演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

MS4A6ACD20L3

membrane spanning 4-domains A6A

MS4A6A 是 MS4A 家族的多次跨膜蛋白,可能作為多聚體受體複合體的一部分參與訊號傳遞。

Homo sapiens11q12.2UniProt Q9H2W1
OFFICIAL SYMBOL
MS4A6A
CHROMOSOME
11
UNIPROT
Q9H2W1
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

MS4A6A(membrane spanning 4-domains A6A)是蛋白質編碼基因,產生屬於 MS4A 家族的膜蛋白。其蛋白質具有四段跨膜區,並由此形成細胞內與細胞外區段交錯的拓樸架構。現有資料將它描述為可能參與訊號傳遞的多聚體受體複合體成分;更具體的作用方式與生物學過程尚未由這些資料說明。

Official symbol
MS4A6A
Gene name
membrane spanning 4-domains A6A
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13375
UniProt
Q9H2W1
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CD20L3MS4A6

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111q12.2
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegMS4A6Apq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr11:60,169,930–60,184,666
Gene span
14,737 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000528851 ★60,172,497–60,183,0836
ENST0000053083960,169,930–60,184,6668
ENST0000052905460,169,930–60,184,6668
ENST0000100738160,169,930–60,184,4958
ENST0000100738260,169,930–60,182,5807
ENST0000100738360,169,930–60,183,8538
ENST0000100738460,169,930–60,183,6657
ENST0000100738560,169,930–60,183,1437
ENST0000100738660,169,930–60,182,5577
ENST0000104985860,169,930–60,184,4958
ENST0000112014860,169,930–60,183,9668
ENST0000112014960,169,930–60,183,9668

顯示 12/29 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

MS4A6A 可能參與訊號傳遞,但目前資料將此功能描述為可能性,未指出特定訊號途徑或其啟動方式。其可能的作用位置是在多聚體受體複合體中,作為複合體的一個組成部分,而非單獨描述為完整受體。這項資訊支持其與受體複合體相關訊號傳遞的可能關聯,但不足以判定它是否直接辨識訊號、如何影響訊號傳遞,或其作用方向與效應大小。

由於來源沒有提供所涉及的配體、受體組成、細胞類型或實驗條件,MS4A6A 在複合體中的具體功能仍無法進一步界定。現有描述也未說明它是否負責組裝或穩定複合體,或是否調節複合體其他成分的活動。因此,不宜將這項可能的複合體成分角色延伸解讀為已確立的分子機制。

就生物學意義而言,資料僅支持 MS4A6A 可能透過參與多聚體受體複合體而與訊號傳遞相關;尚未提供其下游反應、參與的細胞過程或生理結果。這個功能描述應保留「可能」的限定,不代表相關作用已在特定情境中獲得確認。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 60183083 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>MS4A6A ENST00000528851 GRCh38 chr11:60182983-60184083 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GTGATGGTTCAGGTTGTGTTTCTGGGTTCATTCTGGAAGCTCCCCCAAGGAAAGGAGGAAGGAAGCTTGC
AGGGTGGGGCTTTGCCATTGCCCTGACTGGCTCTGGTTTCCTTGCCTGATACATTGAAGTCAGCTTCCAA
AGAATGCCACCCAAGGTTTTGAAGGGGCACAGTGCCTCTGTCCTCACAAAACCAGCCTGCATATGAGTTT
ACTGAATTCATTTAGGTCCTGCTGAATCTTTCCCATTTGTTCCTTCTCTGTTTCAATATTTCAATGCTTC
CCTGGAGGGGCCCAACCTTTCTGGAGGGCAAAGATCTGTTGTTAGAGAAAAAGAGCAGCCAGAGGAGGAA
GATGACTTGAGGGTAGGCAGCAGTTGGGCAATCAGTATTGAAAGGTTGCTTTCAGCCTGCCAAGACTTGG
GGAATTAGAAAAGCAAGATAAAACAAAACAAACAAACAAACTATATATATAAAAAACAATTTTTTAAAAG
TTTTTTTATGTTCTATATTACTATTAGCTATATATTAATGAATGTTCCTTTAAAGCAGTGTAGTCATTAT
TGCTATTATTATTATTATGGTTAGTTATAGACAGTGGAATATTGTTCTTTCTCTATATTATGATTACTAG
CACTATTACTGTTATTAGTTACATGTTATTGAAAGCTTCAAAGCAGCATAGGCTTTTTATAAATATTTTT
GCTCATCTTTATGACAATTCTCCAGTGTTGGTATTGCTCCTCTATTTAACAGATTAGAAAACTGAAGCTT
CAAGAACAGACTTGCCTAACAACAGGAAACTTGTATGTCTCGAAGTGGCAATTCACACATAAGGCTCCAT
GACTCCTGAACTCTCACAAATATTAGTTGGCTCTTTTCATGGTTTTACTGAAGTTGCTAGAAGTTTACAG
AAAAGGAAGTGCAGGAACATTTCACAAATCTACAATCTGTGAGTATCACATCCTGTATAGCTGTAAACAC
TGGAATAAGGAAGGGCTGATGACTTTCAGAAGATGAAGGTAAGTAGAAACCGTTGATGGGACTGAGAAAC
CAGAGTTAAAACCTCTTTGGAGCTTCTGAGGACTCAGCTGGAACCAACGGG
MS4A6A 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
MS4A6A_1 ↗11:60,183,083負股60,183,073–60,183,132

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR11_9TTZR · promoter · 60185308–60185685 · regulatory

· motif · 60183163–60183176 · motif

· motif · 60185208–60185219 · motif

· motif · 60185498–60185511 · motif

· motif · 60185578–60185590 · motif

· motif · 60185581–60185588 · motif

· motif · 60185582–60185595 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:248 aa

1 aa248 aa跨膜區拓樸區域
依 Q9H2W1 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

MS4A6A 蛋白長 248 個胺基酸,屬於 MS4A 家族。序列註解預測其具有四段螺旋型跨膜區,分別位於第 47–67、85–105、117–137 與 186–206 個胺基酸。區段拓樸註解顯示,N 端與 C 端位於細胞質側,並有兩段細胞外區域。

拓樸區域Cytoplasmic1–46 aa
跨膜區Helical47–67 aa
拓樸區域Extracellular68–84 aa
跨膜區Helical85–105 aa
拓樸區域Cytoplasmic106–116 aa
跨膜區Helical117–137 aa
拓樸區域Extracellular138–185 aa
跨膜區Helical186–206 aa
拓樸區域Cytoplasmic207–248 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9H2W1…

AlphaFold · Q9H2W1

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane

MS4A6A 被註記為膜蛋白,並具有多次跨膜特性。 現有定位資料未提供其在不同條件下的移動或定位變化資訊。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CD20L3MS4A6AGPRC5D
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能MS4A6A 可能作為多聚體受體複合體的一個組成部分參與訊號傳遞;這項功能描述帶有不確定性,未指出特定訊號途徑或複合體的具體成分。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in signal transduction as a component of a multimeric receptor complex

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位MS4A6A 被註記為膜蛋白,且具有多次跨膜特性;此定位描述未提供其他條件或動態變化資訊。資料庫紀錄
證據與來源

Membrane / Multi-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000528851 · 1,302 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GACTTTCAGAAGATGAAGGTAAGTAGAAACCGTTGATGGG40
41ACTGAGAAACCAGAGTTAAAACCTCTTTGGAGCTTCTGAG80
81GACTCAGCTGGAACCAACGGGCACAGTTGGCAACACCATC120
121ATGACATCACAACCTGTTCCCAATGAGACCATCATAGTGC160
161TCCCATCAAATGTCATCAACTTCTCCCAAGCAGAGAAACC200
201CGAACCCACCAACCAGGGGCAGGATAGCCTGAAGAAACAT240
241CTACACGCAGAAATCAAAGTTATTGGGACTATCCAGATCT280
281TGTGTGGCATGATGGTATTGAGCTTGGGGATCATTTTGGC320
321ATCTGCTTCCTTCTCTCCAAATTTTACCCAAGTGACTTCT360
361ACACTGTTGAACTCTGCTTACCCATTCATAGGACCCTTTT400
401TTTTTATCATCTCTGGCTCTCTATCAATCGCCACAGAGAA440
441AAGGTTAACCAAGCTTTTGGTGCATAGCAGCCTGGTTGGA480
481AGCATTCTGAGTGCTCTGTCTGCCCTGGTGGGTTTCATTA520
521TCCTGTCTGTCAAACAGGCCACCTTAAATCCTGCCTCACT560
561GCAGTGTGAGTTGGACAAAAATAATATACCAACAAGAAGT600
601TATGTTTCTTACTTTTATCATGATTCACTTTATACCACGG640
641ACTGCTATACAGCCAAAGCCAGTCTGGCTGGAACTCTCTC680
681TCTGATGCTGATTTGCACTCTGCTGGAATTCTGCCTAGCT720
721GTGCTCACTGCTGTGCTGCGGTGGAAACAGGCTTACTCTG760
761ACTTCCCTGGGGTGAGTGTGCTGGCCGGCTTCACTTAACC800
801TTGCCTAGTGTATCTTATCCCTGCACTGTGTTGAGTATGT840
841CACCAAGAGTGGTAGAAGGAACAATCAGTCAGTCATGAGA880
881TACACATGGGAGGGCATTTGCATTGTGATGGAAGACAGAG920
921AAGAAAAGCAGATGGCAATTGAGTAGCTGATAAGCTGAAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。