基因總覽
MYOT 是一個蛋白質編碼基因,正式名稱為 myotilin,其產物屬於 myotilin/palladin 家族。myotilin 是肌肉細胞中與肌動蛋白交聯相關的複合體成員,主要與肌原纖維的組裝及穩定有關。蛋白質具有兩個 Ig-like C2-type 結構域,並含有多段註記為無序的區域;這些結構特色構成其蛋白質組成的基本輪廓。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000239926 ★ | 137,867,860–137,887,851 | 10 |
| ENST00000515645 | 137,867,777–137,887,851 | 11 |
| ENST00000968642 | 137,867,777–137,887,851 | 10 |
| ENST00001127954 | 137,867,777–137,887,851 | 9 |
| ENST00001137214 | 137,867,777–137,887,851 | 10 |
| ENST00000421631 | 137,867,858–137,887,851 | 10 |
| ENST00000968643 | 137,870,443–137,887,851 | 7 |
| ENST00000968644 | 137,870,443–137,887,851 | 8 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
myotilin 是由多種肌動蛋白交聯蛋白組成之複合體的一員,參與肌肉細胞中肌原纖維的組裝與穩定。其功能重點與肌原纖維的 Z 線有關;來源指出,myotilin 參與控制這些結構的形成及維持,但未進一步說明其調控步驟或分子機制。
肌原纖維的組裝與穩定是來源所描述的兩項相關功能:前者涉及肌原纖維形成,後者則指向其維持。myotilin 在 Z 線處參與這些過程,顯示其作用與肌肉細胞內肌原纖維的結構組織相關。現有資料未界定其作用是否直接,亦未提供特定實驗條件或細胞外系統的功能證據,因此不宜據此延伸出更細緻的調控模型。
來源將 myotilin 描述為多種肌動蛋白交聯蛋白複合體的一部分,並將其與肌原纖維在 Z 線的組裝和穩定聯繫起來。資料未列出此功能複合體的完整組成,也沒有詳述各成員間如何分工。因而可確定的是,myotilin 與肌肉細胞肌原纖維結構的建立及維持相關;至於它對這些過程的具體貢獻方式,現有資訊尚不足以判定。
Promoter 與基因調控
>MYOT ENST00000239926 GRCh38 chr5:137866860-137867960 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GTTAATTCAATCAAGATTGGGGTATCTACCCATGAGGGAGGGGAACTGAAGCCACCCCATGGAGATAATT CTACTCCCTTGGCCCAATCCTCATGCCACCTACCCTACTTCACCACATTTGCTGATTCGACATTTTATTC TTCTGCAATTATTTACTTCCCTGCACAAAAATGGAAATCTAAATACCATGATGGTCTCTGTGACAAAAAG TGAAAGGAAACTAACTGTTAGGAATAAAGGGAGATGAACATGCATTGACAGCTCTAATTATATAGATTGC TTATTTGTTTGGTTGTTTCTTAAGTGTTTCAAAACTCTTTCAGAATAAAAGTACTAGGCAAAAGGGGCAT ATGCCATACAGATTCAGAAAACTTGCTCAAGAAACACCATCATGTTTTTCCACCTCCCTACCTTCCCAGT GACATGTCACTATGACCTCGGTCTCCTGCTTTGCCCAGACTGCCCTCCACCTCGGAACAAACTGCTAGTA CTGAGAGACCTCAAATCTATTATTGAATCCTACTCTCATTAGGCAAAAGAAAAAAGACTTCAGATGAAGA ATTATGCAATACAAATCAATTGGGAGCCCATCTATCACTGGTCTTATTCCTGGAGAAGTCTTAGTATAAT AGATAGAAGAACTCCACTCTTGAAATATTATTTTCCCTTTAGTCCTCTCTCTTAAACTGGGAAAATTCAA AGTCCCCACCATAATAAAGAAATAAGAGGGTTTTTTTTCTATTTTTCCCATTTCCCTATTCACTGCCCTT CCCTCACATGAGCTTGCTAAAGTTCATAGTCAAAATTCACGTCTGAAATAAAGAGGCTTGCAAAAGAAGC TCATGTAATCCCACTCCTTAAATACCACTAAGACACGTGAGATATTGTTTAGATTGTGGACTCTTACTTT GACATGCCAGCATAGGTAGATGGACAGGCAAGCACATCAGATGTCACTGTTTGGCAGCTGATAAAAGTCA GTGGTGCTATAATACTAAGCACAGAGCCACTAGATTAGTCTGTGAGGGAAGGAGATGCCTCTTCCTTCCC TTCAATAGTGGGTTAAACCCAGCTGGCACCCTCTGGAACTACGGGTAAGTC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MYOT_1 ↗ | 5:137,867,860 | 正股 | 137,867,811–137,867,870 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
· motif · 137866974–137866985 · motif
· motif · 137866978–137866992 · motif
· motif · 137866978–137866992 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:498 aa
myotilin 長 498 個胺基酸,屬於 myotilin/palladin 家族。蛋白質含有兩個 Ig-like C2-type 結構域,分別位於第 250–335 與第 349–441 個胺基酸。另有多段區域註記為無序;第 79–150 位區域為與 ACTN1 互作所需,第 215–498 位與 ACTA1 互作所需,第 215–493 位則與 FLNC 互作所需。
蛋白質三維結構
細胞內定位
myotilin 位於肌肉細胞的肌原纖維肌節 Z 線,也可見於肌膜及細胞骨架。 於骨骼肌中,myotilin 與 MYOZ1 在 Z 線共定位;來源未描述定位隨條件或異構型而變化。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 26 個夥伴
- ACTN2P35609 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ACTN3Q08043 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- APBA1Q02410 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG1Q12959 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG3Q92796 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG4P78352 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- FLNCQ14315 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- FRMPD2Q68DX3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRID2IPA4D2P6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRIP1Q9Y3R0 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GRIP2Q9C0E4 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- IL16Q14005 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX2Q8N448 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI1Q96QZ7 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI2Q86UL8 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- MPDZO75970 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NHERF4Q86UT5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- NME7Q9Y5B8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PATJQ8NI35 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- PDZK1Q5T2W1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PFDN5Q99471 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SCRIBQ14160 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TJP1Q07157 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
myotilin 可形成同源二聚體,並與 ACTA1、ACTN1、FLNA、FLNB、FLNC 及 MYOZ2 互作;此外,它與 MYOZ1 的 C 端區域互作。來源未進一步界定這些互作是否同屬一個複合體。
疾病與遺傳關聯
MYOT 相關變異可造成肌原纖維肌病 3 型(MFM3),屬慢性神經肌肉疾病。患者可有進行性骨骼肌無力,遠端通常比近端嚴重;部分患者也有心肌病與周邊神經病變。受影響肌肉可見 Z 線紊亂或延展、玻璃樣結構,以及 myotilin 和其他異位表現蛋白過度累積。這些資料描述疾病與基因變異的關聯。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | myotilin 是多種肌動蛋白交聯蛋白所組成複合體的成員,參與肌肉細胞中肌原纖維的組裝與穩定,並與肌原纖維 Z 線處的結構維持相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of a complex of multiple actin cross-linking proteins. Involved in the control of myofibril assembly and stability at the Z lines in muscle cells PMID 12499399 ↗ |
| 交互作用 | myotilin 可形成同源二聚體,並與 ACTA1、ACTN1、FLNA、FLNB、FLNC 及 MYOZ2 互作;另與 MYOZ1 的 C 端區域互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Interacts with ACTA1, ACTN1, FLNA, FLNB, FLNC and MYOZ2. Interacts with the C-terminal region of MYOZ1 PMID 10369880 ↗ · PMID 10958653 ↗ · PMID 11038172 ↗ · PMID 12499399 ↗ · PMID 16076904 ↗ |
| 細胞定位 | myotilin 位於細胞膜的肌膜、細胞質細胞骨架,以及肌原纖維肌節的 Z 線;在骨骼肌中,myotilin 與 MYOZ1 於 Z 線共定位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane, sarcolemma; Cytoplasm, cytoskeleton; Cytoplasm, myofibril, sarcomere, Z line; Sarcomeric, also localized to the sarcolemma. Colocalizes with MYOZ1 at the Z-lines in skeletal muscle PMID 10369880 ↗ · PMID 16076904 ↗ |
| 疾病關聯 | MYOT 相關變異可造成肌原纖維肌病 3 型(MFM3),此慢性神經肌肉疾病可呈現遠端較近端明顯的進行性骨骼肌無力、緊繃的跟腱與低反射;部分患者有心肌病或周邊神經病變。受影響肌肉可見 Z 線紊亂與延展、大型玻璃樣結構、myotilin 及其他異位表現蛋白過度累積,以及明顯剛果紅陽性沉積。 | 含實驗來源 | 證據與來源Myopathy, myofibrillar, 3 MFM3 A form of myofibrillar myopathy, a group of chronic neuromuscular disorders characterized at ultrastructural level by disintegration of the sarcomeric Z disk and myofibrils, and replacement of the normal myofibrillar markings by small dense granules, or larger hyaline masses, or amorphous material. MFM3 is characterized by progressive skeletal muscle weakness greater distally than proximally, tight heel cords, hyporeflexia, cardiomyopathy and peripheral neuropathy in some patients. Affected muscle exhibits disorganization and streaming of the Z-line, presence of large hyaline structures, excessive accumulation of myotilin and other ectopically expressed proteins and prominent congophilic deposits. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 609200 PMID 10958653 ↗ · PMID 12428213 ↗ · PMID 15111675 ↗ · PMID 16380616 ↗ · PMID 25208129 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACAGAGCCACTAGATTAGTCTGTGAGGGAAGGAGATGCCT40CTTCCTTCCCTTCAATAGTGGGTTAAACCCAGCTGGCACC80CTCTGGAACTACGGGAACAATATTCTTCAAGAGAAGGTCA120CTCTACCAAAGCCAGGAGCACAGTATTCTCAGGATCTCAA160CAAGGAAGAGCAGACCAAGGTTGCTTCTGATTCCTTACAA200CCTTCCGTAATTCCAGGCTTGTGGCCCCAAATTCAGGGCC240CCACCCTTCCAGGAACAAATCATTATAGTAATAATTTGCC280TTCATCTTCCATATACCAACTAAGCATGTTTAACTACGAA320CGTCCAAAACACTTCATCCAGTCCCAAAACCCATGTGGCT360CCAGATTGCAGCCTCCTGGACCAGAAACCTCCAGCTTCTC400TAGCCAGACCAAACAGTCTTCCATTATCATCCAGCCCCGC440CAGTGTACAGAGCAAAGATTTTCTGCCTCCTCAACACTGA480GCTCTCACATCACCATGTCCTCCTCTGCTTTCCCTGCTTC520TCCCCAGCAGCATGCTGGCTCCAACCCAGGCCAAAGGGTT560ACAACCACCTATAACCAGTCCCCAGCCAGCTTCCTCAGCT600CCATATTACCATCACAGCCTGATTACAATAGCAGTAAAAT640CCCTTCCGCTATGGATTCCAACTATCAACAGTCCTCAGCT680GGCCAACCTATAAATGCAAAGCCATCCCAAACTGCAAATG720CTAAGCCCATACCAAGAACTCCTGATCATGAAATACAAGG760ATCAAAAGAAGCTTTGATTCAAGATTTGGAAAGAAAGCTG800AAATGCAAGGACACCCTTCTTCATAATGGAAATCAACGTC840TAACATATGAAGAGAAGATGGCTCGCAGATTGCTAGGACC880ACAGAATGCAGCTGCTGTGTTTCAAGCTCAGGATGACAGT920GGTGCACAAGACTCGCAGCAACACAACTCAGAACATGCGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。