基因總覽
MRPS15 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein S15。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 1p34.3。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000373116 ★ | 36,455,718–36,464,384 | 8 |
| ENST00000869082 | 36,455,718–36,464,418 | 8 |
| ENST00000869083 | 36,455,718–36,464,418 | 8 |
| ENST00000869084 | 36,455,718–36,464,418 | 5 |
| ENST00000869085 | 36,455,718–36,464,418 | 9 |
| ENST00000917997 | 36,455,718–36,464,418 | 6 |
| ENST00000917998 | 36,455,718–36,464,418 | 4 |
| ENST00000917999 | 36,455,718–36,464,382 | 6 |
| ENST00000918000 | 36,455,718–36,464,360 | 8 |
| ENST00000918001 | 36,455,718–36,464,292 | 8 |
| ENST00001145552 | 36,455,718–36,464,418 | 8 |
| ENST00000917996 | 36,455,771–36,464,418 | 8 |
顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPS15 ENST00000373116 GRCh38 chr1:36464284-36465384 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATCCAAAGGAAAAATCGATTTCCCCTATCTTTATAACAAAGGGTAGGTTGCAACTAAGAGCTAGGCACCA ACTGAAGTTAGGCTCCTACCCTCCCACAGGAACTGAGAGAGAGCACTATCTTCCTTAATTATTACATTTC AAAGGGTTGGCCCCCAGGTCCTTGAGAAAAACATTCCGGGGTTGTAAAACTGGCAAGAGGTTTATTTACC TTTTAAGAAGATTTACATTCATCGCAAAGCAGTAGAGAAAGTATTCACAATTACAAGTTTTCTAAAGTAA ATGCTCTCAGAAAAGTGAGGGGAAGGAGTCTTTTCCCTTTTTGCGCCAGGGAAAATTAAATTTTCTTTTT CTTCTAATTTGTATCCACCCTTACACCACTCATTTCACAAATAACGTCACCGTAAAGATTTACTAAATGC TCACTATATACCAGGTGGTCTGCATACAACTCAGTTAATCCTCTCAACAACCTAAAAGAGAGATATTGTT ATTACTATCCCTACAGGGCCCACATAGGTTAAGTGACTTGCCCACAAGATCACATGTTGAGTAAATGGCT GAGTTAGGATTCCAGACCAGGACTGTGCGATTCCAAACTCAGCGACTTTAGTCTCCAGGCTACGAGGCTG CCAGAGACATGGCTGAAACCCAGTAGTAGTTCTTACACGGTCCCATCCTTGTCTAAGGGAGGGGTGAGGT GGGGTGGAGAGGGGATTGGGTTGGGGGTAGAAGGCTACCGCAGGCGCCATGGACCTCCCAAAATAACCCT GGCCCGAGGGCCAGGAATGAGATTAAGGACGGAACGCATGCCCTCCAAAAAGTGGCATTTTAGAATTTAT ACAGCACCCCAGCACGCTGCTAAACGTGGGCACACAACCACCACGGCCCGATCACGCGCAGCGGGAACCC GGTCTCTGAGCTCCGCCCCGTGCGTTGCGTCATCAGAGTCACGCCACCTAATCCATTCTCTCGGTCTTCG TCTGCTCCGGTATTGCAACTGCCTCGATTGGTCGATCCTGGGCCAGCATGGCGGCGCCCATGTAACCCGG TCCGTGCCGCAAAGCGAACGGCGGCCGCGGCGCGGGCCCCGCGGGGGTTAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPS15_1 ↗ | 1:36,464,382 | 負股 | 36,464,372–36,464,431 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_9JGR4 · promoter · 36464374–36464874 · regulatory
ENSR1_9JGR9 · enhancer · 36465140–36465399 · regulatory
· motif · 36459954–36459967 · motif
· motif · 36459954–36459967 · motif
· motif · 36463614–36463626 · motif
· motif · 36463937–36463954 · motif
· motif · 36464015–36464024 · motif
· motif · 36464015–36464024 · motif
· motif · 36464028–36464041 · motif
· motif · 36464274–36464286 · motif
· motif · 36464277–36464292 · motif
· motif · 36464278–36464291 · motif
· motif · 36464278–36464293 · motif
· motif · 36464316–36464331 · motif
· motif · 36464427–36464438 · motif
· motif · 36464442–36464451 · motif
· motif · 36464983–36464996 · motif
· motif · 36464983–36464996 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：257 aa
mitochondrial ribosomal protein S15 長 257 個胺基酸，屬於 universal ribosomal protein uS15 family。其 N 端第 1–57 位為粒線體轉運胜肽；第 225–257 位則註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
mitochondrial ribosomal protein S15 位於粒線體基質。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- MRPS27Q92552 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- PTCD3Q96EY7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
MRPS15 是粒線體小型核糖體次單元（mt-SSU）的組成蛋白。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型次單元與 39S 大型次單元組成；前者含有 12S 粒線體核糖體 RNA 與 30 種蛋白質。另有相似性推定指出，MRPS15 與 METTL17 互作。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPS15 是粒線體小型核糖體次單元（mt-SSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體分為 28S 小型與 39S 大型次單元；小型次單元含 12S 粒線體核糖體 RNA 及 30 種不同蛋白質，大型次單元含 16S 粒線體核糖體 RNA、1 個具有重要結構作用的粒線體 valine transfer RNA，以及 52 種不同蛋白質。另有相似性推定顯示 MRPS15 與 METTL17 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial small ribosomal subunit (mt-SSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins. Interacts with METTL17 (By similarity) PMID 25838379 ↗ |
| 細胞定位 | mitochondrial ribosomal protein S15 位於粒線體基質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCCTCGATTGGTCGATCCTGGGCCAGCATGGCGGCGCCCA40TGTAACCCGGTCCGTGCCGCAAAGCGAACGGCGGCCGCGG80CGCGGGCCCCGCGGGGGTTAGAGGTCACCATGCTGAGGGT120CGCGTGGAGGACGCTGAGTTTGATTCGGACCCGGGCAGTT160ACCCAGGTCCTAGTACCCGGGCTGCCGGGCGGTGGGAGCG200CCAAGTTTCCTTTCAACCAGTGGGGCCTGCAGCCTCGAAG240TCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCGGATATGTCGTCCGGAAA280CCAGCCCAGTCTAGGCTGGATGATGACCCACCTCCCTCTA320CGCTGCTCAAAGACTACCAGAATGTCCCTGGAATTGAGAA360GGTTGATGATGTCGTGAAAAGACTCTTGTCTTTGGAAATG400GCCAACAAGAAGGAGATGCTAAAAATCAAGCAAGAACAGT440TTATGAAGAAGATTGTTGCAAACCCAGAGGACACCAGATC480CCTGGAGGCTCGAATTATTGCCTTGTCTGTCAAGATCCGC520AGTTATGAAGAACACTTGGAGAAACATCGAAAGGACAAAG560CCCACAAACGCTATCTGCTAATGAGCATTGACCAGAGGAA600AAAGATGCTCAAAAACCTCCGTAACACCAACTATGATGTC640TTTGAGAAGATATGCTGGGGGCTGGGAATTGAGTACACCT680TCCCCCCTCTGTATTACCGAAGAGCCCACCGCCGATTCGT720GACCAAGAAGGCTCTGTGCATTCGGGTTTTCCAGGAGACT760CAAAAGCTGAAGAAGCGAAGAAGAGCCTTAAAGGCTGCAG800CAGCAGCCCAAAAACAAGCAAAGCGGAGGAACCCAGACAG840CCCTGCCAAAGCCATACCAAAGACACTCAAAGACAGCCAA880TAAATTCTGTTCAATCATTTCTTTCTGTCTTGAAGAATGA920TAGGAGAGATGATGGGGCTCTTTTTGGCCTGAA953cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。