基因總覽
MS4A7 是一個蛋白質編碼基因,其產物 membrane spanning 4-domains A7 屬於 MS4A family。這是一種多次跨膜蛋白,具四段跨膜螺旋,並有位於細胞質側與細胞外側的區域。現有資料將其主要角色描述為可能參與訊號傳遞,但未提供更具體的受體類型或作用情境。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000300184 ★ | 60,378,532–60,395,948 | 7 |
| ENST00001007005 | 60,363,737–60,394,818 | 6 |
| ENST00001007006 | 60,363,737–60,394,802 | 5 |
| ENST00001107195 | 60,363,737–60,390,838 | 4 |
| ENST00000358246 | 60,378,476–60,395,951 | 6 |
| ENST00000534016 | 60,378,476–60,394,522 | 6 |
| ENST00000530234 | 60,378,476–60,395,254 | 4 |
| ENST00000899565 | 60,378,476–60,394,834 | 5 |
| ENST00000899566 | 60,378,476–60,394,828 | 5 |
| ENST00000899567 | 60,378,476–60,394,834 | 6 |
| ENST00000899568 | 60,378,476–60,394,834 | 7 |
| ENST00000899569 | 60,378,476–60,394,834 | 6 |
顯示 12/39 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MS4A7 的功能資料指出,它可能參與訊號傳遞,並可能以多聚體受體複合體成員的身分發揮作用。這項描述將其角色連結至受體複合體與細胞訊號,但使用「可能」表示此功能屬於推定,不能據此視為已確立的作用,也無法判定其在複合體中的具體位置或分子任務。
依現有資訊,MS4A7 可能透過成為多聚體受體複合體的一部分,與訊號傳遞過程相關;然而,來源沒有說明該複合體辨識的訊號、受體所處的生物學情境,或訊號如何由複合體傳遞。因此,目前可支持的功能範圍限於其可能參與此類複合體介導的訊號傳遞,不宜延伸為特定路徑或下游效應。
資料也未提供能區分 MS4A7 是否直接負責訊號辨識、調節複合體組裝,或影響訊號強度與方向的證據。故其功能意義應保留在概括層次:MS4A7 被認為可能是多聚體受體複合體的組成成分,並與訊號傳遞有關;目前不能由此進一步推定其分子機制或生理結果。
Promoter 與基因調控
>MS4A7 ENST00000300184 GRCh38 chr11:60377532-60378632 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGACCAAATGGCAGACTCTTGCCATGAAGCAAGCCCAGACCTCAGTGCCAAGAGATGTGAATTAGATTCC TGCCTCTTCCACAGACTAGACATGTGACTGGGGGCAGATTCCTTCAGCAATATCACCTCATTTGGAGAAG AACTGGACTAAAATACCCTCCAAGTAGTTTATGAGTTATTTAAATCTCCCAGGCTTAGGTTTGCTCCTCT CTTAGGGGATAGCCTTGCCACCCTTCAGGAAATGGAGACTGTATATGGAGCATGTTGTGCCGCCAGCTGC TGCATGTCCCAGAGCCATCTTAAACCCTACCCTTCTGAACAATGGCTAGTCTACAAGAAGCCTTAAAAGG GATGTGAAAGTGGCAACAGTGTCCCCTCAACAACAAATACTTCCCCAAATATGAGCTTGTGTGGAGCCTG ATGACTCTGCCTCTGAGGCCAATCCACTGGCATCTTTCCCAAGATGTGCCTGGACTTCCCTGAGCATGAG GCCAAAGATGGAGAATGGAAACACCCAAAAGAAGTAACAAGGAGACACGGAATTTTCCACAGGTTGCTTT CAGCTTACCAAGAGCCTGGAAAGTGAGAGAATAGATTCTCCAAAATTCAAAACTAACATTACTATTATCA ATATTTATTGTCTACTTTTTGTAAACTCTTTGCATCTTTTTTCTTTAATTCTCCCAACACCCACAGAGTG GAATTATTATTATCCATCCACCATTTATTTAATAGACAAGAAAACTCAGGCTAAGCAAAACTAGATGACT TAAATAATTCTATGTAGGAGTAGGGAAAATGAATTTTAACTGGGACCGTACAAATCACTAGTCTGCACAA AGGTCTTTTTCTCATGTGTCACTTCTATCTTGTGTCATTTTGCCAGACCTCAGAATTTAGAAAGAGGAAG CAGAGGCACTTTTTATATATCAACTGTCTGTAACTACAGCAAAATTCACATCCTGTGTAATCATAAATAC TGCTCTAAGAAAGGGACAGGAAGTCTCAGAGGCTGGAGAGCAGAGCACCAAGATCGTTCTGGCAGGAACA GCCAGTGGGAGGTTCCAGCTGAGCGCTCCCCAGAGGTGAGCTGATCCCCAG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MS4A7_2 ↗ | 11:60,363,776 | 正股 | 60,363,727–60,363,786 |
| MS4A7_1 ↗ | 11:60,378,532 | 正股 | 60,378,483–60,378,542 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_BFZJ9 · promoter · 60377995–60378549 · regulatory
ENSR11_9TZ3P · enhancer · 60378550–60378981 · regulatory
· motif · 60377092–60377104 · motif
· motif · 60377919–60377932 · motif
· motif · 60377923–60377938 · motif
· motif · 60377923–60377938 · motif
· motif · 60378020–60378035 · motif
· motif · 60378430–60378443 · motif
· motif · 60378488–60378497 · motif
· motif · 60378691–60378702 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:240 aa
membrane spanning 4-domains A7 長 240 個胺基酸,屬於 MS4A family。序列註解預測其含四段螺旋跨膜區,並在細胞質側與細胞外側交替形成拓樸區段。C 端第 218–240 位胺基酸另標註為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MS4A7 被註記為膜蛋白,並具有多次跨膜特性。 現有定位資料未提供細胞內具體膜區室、定位改變條件或不同異構型之間的差異。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
- CD72P21854 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DRAM1Q8N682 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EMP1P54849 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IGFBP5P24593 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ITGB2P05107 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LATO43561-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PLNP26678 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PMP22Q01453 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
核酸與蛋白質序列
AAGTCTCAGAGGCTGGAGAGCAGAGCACCAAGATCGTTCT40GGCAGGAACAGCCAGTGGGAGGTTCCAGCTGAGCGCTCCC80CAGAGGTGAGCTGATCCCCAGCCACAGCACACAGGACCAG120GCTGCGAGAACAGCATCATCAGCATCATGCTATTACAATC160CCAAACCATGGGGGTTTCTCACAGCTTTACACCAAAGGGC200ATCACTATCCCTCAAAGAGAGAAACCTGGACACATGTACC240AAAACGAAGATTACCTGCAGAACGGGCTGCCAACAGAAAC280CACCGTTCTTGGGACTGTCCAGATCCTGTGTTGCCTGTTG320ATTTCAAGTCTGGGGGCCATCTTGGTTTTTGCTCCCTACC360CCTCCCACTTCAATCCAGCAATTTCCACCACTTTGATGTC400TGGGTACCCATTTTTAGGAGCTCTGTGTTTTGGCATTACT440GGATCCCTCTCAATTATCTCTGGAAAACAATCAACTAAGC480CCTTTGACCTGAGCAGCTTGACCTCAAATGCAGTGAGTTC520TGTTACTGCAGGAGCAGGCCTCTTCCTCCTTGCTGACAGC560ATGGTAGCCCTGAGGACTGCCTCTCAACATTGTGGCTCAG600AAATGGATTATCTATCCTCATTGCCTTATTCGGAGTACTA640TTATCCAATATATGAAATCAAAGATTGTCTCCTGACCAGT680GTCAGTTTAACAGGTGTCCTAGTGGTGATGCTCATCTTCA720CTGTGCTGGAGCTCTTATTAGCTGCATACAGTTCTGTCTT760TTGGTGGAAACAGCTCTACTCCAACAACCCTGGGAGTTCA800TTTTCCTCGACCCAGTCACAAGATCATATCCAACAGGTCA840AAAAGAGTTCTTCACGGTCTTGGATATAAGTAACTCTTGG880CCTCAGAGGAAGGAAAAGCAACTCAACACTCATGGTCAAG920TGTGATTAGACTTTCCTGAAATCTCTGCCATTTTAGATAC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。