAGTAGATGATTTGGC TGACGGTTGTAATAGGGGTGATACAATGGAGGACTGGTAATTCGGAGCCCTGAGTCTTGGACTCTAGTTC TTAAATTACTATGTTCATTCACCAAAAATTTACTAAGCTCTTTCCACGTGCCGAGCACTGTGCTAGGCGC CCTGTGACCTTGGGTATGGCTCTAGGTCACCTTAAAAGGAGGATGCCATACCCTGCAAGAGCTCTTAGGG GCTTCATAAGGATGCGACTCAGGGAACTGAGGGAAGCGCTCCAGACGCAGAGCTCAATGGCCCTGCCGCC CAGCGCCTCCAAAATCTGAGATTCTTCTCTGAGGAAACTCCGCAGCAAGAAAAACTACATCAAAGATGGC GCCGCCGGCCTCTCCTGGCTCAGCCACCATCTTCTCGGTAGTTCCCGAGGTGGACGGGCACAGCACTCAT GCGCCGCCCTGGCGTCCTCGGCGCGCCTGCGCGGACCGCAGCACCTCCCCCGCCCCTCTCGCCGCCGCCG CCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCTGCTGCTGCACTGACGGCGGGTGCCCGCGCCTCAGGTGA GTGAGCGCCTCCGCCCGGCCCGCGGGGGGCGCGCGGCGCCGCATTCGGGGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| NDRG3_1 ↗ | 20:36,746,087 | 負股 | 36,746,077–36,746,136 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR20_C5MG4 · enhancer · 36744759–36746042 · regulatory
ENSR20_5BMCNG · CTCF_binding_site · 36745580–36745601 · regulatory
ENSR20_5BMCQH · CTCF_binding_site · 36746019–36746040 · regulatory
ENSR20_B99WB · promoter · 36746043–36746580 · regulatory
· motif · 36745472–36745484 · motif
· motif · 36745582–36745598 · motif
· motif · 36746021–36746037 · motif
· motif · 36746148–36746159 · motif
· motif · 36746148–36746159 · motif
· motif · 36746176–36746187 · motif
· motif · 36746448–36746460 · motif
· motif · 36746450–36746463 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：375 aa
NDRG3（NDRG family member 3）屬於 NDRG family，蛋白質長 375 個胺基酸。其第 326 至 375 位胺基酸區段註解為無序區域。
蛋白質三維結構
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GCCGCCGCCGCTGCTGCTGCACTGACGGCGGGTGCCCGCG40CCTCAGAGTTACTGATTTATTCTTGAGATTCCTCTACTCT80CGTTATCTGACCTCATGGATGAACTTCAGGATGTTCAGCT120CACAGAGATCAAACCACTTCTAAATGATAAGAATGGTACA160AGAAACTTCCAGGACTTTGACTGTCAGGAACATGATATAG200AAACAACTCATGGTGTGGTCCACGTCACTATAAGAGGCTT240ACCCAAAGGAAACAGACCAGTTATACTAACATATCATGAC280ATTGGCCTCAACCATAAATCCTGTTTCAATGCATTCTTTA320ACTTTGAGGATATGCAAGAGATCACCCAGCACTTTGCTGT360CTGTCATGTGGATGCCCCAGGCCAGCAGGAAGGTGCACCC400TCTTTCCCAACAGGGTATCAGTACCCCACAATGGATGAGC440TGGCTGAAATGCTGCCTCCTGTTCTTACCCACCTAAGCCT480GAAAAGCATCATTGGAATTGGAGTTGGAGCTGGAGCTTAC520ATCCTCAGCAGATTTGCACTCAACCATCCAGAGCTTGTGG560AAGGCCTTGTGCTCATTAATGTTGACCCTTGCGCTAAAGG600CTGGATTGACTGGGCAGCTTCCAAACTCTCTGGCCTGACA640ACCAATGTTGTGGACATTATTTTGGCTCATCACTTTGGGC680AGGAAGAGTTACAGGCCAACCTGGACCTGATCCAAACCTA720CAGAATGCATATTGCCCAAGACATCAACCAAGACAACCTG760CAGCTCTTCTTGAATTCCTACAATGGACGCAGAGACCTGG800AGATCGAAAGACCCATACTGGGCCAAAATGATAACAAATC840AAAAACATTAAAGTGTTCTACTTTACTGGTGGTAGGGGAC880AATTCGCCTGCAGTTGAGGCTGTGGTCGAATGCAATTCCC920GCCTGAACCCTATAAATACAACTTTGCTAAAGATGGCGGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。