基因總覽
NAPSB 是人類假基因（pseudogene），正式名稱為 napsin B aspartic peptidase (pseudogene)。登錄類型為 pseudogene。此基因座位於 19q13.33。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000562112 ★ | 50,333,877–50,344,761 | 9 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
已知功能與來源註解
Promoter 與基因調控
>NAPSB ENST00000562112 GRCh38 chr19:50344661-50345761 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTATCTTCTCTAAAAGGAAAACAGAGGCCAGGTGTGGTGGCTCACATGTGTAATCCCAGCACTCTGGGAG GCTGAGGCGGGTGGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGATCAGTATGGCCAACATCATGAAACCAAATCT CTATTAAAAATACATAAATTAGCCAGGTGCAGTGGCACGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGA GGCGAGAATCGCTTGAATCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCACCACGGCACTCCAGCCT GGGCGACAATGAGATTCTGTCTCAAAAATAAATGAATAAATAAATAAATAAATAACATGAAAGAAGGACA GAAAGAAGAGAATACTACAAAACAACCAGAAAACAAGTAACAAAATGTCAGGAGGACGTCCTTATCAAGA ACAACATTGAATGTAAATGGACTAAACTCTCGAATAAAAAGATATAGAACGGATGAATGGATGAAAAAGA AGACCCAATGTTTTGTTGCTTACAAGAAACATACTTCACCTACAAATAAGAGTCTGGGTCCTCAGACGCA GGCAGTCCCACTTCATATGGGAGGGCAGGCTTATAATCAGTTCCTCTCTCCCTTCCCCAGGCCCTTCACA GACACCTGCTGGTCCCTCCCACTTGGCCAAGGAAACACTGTGGTTAATGAGTCTCAGAAAAGTGATGTGA AAGTGAGAAGTAAAAGTGACAGAGGCTAAAGGATGGGGGGTGGGAGGCAGTCCCAGCAGAGGACACCCCA CGACCACCACCCCCCAAGTAGGGAATGAGGAGCACTAAGGACACAGGATACAACTTTTGTTGACACTACA CAAATACTCTGCACAAATCTTCAAAAACATCCTTGTCCCCCTGTGTCACCTGCTGAGAGACCTCGTGTTC TGGTCACCTCCTAAACCGGGAGGTGGGGCATAAACAGGGTGGAGTCACAGGGGAAAGAAAACTAGGAAGC CTGGGTTCACACCCGGCTCCCCAGCAATGTCTCCACCACTGCTGCTGCTACCCTTGCTGCTGCTGCTGCC TCTGCTGAATGTGGAGCCTGCTGGGGCCACACTGATCCGGTATGGTGACCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR19_9PZHC · enhancer · 50341060–50341559 · regulatory
ENSR19_83GZ3L · enhancer · 50344508–50344756 · regulatory
ENSR19_BCZQP · promoter · 50344757–50345296 · regulatory
ENSR19_9PZK4 · enhancer · 50347132–50347585 · regulatory
· motif · 50340175–50340187 · motif
· motif · 50340929–50340944 · motif
· motif · 50341145–50341162 · motif
· motif · 50341178–50341191 · motif
· motif · 50341213–50341225 · motif
· motif · 50341216–50341223 · motif
· motif · 50341226–50341239 · motif
· motif · 50341228–50341239 · motif
· motif · 50341228–50341239 · motif
· motif · 50341387–50341402 · motif
· motif · 50341405–50341418 · motif
· motif · 50341520–50341533 · motif
· motif · 50341525–50341537 · motif
· motif · 50341771–50341778 · motif
· motif · 50342303–50342318 · motif
· motif · 50342572–50342583 · motif
· motif · 50342619–50342634 · motif
· motif · 50342624–50342636 · motif
· motif · 50342627–50342642 · motif
· motif · 50342751–50342763 · motif
· motif · 50342757–50342770 · motif
· motif · 50342857–50342870 · motif
· motif · 50342857–50342870 · motif
· motif · 50342901–50342914 · motif
· motif · 50343219–50343230 · motif
· motif · 50343295–50343307 · motif
· motif · 50343348–50343358 · motif
· motif · 50344513–50344528 · motif
· motif · 50345086–50345094 · motif
· motif · 50345122–50345131 · motif
· motif · 50345716–50345731 · motif
· motif · 50346721–50346736 · motif
· motif · 50346726–50346738 · motif
· motif · 50346729–50346736 · motif
· motif · 50346729–50346744 · motif
· motif · 50347284–50347297 · motif
· motif · 50347284–50347299 · motif
· motif · 50347314–50347326 · motif
· motif · 50347389–50347403 · motif
· motif · 50347778–50347800 · motif
· motif · 50347778–50347800 · motif
基因座與轉錄註解
NAPSB 依 HGNC／Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000562112 ★ | transcribed_unprocessed_pseudogene | 1,266 nt | 9 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
DNA 與 RNA 序列
CCAGCAATGTCTCCACCACTGCTGCTGCTACCCTTGCTGC40TGCTGCTGCCTCTGCTGAATGTGGAGCCTGCTGGGGCCAC80ACTGATCCGGATCCCTCTTCGTCAAGTCCACCCTGGACGC120AGGACCCTGAACCTACTGAGGGGATGGGGAAAACCAGCAG160AGCTCCCCAAGTTGGGGGCCCCATCCCCTGGGGACAAGCC200TGCCTCGGTACCTCTCTCCAAATTCCTGGATGCCCAGTAT240TTTGGGGAAATTGGGCTGGGAACGCCTCCACAAAACTTCA280CTGTTGCCTTTGACACTGGCTCCTCCAATCTCTGGGTCCC320GTCCAGGAGATGCCACTTCTTCAGTGTGCCCTGCTGGTTC360CACCACCGCTTCAATCCCAATGCCTCCAGCTCCTTCAAGC400CCAGTGGGACCAAGTTTGCCATTCAGTATGGAACTGGGCG440GGTAGATGGAATCCTGAGTGAGGACAAGCTGACTATTGGT480GGAATCAAGGGTGCATCCGTGATTTTCGGGGAAGCTCTGT520GGGAATCCAGCCTGGTCTTCACTGTTTCCCGCCCCGATGG560GATATTGGGCCTCGGTTTTCCCATTCTGTCTGTGGAAGGA600GTTCGGCCCCCGCTGGATGTACTGGTGGAGCAGGGGCTAT640TGGATAAGCCTGTCTTCTCCTTTTACTTCAACAGGGACCC680TGAAGTGGCTGATGGAGGAGAGCTGGTCCTGGGGGGCTCA720GACCCGGCACACTACATCCCACCCCTCACCTTCGTGCCAG760TCACAGTCCCCGCCTACTGGCAGATCCACATGGAGCGTGT800GAAGGTGGGCTCACGGCTGACTCTCTGTGCCCAGGGCTGT840GCTGCCATCCTGGATACAGGCACACCTGTCATCGTAGGAC880CCACTGAGGAGATCCGGGCCCTGCATGCAGCCATTGGGGG920AATCCCCTTGCTGGCTGGGGAGTACATCATCCGGTGCTCA960cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。