演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

MYO15BMYO15BP

myosin XVB

MYO15B 的基因身分與分類資料已收錄,功能註解尚待補充。

Homo sapiens17q25.1UniProt Q96JP2
OFFICIAL SYMBOL
MYO15B
CHROMOSOME
17
UNIPROT
Q96JP2
PDB / ALPHAFOLD
2DLP
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

MYO15B 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 myosin XVB。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 17q25.1。

Official symbol
MYO15B
Gene name
myosin XVB
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14083
UniProt
Q96JP2
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
MYO15BP

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717q25.1
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegMYO15Bpq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr17:75,587,800–75,626,849
Gene span
39,050 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000645453 ★75,587,800–75,626,84964
ENST0000064200775,610,699–75,626,48442
ENST0000058314075,619,879–75,620,9213
ENST0000057822075,621,075–75,624,89710

顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用;有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 75587800 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>MYO15B ENST00000645453 GRCh38 chr17:75586800-75587900 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GAAGGCAGGCTGGCTTTTTATGGTATTATTATGAAATCACCAGATTACATTGTTAAGTGAAAAAGGCAAA
GTGGAGACCCCGGAGCTACATAAGCTACCACTTGTGCTAAAGGGGAAAAATATAATATTTGCTTTTCTCT
GCATGGAAAGTTTTTGTTGTTGTTTCTTTGTTTTTGAGACAAACAAAATGCTGTCACCCAGGCTGGAGTG
CAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCATGCCATTCTCTCCTGCCTCCTGGG
TTCATGCCATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCCCCACCACGACCGGCTA
ATTTATCGTATTTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTCCATCTCCTGACCT
CGTGATCCGCCCTCCTTGGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAACCT
GGAAAATTTTGCAAGGAAATACAGAAATGGGTAACCTCAGGGGAACACTGAGTACATAGGCTGAGGGTCA
GGAATGGGAGACTTTTATCTTGTAATGTTTGGATGTTTGAATTATGTGAATGTATTACCTGTTTTAAAAA
TAGATATTTTAAAAACACACACATTGGGGCAATCAGGAATGTATGGGGTGTGGTTCTGTTCCACAACTCC
AAGGAGGTAGACAGGCATGTTTTACACCAGTTCAAGATGTACATTTATGTTTTATGTACTTTTCGGTAAA
TTGTATTTATTCCACAATTGAAAAGAACAAAAACCCTAGCGACTCATGGAGTGCTGCCGTGTGCCAGGGT
GGGCCTGGCCCCAGTCCCTTGGAACCCTCAGAAGGAAGAAGTCCAGACAGGTTCTCTGGGCCCTTCCTTG
CTGGGCAAGCACTGAGGTGGGAGTGGAGCATGGACCCCCTCAGTCTGGCGCGGTGCGAGGCTGGCCTGGC
TGGCAGCGCCTCCCGGCGGCACTGTTGCCCTGTCCGCAGCTGTAGCGTCTCCTGTTTCCTGGGCGCCTCT
ATTCCATTGTTGGCCGAGGGGGTCAGGACCCGCCGCCTTCTGCATTATTGA
MYO15B 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
MYO15B_1 ↗17:75,587,800正股75,587,751–75,587,810

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_BK229 · enhancer · 75584266–75584945 · regulatory

ENSR17_93523F · promoter · 75587503–75587810 · regulatory

ENSR17_5MR2TH · CTCF_binding_site · 75587782–75587803 · regulatory

ENSR17_5MR355 · CTCF_binding_site · 75589221–75589242 · regulatory

ENSR17_5MR36L · CTCF_binding_site · 75589536–75589557 · regulatory

ENSR17_5MR36T · CTCF_binding_site · 75589591–75589612 · regulatory

· motif · 75587784–75587800 · motif

· motif · 75587868–75587875 · motif

· motif · 75587999–75588012 · motif

· motif · 75587999–75588012 · motif

· motif · 75589198–75589215 · motif

· motif · 75589207–75589224 · motif

· motif · 75589223–75589239 · motif

· motif · 75589231–75589244 · motif

· motif · 75589299–75589311 · motif

· motif · 75589301–75589308 · motif

· motif · 75589461–75589473 · motif

· motif · 75589463–75589470 · motif

· motif · 75589471–75589484 · motif

· motif · 75589538–75589554 · motif

· motif · 75589593–75589609 · motif

· motif · 75589605–75589620 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:3096 aa

1 aa3096 aa結構域功能區域
依 Q96JP2 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

myosin XVB 為 3,096 個胺基酸的蛋白質,屬於 TRAFAC class myosin-kinesin ATPase 超家族中的 myosin family。其結構包含 Myosin motor、IQ、兩個 MyTH4、SH3 與 FERM 結構域,並有一段 Actin-binding 區域;序列另預測含多個無序區段。

結構域Myosin motor720–1394 aa
結構域IQ1414–1443 aa
結構域MyTH4 11551–1702 aa
結構域SH32481–2542 aa
結構域MyTH4 22643–2789 aa
結構域FERM2795–3096 aa
功能區域Disordered1–330 aa
功能區域Disordered389–489 aa
功能區域Disordered508–540 aa
功能區域Disordered553–649 aa
功能區域Actin-binding1273–1295 aa
功能區域Disordered1802–1833 aa
功能區域Disordered1963–2026 aa
功能區域Disordered2040–2262 aa
功能區域Disordered2548–2567 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2DLP…

PDB · 2DLP

NMR · - · A=2483-2554

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

myosin XVB 的定位註記為細胞質。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 50 個夥伴 · 最多顯示 50 個
MYO15BPMYO15BABI2ADAMTSL4CARD9CCNCCFAP68COILCRXDUSP21ERASFHL2GAB2GADD45GIP1GINS3GPRASP3HOXA1IHO1IKZF3KATNBL1KCNJ6KIAA0408KIF24KIFC3KLF4KLHL12KRT13KRT34KRT35KRT75LIMS1MTUS2MYOZ3NADSYN1NDUFA12NECAB2NEDD4NEFLNHSL2NKAPD1NOTCH2NLCNR1D2NUP62PAK5PKNOX2PLEKHA3PNMA1POU6F2PPM1KPRKAR1BRBM11RCN1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 81 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
細胞定位myosin XVB 的定位註記為細胞質。推論支持
證據與來源

Cytoplasm

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000645453 · 9,914 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1ACTGTTGCCCTGTCCGCAGCTGTAGCGTCTCCTGTTTCCT40
41GGGCGCCTCTATTCCATTGTTGGCCGAGGGGGTCAGGACC80
81CGCCGCCTTCTGCATTATTGATGGTCCTGTAAGGCGGGCA120
121CCTCGGGGAGTAGAGCCTGTAGCCCCTGCGAGAGCAGAGC160
161CGGGTGGTGCACTGCACAGAAGGTCACCGCGGGAGGCCAA200
201ATCCCCGGGGAGGGGAAAGGACCTGGGCGTCGGGAAGCCC240
241GTCTCCTTTGGGCCAGCCATGGGCAGGAACCAGCGCAAAG280
281CGCCCCAGCGCCTGGAGAGGCCCGGGAGGCCGGCCTCAGG320
321GGAGCAGGAGTCGGGGTCGGCCAGCGCGGATGGCGCGCCC360
361AGCCGGGAACGCCGTTCCGACCGCGGGCAGGCGGACAGGG400
401CGAAACCGGCGGCCGAGCCTGCCACCGCCGGGGGCCAGGG440
441AACCCCTGGTGGCCGCAGGAAGCCCACTGCAGAGGGGAAC480
481GGCGGCTGCAGACGCCCAGGGGCTGGGCTGTCCCCGAAAG520
521CCCAGGAGAGGCAAAGCAACGCGCAGCGTCAGGGACGCGG560
561GCCCAGGGGCGGCCGCGGGGGGCGCCTGGAGGAGGGAAGC600
601CTCTCCGGAGGAGAAGAGCTGGGCGGCCGCCGTAGGAGGA640
641AGCGGAAAGATAAGGGGCCCTCGGCTCGGCGGGGCCGCCG680
681GACGCCCAGGAGCCTCAATGGGGACACGTCGGGTGGGGAC720
721GGAGGCAGCTCCTGTCCGGACAGCGAAACCCGCGAGGCCC760
761AGGAGAGCGGCAGCCAGCGCGGCACAGCCCGGGAGCTGCG800
801GCCCACGCCGGAGCCTACGGACATGGGCTCGGAAGGGACA840
841AAAACCGGGCCGGAGTCAGCGCTGGAGCCAAGCAGCGACG880
881GCCTGGACAGCGACTGGCCCCACGCAGATACCCGGGGCCG920
921GGAAGGGTCGTCGGGGACGGGGCCCCTGGGAGCCAGCGAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。