基因總覽
MS4A5 的正式名稱為 membrane spanning 4-domains A5,屬於蛋白質編碼基因;其產物 Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 5 歸於 MS4A family。蛋白質全長 200 個胺基酸,具有多次穿膜的架構,序列中標註四段螺旋型跨膜區,並由細胞質側與細胞外側區段交錯排列。資料指出,MS4A5 可能是多聚體受體複合體的組成部分,並可能參與訊號傳遞;目前提供的資訊未進一步界定其特定受體或作用機制。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000300190 ★ | 60,429,572–60,447,792 | 5 |
| ENST00000528905 | 60,429,755–60,447,792 | 4 |
| ENST00000528093 | 60,429,776–60,447,792 | 4 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MS4A5 可能參與訊號傳遞,其可能的作用位置是在多聚體受體複合體中,作為該複合體的組成部分。這項描述將其功能與受體複合體及細胞訊號傳遞相連,但未指出訊號的種類、受體複合體的具體成員,或 MS4A5 在其中所負責的分子步驟。因此,現有資訊支持的是一項可能的功能角色,而非已確認的特定訊號機制。
Promoter 與基因調控
>MS4A5 ENST00000300190 GRCh38 chr11:60428572-60429672 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCAATATGACATTAACACACATGACTCAGCAGAGGTTTGAAAAGTATTTGTGAATTGGAAGAGAACCAAG AGTCTGCCAACTGCCAGAGACATGACTGAGGCCATCCTAATTCATGTAATTGGACACTCCACCAGGTGAC CACAGTTGCATGAGACAGCCTGGTAGAGAAGTGCTGAGCAGCCTTAGATGAGACAGACCACACACAGGAC CCACAGATGTGTAAACAAAAGCCGATGGTGGTTGCTGGAACTAACTACATTTTGAGGGATTTGTTACACA GCTAAAGCTACTTAAATCAGGTGGCAAAACCACAAAGTGACAGGAAAAATGGATGTTATCTATACTTCAA GAAGTGGTTAATTTGTTCCGTGGCCTGAGAGATTTTGCGTTCTACCTGTGTCTGAAGATATGGAACTGGA ATAAATGTGTATCTAGTTGCCATTTGGTAACTAAAATGTCCTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTT GCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATTTCAGCTCAAGGAAACCTCCGGCTCCTGGGTTCAAGTGATTCT CATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTATATTT TTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCTAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCG CCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCCACCATGCGCGGTCCCTAAAATGTCTTTATAT GTAGATCATCTAGTCCAATTTGGTCAATGTATATATGAGGAATCAGAAACCAGGAGAGGGGGATGTGACT TGCCAAAAGTCACAGTAAACTCCTAACTAAACCAGGACTACTTGTCAGGTTCTCTGATCCCCAGTCCCAG GCATTTTACTTATAGCCATCTTGGGATCTTGAGCAGTCCTGAGATTCTATGACTCTGTGACTCTATGGTT CTATAATTCCAAGACAAAGCAAACAATTCCAGTGCTCCAGGCAGCCTCAGCACAAGAAAAGAACATGGTC TAGACTGAAGTACCAACTAAATCATCTCCTTTCAAATTATCACCGACACCA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_83QZ79 · enhancer · 60428555–60428771 · regulatory
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:200 aa
MS4A5 蛋白全長 200 個胺基酸,屬於 MS4A family。序列註解列出四段螺旋型跨膜區,分別位於第 53–73、81–101、121–141 與 160–180 位胺基酸;其間及兩端區段交替標註於細胞質側與細胞外側。這些拓樸註解提供蛋白質跨膜架構的描述。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MS4A5 被註記為膜蛋白,且屬於多次穿膜蛋白。 此定位描述未提供特定細胞器或組織位置,也未說明定位是否會隨條件或異構型而改變。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | MS4A5 可能作為多聚體受體複合體的組成部分參與訊號傳遞;這描述的是可能的功能角色,並未指明複合體成員、訊號類型或具體分子機制。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源May be involved in signal transduction as a component of a multimeric receptor complex |
| 細胞定位 | MS4A5 被註記為膜上的多次穿膜蛋白;此定位資料未提供更具體的細胞內位置、定位改變條件或異構型差異。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AAACAATTCCAGTGCTCCAGGCAGCCTCAGCACAAGAAAA40GAACATGGTCTAGACTGAAGTACCAACTAAATCATCTCCT80TTCAAATTATCACCGACACCATCATGGATTCAAGCACCGC120ACACAGTCCGGTGTTTCTGGTATTTCCTCCAGAAATCACT160GCTTCAGAATATGAGTCCACAGAACTTTCAGCCACGACCT200TTTCAACTCAAAGCCCCTTGCAAAAATTATTTGCTAGAAA240AATGAAAATCTTAGGGACTATCCAGATCCTGTTTGGAATT280ATGACCTTTTCTTTTGGAGTTATCTTCCTTTTCACCTTGT320TAAAACCATATCCAAGGTTTCCCTTTATATTTCTTTCAGG360ATATCCATTCTGGGGCTCTGTTTTGTTCATTAATTCTGGA400GCCTTCCTAATTGCAGTGAAAAGAAAAACCACAGAAACTC440TGATAATATTGAGCCGAATAATGAATTTTCTTAGTGCCCT480GGGAGCAATAGCTGGAATCATTCTCCTCACATTTGGTTTC520ATCCTAGATCAAAACTACATTTGTGGTTATTCTCACCAAA560ATAGTCAGTGTAAGGCTGTTACTGTCCTGTTCTTGGGAAT600TTTGATTACATTGATGACTTTCAGCATTATTGAATTATTC640ATTTCTCTGCCTTTCTCAATTTTGGGGTGCCACTCAGAGG680ATTGTGATTGTGAACAATGTTGTTGACTAGCACTGTGAGA720ATAAAGATGTGTTAAAATA739cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。