基因總覽
MS4A10(membrane spanning 4-domains A10)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 MS4A family。序列註解顯示,該蛋白質長 267 個胺基酸,含有四段跨膜螺旋,並在膜兩側分布多個胞質區域與細胞外區域。現有資料指出,它可能是多聚受體複合體的組成部分;至於其具體角色,來源僅提示可能參與訊號傳導。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000308287 ★ | 60,785,333–60,801,305 | 8 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MS4A10 可能參與訊號傳導,來源描述的作用情境是它作為多聚受體複合體的一個組成部分。這表示其潛在功能與受體複合體相關,但目前資料並未說明它是否直接辨識訊號、如何影響複合體活動,或訊號如何在細胞內傳遞。因此,不能據此指定特定配體、下游路徑或生理效應。
這項功能描述帶有不確定性:來源使用「可能參與」的表述,並未將其寫成已確立的作用。可支持的結論限於 MS4A10 可能是多聚受體複合體的一部分,並可能與訊號傳導有關;資料沒有提供實驗系統、細胞或組織情境,也未指出受體複合體的其他組成成員或訊號讀出。因此,現有資訊不足以進一步界定其作用條件或功能後果。
Promoter 與基因調控
>MS4A10 ENST00000308287 GRCh38 chr11:60784333-60785433 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ACGAAACTGGTCCCCAGTGCCAGAACGGTTGGGGACCACTGCTCTATGAAAGTAGTTTCTTTTTTCCTTT CCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCACACTGTGTTGCCCGGACTGAGGTGCAGTGGTG TGATCACAGCTCACTGGACTCAAGTGATGCTCCCACCTCAGCCTCTCGAGCAGCTGGAACCATAGACAGG GACCAAGACACCTGGCTCATTTTTGAATTTTTGAATTTTTGTAGAGATGAGGTCTCGCTATGTTGCCCAG GCTGGTCTCAAGCTCTTGGCTCAAGTGATCCTCCCACTTTGGTCTCCCAAAGAGCTGGGATTGCAGGCAT GAGCCACCGCCCGGCCCTTTAAAAGACTAGTTTCCAAATGTTCAACAGAGCTCTGTGGGGCTGCAGGGTT AAACTCTGAGCGTAAATAGACCTCAGTGAGCACCAGGACTCGGTTTTAATTTTTTTGTTCTGATCATGTG GTCACACTTTTTTTTTAAAGAGTCCATATCTTTTAGAGATAAATACTAAAATGCTTACAAATAAAATGGG AAGATATCTGAGTTTTGCTTACTTCTGGGGGAGAATAAGATTGGCCAAGAGCTGCTGATGGTGGCTGTAG CTCGCGAATGGGCACAGGGGTGTCATGGAACCATTCTCTCTACTTTTGTGAGTGCTTGAAATTTTCCAGA ATTAAAAGAACTCTTTCAAAAGGTTCAACTTCTTACTCCACTCCCAGGATCTAAGACGATTACAACCACT TTCACTCCATCAGTCATGCCCTGAAAACAGATTAAATTATCAACATTTCCCTTGCCAAAGGAAATTTACA ACTGTCAAGGAGAGACATAAAGAAGGGCACTAAGATTTTCACCTGCCGGGGTTTGGCGGGAGGGGGAAGG ACTTTGACAGCTTCCATGCAACCGGGGCATGAAGCAGGGCGTGGGTCCAGGAGGGAGAAGATCCAAAGTC GAATGTTGTAAAGATGTGCTGATTTCCCAGCGCTGTCTCTGGGGAGCTCCGGCAGCGCAAGAGGGCAAAG CACAGCTGGAAGCTCAGAGCTGCAGTCCCAGGTCCTGGGGTGAGTGGTCCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MS4A10_1 ↗ | 11:60,785,353 | 正股 | 60,785,304–60,785,363 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_5JB2R8 · CTCF_binding_site · 60785678–60785699 · regulatory
ENSR11_5JB2S2 · CTCF_binding_site · 60785852–60785873 · regulatory
ENSR11_83R8T8 · enhancer · 60786184–60786376 · regulatory
ENSR11_9W5FX · enhancer · 60787218–60787634 · regulatory
· motif · 60785680–60785696 · motif
· motif · 60785854–60785870 · motif
· motif · 60786111–60786124 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:267 aa
MS4A10 蛋白質長 267 個胺基酸,屬於 MS4A family。序列註解標示四段跨膜螺旋,分別位於第 62–82、92–112、122–142 與 172–192 個胺基酸;其間及兩端則有胞質區域與細胞外區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MS4A10 被註記為膜蛋白,具有多次跨膜特徵。 資料未提供定位改變的條件、異構型差異或動態資訊。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- NEDD4P46934 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | MS4A10 可能作為多聚受體複合體的一個組成部分參與訊號傳導;此描述表示一種可能的功能關聯,並未進一步指出受體複合體的成員、訊號傳遞方式或具體生物學結果。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源May be involved in signal transduction as a component of a multimeric receptor complex |
| 細胞定位 | MS4A10 被描述為膜蛋白,具有多次跨膜特徵;此項定位資訊未進一步說明其所在膜的種類、定位變化條件或不同異構型之間的差異。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GATTTCCCAGCGCTGTCTCTGGGGAGCTCCGGCAGCGCAA40GAGGGCAAAGCACAGCTGGAAGCTCAGAGCTGCAGTCCCA80GGTCCTGGGCCAGGGCCCCCATCCAGCATCAATGAAAGCA120GAAGCCACAGTTATTCCCAGCCGTTGTGCTAGGGGGCTCC160CATCATGGCAAGTCCTCAGCCCAGTCCAGCCCTGGCAGAC200AAGTGCACCCCAGAACACGACCCAGCCCAAGCTCCTGGCT240CCACACCAGCACGAGAAGTCCCAGAAGAAGAGCAGCCTTC280TTAAGGAGCTGGGGGCCTTCCACATCACCATCGCTCTGCT320GCACCTGGTCTTTGGGGGCTACCTGGCCTCTATAGTCAAG360AACCTTCACCTGGTGGTGCTGAAGTCTTGGTATCCATTCT400GGGGGGCTGCCTCTTTTCTCATTTCAGGGATCTTGGCGAT440AACAATGAAGACCTTTTCTAAAACTTACCTGAAGATGTTG480TGCCTGATGACAAACCTCATCAGCCTCTTTTGCGTGCTGT520CTGGCCTCTTCGTCATCTCCAAGGATCTCTTTCTGGAGAG560CCCATTTGAGTCCCCGATCTGGAGAATGTACCCCAACTCC600ACGGTCCACATCCAGAGGCTGGAGCTGGCCTTGCTCTGCT640TCACTGTCCTAGAGCTCTTCCTGCCAGTGCCCACAGCTGT680CACAGCCTGGAGAGGGGACTGCCCATCTGCAAAGAATGAT720GATGCATGCCTTGTTCCGAATACACCATTGCATCTCAAAG760GCCTGCCGGTGGAGCCCCCGCCATCCTACCAGAGTGTGAT800TCAAGGCGACGCACAACACAAGCAACATCAGAGGCTCAGA840GAAGTTAAGCAAGTTGCCCCGGACACATGGATAGTCACTG880ACGGAGCTGCGATCTGGACCCAGACTGCAAACTGAAGAGC920CACTGCCTGACAATGCCCAAACTTGGTTGGAGCATAGCCC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。