基因總覽
MRPS6 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein S6。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 21q22.11。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000399312 ★ | 34,073,578–34,143,030 | 3 |
| ENST00001054427 | 34,072,889–34,143,037 | 4 |
| ENST00001125435 | 34,072,889–34,074,277 | 3 |
| ENST00001125436 | 34,072,889–34,074,278 | 2 |
| ENST00001090589 | 34,073,509–34,143,037 | 2 |
| ENST00001108298 | 34,073,509–34,103,331 | 2 |
| ENST00001125433 | 34,073,509–34,143,037 | 4 |
| ENST00001125434 | 34,073,509–34,143,037 | 4 |
| ENST00001125437 | 34,073,509–34,074,281 | 2 |
| ENST00001131585 | 34,073,509–34,143,037 | 3 |
顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPS6 ENST00000399312 GRCh38 chr21:34072578-34073678 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGCGGAGAACCATGTGGGTGTAAAGGGATGGCAAGGGCAGAACGTATGCCCCTGCCCACCTTAGACAGTT GCTAAAGGGTCTCCCAGGCACTCAGCCTAGCCTTTAAGTGAAAGCGGAGGAAACATTTAAAGAAATGAGA TAGAGTTAAGGTGTTCGCCTGCCCTCCGCTGAAACACGTGGGGGCAGGTCAGGGGCACACCACAAATGCC CGTATCGCGCCTGTGTGTACCAGGCACCGTCCTCGGAGGTTAACGTGCAGTAACTCACTCGGGTCCCCAC TTTCGGCACAGGCAGCAGGCCCAAGGTCACGCAGTGCCAAGGGACTGAGTCAGACCCGAGCCCGCGCGCC GCGGCCCACGGCCTGTGCCAGCGCGCTCCTCGCCGGGTAGGGGGCCTGGTCAGCCGCGTCAGACCTGAGA GTTGTGGCTGGGGGCGAGAGCTGCACCCCCCTACCGACCCCGGGCGGGAATGTTCCAGAACCCCTGCGAG CAGCCGTTGGCCGCACAGCCCCCGGGCCGGCCGCGACCCCGCCTTGCGCCGCGAAGGTCCCTAGCTCCGG GGAGTCGCGGGCGAGGGGCACGCGCACGGACGAGACCGCACCGCAGCGCACGCGCACTGGCGGGCACTCA CTCGCCCGCCGCCCGGGAGGAGAAGGAAGGCATGGAAAGTTCCAGCCGGTTCGAGAGCTAGGTAGCAGGC ATGGCAGGAGGCGGGGTAGGGGCAGGCAGGGTCGCGAGGGGGCGTGCGGCCGCCGCGAGCCGCTCTGGGC CGCGTCTGCAGCACCGCCCCTAGCCGCGGCCGGCGGGCTGGGCTGGGGTCGGGGCGGGGGCGGTGCGGCG GGTGCGGGGCTGCGGAGGGGGCGTGGCGGCCGCCCGCGGGCGGAGAGGGGGCGGGGCGGCGGCAAGGCGC GCGGGCGGGGCGGGGCGCGCCGAGGGGGCGTGGCGCGGCGTCTGCGCAGCTGCCAGCGCCTTTAAGCCCG GGCTCGCGCTCTCGGACCGTGCTTTCGCCGCCTGGGAGCCGTCCGGCGCAGCAGTTTCTAGGTCCCCACT GTCCCCGCCGTCCCGCCCCTTCGCGTCCCGGGAACCGGCTGGCTTCCGAGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPS6_1 ↗ | 21:34,073,207 | 正股 | 34,073,158–34,073,217 |
| MRPS6_2 ↗ | 21:34,087,731 | 正股 | 34,087,682–34,087,741 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR21_9HJ66 · promoter · 34073086–34073588 · regulatory
ENSR21_5B2DGS · CTCF_binding_site · 34073305–34073326 · regulatory
ENSR21_C5D9T · enhancer · 34073589–34075396 · regulatory
ENSR21_5B2DP7 · CTCF_binding_site · 34074681–34074702 · regulatory
ENSR21_B8QKZ · enhancer · 34075584–34076441 · regulatory
ENSR21_8323F4 · enhancer · 34077977–34078181 · regulatory
· motif · 34072750–34072759 · motif
· motif · 34072750–34072759 · motif
· motif · 34072878–34072890 · motif
· motif · 34073075–34073092 · motif
· motif · 34073152–34073163 · motif
· motif · 34073182–34073193 · motif
· motif · 34073182–34073193 · motif
· motif · 34073307–34073323 · motif
· motif · 34073310–34073323 · motif
· motif · 34073398–34073411 · motif
· motif · 34073429–34073442 · motif
· motif · 34073459–34073472 · motif
· motif · 34073506–34073519 · motif
· motif · 34073907–34073920 · motif
· motif · 34073945–34073958 · motif
· motif · 34074091–34074107 · motif
· motif · 34074122–34074135 · motif
· motif · 34074160–34074173 · motif
· motif · 34074163–34074176 · motif
· motif · 34074180–34074196 · motif
· motif · 34074212–34074225 · motif
· motif · 34074631–34074642 · motif
· motif · 34074683–34074699 · motif
· motif · 34074691–34074706 · motif
· motif · 34075842–34075853 · motif
· motif · 34078094–34078105 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：125 aa
mitochondrial ribosomal protein S6 屬於 bacterial ribosomal protein bS6 family。
蛋白質三維結構
細胞內定位
mitochondrial ribosomal protein S6 位於粒線體。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MKRN3Q13064 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- STAT5BP51692 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- taxP03410 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- taxP14079 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
mitochondrial ribosomal protein S6 是粒線體小型核糖體亞基（mt-SSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型亞基與 39S 大型亞基構成；28S 亞基含有 12S mt-rRNA 及 30 種不同蛋白質。來源未指出 MRPS6 與其他成分之間的個別直接結合關係。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPS6 是粒線體小型核糖體亞基（mt-SSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型與 39S 大型亞基組成；小型亞基包含 12S mt-rRNA 和 30 種不同蛋白質。大型亞基則含 16S mt-rRNA、具重要結構作用的粒線體纈胺酸轉運 RNA，以及 52 種不同蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial small ribosomal subunit (mt-SSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins PMID 25838379 ↗ |
| 細胞定位 | mitochondrial ribosomal protein S6 位於粒線體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCTTTCGCCGCCTGGGAGCCGTCCGGCGCAGCAGTTTCTA40GGTCCCCACTGTCCCCGCCGTCCCGCCCCTTCGCGTCCCG80GGAACCGGCTGGCTTCCGAGCCGCACTCGCCGATCCTCCA120GGCATGCCCCGCTACGAGCTGGCTTTAATCCTGAAAGCCA160TGCAGCGGCCAGAGACTGCTGCTACTTTGAAACGTACGAT200AGAGGCCCTGATGGACAGAGGAGCAATAGTGAGGGACTTG240GAAAACCTGGGTGAACGAGCGCTTCCTTATAGGATCTCTG280CCCACAGTCAGCAGCACAACAGAGGCGGGTATTTCTTGGT320GGATTTTTATGCACCCACCGCAGCTGTTGAAAGCATGGTG360GAGCACTTGTCTCGAGATATAGATGTGATTAGAGGGAATA400TTGTCAAACACCCTCTGACCCAGGAACTAAAAGAATGTGA440AGGGATTGTCCCAGTCCCACTCGCAGAAAAATTATATTCC480ACAAAGAAGAGGAAGAAGTGAGAAGATTCGCCAGATTTTA520GCCTTATATGTAATTCCTTCACATTTGGGCAGCATGGACG560AGAAGGAAGAATTTGCAAGTTTGGCCTTTATATAAGCATG600TGTTGCAGGTGCTGTTTGATTTTTCTAAGGTATTTTTAGC640CCTTGATCCCCTTTGCTTGCGAGAGGTGGGGAACTGCTCA680CTGACAGCTTCTCTGTAACCTGCAGTACCAGTGGATCGTT720CTTGATTTTGTTTTCATTAGTGTCATTTCTTTGTCATTGA760GGACTTTTCCCCTTACAACAGTAACACCATTTTTTGAAGA800GCAAAACTTATAATACCTCCTGGGATTGTGAGCTAGTCAT840TCAGCCTGTGTAACCATGTGGAAATAAAAATTGACGACCA880ATGTATTATATGGACAACTTTTGCTTTGAGTAATAAACTT920GATTGTAGGAA931cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。