基因總覽
MRPS17 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein S17。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 7p11.2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000285298 ★ | 55,951,877–55,956,500 | 3 |
| ENST00000914644 | 55,950,705–55,956,500 | 3 |
| ENST00000909936 | 55,951,842–55,956,500 | 3 |
| ENST00000914645 | 55,951,842–55,956,500 | 3 |
| ENST00000914647 | 55,951,842–55,955,341 | 3 |
| ENST00000914648 | 55,951,842–55,956,500 | 4 |
| ENST00001140683 | 55,951,842–55,956,500 | 3 |
| ENST00000943621 | 55,951,885–55,956,500 | 2 |
| ENST00001101475 | 55,951,885–55,956,500 | 3 |
| ENST00000909935 | 55,951,918–55,956,500 | 3 |
| ENST00000914650 | 55,951,918–55,956,500 | 3 |
| ENST00000914651 | 55,951,918–55,956,500 | 4 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPS17 ENST00000285298 GRCh38 chr7:55950877-55951977 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CATCTGCTGAAATAGCCTACAGGCAGGAAAATCCCAGTAGCAAGTTGCTCACCTAGCACTCAGAGCTTTG TTGCTAAGTACCACTCCCCACTGATATTTTTCGTTTGAAAAACTTCTGATACAATAACTGGTCAGGGAAA GTATAGGTAAATCTGGACCAGCCAGGCACAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGAACTTTGGGAGTCCGAA ATAGGTGGATCACTTGAGGCCAAGAGTTCAAGAACAGCCTGGCCAACATGGTGAAATCCCGTCTCTACTA AAAATAAAAAAAATTAGCTGGACGTGGTGCCAGATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAG GAGAATCCCTTAAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGTCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGG CAACAAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACTTTTAGGCCAGGCACGGTGGCTCA CGCCTGTAATTCCAACACTTTGAAAGGCCAAAGTGGTTGGATCACTTAAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGC CTGGCCAACATGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCACGCCTG TAATCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGAAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGC AGAGATCGCGCCACTGCACACCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAA AAGAAACAAAACAAAAGAATGAAAGAAAAGTCCGAAACCTCCTGCGCCACTGTCCACTAGCTGCGCGCGT TAGGAAACCAGAGGTCAGCGCCCCCGACCCCGCCACCGCCGCGGGTCCCTTTAAGGGAGAGTGGGCGGGG TCCTGCCTTTAACTCCGCCCACGGCTAAGGAGATGCACGGCCTACGAGAGGGGTAGTGTGGGACTGAGCC AATGCGTACGGCGTGACGCCATCCCGCTGCGACCGGCGCTCCCCGGGGCAGGTGGCTGCATAGTCTTGGC GGAGGTGAGTCTCGTGGTGGAGGTGAGGGCAGGCTCCGGGGTATTGCTGCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPS17_1 ↗ | 7:55,951,877 | 正股 | 55,951,828–55,951,887 |
| MRPS17_2 ↗ | 7:55,953,169 | 正股 | 55,953,120–55,953,179 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR7_9S7LP · promoter · 55951479–55951887 · regulatory
ENSR7_BF4RX · enhancer · 55951888–55952549 · regulatory
· motif · 55951414–55951429 · motif
· motif · 55951725–55951737 · motif
· motif · 55951727–55951734 · motif
· motif · 55951743–55951753 · motif
· motif · 55951772–55951785 · motif
· motif · 55951777–55951787 · motif
· motif · 55951798–55951808 · motif
· motif · 55951800–55951813 · motif
· motif · 55951867–55951880 · motif
· motif · 55951867–55951880 · motif
· motif · 55952040–55952052 · motif
· motif · 55952043–55952050 · motif
· motif · 55954224–55954238 · motif
· motif · 55954224–55954239 · motif
· motif · 55954309–55954324 · motif
· motif · 55954311–55954324 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：130 aa
MRPS17 的蛋白質產物屬於 universal ribosomal protein uS17 家族，全長 130 個胺基酸。其第 1 至 20 位胺基酸被註解為粒線體轉運胜肽。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- GRNP28799 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- WFS1O76024 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
MRPS17 是粒線體小核糖體次單元（mt-SSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小次單元與 39S 大次單元構成；小次單元含有 12S 粒線體核糖體 RNA 和 30 種不同蛋白質。大次單元則含有 16S 粒線體核糖體 RNA、1 個具有重要結構作用的粒線體纈胺酸轉移 RNA，以及 52 種不同蛋白質。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPS17 是粒線體小核糖體次單元（mt-SSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小次單元與 39S 大次單元組成；前者含有 12S 粒線體核糖體 RNA 和 30 種不同蛋白質，後者則含有 16S 粒線體核糖體 RNA、具有重要結構作用的粒線體纈胺酸轉移 RNA，以及 52 種不同蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial small ribosomal subunit (mt-SSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins PMID 25838379 ↗ |
| 細胞定位 | MRPS17 定位於粒線體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ATCCCGCTGCGACCGGCGCTCCCCGGGGCAGGTGGCTGCA40TAGTCTTGGCGGAGGTGACCAAAGCCACGTAATGTCCGTA80GTTCGCTCATCCGTCCATGCCAGATGGATTGTGGGGAAGG120TGATTGGGACAAAAATGCAAAAGACTGCTAAAGTGAGAGT160GACCAGGCTTGTTCTGGATCCCTATTTATTAAAGTATTTT200AATAAGCGGAAAACCTACTTTGCTCACGATGCCCTTCAGC240AGTGCACAGTTGGGGATATTGTGCTTCTCAGAGCTTTACC280TGTTCCACGAGCAAAGCATGTGAAACATGAACTGGCTGAG320ATCGTTTTCAAAGTTGGAAAAGTCATAGATCCAGTGACAG360GAAAGCCCTGTGCTGGAACTACCTACCTGGAGAGTCCGTT400GAGTTCGGAAACCACCCAGCTAAGCAAAAATCTGGAAGAA440CTCAATATCTCTTCAGCACAGTGAAGCGGGAGTGGAAGAA480GGATCTAAAGGGAAAAACTGACATGTTTATGTTATGGAAA520AAGAAATTTTTCTAAGTTTCATCACAAACTGTGTCCAGTT560TCTCTGTGGTGTTTATGAAATAGCTAAAAGCAAATGAAGT600AAAGGGCATACTATGGTTTTTCACAAAGGTTTATGGTCGT640GTTTCAAATTTTCATCATTTCAGTGAACATACTTCCACGT680TACATTAAGTGTGCCTAGCAGTCTGTTGCATTTTGTAAGC720TCACAGTTTTTTGTTTTGAGATGGAATCTCACTCTGTCAC760CCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAA800GCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCGTTCTCCTGCCTCAGCC840TCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCATGCCC880AGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTATTTTTAGTAGA920GACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。