基因總覽
MS4A6A(membrane spanning 4-domains A6A)是蛋白質編碼基因,產生屬於 MS4A 家族的膜蛋白。其蛋白質具有四段跨膜區,並由此形成細胞內與細胞外區段交錯的拓樸架構。現有資料將它描述為可能參與訊號傳遞的多聚體受體複合體成分;更具體的作用方式與生物學過程尚未由這些資料說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000528851 ★ | 60,172,497–60,183,083 | 6 |
| ENST00000530839 | 60,169,930–60,184,666 | 8 |
| ENST00000529054 | 60,169,930–60,184,666 | 8 |
| ENST00001007381 | 60,169,930–60,184,495 | 8 |
| ENST00001007382 | 60,169,930–60,182,580 | 7 |
| ENST00001007383 | 60,169,930–60,183,853 | 8 |
| ENST00001007384 | 60,169,930–60,183,665 | 7 |
| ENST00001007385 | 60,169,930–60,183,143 | 7 |
| ENST00001007386 | 60,169,930–60,182,557 | 7 |
| ENST00001049858 | 60,169,930–60,184,495 | 8 |
| ENST00001120148 | 60,169,930–60,183,966 | 8 |
| ENST00001120149 | 60,169,930–60,183,966 | 8 |
顯示 12/29 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MS4A6A 可能參與訊號傳遞,但目前資料將此功能描述為可能性,未指出特定訊號途徑或其啟動方式。其可能的作用位置是在多聚體受體複合體中,作為複合體的一個組成部分,而非單獨描述為完整受體。這項資訊支持其與受體複合體相關訊號傳遞的可能關聯,但不足以判定它是否直接辨識訊號、如何影響訊號傳遞,或其作用方向與效應大小。
由於來源沒有提供所涉及的配體、受體組成、細胞類型或實驗條件,MS4A6A 在複合體中的具體功能仍無法進一步界定。現有描述也未說明它是否負責組裝或穩定複合體,或是否調節複合體其他成分的活動。因此,不宜將這項可能的複合體成分角色延伸解讀為已確立的分子機制。
就生物學意義而言,資料僅支持 MS4A6A 可能透過參與多聚體受體複合體而與訊號傳遞相關;尚未提供其下游反應、參與的細胞過程或生理結果。這個功能描述應保留「可能」的限定,不代表相關作用已在特定情境中獲得確認。
Promoter 與基因調控
>MS4A6A ENST00000528851 GRCh38 chr11:60182983-60184083 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GTGATGGTTCAGGTTGTGTTTCTGGGTTCATTCTGGAAGCTCCCCCAAGGAAAGGAGGAAGGAAGCTTGC AGGGTGGGGCTTTGCCATTGCCCTGACTGGCTCTGGTTTCCTTGCCTGATACATTGAAGTCAGCTTCCAA AGAATGCCACCCAAGGTTTTGAAGGGGCACAGTGCCTCTGTCCTCACAAAACCAGCCTGCATATGAGTTT ACTGAATTCATTTAGGTCCTGCTGAATCTTTCCCATTTGTTCCTTCTCTGTTTCAATATTTCAATGCTTC CCTGGAGGGGCCCAACCTTTCTGGAGGGCAAAGATCTGTTGTTAGAGAAAAAGAGCAGCCAGAGGAGGAA GATGACTTGAGGGTAGGCAGCAGTTGGGCAATCAGTATTGAAAGGTTGCTTTCAGCCTGCCAAGACTTGG GGAATTAGAAAAGCAAGATAAAACAAAACAAACAAACAAACTATATATATAAAAAACAATTTTTTAAAAG TTTTTTTATGTTCTATATTACTATTAGCTATATATTAATGAATGTTCCTTTAAAGCAGTGTAGTCATTAT TGCTATTATTATTATTATGGTTAGTTATAGACAGTGGAATATTGTTCTTTCTCTATATTATGATTACTAG CACTATTACTGTTATTAGTTACATGTTATTGAAAGCTTCAAAGCAGCATAGGCTTTTTATAAATATTTTT GCTCATCTTTATGACAATTCTCCAGTGTTGGTATTGCTCCTCTATTTAACAGATTAGAAAACTGAAGCTT CAAGAACAGACTTGCCTAACAACAGGAAACTTGTATGTCTCGAAGTGGCAATTCACACATAAGGCTCCAT GACTCCTGAACTCTCACAAATATTAGTTGGCTCTTTTCATGGTTTTACTGAAGTTGCTAGAAGTTTACAG AAAAGGAAGTGCAGGAACATTTCACAAATCTACAATCTGTGAGTATCACATCCTGTATAGCTGTAAACAC TGGAATAAGGAAGGGCTGATGACTTTCAGAAGATGAAGGTAAGTAGAAACCGTTGATGGGACTGAGAAAC CAGAGTTAAAACCTCTTTGGAGCTTCTGAGGACTCAGCTGGAACCAACGGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MS4A6A_1 ↗ | 11:60,183,083 | 負股 | 60,183,073–60,183,132 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_9TTZR · promoter · 60185308–60185685 · regulatory
· motif · 60183163–60183176 · motif
· motif · 60185208–60185219 · motif
· motif · 60185498–60185511 · motif
· motif · 60185578–60185590 · motif
· motif · 60185581–60185588 · motif
· motif · 60185582–60185595 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:248 aa
MS4A6A 蛋白長 248 個胺基酸,屬於 MS4A 家族。序列註解預測其具有四段螺旋型跨膜區,分別位於第 47–67、85–105、117–137 與 186–206 個胺基酸。區段拓樸註解顯示,N 端與 C 端位於細胞質側,並有兩段細胞外區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MS4A6A 被註記為膜蛋白,並具有多次跨膜特性。 現有定位資料未提供其在不同條件下的移動或定位變化資訊。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- GPRC5DQ9NZD1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
核酸與蛋白質序列
GACTTTCAGAAGATGAAGGTAAGTAGAAACCGTTGATGGG40ACTGAGAAACCAGAGTTAAAACCTCTTTGGAGCTTCTGAG80GACTCAGCTGGAACCAACGGGCACAGTTGGCAACACCATC120ATGACATCACAACCTGTTCCCAATGAGACCATCATAGTGC160TCCCATCAAATGTCATCAACTTCTCCCAAGCAGAGAAACC200CGAACCCACCAACCAGGGGCAGGATAGCCTGAAGAAACAT240CTACACGCAGAAATCAAAGTTATTGGGACTATCCAGATCT280TGTGTGGCATGATGGTATTGAGCTTGGGGATCATTTTGGC320ATCTGCTTCCTTCTCTCCAAATTTTACCCAAGTGACTTCT360ACACTGTTGAACTCTGCTTACCCATTCATAGGACCCTTTT400TTTTTATCATCTCTGGCTCTCTATCAATCGCCACAGAGAA440AAGGTTAACCAAGCTTTTGGTGCATAGCAGCCTGGTTGGA480AGCATTCTGAGTGCTCTGTCTGCCCTGGTGGGTTTCATTA520TCCTGTCTGTCAAACAGGCCACCTTAAATCCTGCCTCACT560GCAGTGTGAGTTGGACAAAAATAATATACCAACAAGAAGT600TATGTTTCTTACTTTTATCATGATTCACTTTATACCACGG640ACTGCTATACAGCCAAAGCCAGTCTGGCTGGAACTCTCTC680TCTGATGCTGATTTGCACTCTGCTGGAATTCTGCCTAGCT720GTGCTCACTGCTGTGCTGCGGTGGAAACAGGCTTACTCTG760ACTTCCCTGGGGTGAGTGTGCTGGCCGGCTTCACTTAACC800TTGCCTAGTGTATCTTATCCCTGCACTGTGTTGAGTATGT840CACCAAGAGTGGTAGAAGGAACAATCAGTCAGTCATGAGA880TACACATGGGAGGGCATTTGCATTGTGATGGAAGACAGAG920AAGAAAAGCAGATGGCAATTGAGTAGCTGATAAGCTGAAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。