基因總覽
MS4A6E 的正式名稱為 membrane spanning 4-domains A6E,屬於蛋白質編碼基因。現有資料將其產物歸入 MS4A 家族,並指出它可能是多聚體受體複合體的組成部分;此角色仍屬可能參與的描述,不能據此視為已確立的作用。其蛋白質結構與膜上的拓樸特徵見蛋白質特徵及定位說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000684409 ★ | 60,327,255–60,341,341 | 5 |
| ENST00000969922 | 60,327,251–60,341,341 | 6 |
| ENST00001138891 | 60,327,251–60,341,341 | 5 |
| ENST00000300182 | 60,334,831–60,341,341 | 4 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MS4A6E 可能參與訊號傳導,資料所描述的方式是作為多聚體受體複合體的一個組成部分。這項描述指出其可能與受體複合體相關,但沒有進一步說明複合體的組成、訊號種類或分子作用機制,因此不宜將其延伸解讀為特定受體功能或訊號路徑。
Promoter 與基因調控
>MS4A6E ENST00000684409 GRCh38 chr11:60326255-60327355 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTAGCTTTGCCATCCAAGGATAGCTTAAGTGTTAATAGCTCAGTGGAGGGTCAGTGTGACAGTGTTTTGC ACCTACACTCATGGCACCCAAGTTCTTGTTCAGCATCCAGGAGGAATGAGGTTGCATGAACGAACTGAAG ATGGTAAATGCAAGAGATTTTAGTGCTGGTGAAAGTGGCTTTCAGTGGGAAGGGAATATGTAAAGGGGAT GGATGGAGCGGGAAGGTAATCTTCCCCTGGAATCTGGCCGAGGACTAGATGCTACACCATCAAGCTGTCC CTCTCATGTCAAGCTGCTTCTGTCTGCCATACAACCATAGTCTTCAACATCCAGCTGCATCTCCTCTCTC TGCTGGCTGAGCCTGGGGTGTTTATGAGCATAGGATGGAGGGTGGGGCAGGATATGGGTGGTTTTGGAAA AGGCGACATTCAAGCAGGAAAACAGGGATGTATGTTCTCACTTTGGGCTGAGTTATCAGGCTTTTTGGCT TGACGGTGGGGCCCTTGCTGGGGACCTGCCTTCTTCTGCACAGAATTTCCCTGCCTCCTATACTTATCAA TGCTACTAAAAGCAGTATAAGGATTCAACACAATCCATCTTCACAGAAATATAAAATGAAATGCTAAAAT CCACGTGTAATCACAGAAGACCCTGAATAGCCAAAGTAATTCTGAGAAACAAGAACAAAGTTGGAAGCAT TATGCTTCTTTATTTAAAAGTATATTATAAAGTTATAGTAATCAAAACAGTATAATACTGGCATAAAAGC AGACATATAAACCAGTGGGACAAAAATATACAGCCCAGAAATAAACCCAAATATATATGGTTTCTATGGT TTGAAGCCTTGAATGTTTGTGTCCTTTCCAAAATGCATGTTGAAACTTAATCTCAAATGCAATAGTTTGG GCCTTTAAGAGGAAATTAGGTCATGATGACTCCTCCCTCATGGATGTAATTAAGGTCCTTATAAAAGAGG CTTCACAAGACATTTGGACTATTTCACCCTTCCATTCATTCCACCATGTGAGGACACAGTTTGTCCTATC TGGAAGATGCAGCAACAAGATACCATCTTGGAAGCAAGCAACGTGACCCTA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MS4A6E_1 ↗ | 11:60,327,255 | 正股 | 60,327,206–60,327,265 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
· motif · 60328661–60328670 · motif
· motif · 60328661–60328670 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:147 aa
MS4A6E 蛋白質長 147 個胺基酸,屬於 MS4A 家族。序列註解標示兩段螺旋型跨膜區:第 53–73 位與第 121–141 位;兩段之間為第 74–120 位的胞外區域。另有第 1–52 位及第 142–147 位兩段胞質區域。這些拓樸資訊為序列註解所示。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MS4A6E 被註記為膜上的多次穿膜蛋白。 其拓樸註解包含兩段跨膜區,並將區段分別標示為胞質側與胞外側;資料未提供定位變化條件或異構型差異。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- GJB2P29033 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBE2J1Q9Y385 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | MS4A6E 可能參與訊號傳導,並可能作為多聚體受體複合體的組成部分;此敘述保留可能性的限定,未指明特定受體、訊號路徑或作用機制。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源May be involved in signal transduction as a component of a multimeric receptor complex |
| 細胞定位 | MS4A6E 被註記為膜蛋白,且屬於多次穿膜蛋白;此定位資訊未進一步提供特定細胞膜區域、定位變化條件或異構型差異。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
ATTTCACCCTTCCATTCATTCCACCATGTGAGGACACAGT40TTGTCCTATCTGGAAGATGCAGCAACAAGATACCATCTTG80GAAGCAAGCAACGTGACCCTAAGTAGATGCTGAACCTGTG120GCACCTTGATCGTGGACTTCTCAGTTCCAAAACTTTGGCA160ACACCATTATGACATCACAACCTATTTCCAATGAGACCAT200CATAATGCTCCCATCAAATGTCATCAACTTCTCCCAAGCA240GAGAAACCCGAACCCACCAACCAGGGGCAGGATAGCCTGA280AGAAACGTCTACAGGCAAAAGTCAAAGTTATTGGGGTGCA320TAGCAGCCTGGCTGGAAGCATTCTGAGTGCTCTGTCTGCC360CTGGTGGGTTTCATTCTCCTGTCTGTCAACCCGGCTGCAT400TAAATCCTGCCTCATTGCAGTGTAAGTTGGACGAAAAGGA440TATACCAACCAGACTTCTTCTTTCTTATGATTATCATTCA480CCTTACACCATGGACTGCCATAGAGCCAAAGCCAGTCTGG520CTGGAACTCTGTCTCTGATGCTGGTTTCTACTGTGTTGGA560GTTCTGCCTAGCTGTGCTCACTGCTGTGCTGCAGTGGAAA600CAGACTGTCTGACTTCCCTGGTTACTCATGTCCTCAAAGA640CGACTCATGATGCTGGATATGAAGAACTATTGACTTCTTG680GGAAAAAACGGAGAAATATTAATTGGAAAGTTGATTTTTA720TGATAATATGGAAAACCTAACCATTATAAAAAAGCAAACT760TGAGTTTCCTAAATGTAAGCATTTAAAGTAATGCATATTT800GTTTTAAAAAATTATTTCGCTGTCATTTATGATATGTGTT840CATTGGGGATCTCTTGGTTTGCCTGATACTGACTTCAGCA880AAAGCACAGGGCTGTAAATTACCATTTACTAGACTAGCCA920AATAGTCTTAGACATTTCCCAGAAAACTAGGCAGAATGAT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。