基因總覽
MRPS27（mitochondrial ribosomal protein S27）是蛋白質編碼基因，其產物屬於粒線體特有的核糖體蛋白 mS27 家族。此蛋白是粒線體小型核糖體次單元（mt-SSU）的組成成分，並具有 RNA 結合特性。成熟哺乳類粒線體核糖體由小型與大型次單元構成；MRPS27 所屬的小型次單元含有 12S mt-rRNA 與多種蛋白質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000261413 ★ | 72,219,403–72,320,240 | 11 |
| ENST00000694990 | 72,214,953–72,321,717 | 12 |
| ENST00000694989 | 72,215,027–72,320,812 | 12 |
| ENST00001132809 | 72,219,403–72,320,261 | 11 |
| ENST00000513900 | 72,219,409–72,320,261 | 12 |
| ENST00000694994 | 72,219,422–72,308,295 | 10 |
| ENST00000519143 | 72,219,422–72,308,353 | 10 |
| ENST00000694995 | 72,219,422–72,308,374 | 10 |
| ENST00000694996 | 72,219,422–72,308,425 | 10 |
| ENST00000695298 | 72,219,422–72,320,261 | 10 |
| ENST00000694998 | 72,219,422–72,320,261 | 11 |
| ENST00000695403 | 72,219,422–72,320,342 | 11 |
顯示 12/23 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MRPS27 的產物是粒線體小型核糖體次單元的 RNA 結合成分，參與粒線體蛋白質合成。來源指出，它能刺激粒線體 mRNA 的翻譯，對象為粒線體電子傳遞鏈次單元的組成成分；因此其功能與粒線體核糖體翻譯特定蛋白質的過程相關。
在分子作用上，該蛋白可結合粒線體 12S rRNA（12S mt-rRNA）及 tRNA(Glu)。這些結合關係與其作為小型次單元 RNA 結合成分的角色相符；資料未進一步說明結合的具體方式或各結合對翻譯的獨立影響。
此外，MRPS27 也被報告與細胞增殖及腫瘤細胞生長的正向調控有關。現有資訊僅指出這些生物學關聯，未提供可據以描述其調控機制或因果方向的細節。
Promoter 與基因調控
>MRPS27 ENST00000261413 GRCh38 chr5:72320140-72321240 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCAGATTTAACTCTCTTCATAGAGATGTTAGAGGATAGTTTTGAAAAATGAAGAAACGTGCCGTTAAGTC TTTTAGATTGTTAGCAGAACTGAGACTCCATAAGACCTCTGCTTCCAAACTCTGCAGAAAAGAAAAAGGC CGGGCGCGGTGGCTCACTCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGACCACGAGGTCAGG AGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATAGTGAAACCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTACCCGGGCGT GGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAACTACTCGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCG GAGGCTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACCGCACTCCAGCTTGGGCGACAGAGCAAGACTTCGTCTCAAA AATAAATAAATAAATAAATAAAAGTCACCCAAGGCGGGAGGGATGTTCCTGAAGACGAACGTCGCCCCAT CTGAGGGAGCACTACAGCCCCAAGGTCAATACCCCAGCAGTCCTTCGATTTGCAGGCACTGGGGGTATCC ACGACCCCCAGTGGTCACCACTGCACCCACGTGCAACTAGAGGGCGAGGGTGCGCTCCAGGCCAGTGAGT GACTTAGGAGCTGTGGCTGCTCCACAGAGATGCTAGCTGGGATCTAACACTCCCTTCTCTCCCATCCCTC CCCTCCTTCCCTAGGCTAAAGCCGCGGATACCTCCGAGAGGGCAGCGGCAGCTGACAGAGCCGGAGCCTC CCACCCCAGGATACACCAAAATCTGCAGCGCCTGCAGGAGAACTCGATTCGAGGGCCGAAATGCAGCAGC CATACTGTCTCGGACCATACCAACTACTGGAACCGGGGCGAGGAGGCGGAGCGTCGGTCCTGTCGTCGAG AGCGACAAAAGGGATTCGTCCAATTCTGGGCGCCCCGAGAGGTCGAGCTGTAACCCCGCCCCTTCCTCTG TCCGTAACCCGTTGGCTGTTCCTTTTGGTACGCTCCAAGATGGCTGCCTCCATAGTGCGGCGCGGGATGC TCCTGGCGCGGCAAGTGGTTCTTCCTCAGCTCTCTCCTGCAGGTTGGCCGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPS27_1 ↗ | 5:72,320,239 | 負股 | 72,320,229–72,320,288 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR5_845F42 · promoter · 72320219–72320386 · regulatory
ENSR5_5M29MR · CTCF_binding_site · 72320631–72320652 · regulatory
ENSR5_5M29MX · CTCF_binding_site · 72320663–72320684 · regulatory
ENSR5_933P37 · promoter · 72320802–72321139 · regulatory
ENSR5_933P47 · enhancer · 72324237–72324718 · regulatory
· motif · 72319845–72319862 · motif
· motif · 72319859–72319870 · motif
· motif · 72320033–72320043 · motif
· motif · 72320268–72320278 · motif
· motif · 72320505–72320522 · motif
· motif · 72320560–72320575 · motif
· motif · 72320633–72320649 · motif
· motif · 72320649–72320666 · motif
· motif · 72320665–72320681 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：414 aa
MRPS27 蛋白長 414 個胺基酸，屬於粒線體特有的 mS27 核糖體蛋白家族。序列第 1–36 位標註為粒線體轉運胜肽；第 105–139 位與第 140–175 位各有一個 PPR 重複區，分別標為 PPR 1 與 PPR 2。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MRPS27 的定位資料列出細胞質與粒線體；來源未提供定位變化的條件或不同異構型之間的差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- CFTRP13569 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- MRPS15P82914 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- MRPS18BQ9Y676 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- NECAB2Q7Z6G3-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
MRPS27 是粒線體小型核糖體次單元（mt-SSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型次單元與 39S 大型次單元構成；小型次單元含 12S mt-rRNA 與 30 種不同蛋白質，大型次單元則含 16S mt-rRNA、mt-tRNA(Val) 及 52 種不同蛋白質。另有資料記載 MRPS27 與 NOA1、MIEF1 upstream open reading frame protein 互作；與 METTL17 的互作則為 By similarity。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | MRPS27 是粒線體小型核糖體次單元的 RNA 結合成分，參與粒線體蛋白質合成；可刺激粒線體 mRNA 翻譯電子傳遞鏈次單元成分，並結合 12S mt-rRNA 與 tRNA(Glu)。另與細胞增殖及腫瘤細胞生長的正向調控有關。 | 含實驗來源 | 證據與來源RNA-binding component of the mitochondrial small ribosomal subunit (mt-SSU) that plays a role in mitochondrial protein synthesis. Stimulates mitochondrial mRNA translation of subunit components of the mitochondrial electron transport chain. Binds to the mitochondrial 12S rRNA (12S mt-rRNA) and tRNA(Glu). Involved also in positive regulation of cell proliferation and tumor cell growth PMID 22841715 ↗ · PMID 28714366 ↗ |
| 交互作用 | MRPS27 是粒線體小型核糖體次單元的組成成分。哺乳類 55S 粒線體核糖體包含 28S 小型與 39S 大型次單元，分別含 12S mt-rRNA、30 種蛋白質，以及 16S mt-rRNA、mt-tRNA(Val) 和 52 種蛋白質；另記載其與 NOA1、MIEF1 upstream open reading frame protein 互作，與 METTL17 的互作依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial small ribosomal subunit (mt-SSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins. Interacts with NOA1. Interacts with MIEF1 upstream open reading frame protein. Interacts with METTL17 (By similarity) PMID 19103604 ↗ · PMID 22841715 ↗ · PMID 25838379 ↗ · PMID 30215512 ↗ |
| 細胞定位 | MRPS27 的細胞定位資料列為細胞質與粒線體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CCTTTTGGTACGCTCCAAGATGGCTGCCTCCATAGTGCGG40CGCGGGATGCTCCTGGCGCGGCAAGTGGTTCTTCCTCAGC80TCTCTCCTGCAGGTAAAAGATACCTGCTTTCTTCAGCCTA120TGTAGACAGCCACAAATGGGAAGCAAGAGAAAAAGAACAT160TACTGTCTTGCTGATCTTGCATCTTTAATGGATAAAACAT200TTGAGAGAAAGTTGCCTGTTAGTTCTTTAACAATATCACG240GCTTATAGACAACATTTCCTCTCGGGAAGAGATAGATCAT280GCAGAGTATTACCTTTACAAGTTTCGACACAGCCCCAACT320GCTGGTACCTGAGAAACTGGACTATCCACACCTGGATTAG360GCAGTGTCTAAAATATGATGCACAAGACAAAGCCCTATAT400ACCCTTGTAAATAAGGTTCAATATGGAATTTTTCCAGATA440ACTTTACATTCAATTTACTGATGGATTCTTTCATAAAGAA480AGAAAATTACAAAGATGCTTTATCTGTGGTTTTTGAGGTC520ATGATGCAAGAAGCCTTTGAAGTGCCTTCCACCCAACTTC560TCTCCCTCTATGTTTTATTTCATTGCCTGGCAAAGAAGAC600AGACTTCAGTTGGGAAGAGGAGAGGAACTTTGGTGCATCC640CTTTTGCTTCCAGGCCTAAAACAAAAGAACTCAGTGGGTT680TCAGTTCCCAGTTGTATGGCTATGCACTTCTTGGGAAGGT720GGAGTTGCAGCAAGGGCTACGGGCTGTGTACCACAACATG760CCTCTGATATGGAAACCAGGCTACCTTGACAGAGCCCTTC800AAGTGATGGAGAAAGTGGCTGCCTCCCCAGAAGACATAAA840GCTGTGTAGAGAAGCGCTCGATGTGCTGGGTGCAGTGCTG880AAGGCTCTGACTTCAGCTGATGGGGCTTCAGAGGAGCAGT920CCCAAAATGATGAAGACAACCAGGGGTCAGAAAAACTGGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。