基因總覽
MRPS24 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein S24。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 7p13。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000317534 ★ | 43,866,558–43,869,517 | 4 |
| ENST00000418740 | 43,866,556–43,869,517 | 3 |
| ENST00001058657 | 43,866,556–43,869,524 | 4 |
| ENST00001092490 | 43,866,556–43,869,524 | 3 |
| ENST00001092491 | 43,866,556–43,869,524 | 4 |
| ENST00001135318 | 43,866,556–43,869,524 | 4 |
| ENST00000934254 | 43,866,557–43,869,524 | 4 |
| ENST00000934255 | 43,866,557–43,869,524 | 4 |
| ENST00001058655 | 43,866,558–43,869,524 | 4 |
| ENST00001058659 | 43,866,558–43,869,524 | 4 |
顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPS24 ENST00000317534 GRCh38 chr7:43869417-43870517 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CAGTCCTCCCCCTGACAGGAAACCGCAGCAGTATGCAAGTACTGTACCATTAAGGGGAATGATGTAGACC CAGAACGGCCAAAACATTGGCAATTTCACATCACTCAACCAAACACAACCCATCATTGATTAAATATTCT CTTGATCCTAATAGCTCTATAAGGTAGTACTATTATTAAGGCCCATTTTATAGATAATAGAACTGAGTCT TAACTGTACAAAGATTGTTATACATGGGTCTGACTCCAGAGCCCGTGTTTTTTCCATGACCGTGGTGACT TCTAAAATAAAATATCCCGCGTTGCTATTTTTCCGTTTGACATTAATAATTACTGGATACCAATAATAGT GGCGACGCACTGGTTTCAGCATTACAGGCCCTGCGATATTCTCACGAATCTCCTTGCCCTCCGGCCCCTT CCCCGTACTTAAAATTTTCCTTCCTCAGGGGCCAGTCACCACTGTGGTCACATGTGGCAAACCCATTCTT GCATAACTGCGTAAGTCATCCTTGAAGAATTGGGTGACGTTTTAACCAAAATATGTTTCTTCTTTATTTG TGGATAAAAGTCTGGAGGGTTTTTCTGTTTTGTTTTTCTACGAATATTATTTGGAGGCATAACTAGGACC TGGGGAAACGCTTGGCTCCTCTTCGAGCCCCGAGGGTGCAGGTTGGGCAGGGCGGGCTCCGGTGGGCCGC ACACCCATCACCCGTACTAGCGTGAGGTTGTCGAAGAGAAAATCTCACGTTTCGCATCCTCAAATTTCCG GATCTGAAACCCTATGCAAGCAGCAACCGCGGGAGAGCGAACAGCGGCGGGATGAGCATTCACAAGGCTG AGCATTCACAGGGCTGCGGGGAAGGCGGGAGTAACAGCTAGCAGCATACCGCGGCCCCGCCCCGCAGAGG CCCTGCCCCGCCCCCGCCAGAGTACAGAGTACGAGCTCCGACTTGGTCTCGTCCGCGGTCGTCCCCACCC CTCAGCGCGCTGTGGTACGTCCCGCGCTCCGCTTGGCCCAAGATGGCGGCCTCCGTGTGCAGCGGGTTGC TGGGGCCACGGGTGAGTGGGGCGACTCGGCAGGTCCCTGCGAGTCGGAGGT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPS24_1 ↗ | 7:43,869,517 | 負股 | 43,869,507–43,869,566 |
| MRPS24_2 ↗ | 7:43,869,926 | 負股 | 43,869,916–43,869,975 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_5DBL69 · CTCF_binding_site · 43869221–43869242 · regulatory
ENSR7_839S9H · promoter · 43869507–43869641 · regulatory
ENSR7_BBP3X · enhancer · 43869642–43870529 · regulatory
ENSR7_C6CJN · enhancer · 43872284–43873783 · regulatory
· motif · 43865095–43865106 · motif
· motif · 43865466–43865479 · motif
· motif · 43865496–43865509 · motif
· motif · 43865501–43865513 · motif
· motif · 43865637–43865650 · motif
· motif · 43866623–43866634 · motif
· motif · 43869223–43869239 · motif
· motif · 43869372–43869381 · motif
· motif · 43869448–43869464 · motif
· motif · 43869487–43869497 · motif
· motif · 43869624–43869639 · motif
· motif · 43869744–43869755 · motif
· motif · 43869744–43869755 · motif
· motif · 43869746–43869755 · motif
· motif · 43870001–43870017 · motif
· motif · 43870020–43870036 · motif
· motif · 43872749–43872760 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:167 aa
MRPS24 蛋白長 167 個胺基酸,屬於 universal ribosomal protein uS3 family。序列第 1 至 35 位註解為粒線體轉運胜肽;此區段註解指向粒線體,但來源未提供其他結構域或功能區域資訊。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源未提供其定位隨條件或異構型變化的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
MRPS24 是粒線體小核糖體次單位(mt-SSU)的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小次單位與 39S 大次單位構成;小次單位含有 12S 粒線體核糖體 RNA(12S mt-rRNA)及 30 種不同蛋白質。來源未指出 MRPS24 與特定分子的直接結合關係。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPS24 是粒線體小核糖體次單位(mt-SSU)的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體分為 28S 小次單位與 39S 大次單位;小次單位含 12S 粒線體核糖體 RNA(12S mt-rRNA)及 30 種不同蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial small ribosomal subunit (mt-SSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins PMID 25838379 ↗ |
| 細胞定位 | MRPS24 定位於粒線體;此筆資料未提供更細的粒線體區域或其他定位條件。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CCCGCGCTCCGCTTGGCCCAAGATGGCGGCCTCCGTGTGC40AGCGGGTTGCTGGGGCCACGGGTGCTGTCCTGGAGCCGAG80AGCTGCCTTGCGCTTGGCGCGCCCTGCACACCTCCCCGGT120CTGCGCCAAGAACCGGGCGGCCCGAGTACGCGTAAGCAAG160GGGGACAAGCCGGTGACCTACGAGGAGGCACACGCGCCGC200ACTACATCGCCCACCGTAAAGGCTGGCTGTCGCTGCACAC240AGGTAACCTGGATGGAGAGGACCATGCCGCAGAGCGAACG280GTGGAGGATGTTTTCCTTCGCAAGTTCATGTGGGGTACCT320TCCCAGGCTGCCTGGCTGACCAGCTGGTTTTAAAGCGCCG360GGGTAACCAGTTGGAGATCTGTGCCGTGGTCCTGAGGCAG400TTGTCTCCACACAAGTACTACTTCCTCGTGGGCTACAGTG440AAACTTTGCTGTCCTACTTTTACAAATGTCCTGTGCGACT480CCACCTCCAAACTGTGCCCTCAAAGGTTGTGTATAAGTAC520CTCTAGAACAATCCCCTTTTTTCCATCAAGCTGTAGCCTG560CAGAGAATGGAAACGTGGGAAAGGAATGGTATGTGGGGGA600AATGCATCCCCTCAGAGGACTGAGGCATAGTCTCTCATCT640GCTATTGAATAAAGACCTTCTATCTTG667cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。