基因總覽
myocardin related transcription factor A（MRTFA）是由蛋白質編碼基因 MRTFA 產生的轉錄共活化因子，屬於與 myocardin 相關的轉錄調控因子。它與轉錄因子 serum response factor（SRF）協同作用，參與調控細胞骨架相關基因的表現。MRTFA 含有 RPEL 重複序列，可與球狀肌動蛋白（G-actin）結合；其蛋白質序列也包含 SAP 結構域及雙段式核定位訊號。這些特徵構成其與肌動蛋白及轉錄調控相關的分子基礎。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000355630 ★ | 40,410,289–40,636,719 | 15 |
| ENST00000651595 | 40,410,281–40,636,726 | 15 |
| ENST00000407029 | 40,410,281–40,463,440 | 12 |
| ENST00000652095 | 40,410,281–40,533,827 | 13 |
| ENST00000402042 | 40,410,281–40,636,726 | 14 |
| ENST00001134417 | 40,410,281–40,636,719 | 15 |
| ENST00000614754 | 40,410,282–40,436,310 | 12 |
| ENST00000620651 | 40,410,282–40,436,310 | 11 |
| ENST00000699988 | 40,428,705–40,552,346 | 5 |
| ENST00000402630 | 40,429,351–40,463,418 | 4 |
| ENST00000651694 | 40,429,641–40,533,822 | 5 |
| ENST00000422851 | 40,431,405–40,533,811 | 5 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MRTFA 是轉錄共活化因子，與 serum response factor（SRF）共同調控細胞骨架相關基因的表現。此調控與發育、形態形成及細胞遷移有關，讓細胞骨架狀態能與基因表現變化相連結。
SRF–MRTFA 複合體的活性會回應 Rho GTPase 引起的細胞內 G-actin 濃度變化。MRTFA 透過 RPEL 重複序列結合 G-actin，藉此調節 MRTFA–SRF 複合體的活性。換言之，肌動蛋白的狀態不僅是細胞骨架動態的一部分，也會影響這項轉錄共活化功能。
核內的絲狀肌動蛋白（F-actin）也會調節 MRTFA 活性。因此，來源所述的調控涉及 G-actin 與核內 F-actin，並將細胞骨架動態與相關基因表現連結。資料未進一步界定 F-actin 調控的具體分子步驟。
Promoter 與基因調控
>MRTFA ENST00000355630 GRCh38 chr22:40636619-40637719 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CATATACATATACACATACACATACACATACACATACACATACACATACACATACATATACATGTTTTTA AATCGGGCAGCCACCCGCTCCCCGCCCTCAGCCCGGAATAGGTTCAGAGAGGTGCCCGGGTTCACTTGCG GAGCGTGTGGCCTCTGCGCCTAACGCGCGCCCCTTCACTACACGAATGGGTGCGGGCAAGGGTATAGGAT TTTAGAATTCCAAGAGTTGTCGGGGGTCATCCCGTGGAATCCTCTTTTTTGCAGATGCTCTTCCTGGAGC CTTCCGATGCAAGCTCTTGGGCTCACGCAGCCCTTTTCCTCTTCTAAGCCCAGAGCGCTTTCGCTGCTGC TGATCTCCACGGCCTCGGCAGATAGGGAGGGGCAGGCAGGTGTCAGCGTCCTCCCTTTCACCGTTGGGGA AACTGACTCAGAGAAACAAGGCGACGGGCCTCGGCGGGGCGGGACCGTAACGGGAATTCAAGGCTCCAGG CCAGAGCGGAATTTATTGTGTCTCGTTTTGGGAAGCGTGAATGTGAAATGATCGACTTCGGAGCCCCAGG CGGAGACCCTTCAGTCCCCGACAAGAATCGGGATGGGGTCTGGGATTAATGCAGTAATTACTCGCGCCTG GGCATTGACCCCTTGGCAACTTCGCAAGATCCGGCAGGGTCCACCGCCCTTCCCTTCACAGGGTGACCAC AGGGCTGCGGCCTCTTTAAGGCCCAGAGCTCCGCCCCCGGCTCGTCGCCAACCCCCTCGCCGCAGCTCAG CCAGTTCCAGACTTTCCTCAGAGATGAGGTCATCTCCCCGTTGCCCATTGGCTGCGCCGTGCCGTCAGTC ACAGGAAGTCAGGCCGCCGTTTTCGCCTTCTTCATGCCGCTTCCTTCTCCGCCCGCCCTTTAGTCCGCCG ATCACGACCCCGATCAGGCCTCTGATTGGCTAGCGCCGCCGTCACTTCTCCAGCGGACAGTCTTCAGGAC GGGAGGCGGGCGTGGTGGGCGGGCCCGCAGCTTCCGTGGCTGAGAGGAGCCGGCGGCGGCAGTGTCTGTG GTGGCCGCGGCGGCGAGAGCGACGGTCCCATCTTTCCCACCCTCTTGGTTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MKL1_2 ↗ | 22:40,463,432 | 負股 | 40,463,422–40,463,481 |
| MKL1_1 ↗ | 22:40,636,711 | 負股 | 40,636,701–40,636,760 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR22_9L5GP · enhancer · 40634532–40634941 · regulatory
ENSR22_C62TH · enhancer · 40635049–40636674 · regulatory
ENSR22_5CK3TF · CTCF_binding_site · 40636590–40636611 · regulatory
ENSR22_9L5HC · promoter · 40636675–40636991 · regulatory
ENSR22_C62TM · enhancer · 40636992–40638456 · regulatory
ENSR22_83794C · enhancer · 40641344–40641573 · regulatory
· motif · 40636005–40636014 · motif
· motif · 40636229–40636238 · motif
· motif · 40636592–40636608 · motif
· motif · 40636600–40636610 · motif
· motif · 40636657–40636674 · motif
· motif · 40636715–40636725 · motif
· motif · 40636724–40636734 · motif
· motif · 40636911–40636924 · motif
· motif · 40636911–40636924 · motif
· motif · 40636915–40636928 · motif
· motif · 40636915–40636928 · motif
· motif · 40636982–40636992 · motif
· motif · 40637078–40637093 · motif
· motif · 40637837–40637850 · motif
· motif · 40638145–40638167 · motif
· motif · 40638145–40638167 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：931 aa
MRTFA 蛋白質長 931 個胺基酸。其 N 端含有兩個 RPEL 重複序列，並標註一段雙段式核定位訊號；第 347–381 個胺基酸為 SAP 結構域。第 1–256 個胺基酸區域被註記可介導與 SCAI 及 ACTB 的交互作用。序列中另有多段預測為無序的區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MRTFA 位於細胞質與細胞核，其分布會隨兩處的肌動蛋白狀態而變化。 血清剝奪時觀察到核內 G-actin 增加，並伴隨核內 MRTFA 減少；核內 G-actin 降低則與 MRTFA 在細胞核累積相關。 細胞質中的 G-actin 結合可遮蔽核定位訊號、抑制核輸入；核內 G-actin 結合則促進 MRTFA 輸出至細胞質。 MICAL2 促進核內肌動蛋白去聚合，降低核內 G-actin，並有助 MRTFA 留在細胞核。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- FLNAP21333 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- SRFP11831 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
MRTFA 與 SRF 形成核內複合體，由 SRF 辨識 DNA 上的 CArG box。MRTFA 透過 RPEL 重複序列與 G-actin 結合；依相似性資料，它可形成結合三個或五個 G-actin 單體的複合體。MRTFA、SCAI 與 SRF 可組成核內三元複合體，抑制 MRTFA 誘導的 SRF 轉錄活性。MRTFA 也與 ACTB 及 MRTFB 交互作用；依相似性資料，ACTB 的結合會阻止 MRTFA 與 SCAI 交互作用。
疾病與遺傳關聯
涉及 MRTFA 的染色體易位 t(1;22)(p13;q13) 與 RBM15 形成融合轉錄本，可能是急性巨核細胞白血病的原因之一。雖然兩種互惠融合轉錄本都可在此病中檢出，RBM15–MRTFA 嵌合蛋白被指出是候選致癌基因。另有免疫缺陷 66（IMD66）的資料：此常染色體隱性原發性免疫疾病與影響 MRTFA 所代表基因的變異相關，患者自嬰兒期可能反覆感染病毒，並有與細胞骨架肌動蛋白動態缺陷相關的嗜中性球遷移受損。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | MRTFA 與轉錄因子 SRF 協同調控發育、形態形成及細胞遷移期間的細胞骨架相關基因。Rho GTPase 引發的 G-actin 濃度變化會影響 SRF–MRTFA 複合體活性；MRTFA 透過 RPEL 重複序列結合 G-actin，核內 F-actin 也參與調節其活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcription coactivator that associates with the serum response factor (SRF) transcription factor to control expression of genes regulating the cytoskeleton during development, morphogenesis and cell migration. The SRF-MRTFA complex activity responds to Rho GTPase-induced changes in cellular globular actin (G-actin) concentration, thereby coupling cytoskeletal gene expression to cytoskeletal dynamics. MRTFA binds G-actin via its RPEL repeats, regulating activity of the MRTFA-SRF complex. Activity is also regulated by filamentous actin (F-actin) in the nucleus PMID 26224645 ↗ |
| 交互作用 | MRTFA 與 SRF 形成核內複合體，由 SRF 結合 DNA 上的 CArG box；MRTFA 也經 RPEL 重複序列結合 G-actin，並可依相似性資料結合三個或五個 G-actin 單體。它與 SCAI、SRF 形成的三元複合體會抑制其誘導的 SRF 轉錄活性；ACTB 結合會阻止與 SCAI 交互作用，並且 MRTFA 也與 MRTFB 交互作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with SRF, forming the SRF-MRTFA nuclear complex which binds the 5'-CArG-3' consensus motif (CArG box) on DNA via SRF. Interacts (via RPEL repeats) with globular actin (G-actin), thereby regulating its subcellular location and activity of the complex formed with SRF. Either forms a trivalent (by binding three G-actin monomers) or pentavalent (by binding five G-actin monomers) complex with G-actin (By similarity). Forms a nuclear ternary complex with SCAI and SRF, leading to suppress MRTFA-induced SRF transcriptional activity. Interacts with beta-actin (ACTB); interaction with ACTB prevents interaction with SCAI (By similarity). Interacts with MRTFB PMID 14565952 ↗ · PMID 19350017 ↗ |
| 細胞定位 | MRTFA 位於細胞質與細胞核，其位置受兩處肌動蛋白狀態調節。血清剝奪時核內 G-actin 增加與核內 MRTFA 減少相關；細胞質 G-actin 結合會遮蔽核定位訊號並抑制核輸入，核內 G-actin 結合則促進核輸出。MICAL2 降低核內 G-actin，促進 MRTFA 留在細胞核；核輸入由 KPNA4 與 KPNB1 介導。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Nucleus; Subcellular location is tightly regulated by actin both in cytoplasm and nucleus: high levels of G-actin in the nucleus observed during serum deprivation lead to low levels of nuclear MRTFA, while reduced levels of nuclear G-actin result in accumulation of MRTFA in the nucleus (By similarity). G-actin-binding in the cytoplasm inhibits nuclear import by masking the nuclear localization signal (NLS) (By similarity). In contrast, binding to nuclear globular actin (G-actin) promotes nuclear export to the cytoplasm (By similarity). Nuclear localization is regulated by MICAL2, which mediates depolymerization of nuclear actin, which decreases nuclear G-actin pool, thereby promoting retention of MRTFA in the nucleus and subsequent formation of an active complex with SRF. Nuclear import is mediated by importins KPNA4 and KPNB1 (By similarity) PMID 24440334 ↗ · PMID 19350017 ↗ |
| 疾病關聯 | 涉及 MRTFA 的染色體易位 t(1;22)(p13;q13) 與急性巨核細胞白血病可能有關。該病中可檢出與 RBM15 相關的兩種互惠融合轉錄本；RBM15–MRTFA 嵌合蛋白具有兩個基因所編碼的推定功能結構域，並被提出為候選致癌基因，資料並未將其表述為已確立的唯一致病原因。 | 含實驗來源 | 證據與來源A chromosomal aberration involving MRTFA may be a cause of acute megakaryoblastic leukemia. Translocation t(1;22)(p13;q13) with RBM15. Although both reciprocal fusion transcripts are detected in acute megakaryoblastic leukemia (AMKL, FAB-M7), the RBM15-MRTFA chimeric protein has all the putative functional domains encoded by each gene and is the candidate oncogene PMID 11344311 ↗ · PMID 11431691 ↗ |
| 疾病關聯 | 免疫缺陷 66（IMD66）是常染色體隱性原發性免疫疾病，患者自嬰兒期可能反覆感染病毒。此疾病與影響 MRTFA 所代表基因的變異相關，並伴隨嗜中性球遷移受損；該遷移缺陷與細胞骨架肌動蛋白動態異常有關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Immunodeficiency 66 IMD66 An autosomal recessive primary immunologic disorder characterized by recurrent viral infections from infancy, associated with impaired neutrophil migration due to defects in cytoskeletal actin dynamics. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 618847 PMID 26224645 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GGGCCCGCAGCTTCCGTGGCTGAGAGGAGCCGGCGGCGGC40AGTGTCTGTGGTGGCCGCGGCGGCGAGAGCGACGGTCCCA80TCTTTCCCACCCTCTTGGTTGCCGCTGGCCACACGCCCTC120CGCTGGCGGCGACTTCTCAGCTCCGTGCGCCCGGGCTGGA160CAGTGAGCCTCGAGAGGAGACGCGGGCGGCTAGAGCCGGA200GTGGGGCGAGCCGCGGAACCCGGCCGGGAGCCGCGCGAGG240CGTGATCGGAGGGTATGGTTGGCATGGAATTGAATTTCAT280CTGTCTGTGGGAATTGTAAGCAAGATTGCCATCACGAAAG320CCAAAGTGGATTTCTCCAGTGTGGTGTGCCTGCCCCCTTC360CGTCATTGCTGTGAATGGGCTGGACGGAGGAGGGGCCGGC400GAAAATGATGATGAACCAGTGCTCGTGTCCTTATCTGCGG440CACCCAGTCCCCAGAGTGAAGCTGTTGCCAATGAACTGCA480GGAGCTCTCCTTGCAGCCCGAGCTGACCCTAGGCCTCCAC520CCTGGCAGGAATCCCAATTTGCCTCCACTTAGTGAGCGGA560AGAATGTGCTACAGTTGAAACTCCAGCAGCGCCGGACCCG600GGAAGAACTGGTGAGCCAAGGGATCATGCCGCCTTTGAAA640AGTCCAGCCGCATTTCATGAGCAGAGAAGGAGCTTGGAGC680GGGCCAGGACAGAGGACTATCTCAAACGGAAGATTCGTTC720CCGGCCGGAGAGATCGGAGCTGGTCAGGATGCACATTTTG760GAAGAGACCTCGGCTGAGCCATCCCTCCAGGCCAAGCAGC800TGAAGCTGAAGAGAGCCAGACTAGCCGATGACCTCAATGA840GAAGATTGCACAGAGGCCTGGCCCCATGGAGCTGGTGGAG880AAGAACATCCTTCCTGTTGAGTCCAGCCTGAAGGAAGCCA920TCATTGTGGGCCAGGTGAACTATCCCAAAGTAGCAGACAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。