演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

MT1MMT1

metallothionein 1M

MT1M 編碼 metallothionein 1M,屬於 metallothionein 超家族的 Type 1 family;其富含半胱胺酸,可結合多種重金屬。

Homo sapiens16q13UniProt Q8N339
OFFICIAL SYMBOL
MT1M
CHROMOSOME
16
UNIPROT
Q8N339
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

MT1M 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 metallothionein 1M。其產物屬於 metallothionein 超家族中的 Type 1 family,是一種富含半胱胺酸的蛋白質。這類蛋白質的半胱胺酸殘基可與多種重金屬結合;來源未進一步說明 MT1M 的其他結構特徵或不同金屬的結合情形。

Official symbol
MT1M
Gene name
metallothionein 1M
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14296
UniProt
Q8N339
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
MT1MT1K

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616q13
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegMT1Mpq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr16:56,632,485–56,633,986
Gene span
1,502 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000379818 ★56,632,659–56,633,9813
ENST0000085845256,632,485–56,633,9862
ENST0000112938356,632,485–56,633,9863
ENST0000113397956,632,485–56,633,9863
ENST0000057023356,632,707–56,633,5182

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

MT1M 所屬的 metallothionein 蛋白質富含半胱胺酸殘基,這些殘基能結合多種重金屬。這項結合特性是來源所述的主要分子作用;資料未進一步指出可結合哪些特定金屬,也未描述結合後的下游作用或對細胞的影響,因此不宜由此推定更具體的生理結果。

在調控方面,來源指出 metallothioneins 的轉錄受重金屬與 glucocorticoids 調節。這表示其基因轉錄會受到這兩類因素影響,但資料沒有提供調節方向、條件、作用機制或不同因素之間的關係。上述資訊描述的是 metallothioneins 的家族層級特性,來源未另行提供 MT1M 特有的功能機制或實驗情境。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 56632659 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>MT1M ENST00000379818 GRCh38 chr16:56631659-56632759 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACTGGTGTAGACTCAATGTCATGCAATAGTCAGGTATACTGAAGAGAAACAACTGCATGTCTTGTTTTTT
AATTTTATTATTTTAGAGATGCTGACTTGCTATGTGGACTAGGCAGAACTCGAACTCCTGGGCTCAGGTG
ATCCTCCCGCCTCAGCCTCCTAAGTAGCTGGGACTACAGCTTCCCGCGACCTCACCCATCTTGCTTTTTA
ATTTAAAGCAGAGTCTGCATATCATCTGAAGTCATCTCTCTTTGGGGACATCCCACAGGTCCAGAACTGC
CAGACGGTAGTGGGGTGGCCGGCTAGGCTGTGGGGAGCATGGAGATTTATCTGCAAAGGAGGACCTGGAC
AAATGTTCCCCCACATCCTCTCAGGCGAAGAGAATGGACGGGAGAGAGAGGCCGACCAGTGTTCCCCGTG
TTGCTGTGTACGGAGGAGCCAGTCCGAGGGACCGCGGTGTGGACAGGGACAGGCAAGGCGGGGAAGGAGG
AGAAACGAAAGCCACATTGGTGGCGGGTGCTCTGCACACGACTCGCTCCCTACCACACGCCCCCCGCTCC
GCACACGACCGATCCGGGGACTGGAGCAGGAGGGCTGCACCGGGACTCCGGGACAGGCCCAGTTGAAAAC
GGCGGGGCGAGGGGGTGGGGTGGAGACGCCCGCGACGCCAAGGCTGGGGTCCCGGAAAGCGCGGGGAGGA
GGGTGGAAGGCAAAGGCAACTTCGGGGAAACTGGGAAAGGCGGCCGGGACCTCGGGGACACTGCGTACCA
CCCGGCGCACAGCCCCTCCCGCGCAAACCCGAGCCAAAGGGGCGGTCGAGCGGCGCACTCGGAGCGGAGC
TCAGGGGATGGTGCGCCCGGCACTTATGCTGGGCTCAGCCCAGCCCAGCCCAGGACCGCTGGCGGTGCGA
ACCCAGCCGGGCGGGTGCAAGCGCGGGGCAGGGCCTCTGCGCCCGGCCCCCTCCCCTGAGTAGAAAAGCA
GCCGCAGGCTGTGGCGCTCCACCACGCCGTCCGGGTGGGCCTAGCAGTCGCTCCATTTATCGCTTGAGAT
CTCCAGCCTTACCGCGGCTCGAAATGGACCCCAACTGCTCCTGCACCACTG
MT1M 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
MT1M_2 ↗16:56,632,221正股56,632,172–56,632,231
MT1M_1 ↗16:56,632,659正股56,632,610–56,632,669

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_5HBLZT · CTCF_binding_site · 56628685–56628706 · regulatory

ENSR16_9SGW4 · enhancer · 56630165–56630467 · regulatory

ENSR16_9SGWN · promoter · 56632169–56632669 · regulatory

ENSR16_9SGXJ · enhancer · 56635122–56635502 · regulatory

ENSR16_83MXW9 · promoter · 56635622–56635773 · regulatory

ENSR16_75BWRP · enhancer · 56635774–56635874 · regulatory

· motif · 56628687–56628703 · motif

· motif · 56629509–56629521 · motif

· motif · 56629511–56629518 · motif

· motif · 56629677–56629690 · motif

· motif · 56632299–56632309 · motif

· motif · 56632609–56632619 · motif

· motif · 56632615–56632625 · motif

· motif · 56632934–56632947 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:61 aa

1 aa61 aa功能區域
依 Q8N339 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

metallothionein 1M 長 61 個胺基酸,註解包含兩個區域:第 1 至 29 位為 Beta,第 30 至 61 位為 Alpha。其家族分類為 metallothionein 超家族的 Type 1 family。

功能區域Beta1–29 aa
功能區域Alpha30–61 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q8N339…

AlphaFold · Q8N339

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 6 個夥伴 · 最多顯示 50 個
MT1MT1MCYSRT1DDIT4LKRTAP17-1KRTAP5-1KRTAP5-9SMCP
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

來源將 MT1M 記載為單體(Monomer),未提供其與其他蛋白質實體結合或組成複合體的資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能Metallothioneins 富含半胱胺酸殘基,這些殘基可結合多種重金屬;此外,這類蛋白質的轉錄受重金屬與 glucocorticoids 調節。來源未指明特定金屬、調節方向或作用機制。資料庫紀錄
證據與來源

Metallothioneins have a high content of cysteine residues that bind various heavy metals; these proteins are transcriptionally regulated by both heavy metals and glucocorticoids

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Monomer推論支持
證據與來源

Monomer

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000379818 · 398 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1ACCACGCCGTCCGGGTGGGCCTAGCAGTCGCTCCATTTAT40
41CGCTTGAGATCTCCAGCCTTACCGCGGCTCGAAATGGACC80
81CCAACTGCTCCTGCACCACTGGTGTCTCCTGCGCCTGCAC120
121CGGCTCCTGCACGTGCAAAGAGTGCAAATGCACCTCCTGC160
161AAGAAGAGCTGCTGCTCCTGCTGCCCCGTGGGCTGTGCCA200
201AGTGTGCCCACGGCTGTGTCTGCAAAGGGACGTTGGAGAA240
241CTGCAGCTGCTGTGCCTGATGTGGGAACAGCTCTTCTCCC280
281AGATGTTAATAGAACAAGCTGCACAACCTGGATTTTTTTT320
321CAATACGATACTGAGCCATTTGCTGCATTTCTTTTTATAT360
361TAAATATGTGAGTGACAATAAAACAATTTTGACTTGAA398

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。