基因總覽
MYO1G 是蛋白質編碼基因,產物 myosin IG 屬於 myosin family,並歸入 TRAFAC class myosin-kinesin ATPase superfamily。它是非典型肌球蛋白,具有 ATPase 活性,屬於以 actin 為基礎的馬達分子。其蛋白質包含 Myosin motor、IQ 與 TH1 結構域,以及一段 actin-binding 區域,呈現馬達功能區與其他結構區域並存的特徵。來源所述的功能涉及免疫細胞相關過程;以下功能說明會進一步交代其作用方式與免疫學意義。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000258787 ★ | 44,962,662–44,979,015 | 22 |
| ENST00000891370 | 44,962,662–44,979,105 | 21 |
| ENST00000891371 | 44,962,662–44,979,105 | 22 |
| ENST00000946563 | 44,962,662–44,979,813 | 23 |
| ENST00000946564 | 44,962,662–44,979,105 | 20 |
| ENST00000946565 | 44,962,662–44,979,105 | 21 |
| ENST00000946566 | 44,962,662–44,979,105 | 22 |
| ENST00001138846 | 44,962,662–44,979,105 | 22 |
| ENST00000648014 | 44,962,856–44,979,105 | 21 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
myosin IG 是以 actin 為基礎、具有 ATPase 活性的非典型肌球蛋白,可參與細胞內運動。在免疫反應中,它能調節 T 細胞移動:透過產生膜張力,促使 T 細胞維持細胞內在的迂迴搜尋模式。這種移動方式有助於淋巴結巡查時辨識稀少的抗原呈現細胞,進而支持對病原體的清除。
myosin IG 也與 B 細胞中的多種依賴細胞膜與細胞骨架的過程有關,並參與 Fc-gamma receptor(Fc-gamma-R)介導的吞噬作用。這些描述指出,它在不同免疫細胞中涉及膜與細胞骨架相關活動;來源未進一步列明 B 細胞中的各項過程,也未描述吞噬作用的具體分子步驟。
此外,myosin IG 構成次要組織相容性抗原 HA-2。次要組織相容性抗原是源自多型性細胞內蛋白質的免疫原性胜肽;這些蛋白質經一般抗原處理途徑切割後,胜肽可與 MHC 結合並呈現在細胞表面,供特定 T 細胞辨識。HA-2 受 MHC class I HLA-A*0201 限制。當 HLA 相符的手足捐贈者與受贈者在次要組織相容性抗原上不相符時,這類抗原可刺激 T 細胞反應,並與造血幹細胞移植後的移植物排斥或移植物抗宿主病(GVHD)相關;來源指出,GVHD 是骨髓移植常見的併發症。
Promoter 與基因調控
>MYO1G ENST00000258787 GRCh38 chr7:44978915-44980015 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGTGTGACCTGCCCCAGTCTGTCCTGGGATGAAAAAGAACTTTTTCCAGTCTGCCTGGAAGCTAAGAGAA CTGCACCCCTCCCACTTCTTCCAGGAGCACTAAGTGTCAGGAATGCAGTGTCTGGAGATTTTGGCCACTC CCTAAATGCAGCCGCTCCCCAAATGCGCTGCCTCATCTTCAAAGTGCAGGGACAGCAGCTCTGAGATGAG GCCACAGGGCTCCAGGCATGTTCCTGGTCCTCACTGCAGTTTATGGGGGATCGGCTGGACACAAGTACAA GGCAGAGGACAGTTAGGGGCACAGGGGTCCCACTGAAGGCCAGCCCCATGCAGAGGATGCTCTGGGGTCC TCTGTCCCTCCCCCGTGGCTGGGGTGGGGAATTGCAGTGCTAGGACCACTGGCCCTTGGCAGGTCACACA AGAAGCTTTGCTCGTCTACACCCCAGTGTGGCCTTCACACTGCAAAGAAGGCTGTTGCCCCCACCCCAAA GGCCTGGGCATTAGGATCCTTTTTCATTTTTGTATTAATGTACAATGTACATACAGTATATTGCATCTAG TGTTCAGTTCTGACTTGAGAGACACACACAGCCAGGTAACCAAGATCACGTCAAAAAATCTTTCTTTAAA GTCCCACAAGTGACTCTAACGTGCTGCCAGGGTTGGAAGCCAACCCACGGAGTCTTGTCTCCTGCTTGTG GGTGGAGGGGAGCTTCCGAAGGAGGCCAGCGAAGAACCCTCCAAAGCGGGGAGGACCCAGCATCCGGCCC CTCGCCCCTGGCGTGCAAACGGGTCAGACCGTTAGGCACAGCCTCCTTGTGGGGCGCAGGGACAGGAAGC AGGGTTTAGAGCACCTCGAGGGGGAAGGAGTGGCAAGTGCGGAGGGCAGCCCCTCCCAGGACTAGAACCC ACTTCCTACTTTACACCAGCACTGGAGGAGGCTGGTGGGGCAGGGCGGGGGCGGTGGGGCCTCCCCTAGC CTTCCCTCCCCCTCTCCTTCACTGTCCTTCCAGCAGGCACAGGAAGGTGAGGCAAGGTGTTTCCAGCCGG CAGGATGGAGGACGAGGAAGGCCCTGAGTATGGCAAACCTGACTTTGTGCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MYO1G_1 ↗ | 7:44,979,015 | 負股 | 44,979,005–44,979,064 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_BBWZN · enhancer · 44973671–44974591 · regulatory
ENSR7_C6GHL · enhancer · 44977114–44979004 · regulatory
ENSR7_BBX2F · promoter · 44979005–44979523 · regulatory
ENSR7_D488X · enhancer · 44980524–44982945 · regulatory
· motif · 44974000–44974015 · motif
· motif · 44974083–44974105 · motif
· motif · 44974083–44974105 · motif
· motif · 44974098–44974113 · motif
· motif · 44974098–44974113 · motif
· motif · 44974516–44974529 · motif
· motif · 44974516–44974529 · motif
· motif · 44974854–44974867 · motif
· motif · 44974854–44974867 · motif
· motif · 44976988–44977003 · motif
· motif · 44977137–44977152 · motif
· motif · 44977137–44977152 · motif
· motif · 44977220–44977227 · motif
· motif · 44977220–44977235 · motif
· motif · 44977311–44977324 · motif
· motif · 44977311–44977324 · motif
· motif · 44977319–44977334 · motif
· motif · 44977325–44977337 · motif
· motif · 44977614–44977629 · motif
· motif · 44977653–44977668 · motif
· motif · 44977658–44977670 · motif
· motif · 44977661–44977668 · motif
· motif · 44977714–44977726 · motif
· motif · 44977717–44977724 · motif
· motif · 44977717–44977732 · motif
· motif · 44977865–44977878 · motif
· motif · 44978126–44978139 · motif
· motif · 44978126–44978139 · motif
· motif · 44978332–44978345 · motif
· motif · 44978332–44978345 · motif
· motif · 44978407–44978420 · motif
· motif · 44978688–44978701 · motif
· motif · 44978688–44978701 · motif
· motif · 44978780–44978793 · motif
· motif · 44979051–44979064 · motif
· motif · 44979363–44979379 · motif
· motif · 44979363–44979379 · motif
· motif · 44979597–44979610 · motif
· motif · 44980041–44980052 · motif
· motif · 44980049–44980061 · motif
· motif · 44980051–44980058 · motif
· motif · 44980128–44980140 · motif
· motif · 44980130–44980137 · motif
· motif · 44980130–44980143 · motif
· motif · 44980130–44980145 · motif
· motif · 44980361–44980377 · motif
· motif · 44980632–44980645 · motif
· motif · 44980632–44980645 · motif
· motif · 44980762–44980777 · motif
· motif · 44980930–44980939 · motif
· motif · 44980985–44980998 · motif
· motif · 44980985–44980998 · motif
· motif · 44981070–44981083 · motif
· motif · 44981148–44981161 · motif
· motif · 44981148–44981161 · motif
· motif · 44981616–44981631 · motif
· motif · 44981773–44981784 · motif
· motif · 44981773–44981784 · motif
· motif · 44981952–44981967 · motif
· motif · 44982168–44982183 · motif
· motif · 44982270–44982292 · motif
· motif · 44982270–44982292 · motif
· motif · 44982808–44982823 · motif
· motif · 44982808–44982823 · motif
· motif · 44983628–44983643 · motif
· motif · 44983734–44983741 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:1018 aa
myosin IG 長 1018 個胺基酸,屬於 myosin family,並歸入 TRAFAC class myosin-kinesin ATPase superfamily。蛋白質含有 Myosin motor 結構域(第 9–707 位)、IQ 結構域(第 710–739 位)及 TH1 結構域(第 824–1017 位);第 584–606 位另註記為 actin-binding 區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
myosin IG 為周邊膜蛋白,可見於細胞膜及吞噬杯,並會被招募至 Fc-gamma receptor(Fc-gamma-R)吞噬杯。 在 T 細胞中,依相似性推定,它會於移動中的細胞或膜變形時,短暫聚集在質膜的局部區域。 其膜定位不高度依賴 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate;ATP 存在時則會從膜上釋離。 它也可能富集於微絨毛或膜皺褶等周邊突起。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Cell projection, phagocytic cup。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
myosin IG 透過自身的 IQ motifs 與 calmodulin 交互作用。來源描述的是兩者之間的交互作用,未指出它們組成特定複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | myosin IG 是具 ATPase 活性的非典型肌球蛋白,能以 actin 為基礎參與細胞內運動。它在免疫反應中藉由產生膜張力調節 T 細胞移動,維持迂迴搜尋,促進淋巴結巡查時辨識稀少的抗原呈現細胞;也參與 B 細胞的膜與細胞骨架相關過程,以及 Fc-gamma receptor 介導的吞噬作用。 | 推論支持 | 證據與來源Unconventional myosin required during immune response for detection of rare antigen-presenting cells by regulating T-cell migration. Unconventional myosins are actin-based motor molecules with ATPase activity and serve in intracellular movements. Acts as a regulator of T-cell migration by generating membrane tension, enforcing cell-intrinsic meandering search, thereby enhancing detection of rare antigens during lymph-node surveillance, enabling pathogen eradication. Also required in B-cells, where it regulates different membrane/cytoskeleton-dependent processes. Involved in Fc-gamma receptor (Fc-gamma-R) phagocytosis |
| 功能 | myosin IG 構成次要組織相容性抗原 HA-2。此類抗原胜肽源自多型性細胞內蛋白質,經抗原處理後與 MHC 結合並呈於細胞表面,可引發特定 T 細胞反應。HA-2 受 MHC class I HLA-A*0201 限制;在 HLA 相符手足間移植時,次要抗原不相符可與移植物排斥或 GVHD 相關,後者是骨髓移植常見併發症。 | 含實驗來源 | 證據與來源Constitutes the minor histocompatibility antigen HA-2. More generally, minor histocompatibility antigens (mHags) refer to immunogenic peptide which, when complexed with MHC, can generate an immune response after recognition by specific T-cells. The peptides are derived from polymorphic intracellular proteins, which are cleaved by normal pathways of antigen processing. The binding of these peptides to MHC class I or class II molecules and their expression on the cell surface can stimulate T-cell responses and thereby trigger graft rejection or graft-versus-host disease (GVHD) after hematopoietic stem cell transplantation from HLA-identical sibling donor. GVHD is a frequent complication after bone marrow transplantation (BMT), due to mismatch of minor histocompatibility antigen in HLA-matched sibling marrow transplants. HA-2 is restricted to MHC class I HLA-A*0201 PMID 11544309 ↗ |
| 交互作用 | myosin IG 透過其 IQ motifs 與 calmodulin 交互作用;此敘述指出兩者的交互作用,未提供其他結合條件或複合體資訊。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | myosin IG 是周邊膜蛋白,位於細胞膜與吞噬杯,並會被招募至 Fc-gamma receptor 吞噬杯。依相似性推定,它在 T 細胞移動或膜變形時短暫聚集於質膜局部;此定位不高度依賴 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate,ATP 存在時會離開膜,且可能富集於微絨毛或膜皺褶。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Peripheral membrane protein; Cell projection, phagocytic cup; Recruited to Fc-gamma receptor (Fc-gamma-R) phagocytic cup. In T-cells, transiently accumulates in discrete areas at the plasma membrane of migrating cells or when membranes are deformed (By similarity). Localization at the membrane is not highly dependent on phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate levels. Released from the membrane in the presence of ATP. May be enriched in peripheral processes, such as microvilli or ruffles PMID 19968988 ↗ · PMID 20071333 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACTGTCCTTCCAGCAGGCACAGGAAGGTGAGGCAAGGTGT40TTCCAGCCGGCAGGATGGAGGACGAGGAAGGCCCTGAGTA80TGGCAAACCTGACTTTGTGCTTTTGGACCAAGTGACCATG120GAGGACTTCATGAGGAACCTGCAGCTCAGGTTCGAGAAGG160GCCGCATCTACACCTACATCGGTGAGGTGCTGGTGTCCGT200GAACCCCTACCAGGAGCTGCCCCTGTATGGGCCTGAGGCC240ATCGCCAGGTACCAGGGCCGTGAGCTCTATGAGCGGCCAC280CCCATCTCTATGCTGTGGCCAACGCCGCCTACAAGGCAAT320GAAGCACCGGTCCAGGGACACCTGCATCGTCATCTCAGGG360GAGAGTGGGGCAGGGAAGACAGAAGCCAGTAAGCACATCA400TGCAGTACATCGCTGCTGTCACCAATCCAAGCCAGAGGGC440TGAGGTGGAGAGGGTCAAGGACGTGCTGCTCAAGTCCACC480TGTGTGCTGGAGGCCTTTGGCAATGCCCGCACCAACCGCA520ATCACAACTCCAGCCGCTTTGGCAAGTACATGGACATCAA560CTTTGACTTCAAGGGGGACCCGATCGGAGGACACATCCAC600AGCTACCTACTGGAGAAGTCTCGGGTCCTCAAGCAGCACG640TGGGTGAAAGAAACTTCCACGCCTTCTACCAATTGCTGAG680AGGCAGTGAGGACAAGCAGCTGCATGAACTGCACTTGGAG720AGAAACCCTGCTGTATACAATTTCACACACCAGGGAGCAG760GACTCAACATGACTGTGCACAGTGCCTTGGACAGTGATGA800GCAGAGCCACCAGGCAGTGACCGAGGCCATGAGGGTCATC840GGCTTCAGTCCTGAAGAGGTGGAGTCTGTGCATCGCATCC880TGGCTGCCATATTGCACCTGGGAAACATCGAGTTTGTGGA920GACGGAGGAGGGTGGGCTGCAGAAGGAGGGCCTGGCAGTG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。