演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

MRPS23MRP-S23

mitochondrial ribosomal protein S23

MRPS23 的基因身分與分類資料已收錄,功能註解尚待補充。

Homo sapiens17q22UniProt Q9Y3D9
OFFICIAL SYMBOL
MRPS23
CHROMOSOME
17
UNIPROT
Q9Y3D9
PDB / ALPHAFOLD
3J9M
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

MRPS23 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein S23。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 17q22。

Official symbol
MRPS23
Gene name
mitochondrial ribosomal protein S23
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14509
UniProt
Q9Y3D9
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
MRP-S23CGI-138HSPC329mS23

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717q22
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegMRPS23pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr17:57,834,781–57,850,076
Gene span
15,296 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000313608 ★57,834,781–57,850,0445
ENST0000091656657,834,781–57,850,0764
ENST0000091656757,834,781–57,850,0765
ENST0000091656857,834,781–57,850,0764
ENST0000113861957,834,781–57,850,0765
ENST0000098147957,839,477–57,850,0765
ENST0000098148157,839,481–57,850,0766
ENST0000057844457,840,800–57,850,0764
ENST0000057938057,841,004–57,850,0564

顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用;有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 57850044 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>MRPS23 ENST00000313608 GRCh38 chr17:57849944-57851044 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACATAAGTCATGTACCTTAACCTTGGTAAATACATGTGGATCTAGCTCATTCATTTTAATAGCTGCATAG
GGTTCCAAAGAAAGTATGAACAATAATTTTCCAGCTATTTCTCATCTGATGGATTTTTTTTCCCACTACA
AACAATGCTGCAACGATGATCCTTGCACAAACATCCTCATGAATTGATGCTTTAATTTCTAAGGGGTTCT
TTCCCCGAAATATGATTACTGGGTCAAAGGGTATGCTACACACAGTTTATATTTTTTTACAGTTTAACAC
TGAGAGATGACTTTCTCCAGATTTTTTCGTTTCCCTCTCGGCGTCTGTTTGTTCCGGACACTTTCACTTT
TCGAGTTCCAAGGAGGAGGTAGCCCGCGACACCGGCCGCGGGAAACACGAGTTGCAGCCAGCATCCTAGT
TAGCGTGGATGCAGGTGGCACTCCGGGGACGAGGGGCTTAGTGGGGAGCACTACACAGCCAGAGGCGGAG
GCCCGAGATCTAGCACGACGCTGGGCAAGTGACGGCCCCTCCCCGGCCTTGGTTTTCTTCTGCGTAGTCT
GTGACTCTAAACAACATTAGGCTCAGCCTGGGCCTAGAGCTGGTGACCTCAAATCTCGGCCTTTGTTGGC
TCCCCTAGGACTGTAGGCTGCGCTTCACCCCTGCTCTGCCCCACTACTTCTCCTCCGCGCGGCCCCACCT
TTTCAGAGGAGTTGGCTCAACAAGGCGAGAGAGAGTAAAGCAACCATCATGATGAATCCCTCCCACAGCT
CGGTCATTTATTACTTCTGTCCGGCTTTGGCTCGCTCCTGCCCTTTTGGCTCGGCTATCGAGTGCTCCTG
CCTGAACCTGGCAAGTAACCTCGGAGCGCGCCCGTTCGGCCTATCACTTGCTTCTGCCTGCGCCGCTCTC
CCGCAGGGGCTGCGGTGAAAGCCCAGCGATCCTTGGCTCGGCCAGCAACTTATGCGCCCTTTACCTGGAG
CAGCCGCTTCCGGTTCCGGTAGCAGCTAGTCACGCTCGGTACCAGGCGCAGATCATGGCAGGCAGCCGGC
TGGAAACCGTAGGGAGCATCTTCTCTCGGTGTGTGCTCCCAGCCGTGGTGG
MRPS23 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
MRPS23_1 ↗17:57,850,037負股57,850,027–57,850,086

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:190 aa

1 aa190 aa功能區域
依 Q9Y3D9 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

MRPS23 的蛋白質屬於粒線體專一性核糖體蛋白 mS23 家族,全長 190 個胺基酸。其第 139 至 190 位胺基酸區段被註記為無序區域。

功能區域Disordered139–190 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 3J9M…

PDB · 3J9M

EM · 3.50 A · AS=1-190

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Mitochondrion

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
MRP-S23MRPS23GSC2POLR1CUSHBP1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

MRPS23 是粒線體小核糖體次單元(mt-SSU)的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小次單元與 39S 大次單元構成;小次單元含有 12S 粒線體核糖體 RNA(12S mt-rRNA)及 30 種不同蛋白質。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

MRPS23 所代表的基因可能因變異而與複合型氧化磷酸化缺陷 46(COXPD46)有關。這是一種體染色體隱性遺傳疾病,特徵包括兒童期起病的粒線體呼吸鏈複合體缺陷,尤以複合體 I 和 IV 為主,並伴有肝臟疾病;此關聯不表示所有相關變異均會導致疾病。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
交互作用MRPS23 是粒線體小核糖體次單元(mt-SSU)的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小次單元與 39S 大次單元組成;28S 小次單元含有 12S 粒線體核糖體 RNA(12S mt-rRNA)及 30 種不同蛋白質。含實驗來源
證據與來源

Component of the mitochondrial small ribosomal subunit (mt-SSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins

PMID 25838379 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位MRPS23 位於粒線體。含實驗來源
證據與來源

Mitochondrion

PMID 25838379 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯複合型氧化磷酸化缺陷 46(COXPD46)是一種體染色體隱性遺傳疾病,特徵為兒童期起病的粒線體呼吸鏈複合體缺陷,尤以複合體 I 和 IV 為主,並有肝臟疾病。此疾病可能由影響 MRPS23 所代表基因的變異造成。含實驗來源
證據與來源

Combined oxidative phosphorylation deficiency 46 COXPD46 An autosomal recessive disorder characterized by childhood-onset mitochondrial respiratory chain complex deficiencies, particularly complexes I and IV, and hepatic disease. The disease may be caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 618952

PMID 26741492 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000313608 · 5,609 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGCAGCTAGTCACGCTCGGTACCAGGCGCAGATCATGGCA40
41GGCAGCCGGCTGGAAACCGTAGGGAGCATCTTCTCTCGGA80
81CTCGGGACCTGGTTCGGGCCGGGGTGCTGAAGGAGAAGCC120
121CCTGTGGTTTGACGTATATGACGCCTTTCCCCCGCTGAGG160
161GAGCCCGTCTTCCAAAGGCCTCGAGTGCGATATGGCAAAG200
201CCAAAGCTCCCATCCAAGACATCTGGTACCACGAGGATCG240
241GATTAGAGCGAAGTTTTATTCAGTGTATGGGTCTGGTCAA280
281AGAGCTTTTGATCTATTCAATCCAAACTTCAAGTCTACCT320
321GTCAACGGTTTGTGGAGAAGTACACTGAGCTACAGAAACT360
361TGGAGAAACAGATGAAGAGAAGTTATTTGTGGAAACAGGG400
401AAGGCTTTATTGGCAGAAGGTGTCATTTTAAGACGAGTAG440
441GCGAAGCAAGGACTCAACACGGAGGTAGTCACGTTTCCCG480
481GAAATCCGAACACTTGAGTGTCAGACCACAGACTGCGTTG520
521GAAGAAAACGAGACTCAGAAAGAAGTTCCACAGGACCAGC560
561ATTTGGAGGCACCTGCAGACCAGTCGAAAGGTCTCTTGCC600
601TCCCTGAAGGACCTGTATACTGTGTATGCTGGCATTCACA640
641CTCTACTCACTGGCTGAATGTTGAGCTATTTTTAAACAGT680
681TGAACTGTGTAAATGTTTCTTGATCTCTAAGGTATTATGT720
721TTGCCTTCTCTTAGTTATTTCTGGGTTGTCACAAAGCTCA760
761GTATCATGGTTTGACAGAAGCAGTTATGTGAACTTTTATG800
801TTAGGACATTACTAAATAAAGAATTCCCTAGCTGCTTATA840
841AAGTAAATTTACTTTGAATTGTAAATAACATGAAGAAACC880
881TTTATAAAGATTGTTCAAATGGGACTCAATCTGACTAGGC920
921TTGCTTTGATGTTTGTTAGTATGTGGGCTGGCTACATCTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。