演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

MS4A12Ms4a10

membrane spanning 4-domains A12

MS4A12 是編碼膜蛋白的基因,產物屬於 MS4A 家族,可能作為多聚受體複合體的一部分參與訊號傳導。

Homo sapiens11q12.2UniProt Q9NXJ0
OFFICIAL SYMBOL
MS4A12
CHROMOSOME
11
UNIPROT
Q9NXJ0
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

MS4A12 的正式名稱為 membrane spanning 4-domains A12,屬於蛋白質編碼基因。其產物屬於 MS4A 家族,是一種多次跨膜蛋白;資料指出它可能作為多聚受體複合體的組成部分參與訊號傳導,但未進一步說明受體組成或訊號的具體內容。

Official symbol
MS4A12
Gene name
membrane spanning 4-domains A12
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13370
UniProt
Q9NXJ0
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
Ms4a10FLJ20217

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111q12.2
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegMS4A12pq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr11:60,492,696–60,507,535
Gene span
14,840 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000016913 ★60,492,778–60,507,4307
ENST0000088003460,492,722–60,507,5357
ENST0000053707660,492,725–60,507,5356
ENST0000088003560,492,725–60,507,5355
ENST0000097181560,492,725–60,507,5358
ENST0000097181660,492,725–60,507,5357
ENST0000114329160,492,725–60,507,5357
ENST0000052678460,492,778–60,506,7985
ENST0000097181760,492,779–60,507,5356
ENST0000053000760,492,800–60,501,1113

顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

MS4A12 可能參與訊號傳導,資料所述的可能作用方式,是作為多聚受體複合體的一個組成部分。這項描述表示其功能或與受體複合體的組成及訊號傳遞有關,但來源並未指出它在複合體中的具體位置、參與何種訊號,或其作用如何影響下游反應。

此功能敘述帶有不確定性:目前僅能表述為「可能參與」,不能據此視為已確立的作用。來源也未提供特定細胞或生理情境、實驗條件、受體複合體的其他成員,或可用來判定訊號傳導結果的細節。因此,MS4A12 與訊號傳導之間的關聯應限於其可能作為多聚受體複合體成分這一層次。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 60492778 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>MS4A12 ENST00000016913 GRCh38 chr11:60491778-60492878 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGGTGGGGGGGTCAGCCCCCGCCCGGCCAGCCGCCCCCTCCGGGAGGGAGGTGGGGGGCGCCTCCGCCCA
GCCGCCCCTTCTGGGAAGTGAGGAGCCCCTCTGCCTGGCCATCACCCCGTCTGGGAGGTGTACCCAACAG
CTCATTGAGAACGGGCCATGATGACGATGGCGGTTTTGTGGAATAGAAAAGGGGGAAAGGTGGGGAAAAG
ATAGAGAAATCAGATTGTTGCTGTGTCTGTGTAGAAAGAAGTAGACATGGGAGATTTCATTTTGTTCTGT
ACTAAGAAAAATTCTTCTGCCTTGGGATGCTGTTGATCTATGACCTTACCCCCAACCCTGTGCTCTCTGA
AACATGTGCTGTGTCCACTCAGGGTTCAATGGATTAAGGGCGGTGCAAGATGTGCTTTGTTAAACAGATG
CTTGAAGGCAGCATGCTCGTTAAGAGTCATCACCACTCCCTAATCTCAAGTACCCAGGGACAAAAACACT
GCGGAAGGCCGCAGGGTCCTCTGCCTAGGAAAGCCAGAGACCTTTGTTCACTTGTTTATCTGCTGACCTT
CCCTTCACTATTGTCCTATGACCCTGCCAAATCCCCCTCTGTGAGAAACACCCAAGAATGATCAATAAAA
AAAAAAAAGAGACTATAAACATAATTTGAGTGTTTAGAAATTTAAAAATAAAATCCCAGTAAAAAAAATA
AATAAATAAAAATAAAAATAAAAAAATGCAGTATGATATTGCAATGATTGAGCATTAGAAAGCTGGAGAA
AATAAATACTAAAGTGTTTGGGAGGGTCACAATAGGCTTCCCAGTAAAAATTAGAGGAGGATGTGAAAGC
ACAGCGTATTCCAAACTTTACAGTTGCATTTACATCTCTTGAGGTGAAAGAGAAATAACCATAAAAGGAC
TCTGGAACTACATAAAGATACAAGACAAATTGGTTTGGAGAACGGAAATAAAATCTACCTATAAAATCCA
GGTAAATATCTGATACTGGCACACAGGTTGGAGCAGAGAAAGAGGAAACATAGAGGTGCCAAAGGAACAA
AGTAAGTCCATTGATACGTTCTTGCCTATCTCTCCTCCAAATCAATGGGCA
MS4A12 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
MS4A12_1 ↗11:60,492,778正股60,492,729–60,492,788

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

· motif · 60493641–60493652 · motif

· motif · 60497317–60497330 · motif

· motif · 60497317–60497330 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:267 aa

1 aa267 aa功能區域跨膜區拓樸區域
依 Q9NXJ0 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

MS4A12 蛋白長 267 個胺基酸,屬於 MS4A family。序列註解標示四段螺旋型跨膜區,並交替分布於細胞質側與細胞外側的拓撲區域;末端細胞質區段另被註解為無序區。

拓樸區域Cytoplasmic1–91 aa
跨膜區Helical92–112 aa
拓樸區域Extracellular113–120 aa
跨膜區Helical121–141 aa
拓樸區域Cytoplasmic142–160 aa
跨膜區Helical161–181 aa
拓樸區域Extracellular182–200 aa
跨膜區Helical201–221 aa
拓樸區域Cytoplasmic222–267 aa
功能區域Disordered248–267 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9NXJ0…

AlphaFold · Q9NXJ0

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane

MS4A12 被註解為膜上的多次跨膜蛋白。 來源未提供其定位隨條件改變或異構型差異的資訊。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
Ms4a10MS4A12FAM3AMALLPLLP
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能MS4A12 可能參與訊號傳導,並可能是多聚受體複合體的組成部分。此敘述保留可能性,未提供具體受體、訊號種類或作用機制,因此不能解讀為已確立的功能。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in signal transduction as a component of a multimeric receptor complex

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位MS4A12 被描述為位於膜上的多次跨膜蛋白;此定位資訊未進一步限定膜的種類、細胞情境或定位變化,也未提供異構型差異。資料庫紀錄
證據與來源

Membrane / Multi-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000016913 · 1,167 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACACAGGTTGGAGCAGAGAAAGAGGAAACATAGAGGTGCC40
41AAAGGAACAAAGACATAATGATGTCATCCAAGCCAACAAG80
81CCATGCTGAAGTAAATGAAACCATACCCAACCCTTACCCA120
121CCAAGCAGCTTTATGGCTCCTGGATTTCAACAGCCTCTGG160
161GTTCAATCAACTTAGAAAACCAAGCTCAGGGTGCTCAGCG200
201TGCTCAGCCCTACGGCATCACATCTCCGGGAATCTTTGCT240
241AGCAGTCAACCGGGTCAAGGAAATATACAAATGATAAATC280
281CAAGTGTGGGAACAGCAGTAATGAACTTTAAAGAAGAAGC320
321AAAGGCACTAGGGGTGATCCAGATCATGGTTGGATTGATG360
361CACATTGGTTTTGGAATTGTTTTGTGTTTAATATCCTTCT400
401CTTTTAGAGAAGTATTAGGTTTTGCCTCTACTGCTGTTAT440
441TGGTGGATACCCATTCTGGGGTGGCCTTTCTTTTATTATC480
481TCTGGCTCTCTCTCTGTGTCAGCATCCAAGGAGCTTTCCC520
521GTTGTCTGGTGAAAGGCAGCCTGGGAATGAACATTGTTAG560
561TTCTATCTTGGCCTTCATTGGAGTGATTCTGCTGCTGGTG600
601GATATGTGCATCAATGGGGTAGCTGGCCAAGACTACTGGG640
641CCGTGCTTTCTGGAAAAGGCATTTCAGCCACGCTGATGAT680
681CTTCTCCCTCTTGGAGTTCTTCGTAGCTTGTGCCACAGCC720
721CATTTTGCCAACCAAGCAAACACCACAACCAATATGTCTG760
761TCCTGGTTATTCCAAATATGTATGAAAGCAACCCTGTGAC800
801ACCAGCGTCTTCTTCAGCTCCTCCCAGATGCAACAACTAC840
841TCAGCTAATGCCCCTAAATAGTAAAAGAAAAAGGGGTATC880
881AGTCTAATCTCATGGAGAAAAACTACTTGCAAAAACTTCT920
921TAAGAAGATGTCTTTTATTGTCTACAATGATTTCTAGTCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。