基因總覽
MSRB1 是蛋白質編碼基因，其產物正式名稱為 methionine sulfoxide reductase B1，屬於 MsrB Met sulfoxide reductase family。這是一種 methionine sulfoxide reductase，具有辨識特定 methionine 氧化型態的酵素角色。蛋白質本身的家族與結構域資訊可協助辨識其分子類別；其在 actin 調節及先天免疫中的具體作用，於功能段落說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000361871 ★ | 1,938,229–1,943,199 | 4 |
| ENST00001137036 | 1,935,685–1,943,270 | 4 |
| ENST00000473663 | 1,938,942–1,943,123 | 3 |
| ENST00000564908 | 1,939,095–1,943,270 | 5 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
methionine sulfoxide reductase B1 可將 methionine (R)-sulfoxide 還原回 methionine。methionine 氧化有時是氧化壓力下隨機發生的結果，也可能是作用於特定殘基的轉譯後修飾；來源所述的 MSRB1 功能針對前述 R 型氧化態。
在 actin 調節方面，MICAL1、MICAL2 或 MICAL3 可使 actin 上的 methionine 殘基氧化。MSRB1 還原這些由 MICALs 介導形成的 methionine (R)-sulfoxide，促進 actin filament 再聚合，因此參與調節 actin 組裝。
MSRB1 也參與巨噬細胞的先天免疫相關作用：它藉由還原氧化的 actin，促使 actin 再聚合。來源支持的是這項還原與再聚合的關聯，並未進一步界定其對免疫反應的其他影響。
Promoter 與基因調控
>MSRB1 ENST00000361871 GRCh38 chr16:1943099-1944199 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTTAGTCCTAAAAATGCAATCTAGTCCCCAGGCAAGGAGGTGGTCTGCTTTGGGAAAGGGCTGTTACTGT CTTTGTTTTAAACTATAAACTGGCTGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCA AGATGGGCGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATCGAGAAACCTCGTCTCTAT TAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGCATGATTGTAATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG GAGAATTGCTTGAACCAGCGAGTTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCTACTGCACTCCAGCCTGGA AACAGAGTAAGACTCCGTCTCAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAAAACAAAAAACTATAAACTGAGTT TCTCCCAAAGTTATTTCAACCTACCAGCAGGGATGAATAAGGACAGCTTGGAGGTTAGAAGCAAGATAGA GTCGGCTGAGTTAGATCTCTTTCACTGTTTCAGTCATCATTTTGCAAAGGCGGTTTCACCTGGGCGCGGA AAGGCTGCATGACCTCCGGCAGCTCCGGGCTTAGTACCAGGGACTGGACTGGGGGGACACGACCCTACGG ATTCGCGCCGTCGCCCACCTGGCCAGGCCCCATGTGCGCCCCTAGCCACCAGGGCGCGAGGGGCGGCAGG GGCGGGGCCTTGGGGAAGCGGCCTAGGGGTGGTCCCTGGGAGTTTCCATGGGCGGGGCCTGCTGGGGAGA TGCGATTGGACTGGCACCGGGGGGCGGGGCCTTGGGGAAGTGGCCCAGGAGTGGTCCCAAGGAGTCAACG TGGGCGGGGCCAGCTGGGAAGATCGTATTGGACCAGCCCTGAGGAGGGGCGGGGCCTCCCGGAGGCGGAA GCCGGGATTCGCCCTCCGGGGAGCGATTGGTCCTCGGGAGGGGCGGGGAGGTGGACGCGGGTACCGGCGG TCGTCGGGTCGGCAGCCTTTGGTCAGTTGGCAGCGGCAAGCGCGCTGCGGTTCCGGTGGCGCCATGTCGT TCTGCAGCTTCTTCGGGGGCGAGGTTTTCCAGAATCACTTTGAACCTGGTT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MSRB1_1 ↗ | 16:1,943,195 | 負股 | 1,943,185–1,943,244 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR16_83JKX · enhancer · 1940351–1940513 · regulatory
ENSR16_9QSB · promoter · 1943189–1943499 · regulatory
ENSR16_9QSF · enhancer · 1943500–1943945 · regulatory
ENSR16_83JN8 · enhancer · 1944308–1944530 · regulatory
ENSR16_5GCRN · CTCF_binding_site · 1946726–1946747 · regulatory
· motif · 1940054–1940066 · motif
· motif · 1940056–1940063 · motif
· motif · 1940056–1940071 · motif
· motif · 1940729–1940742 · motif
· motif · 1940729–1940743 · motif
· motif · 1940729–1940744 · motif
· motif · 1940782–1940796 · motif
· motif · 1940782–1940797 · motif
· motif · 1940803–1940816 · motif
· motif · 1940803–1940816 · motif
· motif · 1941021–1941033 · motif
· motif · 1941023–1941038 · motif
· motif · 1941023–1941038 · motif
· motif · 1941024–1941038 · motif
· motif · 1941025–1941038 · motif
· motif · 1941228–1941238 · motif
· motif · 1941234–1941244 · motif
· motif · 1941246–1941259 · motif
· motif · 1941455–1941462 · motif
· motif · 1942062–1942075 · motif
· motif · 1942085–1942093 · motif
· motif · 1942119–1942132 · motif
· motif · 1942119–1942132 · motif
· motif · 1942949–1942964 · motif
· motif · 1942954–1942966 · motif
· motif · 1942957–1942964 · motif
· motif · 1943011–1943026 · motif
· motif · 1943158–1943175 · motif
· motif · 1943167–1943182 · motif
· motif · 1943241–1943251 · motif
· motif · 1943287–1943298 · motif
· motif · 1943287–1943301 · motif
· motif · 1943305–1943315 · motif
· motif · 1943350–1943360 · motif
· motif · 1943400–1943410 · motif
· motif · 1943442–1943452 · motif
· motif · 1943492–1943502 · motif
· motif · 1944386–1944400 · motif
· motif · 1944386–1944400 · motif
· motif · 1946728–1946744 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：116 aa
methionine sulfoxide reductase B1 長 116 個胺基酸，屬於 MsrB Met sulfoxide reductase family。其 N 端至第 106 位胺基酸標註有 MsrB domain；每個次單元可結合 1 個 zinc ion。
蛋白質三維結構
細胞內定位
methionine sulfoxide reductase B1 被記錄於細胞質、細胞核及細胞質中的細胞骨架區域。 來源未提供這些定位之間轉換的條件或動態資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- APPP05067 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- CLUP10909-5 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- CYSRT1A8MQ03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IFT88Q13099 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- INCA1Q0VD86 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM27P14373 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | methionine sulfoxide reductase B1 特異性地將 methionine (R)-sulfoxide 還原為 methionine。methionine 氧化可能源於氧化壓力下的隨機氧化，也可能是發生於特定殘基的轉譯後修飾。MSRB1 還原 MICAL1、MICAL2 或 MICAL3 介導的 actin 氧化，促進 filament 再聚合並調節 actin 組裝；在巨噬細胞中，還原氧化 actin 並促進再聚合也與先天免疫相關。 | 推論支持 | 證據與來源Methionine-sulfoxide reductase that specifically reduces methionine (R)-sulfoxide back to methionine. While in many cases, methionine oxidation is the result of random oxidation following oxidative stress, methionine oxidation is also a post-translational modification that takes place on specific residue. Acts as a regulator of actin assembly by reducing methionine (R)-sulfoxide mediated by MICALs (MICAL1, MICAL2 or MICAL3) on actin, thereby promoting filament repolymerization. Plays a role in innate immunity by reducing oxidized actin, leading to actin repolymerization in macrophages |
| 分子活性 | L-methionyl-[protein] + [thioredoxin]-disulfide + H2O = L-methionyl-(R)-S-oxide-[protein] + [thioredoxin]-dithiol | 推論支持 | 證據與來源L-methionyl-[protein] + [thioredoxin]-disulfide + H2O = L-methionyl-(R)-S-oxide-[protein] + [thioredoxin]-dithiol |
| 分子活性 | [thioredoxin]-disulfide + L-methionine + H2O = L-methionine (R)-S-oxide + [thioredoxin]-dithiol | 推論支持 | 證據與來源[thioredoxin]-disulfide + L-methionine + H2O = L-methionine (R)-S-oxide + [thioredoxin]-dithiol |
| 分子活性 | 每個次單元結合 1 個 zinc ion。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | methionine sulfoxide reductase B1 的定位包括細胞質、細胞核，以及細胞質中的細胞骨架區域。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GGTCAGTTGGCAGCGGCAAGCGCGCTGCGGTTCCGGTGGC40GCCATGTCGTTCTGCAGCTTCTTCGGGGGCGAGGTTTTCC80AGAATCACTTTGAACCTGGCGTTTACGTGTGTGCCAAGTG120TGGCTATGAGCTGTTCTCCAGCCGCTCGAAGTATGCACAC160TCGTCTCCATGGCCGGCGTTCACCGAGACCATTCACGCCG200ACAGCGTGGCCAAGCGTCCGGAGCACAATAGATCTGAAGC240CTTGAAGGTGTCCTGTGGCAAGTGTGGCAATGGGTTGGGC280CACGAGTTCCTGAACGACGGCCCCAAGCCGGGGCAGTCCC320GATTCTGAATATTCAGCAGCTCGCTGAAGTTTGTCCCTAA360AGGCAAAGAAACTTCTGCCTCCCAGGGTCACTAGGCGGGC400AGCCCACACCCACCCCAGACGGCCACCACACTGAGGCCAC440ACGTTGGCCATTCCACCTTGGAGTTGGAACCCTGGGCGTC480GAGACAGGAAGGCAGGGCGCAGTGGTTGAAACATCAGGAC520ACTCCCAAGGCCCCGGCTCTGAACAAGACCTTTTCGTTTC560TTGGAAAAGAGACTCATTTGCTGATGGTTCATGCCTTCTG600CTGGGACAGGCCTGGGCTGTGCAGCCACACTGTCGGCTGA640CTTAGCCCCCTGCTCACTCTAGGTGCCTCCAGGAGGTGAG680CCCTGGGTGCAGCTGGTCTCTGAATGACGTTACACCCTCA720CCTTCTTTTCCTGGCCCTGTCTCTGGACTCTCCCCTGTGA760GGCCCAATTCCAAGACAGACTCTCGTCCTCACCGAAGCTT800AGGCCCACATCTCCCAGGCTGCTTAGGAGACAGAATGGAA840ACGGAGGCCGCCCCTGCCAGCCGCCCTGGCCCTGGTCACT880GCATGATCCGCTCTGGTCAAACCCTTCCAGGCCAGCCAGA920GTGGGGATGGTCTGTGACCTGCTGGGAAGGCAGGCTGATG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。