基因總覽
MXD3（MAX dimerization protein 3）是由蛋白質編碼基因 MXD3 產生的轉錄調控蛋白。來源將其描述為轉錄抑制因子，並指出它能與 MAX 結合形成辨識特定 DNA 序列的複合體。其已註解的結構包含 bHLH 結構域；這項特徵與來源所述的 DNA 結合及二聚化關係相符。關於其具體作用方式與功能意義，見下方功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000439742 ★ | 177,307,210–177,311,898 | 6 |
| ENST00000427908 | 177,305,500–177,311,905 | 6 |
| ENST00000423571 | 177,306,817–177,311,905 | 5 |
| ENST00000927425 | 177,307,205–177,312,344 | 7 |
| ENST00000927426 | 177,307,205–177,312,344 | 7 |
| ENST00000927427 | 177,307,210–177,312,344 | 7 |
| ENST00000927428 | 177,307,210–177,312,344 | 6 |
| ENST00001132076 | 177,307,210–177,311,905 | 6 |
| ENST00000513063 | 177,307,435–177,312,757 | 7 |
| ENST00000513169 | 177,307,813–177,311,882 | 5 |
| ENST00000502529 | 177,307,882–177,311,896 | 4 |
| ENST00001130913 | 177,309,545–177,311,905 | 5 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MXD3 被描述為轉錄抑制因子。依據相似性推定，它與 MAX 結合後形成具有序列選擇性的 DNA 結合蛋白複合體，可辨識核心序列 5'-CAC[GA]TG-3'。這表示 MXD3 的 DNA 辨識作用是在與 MAX 組成複合體的條件下描述，而非單獨進行。
來源指出，MXD3 會藉由競爭 MAX 來拮抗 MYC 的轉錄活性。此作用將 MXD3 與 MYC 依賴的轉錄調控連結起來；但現有資料未進一步交代其調控的具體基因或其他下游分子步驟。
在生物學效應方面，MXD3 被描述為可抑制 MYC 依賴的細胞轉化。這項功能敘述同樣標註為依據相似性推定，因此應視為推論性資料，而非此處已直接證實的實驗結論。整體而言，來源支持的功能圖像是：MXD3 與 MAX 協同辨識 DNA，並透過與 MYC 競爭 MAX，抑制 MYC 轉錄活性及 MYC 依賴的細胞轉化；其作用細節仍未由所提供資料說明。
Promoter 與基因調控
>MXD3 ENST00000439742 GRCh38 chr5:177311798-177312898 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGGCATTGGCTCTGATCCTTCAACGCTGTCGCAGGGCTCCTGAGGCTTAGAGACGGAGGTCACCTCCTGA GTCATACACAGCTGAGACATCAGTGACAGGAGAGGACCCCAACTGCGTGGATACCAGAGCCCAAGGCCCC GGAAAAGGCCATTTCGCGTGCCTCCAGGGTATGGCCTGCCTGAGGAAGCTGTTACCCCACTGACGTTTTC GTAGCAACAACAGCTTCCTCACAGAAGAGGAGGGGGGCCGAGATATTATTCCCATTCGACACAGTAGGAA GCTGGGGCCCACGGGGGCCTTCGGGGGCAGATGGCAGGCAGGCTTGGGGACAGACCCCGGAGGGCAGGAG CCGGGTCCGCCGCCCCTCCGCCGGCGCCTGCGCATTGAGGCCCAGCTCCCCTCTCAACCCCGCCCCATCG CTTGGGTTTTCAAATTTGAAACCTGCTTCTTTTCCCGCCCGAACGTGTGGATCAGCGGCGGGAGAGGGCG GGGCAGAGCGCCAGCCAATAGGGCATCAGAGGCTCCCCGACCCCGCCCCGAGGATGACAACAGCGATCCT TGAGAAGCCATGTGCGAATGGGCGAGCGGCGGCCGGAGGCCCCGCCCCCGCGGCACCCACGTGCAGCGGC TGGGCCCGGCGCTTTCAGGGGACCACCAGGCCCCCAGAGCGCCGTGCTATGTTGGGGGCTAGTCACTAGC ACGGGGCTGGAAGCTGAGATCAAAGACGCCAATGAGCCGGCGTGGGTGGATGAGTGAGGCGGGCAAGAAG CAGCACCGGTTAGCCTGAGGGTTCGCTCCAGGGCCAGGCCTGGAGCCAGCGCCCTTACCTGCCCCTGGAA AGTCTGAGACCACTCGGGGCGGGGCGGCTGCCGGAGGGTGGGCTGCGGCTCCGTGGCGGGTTCCAGAGGG GCGGAGCCAAGGGCTGGGCGTTCCCGCGGGCGGGGCGTCCCGGGGGCGGGGCGGGCCCCTGTGTTTGTTG CACCGTGTCAGTTACTTTGTAACAAAAGTGCTGCAGCCGCTTGCTCCGGCCGGCACCCTAGGCCGGCCCG CCGCCAGCTGTCGCCGACATGGAACCCTTGGCCAGCAACATCCAGGTCCTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MXD3_1 ↗ | 5:177,311,898 | 負股 | 177,311,888–177,311,947 |
| MXD3_3 ↗ | 5:177,312,271 | 負股 | 177,312,261–177,312,320 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR5_53JP2RB · CTCF_binding_site · 177309060–177309081 · regulatory
ENSR5_53JP2WL · CTCF_binding_site · 177309767–177309788 · regulatory
ENSR5_53JP2X2 · CTCF_binding_site · 177309860–177309881 · regulatory
ENSR5_94LD7L · promoter · 177311885–177312388 · regulatory
ENSR5_94LD7S · promoter · 177312747–177313247 · regulatory
ENSR5_53JP45C · CTCF_binding_site · 177316840–177316861 · regulatory
· motif · 177309062–177309078 · motif
· motif · 177309569–177309577 · motif
· motif · 177309769–177309785 · motif
· motif · 177309793–177309801 · motif
· motif · 177309793–177309810 · motif
· motif · 177309862–177309878 · motif
· motif · 177311212–177311224 · motif
· motif · 177311937–177311947 · motif
· motif · 177311953–177311963 · motif
· motif · 177311982–177311992 · motif
· motif · 177312034–177312044 · motif
· motif · 177312149–177312162 · motif
· motif · 177312234–177312244 · motif
· motif · 177312276–177312292 · motif
· motif · 177312276–177312292 · motif
· motif · 177312285–177312298 · motif
· motif · 177312290–177312300 · motif
· motif · 177312359–177312369 · motif
· motif · 177312405–177312415 · motif
· motif · 177312437–177312448 · motif
· motif · 177312482–177312492 · motif
· motif · 177312515–177312526 · motif
· motif · 177312515–177312526 · motif
· motif · 177313075–177313084 · motif
· motif · 177316842–177316858 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：206 aa
MXD3 蛋白長 206 個胺基酸。其第 57 至 109 位胺基酸區段註解為 bHLH 結構域；第 8 至 25 位區段與 SIN3A、SIN3B 的互作相關。第 25 至 67 位及第 146 至 171 位區段則註解為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MXD3 的細胞內定位註解為細胞核。 來源未提供定位變化的條件或不同異構型之間的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 10 個夥伴
- CYSRT1A8MQ03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT31Q15323 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP1-1Q07627 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP1-3Q8IUG1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-7P60409 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP3-3Q9BYR6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NOTCH2NLAQ7Z3S9 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- NOTCH2NLCP0DPK4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NUP62P37198 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TFIP11Q9UBB9 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
MXD3 與 MAX 形成異源二聚體並結合 DNA；來源指出，有效的 DNA 結合需要與另一個 bHLH 蛋白二聚化。另有互作註解記載 MXD3 與 SIN3A、SIN3B 及 RNF17 互作；這些描述未進一步說明互作方式或所形成的複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | MXD3 被描述為轉錄抑制因子；依據相似性推定，它與 MAX 結合形成序列專一性的 DNA 結合複合體，可辨識核心序列 5'-CAC[GA]TG-3'。MXD3 也會競爭 MAX，以拮抗 MYC 的轉錄活性，並抑制 MYC 依賴的細胞轉化。 | 推論支持 | 證據與來源Transcriptional repressor. Binds with MAX to form a sequence-specific DNA-binding protein complex which recognizes the core sequence 5'-CAC[GA]TG-3'. Antagonizes MYC transcriptional activity by competing for MAX and suppresses MYC dependent cell transformation (By similarity) |
| 交互作用 | 有效的 DNA 結合需要 MXD3 與另一個 bHLH 蛋白二聚化；MXD3 可與 MAX 形成異源二聚體並結合 DNA。此外，MXD3 與 SIN3A、SIN3B 及 RNF17 有互作；來源未提供這些互作的進一步條件或方式，並將相關資料標示為依據相似性推定。 | 推論支持 | 證據與來源Efficient DNA binding requires dimerization with another bHLH protein. Binds DNA as a heterodimer with MAX. Interacts with SIN3A AND SIN3B. Interacts with RNF17 (By similarity) |
| 細胞定位 | MXD3 的細胞內定位註解為細胞核。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AACAAAAGTGCTGCAGCCGCTTGCTCCGGCCGGCACCCTA40GGCCGGCCCGCCGCCAGCTGTCGCCGACATGGAACCCTTG80GCCAGCAACATCCAGGTCCTGCTGCAGGCGGCCGAGTTCC120TGGAGCGCCGTGAGAGAGAGGCCGAGCATGGTTATGCGTC160CCTGTGCCCGCATCGCAGTCCAGGCCCCATCCACAGGAGG200AAGAAGCGACCCCCCCAGGCTCCTGGCGCGCAGGACAGCG240GGCGGTCAGTGCACAATGAACTGGAGAAGCGCAGGAGGGC280CCAGTTGAAGCGGTGCCTGGAGCGGCTGAAGCAGCAGATG320CCCCTGGGGGCCGACTGTGCCCGGTACACCACGCTGAGCC360TGCTGCGCCGTGCCAGGATGCACATCCAGAAGCTGGAGGA400TCAGGAGCAGCGGGCCCGACAGCTCAAGGAGAGGCTGCGC440AGCAAGCAGCAGAGCCTGCAGCGGCAGCTGGAGCAGCTCC480GGGGGCTGGCAGGGGCGGCCGAGCGGGAGCGGCTGCGGGC520GGACAGTCTGGACTCCTCAGGCCTCTCCTCTGAGCGCTCA560GACTCAGACCAAGAGGAGCTGGAGGTGGATGTGGAGAGCC600TGGTGTTTGGGGGTGAGGCCGAGCTGCTGCGGGGCTTCGT640CGCCGGCCAGGAGCACAGCTACTCGCACGGCGGCGGCGCC680TGGCTATGATGTTCCTCACCCAGGGCGGGCCTCTGCCCTC720TACTCGTGCCAGGCCCACTTGCCAGGCAGGAGCCCTCCCC760AAGCCTTCAGGGCTGCTCGGAGTCACCTGTTGGAATGGAC800TAAAAGGACCCTTGTGTGGGAACAGGTGCTCCCCAAACAC840CCTGCTGCTGGCTGCCAGGCAGGCCCTCTGGAAGGGAAGG880GGCAGGACTCATCAGGACCTCCCTGGACCCCTGCAGGGCA920GGCAGCTTGGGCCCGAGCCCAAGCATTTGGCTCTGCTGCC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。