演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN GENE LOCUS

MSLNLMPFL

mesothelin like

MSLNL(mesothelin like)是人類基因;資料預測其可能參與細胞與基質的黏附,並與膜及細胞表面相關。

Homo sapiens16p13.3
OFFICIAL SYMBOL
MSLNL
CHROMOSOME
16
LOCUS TYPE
protein_coding
TRANSCRIPTS
1
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

MSLNL 的正式名稱為 mesothelin like,位於人類第 16 號染色體。現有資料將其基因類型標示為 unknown,因此不足以判定其產物屬於蛋白質或 RNA,也沒有提供家族分類、分子結構或其他產物特徵。功能摘要指出,MSLNL 可能與細胞—基質黏附有關,並預測其位於膜、在細胞表面具有活性;這些描述屬於預測,不能視為已確認的定位或功能。

Official symbol
MSLNL
Gene name
mesothelin like
Organism
Homo sapiens
Gene type
unknown
HGNC ID
HGNC:14170
Locus type
unknown
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
MPFLC16orf37

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p13.3
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegMSLNLpq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr16:769,428–782,054
Gene span
12,627 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000537221774,188–778,7005

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

現有功能摘要預測,MSLNL 可能參與細胞—基質黏附。這表示它可能與細胞和周遭基質之間的附著過程有關,但資料沒有說明其在黏附中的具體作用,也未提供分子作用方式或相關實驗結果。因此,不能據此推定它直接連接細胞與基質,或進一步描述其調控方式。

摘要另預測 MSLNL 位於膜,並在細胞表面具有活性。這些定位與活性描述同樣屬預測;來源未指出膜的具體類型、細胞表面的作用形式,或定位與黏附功能之間的實驗關聯。現有資訊僅支持將膜與細胞表面視為預測相關的位置,不能據此補充更精確的細胞區室或分子互作。

上述內容由 Alliance of Genome Resources 提供,且明確標示為預測。資料未列出研究系統、擾動方式、讀出指標或結果,也沒有說明推論所依據的證據細節。因此,MSLNL 與細胞—基質黏附、膜定位及細胞表面活性的關係,應保留為待驗證的功能預測,而非已確立的生物學機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 778700 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>MSLNL ENST00000537221 GRCh38 chr16:778600-779700 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGGCTGGTCAGTTGACTAACCAGGGCGTCTGTGAGGCAGGGCTGGGGTCCTGAGTGGCACAAGGCCCGCT
CTGTGTTGGACTGGATTAGACTCACACCACAAGGAAGGCTGGGGAGACGGCTTCCCCGGGGCTGCCCAGC
AGGTGCCAAAGCCCTGGGTGGGGGTGTCTCCTCCTCAGGTGCCTCAGCAGCCAGCGGGGATGTTCAGGGA
GCCACCTGAGCTCCCGGCCGGCTGGGACCCAGCCTCAGGAGGAAGTGCTGTCCCAGGGTCTAGGCAGGGG
CCACACATAAGGCTCTGTGTGCAGCCCAGAGCCTGGCCCCACAGGGTGTTCTGGAGAGAATGAATGAAAG
ACAGAATGAATGAATGAGTGAGTGAGTGAATGAGTGAATGAGTGACCGAATGAATGAGTGAATGAATGAG
TGAAAAATGAGTGAACGAGTGAGTGAAAATGAGTGAATGAGTGAGTGGGTAAATGAATGAATAAGTGAAA
ATGAGTGAGTGAATGAATGAGTAAAATGAGTAAAGAGTGAGTGAATGAGTGAAAATGAGTGAATGAGTGA
AAATGAGTAAAAATGAGTGAATGAGTGAATGAATGAGTGAATGAGTGAGTGAAAATGAGTGAATGAGTAA
AAATGAGTGTGTGAATGAATGAGTGAATGAGTGAGTGAATGAGTGAGTGAGTGAATGAGTGAGTGAGTGA
ATGAATGAGTGAATGAATGAATGAGTCAATGAGTGAATGAGTGAGTGAGTGAAGCAGGACCTTGCCTGTG
TCCGGGGCACCACCTCCCACTCTCCCTCCTTCAGTGCTGGGGAGCGGTGGAGTCAGACCTTGGTCCTGCA
GGCTGCGTGCGGCCCATGCCCTTCTGCTAGGCAGCCCCCCTCAGCTGCTTCCACCCCTCCTGGACCCTCC
CTGCCCCTGTCTCCTCCTCTCTGCCCAGTGCCAACTGCTCCCTGCTGCAAGGCTTCTGGTGCCAGCCGGC
CAGCCAGCTGCCCCGGGACCAGCTCTCAGCCCTAATCCAGAGGCTGGCCTTGCTGCAGGTCCCCCTCCAG
GCCTGGCAGGTGAGCGGGAAGGAGTGTGAGTGGGTGGGCGGGTGACCGAGG
MSLNL 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_B66K · enhancer · 777869–778536 · regulatory

ENSR16_8LNN · enhancer · 778696–778861 · regulatory

ENSR16_D33C · enhancer · 782328–784420 · regulatory

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / GENE ANATOMY

基因座與轉錄註解

unknown

MSLNL 依 HGNC/Ensembl 分類為 unknown。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。

轉錄本Biotype拼接長度Exons
ENST00000537221retained_intron820 nt5

拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與基因產物定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能MSLNL 被預測可能參與細胞與基質之間的黏附,並可能位於膜、在細胞表面具有活性。這些資訊是功能與定位預測;來源沒有提供具體作用機制、研究系統或實驗證據細節。推論支持
證據與來源

Predicted to be involved in cell-matrix adhesion. Predicted to be located in membrane. Predicted to be active in cell surface.

開啟資料庫紀錄 ↗

· CC BY 4.0
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

DNA 與 RNA 序列

完整非編碼轉錄本 · FASTA
ENST00000543963 · 2,259 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1TCCTGGACCCACTGCCCTTGGCCCCAGCACCTTCCTGCCC40
41TGGGACGTCTCAGCCAGGATGACCAGTGCACGCCGCCGCA80
81CAGACGTGGGCCCCAGAGTGGGTGCCCTGCAGAGCTCAGG120
121CCTCACCCTCCTGCTGTCCCTTGCTGCCCACTGCTCTGGG160
161CCCCAGGCCAAGGTTCTTTCCCCAGGAGGGCTGGATGCCA200
201GCGGGGCCAACCTGTGGGCCAGTGCCAACTGCTCCCTGCT240
241GCAAGGCTTCTGGTGCCAGCCGGCCAGCCAGCTGCCCCGG280
281GACCAGCTCTCAGCCCTAATCCAGAGGCTGGCCTTGCTGC320
321AGGTCCCCCTCCAGGCCTGGCAGGTGAGCGGGAAGGAGTC360
361TGCTTGGCCAACCTGGCGTCACGGTGCGGCCTCCAGGACG400
401ACTTCACGCTCCACCCACCCAACCTGCTGCTCTTCTACAA440
441CCTGAGCCAGGTGCGGGAAGCCGACTGCCGGGCCTTCATC480
481CGCCGTGCCGCCCAGGGGGACGTGGAGCTGCTGAGCCATC520
521TACCCGACCAGAGGGTCGCCCTGTGGCGTGCGGCTGTGGC560
561CTGCCTGGTGGGCGCTGGGTGGGGATGGGCCCGGTGCATT600
601GGAGGCAGCCTCCCGCTGGGCGCCGACCTGCTGGCCCTGC640
641AGGGGGTGGCCCGCCTGCGACTCAGCGCCTCCGACCAGCA680
681ACTGCTCGGGGCCCTGGTGTGTGACATGGACGCGTCCAGC720
721ATCGGTGCCGCAGACCCCCACATGCTGGAGAACCTGCGGC760
761GCTGCCCCCGGCTGACCGCTGCCCAGCGCATTGCCCTTAA800
801CTCACTGCTGGCCGGTGGGAAGACCTCGCTCGGGCCCCCT840
841GGCTCCTGGACACTGGAGGGGCTACAGGCCCTGGGGCCCC880
881TGGCCACATACATCAGCCCTCACCTGTGGGCGCAGGTGCA920
921GGAGGCCGTGGGCCTGGGCTTCTTCCGCAGCGTGGTGGCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。