基因總覽
MRPS5 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein S5。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 2q11.1。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000272418 ★ | 95,085,369–95,121,808 | 12 |
| ENST00000695433 | 95,085,369–95,120,959 | 12 |
| ENST00000695434 | 95,085,369–95,121,557 | 12 |
| ENST00000695436 | 95,085,369–95,121,600 | 12 |
| ENST00000695439 | 95,085,369–95,121,993 | 11 |
| ENST00000882059 | 95,085,369–95,121,993 | 10 |
| ENST00000882060 | 95,085,369–95,121,993 | 10 |
| ENST00000969116 | 95,085,369–95,121,993 | 9 |
| ENST00000969117 | 95,085,369–95,121,993 | 11 |
| ENST00000978717 | 95,085,369–95,121,993 | 11 |
| ENST00001141879 | 95,085,369–95,121,993 | 12 |
| ENST00000882061 | 95,087,207–95,121,993 | 12 |
顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPS5 ENST00000272418 GRCh38 chr2:95121708-95122808 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTGGTCTTACCATGTTCCCAATTATGCTGAAGCAGTTGGCTTTACACATAGGTGTAATCAATCTCTTTTC TCTTAATTTCGCCAACTCAATATATAAAAGGCCTGTTGAAAATGGTGTACATCAAAATAACCTGGAGTGA AATAAGTTGTCTATTTCAGCAAAGAAAATGGGAAAATAATAGATGAAACAACTGTGTTCCTCTTGATAAT CGTTAAGTCTAGCTTGTCAGTATTTTTACTCTTCGGTATGTTTGAAAATTTTTATGCTAGACTCGAAAAC CAGACTACCCTCTTACAAGACATTGTATCTGAGCAGGCTACCCTCTTACAAGACATTGTGCCCTTCTGTG TTGCAGGTGTGTGGGTCACTTGAGTAGGCGTAGATGGTATGGAGGCAATAAAAAAACCATGGCCCAGGGC TGAGATATGCATGTGTGACCAAACGTTAGAATCAGTATGAATCCACAAGTGTATGTGAAATGCAGGTCAT TTAAGTGCTTAATCTAATGAAACTCAGAGCTTTACTGGAGTTGGGGATGAACACTTTCTCTACATTCCTC GCTTATTCATCCCTTGGATCCTCATTGCACTTGGCCCCCTTCCGTGCTTCTATGAACCTCGCAGGGGTCC GCAGTGCCAGCTCGGGTAAGTCCGAGGGTCCCCCGCCAGCGGACCCCTTCAGAGCTCCTGCACGAGCAGC CAAATCCACCCGGCCGGTCCTGCCCTCTCTCCGGCGCTGCAGGAGCCAGCTAGCCCCGCCCACGCCCGGC CGCCAGTCCAAGCCCCGCCCTCGGGTCCTAACGGGAGGCGCCCGCGGGGCTGTCCGCGGTCGCGCCGGGC TCCGCCTGCAGTGTGGCCCGTCCGGACAGTCCCTCACCCCGGCCTGCGCTGCTGCGTGGACTCGGGCCTC AGGAATTCCGCTGCGGCCCAAGGCTTGCCGTTTGACGAGGAGCAGTCGCGGTAGGCGGTGGGCAAGGCTG CCCTGGGCGGAGGCCGAGGCGCGGCTCGGACTCCAGCATGGCGACCGCGGTGCGCGCTGTGGGCTGCCTC CCCGTGCTGTGTAGCGGGACGGCAGGTGAGAGCTGGGACGCCGGGAGCAGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPS5_1 ↗ | 2:95,121,801 | 負股 | 95,121,791–95,121,850 |
| MRPS5_2 ↗ | 2:95,121,981 | 負股 | 95,121,971–95,122,030 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR2_93DQDH · promoter · 95120949–95121449 · regulatory
ENSR2_5SD48M · CTCF_binding_site · 95121346–95121367 · regulatory
ENSR2_BNTNT · promoter · 95121547–95122468 · regulatory
· motif · 95121209–95121222 · motif
· motif · 95121328–95121343 · motif
· motif · 95121348–95121364 · motif
· motif · 95121738–95121754 · motif
· motif · 95122041–95122054 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：430 aa
MRPS5 產物為 430 個胺基酸的蛋白質，屬於 universal ribosomal protein uS5 家族。其第 218 至 282 位胺基酸區段具有 S5 DRBM 結構域註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
MRPS5 是粒線體小型核糖體亞基（mt-SSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型亞基與 39S 大型亞基構成；其中小型亞基含有 12S 粒線體核糖體 RNA（12S mt-rRNA）及 30 種不同蛋白質。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPS5 是粒線體小型核糖體亞基（mt-SSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型亞基和 39S 大型亞基構成；28S 小型亞基含有 12S 粒線體核糖體 RNA（12S mt-rRNA）及 30 種不同蛋白質。39S 大型亞基含有 16S rRNA、1 個具重要結構作用的粒線體纈胺酸轉運 RNA（mt-tRNA(Val)），以及 52 種不同蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial small ribosomal subunit (mt-SSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins PMID 25838379 ↗ |
| 細胞定位 | MRPS5 位於粒線體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCGGCTCGGACTCCAGCATGGCGACCGCGGTGCGCGCTGT40GGGCTGCCTCCCCGTGCTGTGTAGCGGGACGGCAGGTCAT80TTATTGGGGAGGCAGTGTTCCCTAAACACCTTACCAGCAG120CTTCCATTTTGGCATGGAAGAGTGTTCTCGGCAATGGCCA160TTTGTCATCACTGGGAACCAGAGACACCCATCCCTACGCC200AGCTTGAGCCGTGCACTGCAGACACAATGCTGTATTTCTT240CTCCCAGTCACCTGATGAGCCAGCAGTATAGACCATATAG280TTTCTTCACTAAATTGACTGCAGATGAGCTGTGGAAAGGC320GCTTTAGCAGAGACTGGTGCTGGAGCAAAAAAAGGAAGAG360GCAAAAGAACTAAAAAGAAGAAAAGAAAGGATCTGAACAG400GGGTCAGATCATTGGTGAAGGGCGTTATGGTTTTCTATGG440CCCGGACTGAATGTCCCTCTTATGAAAAATGGAGCAGTGC480AGACCATTGCCCAAAGAAGCAAGGAAGAGCAGGAGAAGGT520GGAGGCAGACATGATCCAGCAGAGAGAAGAGTGGGACCGA560AAGAAGAAGATGAAGGTTAAACGGGAGCGAGGATGGAGTG600GAAACTCATGGGGAGGCATCAGTCTTGGCCCCCCTGACCC640TGGTCCCTGTGGAGAAACATATGAGGATTTTGATACCAGG680ATACTTGAGGTAAGAAACGTTTTCACTATGACTGCGAAAG720AGGGAAGAAAGAAATCGATCCGTGTCTTGGTGGCTGTGGG760GAACGGAAAAGGAGCTGCAGGTTTTTCTATTGGGAAAGCT800ACTGATCGGATGGATGCTTTCAGGAAAGCAAAGAACAGAG840CAGTTCACCATTTGCATTATATAGAACGATATGAAGACCA880TACAATATTCCATGATATTTCATTAAGATTTAAAAGGACG920CATATCAAGATGAAGAAACAACCCAAAGGTTACGGCCTCC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。