基因總覽
MRPS21 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein S21。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 1q21.2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000614145 ★ | 150,293,861–150,308,979 | 3 |
| ENST00000877737 | 150,293,849–150,309,828 | 3 |
| ENST00000877738 | 150,293,849–150,309,828 | 3 |
| ENST00000877739 | 150,293,849–150,309,828 | 3 |
| ENST00000935113 | 150,293,849–150,309,828 | 3 |
| ENST00000935115 | 150,293,849–150,309,828 | 3 |
| ENST00000935116 | 150,293,849–150,309,828 | 3 |
| ENST00000935117 | 150,293,849–150,309,828 | 3 |
| ENST00001097047 | 150,293,849–150,309,828 | 4 |
| ENST00001097050 | 150,293,849–150,308,350 | 4 |
| ENST00001097053 | 150,293,849–150,308,349 | 4 |
| ENST00001145401 | 150,293,849–150,309,828 | 3 |
顯示 12/22 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPS21 ENST00000614145 GRCh38 chr1:150292861-150293961 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACTACTTTGTTTTAGTATCTTTTATGTGGTCCTAGTGGTCCAGGAGGCACTAGAGTGGTATCAACAGTAT CTGACACAGAGTAGTCATTCAGTGAAAGTTTGTTGACAAGCATAATAATGTCCCAATCTAGTTCTATTTC GTTACTTTGGACCTGGCTTACTCTGAGGTGGGCTTAAGTGTTAGTGTAAGTTATTAGCATCAACTGATGA TGCACACGTCTGTGTCTGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGAGCGTGCGCGCGCACTCTCTCTCTAA GGGAGGTACGTTTTCCTACAGCCATTAGATGTTAACTTACGTGAATAACCATAAATGGATATGTACAGGT AGCATACAAATAGGAGGACGGGTGTCTCCACAGCGAAGAAGAAATTTAAAAGGAGGTTTTTCAGTAGGTC TCATTAGCACGAAAAGGCATAGAAGCTGACATAATTTTTTATTCTAAACCCTGCAGGTGTTTCCCATATA TCTTTATTGATTTCACTTTATGTAGTTAAATTAGTGGGAAGATGATATAGGAAACTCACAGTATGTTTAT TTCTTTTCCTTAGCACTTAGGCAGATGACGTGTATGAATCAATCTATTTTTCGTCCGGAGAGCAGATCTC AAAGAGTCTGTCCTTTCCAAAGAGAAAACAGGAAGCATCCTCAGGAAGCGCCTACTTCTCTTGTTTTCCA TCGAGAAAGAGAAATGGCTCAAATATTTATCAAGGATTTCACAGGATTAAGGGGTATGAAATTGGGCTGA CCTTCTCAGAGGCCGAAGGACTTCGACTCCATGAGAGGGCGAGAAACGTGTTTCGGGGGAATTTAAGTCA ATGAGTATTTTGCTTTGTCAGGTGTAGAGTCCAGGCCCGGGGAAGAGAGGCAGTCAACAGAGGCCAGAAA GGACGTTGCTATGGTTTCCACGCACGTTGTCTCCCTCGGCCTGTTTCTTTGCGCGGCGCTGGCGATTCCG TAATTTCCGCTTCCGGTAGTGAGAACCCTTCCGGTGGGCTAGGTACTGAGCGCGCGAGGTGAGGAGTTGT GCAGGGTTTGGGGAAAGGAAGGCTGGCTTGGCGAGAGGGCAGGTTTGCGGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPS21_1 ↗ | 1:150,293,868 | 正股 | 150,293,819–150,293,878 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_B34SBT · enhancer · 150293237–150293792 · regulatory
ENSR1_53BCGJ2 · CTCF_binding_site · 150293655–150293676 · regulatory
ENSR1_86FBBL · promoter · 150293793–150293930 · regulatory
· motif · 150293657–150293673 · motif
· motif · 150293673–150293682 · motif
· motif · 150293681–150293692 · motif
· motif · 150293842–150293853 · motif
· motif · 150293848–150293857 · motif
· motif · 150293866–150293875 · motif
· motif · 150293937–150293948 · motif
· motif · 150294070–150294086 · motif
· motif · 150294070–150294086 · motif
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
MRPS21 是粒線體小型核糖體次單元（mt-SSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型次單元與 39S 大型次單元構成；小型次單元含有 12S 粒線體核糖體 RNA（12S mt-rRNA）及 30 種不同蛋白質。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPS21 是粒線體小型核糖體次單元（mt-SSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體包含 28S 小型與 39S 大型次單元；小型次單元含 12S mt-rRNA 和 30 種不同蛋白質，大型次單元則含 16S mt-rRNA、具有重要結構作用的一份粒線體纈胺酸轉運 RNA（mt-tRNA(Val)），以及 52 種不同蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial small ribosomal subunit (mt-SSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins PMID 25838379 ↗ |
| 細胞定位 | MRPS21 的定位為粒線體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GAGAACCCTTCCGGTGGGCTAGGTACTGAGCGCGCGAGGC40TCTACAGAGTGAAGGTTTAAATCCAAGGTCATGGCAAAAC80ATCTGAAGTTCATCGCCAGGACTGTGATGGTACAGGAAGG120GAACGTGGAAAGCGCATACAGGACCCTAAACAGAATCCTC160ACTATGGATGGGCTCATTGAGGACATTAAGCATCGGCGGT200ATTATGAGAAGCCATGCTGCCGGCGACAGAGGGAAAGCTA240TGAAAGGTGCCGGCGGATCTACAACATGGAAATGGCTCGC280AAGATCAACTTCTTGATGCGAAAGAATCGGGCAGATCCGT320GGCAGGGCTGCTGAGGCCTGTGGGTGGGACACCCAGTGCG360AAACCCTCATCCAGTTTTCTCTCCATCTCTTTTCTTTGTA400CAATCCCATTTCCTATTACCATTCTCTGCAATAAACTCAA440ATCACATGTCTGCAAGAAGGCCTCCAAATATAGAAACAAT480CCCATTAGTCAGCAGTGGACCCTGTCTTTTATTAAGTGAA520AGAAGAAACTGAGTCTGAAAGTACTCTAGGAGTAGAATGG560TATTTGCCAGGGACTGGAGGAGGGGGCAGTGAGGAGTTAT600TGTTTAATGGGTACAGAGTTTCAGTTTGGGCAGATGAAAA640AGTTCAGGAGACGATGGCCTGGCATGGTGGCTCACGCCTG680TTATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCGGCTCACT720TGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAGCTTGGCCAATGTGGTGA760AACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAATTGGCCGG800GCGTGGTGGTGCACGCCTGTAATCCCAGATACTTGGGTGG840CTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACTGGGGAGGAAGAGGTT880GCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGC920GACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAACAAAAAAACGGAGAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。