基因總覽
MRPS18B 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein S18B。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 6p21.33。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000259873 ★ | 30,617,840–30,626,392 | 7 |
| ENST00000854951 | 30,617,759–30,626,398 | 6 |
| ENST00000854952 | 30,617,759–30,626,398 | 6 |
| ENST00000854954 | 30,617,759–30,626,398 | 7 |
| ENST00000854955 | 30,617,759–30,626,398 | 7 |
| ENST00000940251 | 30,617,759–30,626,398 | 7 |
| ENST00000940252 | 30,617,759–30,626,398 | 7 |
| ENST00000940253 | 30,617,759–30,626,393 | 5 |
| ENST00000991166 | 30,617,759–30,626,398 | 6 |
| ENST00001098811 | 30,617,759–30,626,390 | 7 |
| ENST00001098812 | 30,617,759–30,626,398 | 5 |
| ENST00001135693 | 30,617,759–30,626,398 | 7 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPS18B ENST00000259873 GRCh38 chr6:30616840-30617940 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGATAGGTGGGAAGGGGCAGAAGACACAAGTGGTTGGGCTGGTGGCTGCTGTTTTCCCTTTCCCCCCTCT CTCAGGATCCTTTCAAGGGCTTAGATGTTGCTGCGGCTTGTTTCTGTTTTCCTCGTGGCCGGCCTGTCTT TCTCCGAGAAAATTCAAACCTGGGATAAAAGGAACACAAGGGAGAAAGATGTAATCAGTACGGGTTGCTT CAAAACACTCACAAATGCCATCTTTGTTGTCCCCAAACAAACCTGTGTCCCATCCTGATCGCAACCGCTT TAAGCCGTGGCTCTCAAATGAACCCATCCATCCCTATCCCGCTTCCCAGATCCAACGCTCTCCGCAAAAT TTTACCCACTAGACGACAAAGTAGGCAAACTTACCTCTAAACGAACCCCAGAATGGCGGCCGCCCGCTCG GGTGGAGTCTTTTATACCCGGACGCCGCCCAACGCGCCCAAACGTGCTAGTGAAACGCCCTTGTCGCGAG ACATTATACGCGAGGCGTGAACTCATTGGTCAACCCAAATGACAACTCGCCAACTGATTGGCTACTCTCA CTTCACCTTTGCTCCGCCCCTTTCCCTGGCACTCTCTTCCGCCTCCTTCCTGCCTCCCTGTCGCGTGCGC GTGACCAGGAGCCTAGCACCTCCCTTTCCTCTGCTTCCGCCACTTCCGCCCTGGAGAACATTTCTCACCC AGGATTGGTAGAAACCTAAGAGCGCATGCGCACTGAGAGGATACCGCTAAAAATCGCCTTCAAAATTGCT TAAAAGGCAAACTTTAACAATGCGATCTAAGAGTCGTAGTGACTGGCCAAAAAAAACCGCAATTTTGGGG TCTAATTCGATTGTGACGCAGTTGAAATTAGCTTCTCCCCCATGCCTTCCCTTTCACGCTTCCGTCCTGA CGCAAACGTGGGGCCGCCTTCCGCACTGCGGGCTTGTCCTTGGCCCTGCCCTACTCAGTTTCCTGAAGCA TGCGCAGTTGCCTTTCCGTCAATTCCTGTCCTGGGCGTACGTCAAGATGGCGGCGTCTGTATTAAACACC GTGCTGAGGCGGCTTCCTATGCTATCTCTCTTCCGAGGTTCTCACAGAGTT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPS18B_1 ↗ | 6:30,617,840 | 正股 | 30,617,791–30,617,850 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_597FM5 · CTCF_binding_site · 30615860–30615881 · regulatory
ENSR6_B843L · promoter · 30617233–30617850 · regulatory
ENSR6_597FWF · CTCF_binding_site · 30617435–30617456 · regulatory
ENSR6_B843P · enhancer · 30617851–30618835 · regulatory
· motif · 30613458–30613480 · motif
· motif · 30613458–30613480 · motif
· motif · 30613625–30613633 · motif
· motif · 30613659–30613674 · motif
· motif · 30614111–30614122 · motif
· motif · 30614112–30614123 · motif
· motif · 30614294–30614305 · motif
· motif · 30614316–30614328 · motif
· motif · 30614320–30614335 · motif
· motif · 30615033–30615046 · motif
· motif · 30615136–30615146 · motif
· motif · 30615399–30615409 · motif
· motif · 30615543–30615553 · motif
· motif · 30615862–30615878 · motif
· motif · 30616642–30616653 · motif
· motif · 30616842–30616853 · motif
· motif · 30616889–30616909 · motif
· motif · 30617240–30617250 · motif
· motif · 30617341–30617353 · motif
· motif · 30617402–30617415 · motif
· motif · 30617410–30617420 · motif
· motif · 30617433–30617444 · motif
· motif · 30617437–30617453 · motif
· motif · 30617459–30617470 · motif
· motif · 30617501–30617512 · motif
· motif · 30617510–30617519 · motif
· motif · 30617510–30617521 · motif
· motif · 30617510–30617521 · motif
· motif · 30617560–30617571 · motif
· motif · 30617560–30617571 · motif
· motif · 30617605–30617619 · motif
· motif · 30617605–30617619 · motif
· motif · 30617663–30617671 · motif
· motif · 30617814–30617825 · motif
· motif · 30617814–30617825 · motif
· motif · 30617864–30617874 · motif
· motif · 30617890–30617904 · motif
· motif · 30617890–30617904 · motif
· motif · 30618066–30618075 · motif
· motif · 30618066–30618077 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：258 aa
MRPS18B 蛋白質長 258 個胺基酸，屬於 bacterial ribosomal protein bS18 家族中的粒線體專一性 mS40 亞家族。其第 1–35 位胺基酸標註為粒線體轉運胜肽；第 214–258 位則標註為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 20 個夥伴
- BMP10O95393 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CD81P60033 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CLEC1AQ8NC01 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IGFBP5P24593 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LATO43561-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LRP10Q7Z4F1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MIPP30301 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MRPS22P82650 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- MRPS27Q92552 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- RB1P06400 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SEC22BO75396 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SLC35A1P78382 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SYS1Q8N2H4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMED8Q6PL24 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMEM120BA0PK00 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMEM128Q5BJH2-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TNFRSF10CO14798 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TUSC5A5PKU2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZFPL1O95159 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EBNA6P03204 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
MRPS18B 是粒線體小核糖體次單元（mt-SSU）的組成成分。成熟哺乳類粒線體核糖體為 55S，由 28S 小次單元與 39S 大次單元構成；小次單元含 12S 粒線體核糖體 RNA 和 30 種蛋白質。資料另指出 mS40 具有鋅結合位點。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPS18B 是粒線體小核糖體次單元（mt-SSU）的組成成分。成熟哺乳類粒線體核糖體由 28S 小次單元與 39S 大次單元構成；小次單元含 12S 粒線體核糖體 RNA 及 30 種蛋白質，大次單元含 16S RNA、具重要結構作用的粒線體纈胺酸轉運 RNA，以及 52 種蛋白質。資料並指出 mS40 具有鋅結合位點。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial small ribosomal subunit (mt-SSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins. mS40 has a zinc binding site PMID 25838379 ↗ |
| 細胞定位 | MRPS18B 的細胞內定位為粒線體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AATTCCTGTCCTGGGCGTACGTCAAGATGGCGGCGTCTGT40ATTAAACACCGTGCTGAGGCGGCTTCCTATGCTATCTCTC80TTCCGAGGTTCTCACAGAGTTCAGGTTCCCCTCCAGACTC120TTTGCACCAAAGCTCCCTCTGAGGAAGATTCTTTGTCCTC160AGTTCCCATTTCTCCTTATAAGGATGAGCCCTGGAAATAT200CTGGAATCAGAAGAATACCAGGAGCGATATGGTTCTCGCC240CCGTCTGGGCTGACTACCGCCGCAACCACAAGGGTGGTGT280ACCCCCACAGCGGACTCGGAAGACATGTATTCGTCGGAAT320AAAGTTGTTGGGAATCCCTGCCCCATCTGTCGAGATCACA360AGTTGCATGTTGACTTTAGGAACGTGAAGCTCTTGGAGCA400ATTTGTCTGCGCCCACACGGGTATCATCTTCTATGCTCCA440TACACAGGAGTCTGTGTGAAGCAGCACAAGCGGTTGACCC480AGGCCATCCAGAAAGCCAGGGATCATGGTCTCCTCATTTA520CCACATCCCCCAGGTTGAACCACGGGACCTTGACTTCAGT560ACCTCTCATGGGGCTGTGAGTGCTACTCCGCCAGCCCCCA600CCCTGGTCTCAGGTGACCCCTGGTACCCATGGTACAACTG640GAAACAGCCACCGGAGAGAGAACTGTCTCGCCTTCGCCGG680CTTTACCAGGGTCATCTCCAAGAAGAGAGTGGCCCCCCAC720CTGAGTCAATGCCCAAGATGCCCCCTAGAACACCAGCGGA760AGCCTCCTCCACTGGGCAGACAGGCCCTCAGAGTGCTCTG800TAGGAGCTGTAGACTGGGAAGAGAGGCCAGGCGTGGTGGC840TCACTCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGGG880CTGATCACTTGATCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCA920CCATGGTGAAACCTCGTCTTTACCAAAAAATACAAAAATT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。