演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

MS4A4E

membrane spanning 4-domains A4E

MS4A4E 的基因身分與分類資料已收錄,功能註解尚待補充。

Homo sapiens11q12.2UniProt Q96PG1
OFFICIAL SYMBOL
MS4A4E
CHROMOSOME
11
UNIPROT
Q96PG1
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

MS4A4E 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 membrane spanning 4-domains A4E。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 11q12.2。

Official symbol
MS4A4E
Gene name
membrane spanning 4-domains A4E
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14284
UniProt
Q96PG1
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111q12.2
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegMS4A4Epq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr11:60,200,270–60,243,162
Gene span
42,893 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000651255 ★60,200,270–60,243,1379
ENST0000114452860,200,270–60,243,1629
ENST0000111066260,212,490–60,243,1625
ENST0000039898460,213,089–60,230,0555

顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用;有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 60243137 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>MS4A4E ENST00000651255 GRCh38 chr11:60243037-60244137 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACCTAGCTCCATCCTTCTTCCATTTGTGTGTCTTTTGCTTATTCATCAGGTCTCCAATTAGATGTCCCTT
TATCTAGGAAGTCTCCTCTGCCTACCTACCCAACGTTGAGTTCTTTGATCCTCCTATGAGCTCTCTCAGG
ATATCCAATTTTACCTTGCAGATCACTGATTATAATGGGTTGTAATGATTTATTTATTCATCAGCATTGC
CACTTTACCTTGCAGGTAACTGATTATAATGGGTGATTTATTTACTTGTCTATATTGTCAAGTAGCCTAT
AAAATCCTTGAGCGAAAATCATTTTTCACCATTTTATCTGAAGCACATGGCACACTGCTTGGCTTATAGT
AGCTTTTCTCTAAGAAAATGCTGAGTGAATGAAAATTGCATGCCACTTTGCTTTCCTCCATGTAAAGAAG
GCATTATTTTATTTTACCAATGAATCAGGTTCAGGGGATTAACAAGGTCATACAAGAAATGATTGCCATT
GGGTTTGTCTTAGTCAAAGACCAGCTTGTTCTATGATACCAGCTGCTTCTTTGACTTAGAAAGGTGTTGT
ATTAATTATTGCTGTACAACCAACTTGTTCCCATTTTGTGGCTATTCATGTTGAACCTCCAAAGGTGAAA
TATCATGAAAATAAGATATTTAAGTTGTGTATATTAAGGCACAATTACTTTTTCACCAACCTAATACAAT
AGTAACAGTAGTTCTCTGGGAAGAAGAGTACTGTGGAAATGTGTGAAATTGTGAAAGGGGGCATTTATAA
ATTACCATTTACTTAGTTGTGTATATAACAATCTTTGAGCAGAGTCTGGCAAACAGAAAATCCTCCACCA
CTGATACCCACAGTAATTAGCACTATTATTTTCATAGGAAAGACTGTATCAGGCAGCCACTGCTTTTTCA
GCAAATTTCAAAATAAACGTCCACACCCATATTGGGAACGCAAAATCAGTTAATGCTTCCGATAAAAAAG
AGGAACTAGTTGTGTGTCTCAGAAGTTCTCAACACATCCTTTAAGGTTCCAAACATCTACTAGAAAAGGA
GTGCAGATTTAAACTGAGTGAGGTGTGGAGTGGGGGAAGCTGACTGTGTCT
MS4A4E 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
MS4A4E_1 ↗11:60,243,088負股60,243,078–60,243,137

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

· motif · 60243150–60243163 · motif

· motif · 60243763–60243774 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:132 aa

1 aa132 aa跨膜區
依 Q96PG1 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

MS4A4E 是長 132 個胺基酸的蛋白質,屬於 MS4A family。序列註解標示兩段螺旋型跨膜區,分別位於第 52–72 與第 76–96 個胺基酸位置。

跨膜區Helical52–72 aa
跨膜區Helical76–96 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q96PG1…

AlphaFold · Q96PG1

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane

MS4A4E 被註解為多次穿膜的膜蛋白;此定位資料描述的是 MS4A4E 本身。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
細胞定位MS4A4E 被註解為膜蛋白,並具有多次穿膜的特性。推論支持
證據與來源

Membrane / Multi-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000651255 · 2,465 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AGAAGTTCTCAACACATCCTTTAAGGTTCCAAACATCTAC40
41TAGAAAAGGAGTGCAGATTTAAACTGAGTGAGGTGTGGAG80
81TGGGGGAAGCTGACTGTGTCTGGAACAAAGAACTTTGAGG120
121AACTTGCCCAGAGCCCTGCACTCATCAGACCTGCAGCAGA160
161CATTGCAGGCCTGAAGAAAGCACCTTTTCTGCTGCCATGA200
201CAACCATGCAAGGAATGGAACAGACCACTCCAGGGGCTGG240
241CCCTGATGTGCCCCAGCTGGGAAACATAGATGTCATACAT280
281TCATATCTGTGTAAAGGATTGCAAGAGAAGTTCTTCAAGA320
321GGAAACCCAAAGTCCTTGGGGTTTTGTGTGGACATAAGTT360
361TTCAACTCATTCGGTATCCTTATCAGTTGCAGCAGGAATT400
401AGAACAACAAAAGGTCTGGTTGGAGGTAGTCTAGGAAAGA440
441ATATCACCAGTTCAGTCTTGGCTATATCAGGGATCTTAAT480
481CAATGCAATAAGCTTGACGTTTTATTCATTCCGTTACCAT520
521TACTGTAACCACGATCAGTTGTCAAGTAATTGTTACATGA560
561CTATGTCCATTTTAATGGGTACGGATGGCATGGTGCTCCT600
601CTTAAGTGTGCTGGAATTCTGCATTGCTGTGGCCCTCTCT640
641GCCTTTGGATGTAAAGTGCTTTGTTGTAGCCCCAGTGAGA680
681GCAAAAATAAAATTAGAAGCAATACTTTCATGTGCTACCT720
721CCTTTCTATTCAGATGCAATATGATGGAAAGAGACTAAAT760
761GTTGATGTCGACAGTACTGTATGGTGCTCCGGAGATGGAC800
801AGTATCTGGAAAAAGTCTATTATGACATTCTATCTTCTTG840
841GTTGAGGATTGAAAGTATTTATCGAGTGCTCAATGGTGCC880
881CAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCCCTACAAC920
921CTCCACCTCCCAGCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。